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The map label for this gene is lagD [H]

Identifier: 50365080

GI number: 50365080

Start: 302391

End: 304217

Strand: Direct

Name: lagD [H]

Synonym: Mfl264

Alternate gene names: 50365080

Gene position: 302391-304217 (Clockwise)

Preceding gene: 50365079

Following gene: 50365081

Centisome position: 38.12

GC content: 18.5

Gene sequence:

>1827_bases
GTGATTTTTTTGAAGTTAGTAAAACAAACCTCGTATCAAGATTGTGGTGTTGCATGCATAGCAATGATGATTAATCATTT
TTATAAGTATGAAATAGATTTGCAACAAGTTAAAAATTATCTATCAATCCATGATGATGAACTTAGTTTTTATGACGTGA
TTGATTTAGCTAGTAATTTTTATTTAAAAGGTGATGCTTTTAAAGTTGAGCAAGATTTTTTAGAATTAAAAAATAAAGTA
CCATTTTTAGCACAAGTGATAAATTCTGATGGATTATTACATTTTGTTATAGTAGAAAGTATTTTACAAAATAATTTAAT
TGTTTTTGATCCAAGCAAAGAAAAAAAGATTAAGCAAAATATCTCTGAATTTTTGAAATGTTTTAATAGTAACGTAATAA
TTTTTAAATCTAACATCAAATCATTTAATAAAGACTTTAAATTTAATTTTAAAAAGTTTTTAAATATTTTTAATTTTGAT
TTTATTTTATACTTATTAATAAATTTAGTATCAACACTATTGTTCATTTTAGATACACAATTTCTTAAGATGTTTTCTAA
TTCATTATCTGAACAGACTCAAGATTTTTTAATATATTTATTTCCATTAATCATTTTATTGTTTAATATGCTTTTCAAAA
ATATATCGATTAATATTCTTAATAAGAATTATAAAAAAAGAAAACATTTTTTATTAAAAAAATTCTTAAACTTAATTGAA
TCTACAAATTCAGAAGATTTATTTTATTTATATCAAGAAATAAAATGAGTATGTCAATATGAAAACTACAGTTTGAAAAG
CAGCATTTCATCGTTTATTTCTGAAGTAGTAAGTTTATTCTTTATTTATTTTATTATTAAAGAATTATTTTTAATAATAC
TTATAGCTGATGTTATTTATATATTGATTAATACTTTTATAAATAATTTTGTTAAAAAAGATAGTTTTAATCAAGATAAA
GAATGATTTACATTTTTAAGTAATATTGAACATGTAAAAAATATTTGTGCTGAATATGATATGTTAACAGAACTTTTAAA
ATTAGAAGAAAAAGATAAGTTGGCAAGTTCAACGTTAAATTGAATTGAACTTTGAGATAAAGTTGGCTTAATATTAATTT
ATATAGTTAGTTGATCATTATTAAAAAATGGTAATTTAGAATTTTCACTTTTCTTTATAATTTTATTGTTTAAAAATTTT
AGTAGAATTAATATTTTTAATTTAGGTCAAACTTTAATATGAATAAAAAAGTATAAGATATCAATTATAAAATTTGAAAA
AATTTTTATTGAAAAAAATGAAGTTAATTTTAATGAAGAAATAAGCAATATTCTAATTTCAAATAAACAACAAAAATTAG
AATTAAATAAAGGGTTAAACATAATAAATTTTAAAATTGATTTAGGTAATGTAAATAAAACTAAAAATGATATAGAAGTT
GATGTCTACATAAATAACAAGAACATTAGCATTTTAAAAACATCTGATTTACGTAAACAAATTTATTATTCAAAAAATTT
TCAAATCAAATTTGGAACTATTTTTCAAAACATAACATCATCAAACATAAATAGTATAAATATTTTTAATATTAAGGAAA
TTAATGAACTTTTAAATAAATACTCAATCAAAATAACAAAACTAGTAAAACCAGAAACTAATAGTCAAATTGAAAAAGAG
ATAATTAAGCTATTGAATGTGTTTTACATTAACAAAAAAGTAATATTAATTAAAAATGATTTTCAAATATTAACTTTTGA
TGAAATAAAGTCAATTTTAACTATCTTTACTGAATTAAGTGATGATAAATTTTTGATTTTGTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCTTAAATATAATAGAATATCTACAAGGAAAAGAACAAAAAGAAAAAATTAGACAACAACTTGTAATTATTTAACAAAAT
CACCTTACTAATACAGTGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTAATATATTAAAGTAAAAAGGGATAAGAATGATAAGTATTGATTTTATAAATGAAACTGATTTAAAAGTAAAAGAAT
GAGAAGATTTAGCAAAACAA

Product: putative multidrug ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 608; Mature: 608

Protein sequence:

>608_residues
MIFLKLVKQTSYQDCGVACIAMMINHFYKYEIDLQQVKNYLSIHDDELSFYDVIDLASNFYLKGDAFKVEQDFLELKNKV
PFLAQVINSDGLLHFVIVESILQNNLIVFDPSKEKKIKQNISEFLKCFNSNVIIFKSNIKSFNKDFKFNFKKFLNIFNFD
FILYLLINLVSTLLFILDTQFLKMFSNSLSEQTQDFLIYLFPLIILLFNMLFKNISINILNKNYKKRKHFLLKKFLNLIE
STNSEDLFYLYQEIKWVCQYENYSLKSSISSFISEVVSLFFIYFIIKELFLIILIADVIYILINTFINNFVKKDSFNQDK
EWFTFLSNIEHVKNICAEYDMLTELLKLEEKDKLASSTLNWIELWDKVGLILIYIVSWSLLKNGNLEFSLFFIILLFKNF
SRINIFNLGQTLIWIKKYKISIIKFEKIFIEKNEVNFNEEISNILISNKQQKLELNKGLNIINFKIDLGNVNKTKNDIEV
DVYINNKNISILKTSDLRKQIYYSKNFQIKFGTIFQNITSSNINSINIFNIKEINELLNKYSIKITKLVKPETNSQIEKE
IIKLLNVFYINKKVILIKNDFQILTFDEIKSILTIFTELSDDKFLILS

Sequences:

>Translated_608_residues
MIFLKLVKQTSYQDCGVACIAMMINHFYKYEIDLQQVKNYLSIHDDELSFYDVIDLASNFYLKGDAFKVEQDFLELKNKV
PFLAQVINSDGLLHFVIVESILQNNLIVFDPSKEKKIKQNISEFLKCFNSNVIIFKSNIKSFNKDFKFNFKKFLNIFNFD
FILYLLINLVSTLLFILDTQFLKMFSNSLSEQTQDFLIYLFPLIILLFNMLFKNISINILNKNYKKRKHFLLKKFLNLIE
STNSEDLFYLYQEIK*VCQYENYSLKSSISSFISEVVSLFFIYFIIKELFLIILIADVIYILINTFINNFVKKDSFNQDK
E*FTFLSNIEHVKNICAEYDMLTELLKLEEKDKLASSTLN*IEL*DKVGLILIYIVS*SLLKNGNLEFSLFFIILLFKNF
SRINIFNLGQTLI*IKKYKISIIKFEKIFIEKNEVNFNEEISNILISNKQQKLELNKGLNIINFKIDLGNVNKTKNDIEV
DVYINNKNISILKTSDLRKQIYYSKNFQIKFGTIFQNITSSNINSINIFNIKEINELLNKYSIKITKLVKPETNSQIEKE
IIKLLNVFYINKKVILIKNDFQILTFDEIKSILTIFTELSDDKFLILS
>Mature_608_residues
MIFLKLVKQTSYQDCGVACIAMMINHFYKYEIDLQQVKNYLSIHDDELSFYDVIDLASNFYLKGDAFKVEQDFLELKNKV
PFLAQVINSDGLLHFVIVESILQNNLIVFDPSKEKKIKQNISEFLKCFNSNVIIFKSNIKSFNKDFKFNFKKFLNIFNFD
FILYLLINLVSTLLFILDTQFLKMFSNSLSEQTQDFLIYLFPLIILLFNMLFKNISINILNKNYKKRKHFLLKKFLNLIE
STNSEDLFYLYQEIK*VCQYENYSLKSSISSFISEVVSLFFIYFIIKELFLIILIADVIYILINTFINNFVKKDSFNQDK
E*FTFLSNIEHVKNICAEYDMLTELLKLEEKDKLASSTLN*IEL*DKVGLILIYIVS*SLLKNGNLEFSLFFIILLFKNF
SRINIFNLGQTLI*IKKYKISIIKFEKIFIEKNEVNFNEEISNILISNKQQKLELNKGLNIINFKIDLGNVNKTKNDIEV
DVYINNKNISILKTSDLRKQIYYSKNFQIKFGTIFQNITSSNINSINIFNIKEINELLNKYSIKITKLVKPETNSQIEKE
IIKLLNVFYINKKVILIKNDFQILTFDEIKSILTIFTELSDDKFLILS

Specific function: LagD (TC 3.A.1) is involved in processing the signal peptide and probably also in export of the bacteriocin lactococcin G [H]

COG id: COG2274

COG function: function code V; ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 peptidase C39 domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003439
- InterPro:   IPR017871
- InterPro:   IPR017940
- InterPro:   IPR001140
- InterPro:   IPR011527
- InterPro:   IPR003593
- InterPro:   IPR005897
- InterPro:   IPR005074 [H]

Pfam domain/function: PF00664 ABC_membrane; PF00005 ABC_tran; PF03412 Peptidase_C39 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70813; Mature: 70813

Theoretical pI: Translated: 8.97; Mature: 8.97

Prosite motif: PS50990 PEPTIDASE_C39

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIFLKLVKQTSYQDCGVACIAMMINHFYKYEIDLQQVKNYLSIHDDELSFYDVIDLASNF
CEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
YLKGDAFKVEQDFLELKNKVPFLAQVINSDGLLHFVIVESILQNNLIVFDPSKEKKIKQN
EECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHH
ISEFLKCFNSNVIIFKSNIKSFNKDFKFNFKKFLNIFNFDFILYLLINLVSTLLFILDTQ
HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLKMFSNSLSEQTQDFLIYLFPLIILLFNMLFKNISINILNKNYKKRKHFLLKKFLNLIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
STNSEDLFYLYQEIKVCQYENYSLKSSISSFISEVVSLFFIYFIIKELFLIILIADVIYI
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINTFINNFVKKDSFNQDKEFTFLSNIEHVKNICAEYDMLTELLKLEEKDKLASSTLNIE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEE
LDKVGLILIYIVSSLLKNGNLEFSLFFIILLFKNFSRINIFNLGQTLIIKKYKISIIKFE
EHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEE
KIFIEKNEVNFNEEISNILISNKQQKLELNKGLNIINFKIDLGNVNKTKNDIEVDVYINN
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEC
KNISILKTSDLRKQIYYSKNFQIKFGTIFQNITSSNINSINIFNIKEINELLNKYSIKIT
CCEEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCEEEE
KLVKPETNSQIEKEIIKLLNVFYINKKVILIKNDFQILTFDEIKSILTIFTELSDDKFLI
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LS
EC
>Mature Secondary Structure
MIFLKLVKQTSYQDCGVACIAMMINHFYKYEIDLQQVKNYLSIHDDELSFYDVIDLASNF
CEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
YLKGDAFKVEQDFLELKNKVPFLAQVINSDGLLHFVIVESILQNNLIVFDPSKEKKIKQN
EECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHH
ISEFLKCFNSNVIIFKSNIKSFNKDFKFNFKKFLNIFNFDFILYLLINLVSTLLFILDTQ
HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLKMFSNSLSEQTQDFLIYLFPLIILLFNMLFKNISINILNKNYKKRKHFLLKKFLNLIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
STNSEDLFYLYQEIKVCQYENYSLKSSISSFISEVVSLFFIYFIIKELFLIILIADVIYI
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINTFINNFVKKDSFNQDKEFTFLSNIEHVKNICAEYDMLTELLKLEEKDKLASSTLNIE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEE
LDKVGLILIYIVSSLLKNGNLEFSLFFIILLFKNFSRINIFNLGQTLIIKKYKISIIKFE
EHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEE
KIFIEKNEVNFNEEISNILISNKQQKLELNKGLNIINFKIDLGNVNKTKNDIEVDVYINN
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEC
KNISILKTSDLRKQIYYSKNFQIKFGTIFQNITSSNINSINIFNIKEINELLNKYSIKIT
CCEEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCEEEE
KLVKPETNSQIEKEIIKLLNVFYINKKVILIKNDFQILTFDEIKSILTIFTELSDDKFLI
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LS
EC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7565085 [H]