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The map label for this gene is 46447450

Identifier: 46447450

GI number: 46447450

Start: 2170767

End: 2172965

Strand: Reverse

Name: 46447450

Synonym: pc1816

Alternate gene names: NA

Gene position: 2172965-2170767 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447451

Following gene: 46447449

Centisome position: 90.0

GC content: 32.97

Gene sequence:

>2199_bases
ATGTGTTCAGTGACTTCAATCTCTGAGTATGCTCAGGAAATTCACCTTGCTCTTCCTTATAATCAGCCACGAATTCAAGA
GCTATTAGAAACTAGTTATCCTGAAATTTTAGCTAAATTTTATGAAATTTTTACTCGGTTCCCTAAAAAATTTTCTGAAC
TAACCGATTTATACGAAGAAAATAATGAACGTGTTATCTTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTGTCTGTTCCTGAAGAAAAA
TTATATCGCGCGCTTAAAAAGCTAGTTTCAATCTCAATAAGGACAACTATCCCGTTGGGAGAAATTTCTCAACCTAATCT
GTTTAATTCTCTAAAAACTATAAAAGACAGCGAATCACAAAATGAAGGAGAACTTAAGCTAAATGTTTTGCCGGTAGAGA
TTTTAGAACAAATTTTTTCTTATGAAAAAACATGGAATAAACTTGGTCAAATTGGCTTAGTTTGTAAAATATTTCATAGT
ATAGTCACAGAGCCCTTATTTTTAAGAAAATTTTTTAATCAGTACCCCCATCAATTTTCAACGATTCGAACCAATAGCTT
GAGCCGCCGTTTACTTGATTGGACAAATTACCTTCCTTCCTCTTTTTTTCCTCGACAAAACAATCTCTCTGATGGCGATT
TGCAAAGTCTAGCAAGACATACGGTAAAGCTTGAAAATTTAGCGTTGAACGGGGGAACTTATACTCCAGAAGGACTTGCA
AATTTACTTCAACAGTCACCCAATTTGCAAACATTAGAATTTTATCATCATCCCTCACTGTCCTTTGATGATTATATTGC
TATTATTTGTTTATATGCCCCACAAATCAAAAATTTGAAAATCATCGATTGTCACATTTCCGACCTGTCCTTACTTGAGC
TTGCACTTTCAGAAATTAAATTAACTCATTTTGAATGTTGGGATAGCTCAGGGAAAGGGTCTTTGACTGATTACGGACTA
TATCCTTTAATGAAAAAAAAAAGTTGTCTAGAAAAATTATCCCTCACAGGTTTTCCTCTGGTTACTCAAGAGTCTCTTTT
TACCCTTACAAGTCACATCAAAACTTTAAATTTTACTAATTGCGGTGCTGTTAATCATCGGTTATTAGATACTATTGCAA
GTCGCTTAACCCAATTAGAAGAATTGGAGTTAGGGTTTCTTCCTTGTTCTAACCGCTCTAGCGATACTCAACGCATGCAA
CAAGCTTTCTCGAATGTTGCTCAAAACTGTCAACAATTAAAAAAAATTAAAATTAGCGATTGTTTTTTTTTAAATGATGA
AACAATAAAAGAAACCTTAAACAAATGGCTTAAACTTCAGCATCTTGAACTTTATCGAAGCATTCCTATGACAAAAACTT
TTTTGGCGCAATTAAAGTCTTTAAAAAATTTGAAAGTTTTTAAATTTGAAAATCCATATCATTCGCCAGGCGAATTTTCA
ATCGAACCCCATGATTTTAAATGTTTAGAGACATTAAAATTAACAAATTGCCTGATCGATGAAAAAGAGTTAATTGCTTT
TCTCAAAGCCAAAAGCTCTTCAGAAGCATCATCTTTAAAACGTTTATGCTTATTTAATACAGGATATATTAGTCAGCAAC
TATTAGAAGCCTTAGGAGACTATTGCCCAAAATTAAAAGTCGTCGAGCTTGAACAGGACAAATTAATGGCTAAACACGCC
ATAATTAATGATGAGGGGATTCAAAAATTAACCAAACGTTGTCGTTTTCTTAAAACCTTACATATCAAATCTCCTAATCC
TTCTTGGAATTTTACGGATCAATCTTTGATGTATCTCAGTGCTTGCTCAAAGTTAGAACAATTAACTCTCAGTCACTTGC
ATTCAACCTCTAATAATAACGATAATATTCGGATTTTTCATCTCCAGTGTCTGCATTTGAATCATTTAGGAATTCCTTTT
CATCAACTGGAAGAGCCTCATCTTACAAATTTATTAGAAAGATATAGTGAGCAGTTACTTTCATTAGATATTCAAGCAAT
GCCCAATCTGAGAAAAAAATTAAAAGGGAAGTTTTCCCATCTCCGCTCACTTACAACAGACTATCAAAATTTAACCATAG
CGACCATCTCTTTTCTTCAATTATCAGCTCCCTCATTACAACTGATTAATATCAAAAATCAAGAAGGTTTTATGCAACAC
CACCCATTTTCTGCGTATTTGAATCAACTAAATAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTGCTTCCTTATTAAACAAAATTAATTAAAATAATTAATTTTATTTTTAAATTTAAATGTAATAATTTTTTTTAATTT
AATTAGAAAAGGGAAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTTATTTATCCACGTTGACGAAAACTTAATATTTCTTGGATAATAAAAACATGAATCTACCTGTTTTTAGTGCGCTGCA
GATCACTGCTTTACTTTCTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 732; Mature: 732

Protein sequence:

>732_residues
MCSVTSISEYAQEIHLALPYNQPRIQELLETSYPEILAKFYEIFTRFPKKFSELTDLYEENNERVILIKKRQVLSVPEEK
LYRALKKLVSISIRTTIPLGEISQPNLFNSLKTIKDSESQNEGELKLNVLPVEILEQIFSYEKTWNKLGQIGLVCKIFHS
IVTEPLFLRKFFNQYPHQFSTIRTNSLSRRLLDWTNYLPSSFFPRQNNLSDGDLQSLARHTVKLENLALNGGTYTPEGLA
NLLQQSPNLQTLEFYHHPSLSFDDYIAIICLYAPQIKNLKIIDCHISDLSLLELALSEIKLTHFECWDSSGKGSLTDYGL
YPLMKKKSCLEKLSLTGFPLVTQESLFTLTSHIKTLNFTNCGAVNHRLLDTIASRLTQLEELELGFLPCSNRSSDTQRMQ
QAFSNVAQNCQQLKKIKISDCFFLNDETIKETLNKWLKLQHLELYRSIPMTKTFLAQLKSLKNLKVFKFENPYHSPGEFS
IEPHDFKCLETLKLTNCLIDEKELIAFLKAKSSSEASSLKRLCLFNTGYISQQLLEALGDYCPKLKVVELEQDKLMAKHA
IINDEGIQKLTKRCRFLKTLHIKSPNPSWNFTDQSLMYLSACSKLEQLTLSHLHSTSNNNDNIRIFHLQCLHLNHLGIPF
HQLEEPHLTNLLERYSEQLLSLDIQAMPNLRKKLKGKFSHLRSLTTDYQNLTIATISFLQLSAPSLQLINIKNQEGFMQH
HPFSAYLNQLNN

Sequences:

>Translated_732_residues
MCSVTSISEYAQEIHLALPYNQPRIQELLETSYPEILAKFYEIFTRFPKKFSELTDLYEENNERVILIKKRQVLSVPEEK
LYRALKKLVSISIRTTIPLGEISQPNLFNSLKTIKDSESQNEGELKLNVLPVEILEQIFSYEKTWNKLGQIGLVCKIFHS
IVTEPLFLRKFFNQYPHQFSTIRTNSLSRRLLDWTNYLPSSFFPRQNNLSDGDLQSLARHTVKLENLALNGGTYTPEGLA
NLLQQSPNLQTLEFYHHPSLSFDDYIAIICLYAPQIKNLKIIDCHISDLSLLELALSEIKLTHFECWDSSGKGSLTDYGL
YPLMKKKSCLEKLSLTGFPLVTQESLFTLTSHIKTLNFTNCGAVNHRLLDTIASRLTQLEELELGFLPCSNRSSDTQRMQ
QAFSNVAQNCQQLKKIKISDCFFLNDETIKETLNKWLKLQHLELYRSIPMTKTFLAQLKSLKNLKVFKFENPYHSPGEFS
IEPHDFKCLETLKLTNCLIDEKELIAFLKAKSSSEASSLKRLCLFNTGYISQQLLEALGDYCPKLKVVELEQDKLMAKHA
IINDEGIQKLTKRCRFLKTLHIKSPNPSWNFTDQSLMYLSACSKLEQLTLSHLHSTSNNNDNIRIFHLQCLHLNHLGIPF
HQLEEPHLTNLLERYSEQLLSLDIQAMPNLRKKLKGKFSHLRSLTTDYQNLTIATISFLQLSAPSLQLINIKNQEGFMQH
HPFSAYLNQLNN
>Mature_732_residues
MCSVTSISEYAQEIHLALPYNQPRIQELLETSYPEILAKFYEIFTRFPKKFSELTDLYEENNERVILIKKRQVLSVPEEK
LYRALKKLVSISIRTTIPLGEISQPNLFNSLKTIKDSESQNEGELKLNVLPVEILEQIFSYEKTWNKLGQIGLVCKIFHS
IVTEPLFLRKFFNQYPHQFSTIRTNSLSRRLLDWTNYLPSSFFPRQNNLSDGDLQSLARHTVKLENLALNGGTYTPEGLA
NLLQQSPNLQTLEFYHHPSLSFDDYIAIICLYAPQIKNLKIIDCHISDLSLLELALSEIKLTHFECWDSSGKGSLTDYGL
YPLMKKKSCLEKLSLTGFPLVTQESLFTLTSHIKTLNFTNCGAVNHRLLDTIASRLTQLEELELGFLPCSNRSSDTQRMQ
QAFSNVAQNCQQLKKIKISDCFFLNDETIKETLNKWLKLQHLELYRSIPMTKTFLAQLKSLKNLKVFKFENPYHSPGEFS
IEPHDFKCLETLKLTNCLIDEKELIAFLKAKSSSEASSLKRLCLFNTGYISQQLLEALGDYCPKLKVVELEQDKLMAKHA
IINDEGIQKLTKRCRFLKTLHIKSPNPSWNFTDQSLMYLSACSKLEQLTLSHLHSTSNNNDNIRIFHLQCLHLNHLGIPF
HQLEEPHLTNLLERYSEQLLSLDIQAMPNLRKKLKGKFSHLRSLTTDYQNLTIATISFLQLSAPSLQLINIKNQEGFMQH
HPFSAYLNQLNN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84393; Mature: 84393

Theoretical pI: Translated: 8.12; Mature: 8.12

Prosite motif: PS50181 FBOX

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCSVTSISEYAQEIHLALPYNQPRIQELLETSYPEILAKFYEIFTRFPKKFSELTDLYEE
CCCCCHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NNERVILIKKRQVLSVPEEKLYRALKKLVSISIRTTIPLGEISQPNLFNSLKTIKDSESQ
CCCEEEEEECCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
NEGELKLNVLPVEILEQIFSYEKTWNKLGQIGLVCKIFHSIVTEPLFLRKFFNQYPHQFS
CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHH
TIRTNSLSRRLLDWTNYLPSSFFPRQNNLSDGDLQSLARHTVKLENLALNGGTYTPEGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHH
NLLQQSPNLQTLEFYHHPSLSFDDYIAIICLYAPQIKNLKIIDCHISDLSLLELALSEIK
HHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
LTHFECWDSSGKGSLTDYGLYPLMKKKSCLEKLSLTGFPLVTQESLFTLTSHIKTLNFTN
HHHEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
CGAVNHRLLDTIASRLTQLEELELGFLPCSNRSSDTQRMQQAFSNVAQNCQQLKKIKISD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
CFFLNDETIKETLNKWLKLQHLELYRSIPMTKTFLAQLKSLKNLKVFKFENPYHSPGEFS
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCC
IEPHDFKCLETLKLTNCLIDEKELIAFLKAKSSSEASSLKRLCLFNTGYISQQLLEALGD
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
YCPKLKVVELEQDKLMAKHAIINDEGIQKLTKRCRFLKTLHIKSPNPSWNFTDQSLMYLS
HCCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHH
ACSKLEQLTLSHLHSTSNNNDNIRIFHLQCLHLNHLGIPFHQLEEPHLTNLLERYSEQLL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SLDIQAMPNLRKKLKGKFSHLRSLTTDYQNLTIATISFLQLSAPSLQLINIKNQEGFMQH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHC
HPFSAYLNQLNN
CCHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MCSVTSISEYAQEIHLALPYNQPRIQELLETSYPEILAKFYEIFTRFPKKFSELTDLYEE
CCCCCHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NNERVILIKKRQVLSVPEEKLYRALKKLVSISIRTTIPLGEISQPNLFNSLKTIKDSESQ
CCCEEEEEECCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
NEGELKLNVLPVEILEQIFSYEKTWNKLGQIGLVCKIFHSIVTEPLFLRKFFNQYPHQFS
CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHH
TIRTNSLSRRLLDWTNYLPSSFFPRQNNLSDGDLQSLARHTVKLENLALNGGTYTPEGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHH
NLLQQSPNLQTLEFYHHPSLSFDDYIAIICLYAPQIKNLKIIDCHISDLSLLELALSEIK
HHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
LTHFECWDSSGKGSLTDYGLYPLMKKKSCLEKLSLTGFPLVTQESLFTLTSHIKTLNFTN
HHHEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
CGAVNHRLLDTIASRLTQLEELELGFLPCSNRSSDTQRMQQAFSNVAQNCQQLKKIKISD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
CFFLNDETIKETLNKWLKLQHLELYRSIPMTKTFLAQLKSLKNLKVFKFENPYHSPGEFS
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCC
IEPHDFKCLETLKLTNCLIDEKELIAFLKAKSSSEASSLKRLCLFNTGYISQQLLEALGD
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
YCPKLKVVELEQDKLMAKHAIINDEGIQKLTKRCRFLKTLHIKSPNPSWNFTDQSLMYLS
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ACSKLEQLTLSHLHSTSNNNDNIRIFHLQCLHLNHLGIPFHQLEEPHLTNLLERYSEQLL
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SLDIQAMPNLRKKLKGKFSHLRSLTTDYQNLTIATISFLQLSAPSLQLINIKNQEGFMQH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHC
HPFSAYLNQLNN
CCHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA