| Definition | Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012785 |
| Length | 2,302,126 |
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The map label for this gene is 239616917
Identifier: 239616917
GI number: 239616917
Start: 560338
End: 564183
Strand: Reverse
Name: 239616917
Synonym: Kole_0513
Alternate gene names: NA
Gene position: 564183-560338 (Counterclockwise)
Preceding gene: 239616918
Following gene: 239616916
Centisome position: 24.51
GC content: 39.94
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATACCTAATACGCCTATTAAAAAGCAGTTGAAATTGCAAAAGAGATCCAGAAGATAGATTCGAAGAGCGATAAATGG ATTGCTTCCGATGCTATACG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1281; Mature: 1281
Protein sequence:
>1281_residues MKKIVVVMFFLLFCFCAFSASNDALQYRINITSELNKSYLKTIQGIINYNGLFKSGRDVFLEMLYSKDPLLARFQKETQE AVRKMQEARSRGASSEEILRLQLEYQEARLRENKQLTALIESNLYNSIDYLASETLKGSMKTAGKVIDDVLSNWKTILEP LLEGDFGGVVKNAILQLIDSTYKVTFIDYCKRNYGATEKIAQYWWKTYFVEPFETSEEKKLVDKVLTKASDDLKDKLKDR LTKRLELEILSKGGKLTKEAIEKTVKEKAESILKNIIETPSLLVELFTKYYNVVDFQIMFNDIAANEVVFIKKIRELVGD NEDEINKCYFDKAYFLSKIKALNKGKIQVQGKKEPSKKLAKSEEVIPAEVIVKAEETARTHDPLREVSTIQNIEDKIETL SELQVEEKIPSPDNAKQIIEYAFGQLENDEITLSAFTYEVNQVVSSYISQMNEAKAKIASALKMDYNKGLIDWNEYSEKV KSINEDVKQNLEELNTFISSKKQEIERNQKAFRQKLSQLIRSFNPGNEMKLIQDKLSTKIVEFLKLYKQKTGQYVSIYPY SSFSAMMKEFNEGFGQSFINQLTSKAPSLFLLQNGGWILENLLGICYEDEHLTGTLIEKVNSLSEKINALFDSVPEYYYT DRDGRIVYSRDLASIEAFKKSLLGRMKGTLDWKATVSQWAYMAELKNEKTKQYLEVYLAFLTQKVELFQNMLQIVVDGFN SLEPLYMEKWVSKIEQMAYTIRNMWEQKITPDEARNKLRKISQITKDVDSKYAYWLETRDVLEAIASDVYRIKSNGVAML NFEPSKKYSDYINSLIVKNNQLKKRASQMIEEYEKASLFDYTHDLKTRVLDFVSKYRSYLGHGFCAQKAGISFPLGPDDP DIMGIVGGDLEKALNLCERYEQFLEMAEKREKAAKEADRVLDSYLDKIQAEVEAIEKAGGYTTSEKKEELIRLLAEAVEK ATETFKSYGFEYSNWSSSRERNLRSRIENIRVLESNVGQSVGKTTNKFREIEKPEKITLGDLVWLNVMKDGYPSYRFRLS PDGKKLLIERNNNSGNSFSLYNIETGTLDEFPLSEPVKAILSKGYNFDWISEDKIYLYAYSGEGFEIDKSGSYKDRPVTT IKGMGLVLQGISPSGEYILARKLDGGIYVLKISDATIEKIGITYADKILQWVPGTDSVLFKDQNSKLNIYDVKSRTLKTY ETTFEGYVCAILPGGKWIVYGNPFEVVAQNLNDSQKITLWKGEGGANILTGIYPLQGNTVLLVWMHHGESFDYGVQVCKI E
Sequences:
>Translated_1281_residues MKKIVVVMFFLLFCFCAFSASNDALQYRINITSELNKSYLKTIQGIINYNGLFKSGRDVFLEMLYSKDPLLARFQKETQE AVRKMQEARSRGASSEEILRLQLEYQEARLRENKQLTALIESNLYNSIDYLASETLKGSMKTAGKVIDDVLSNWKTILEP LLEGDFGGVVKNAILQLIDSTYKVTFIDYCKRNYGATEKIAQYWWKTYFVEPFETSEEKKLVDKVLTKASDDLKDKLKDR LTKRLELEILSKGGKLTKEAIEKTVKEKAESILKNIIETPSLLVELFTKYYNVVDFQIMFNDIAANEVVFIKKIRELVGD NEDEINKCYFDKAYFLSKIKALNKGKIQVQGKKEPSKKLAKSEEVIPAEVIVKAEETARTHDPLREVSTIQNIEDKIETL SELQVEEKIPSPDNAKQIIEYAFGQLENDEITLSAFTYEVNQVVSSYISQMNEAKAKIASALKMDYNKGLIDWNEYSEKV KSINEDVKQNLEELNTFISSKKQEIERNQKAFRQKLSQLIRSFNPGNEMKLIQDKLSTKIVEFLKLYKQKTGQYVSIYPY SSFSAMMKEFNEGFGQSFINQLTSKAPSLFLLQNGGWILENLLGICYEDEHLTGTLIEKVNSLSEKINALFDSVPEYYYT DRDGRIVYSRDLASIEAFKKSLLGRMKGTLDWKATVSQWAYMAELKNEKTKQYLEVYLAFLTQKVELFQNMLQIVVDGFN SLEPLYMEKWVSKIEQMAYTIRNMWEQKITPDEARNKLRKISQITKDVDSKYAYWLETRDVLEAIASDVYRIKSNGVAML NFEPSKKYSDYINSLIVKNNQLKKRASQMIEEYEKASLFDYTHDLKTRVLDFVSKYRSYLGHGFCAQKAGISFPLGPDDP DIMGIVGGDLEKALNLCERYEQFLEMAEKREKAAKEADRVLDSYLDKIQAEVEAIEKAGGYTTSEKKEELIRLLAEAVEK ATETFKSYGFEYSNWSSSRERNLRSRIENIRVLESNVGQSVGKTTNKFREIEKPEKITLGDLVWLNVMKDGYPSYRFRLS PDGKKLLIERNNNSGNSFSLYNIETGTLDEFPLSEPVKAILSKGYNFDWISEDKIYLYAYSGEGFEIDKSGSYKDRPVTT IKGMGLVLQGISPSGEYILARKLDGGIYVLKISDATIEKIGITYADKILQWVPGTDSVLFKDQNSKLNIYDVKSRTLKTY ETTFEGYVCAILPGGKWIVYGNPFEVVAQNLNDSQKITLWKGEGGANILTGIYPLQGNTVLLVWMHHGESFDYGVQVCKI E >Mature_1281_residues MKKIVVVMFFLLFCFCAFSASNDALQYRINITSELNKSYLKTIQGIINYNGLFKSGRDVFLEMLYSKDPLLARFQKETQE AVRKMQEARSRGASSEEILRLQLEYQEARLRENKQLTALIESNLYNSIDYLASETLKGSMKTAGKVIDDVLSNWKTILEP LLEGDFGGVVKNAILQLIDSTYKVTFIDYCKRNYGATEKIAQYWWKTYFVEPFETSEEKKLVDKVLTKASDDLKDKLKDR LTKRLELEILSKGGKLTKEAIEKTVKEKAESILKNIIETPSLLVELFTKYYNVVDFQIMFNDIAANEVVFIKKIRELVGD NEDEINKCYFDKAYFLSKIKALNKGKIQVQGKKEPSKKLAKSEEVIPAEVIVKAEETARTHDPLREVSTIQNIEDKIETL SELQVEEKIPSPDNAKQIIEYAFGQLENDEITLSAFTYEVNQVVSSYISQMNEAKAKIASALKMDYNKGLIDWNEYSEKV KSINEDVKQNLEELNTFISSKKQEIERNQKAFRQKLSQLIRSFNPGNEMKLIQDKLSTKIVEFLKLYKQKTGQYVSIYPY SSFSAMMKEFNEGFGQSFINQLTSKAPSLFLLQNGGWILENLLGICYEDEHLTGTLIEKVNSLSEKINALFDSVPEYYYT DRDGRIVYSRDLASIEAFKKSLLGRMKGTLDWKATVSQWAYMAELKNEKTKQYLEVYLAFLTQKVELFQNMLQIVVDGFN SLEPLYMEKWVSKIEQMAYTIRNMWEQKITPDEARNKLRKISQITKDVDSKYAYWLETRDVLEAIASDVYRIKSNGVAML NFEPSKKYSDYINSLIVKNNQLKKRASQMIEEYEKASLFDYTHDLKTRVLDFVSKYRSYLGHGFCAQKAGISFPLGPDDP DIMGIVGGDLEKALNLCERYEQFLEMAEKREKAAKEADRVLDSYLDKIQAEVEAIEKAGGYTTSEKKEELIRLLAEAVEK ATETFKSYGFEYSNWSSSRERNLRSRIENIRVLESNVGQSVGKTTNKFREIEKPEKITLGDLVWLNVMKDGYPSYRFRLS PDGKKLLIERNNNSGNSFSLYNIETGTLDEFPLSEPVKAILSKGYNFDWISEDKIYLYAYSGEGFEIDKSGSYKDRPVTT IKGMGLVLQGISPSGEYILARKLDGGIYVLKISDATIEKIGITYADKILQWVPGTDSVLFKDQNSKLNIYDVKSRTLKTY ETTFEGYVCAILPGGKWIVYGNPFEVVAQNLNDSQKITLWKGEGGANILTGIYPLQGNTVLLVWMHHGESFDYGVQVCKI E
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 146944; Mature: 146944
Theoretical pI: Translated: 5.94; Mature: 5.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKIVVVMFFLLFCFCAFSASNDALQYRINITSELNKSYLKTIQGIINYNGLFKSGRDVF CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHHH LEMLYSKDPLLARFQKETQEAVRKMQEARSRGASSEEILRLQLEYQEARLRENKQLTALI HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH ESNLYNSIDYLASETLKGSMKTAGKVIDDVLSNWKTILEPLLEGDFGGVVKNAILQLIDS HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHC TYKVTFIDYCKRNYGATEKIAQYWWKTYFVEPFETSEEKKLVDKVLTKASDDLKDKLKDR CHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LTKRLELEILSKGGKLTKEAIEKTVKEKAESILKNIIETPSLLVELFTKYYNVVDFQIMF HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE NDIAANEVVFIKKIRELVGDNEDEINKCYFDKAYFLSKIKALNKGKIQVQGKKEPSKKLA HHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHH KSEEVIPAEVIVKAEETARTHDPLREVSTIQNIEDKIETLSELQVEEKIPSPDNAKQIIE CCCCCCCHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH YAFGQLENDEITLSAFTYEVNQVVSSYISQMNEAKAKIASALKMDYNKGLIDWNEYSEKV 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA