Definition | Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_012563 |
Length | 4,155,278 |
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The map label for this gene is 226947906
Identifier: 226947906
GI number: 226947906
Start: 821769
End: 824489
Strand: Direct
Name: 226947906
Synonym: CLM_0764
Alternate gene names: NA
Gene position: 821769-824489 (Clockwise)
Preceding gene: 226947905
Following gene: 226947909
Centisome position: 19.78
GC content: 24.29
Gene sequence:
>2721_bases ATGCTAAATGGAAAAATGAGTTTAAGAATTAAGTTGTTAACACTTCCTTTTTCTGAAATTAAGTTTTATGATCATGATTA CATTGATGACTTAGCTAAATGTAAGGATAATAAAAGTTATGAAAAAAAATGCTTTGGCAAATGTTTAAAAAATATATATA GTATTATAAATATTAAAAACAATATTTATAATTTAGATGAAATAAATTTATTAATGAGAAGTTTTTATGATAAAGATGAG ATGGACGAATATTTTAAAAAAAATAATAACATATCTGATTTTTATTTAGCGCATTTAAGTAAACTAAGCAAAATATTTCT TTCGCACAGAAATGGTAAAATTTCATTAAAATATTGGAAAACAAAAGATGAGGAAGATATTTTAGGACCTTATAGTGGTA TATATAAAATAGCTTTATGGAATTTATTAAATAGAAAGTTCACTATAGATTTATTAGTATTATTATATTTATTAGATAAT GGCATGGAAGATGAATATTATTTATCCGGATACCATTCCTTAGTGGTTTTAGATGATTTACAATTAGAGCAAATACTTAA TAAAGGGGTGGCAGAAACACATTTGCATTTAAAAGCAGGAATAAATTTTATTTTAAGTTGGCAAGATTTAATGTGTTTAA AAGAAGAGAAATATAAAAATAAAGAAATTTCTTTTTATGATCAAATTATAGGAAGAAATATAGGCTTAGAAAACTATGTT AAAGCCATTGCAATTTTAAGAATAGTAATGAGTTTATTTTTAAGAGAAAAAACAGATAAAAAATTTTCTTTGTATGTTAT AGAAAATTTTAAAGAGTTAAATGATCTAAATAAGTTAATAGAAAGTTTGTATAATGGAGAAAATTTACTAGAAAAAAAAT TTAGTTATAAGAGTATATATGAAGAATTAAAAATGGAAAAAGATATAAAACAAATTGGTTCACCTCGTACGGGTAGTTGG AGTGAAGATTTAGCTCAAAAAGATATTATATATAGTATATTGAATTTGAATATAAGTGAAGATTATTCTACAGTAGAAAA TATATTTTTATTTAGATGTTTAAAACACATTAAAAAAAGTAGTAATGATTTATATTTTTCAAAATTATTTTGGCAATATA TAAGAGTTAAGAATGAAGTTTTTCAACTTAAAATACAAGGTAATGGAATAAAGGGTTTAGAATATTTTAAGAATTTTTAT CATAGATCTACAACTACAAATTATTCCAATAAAGAAACTATAGGATTAGTTATTCATACACAACTTGAAAATTCAAACTT AAAAAAGTTAGAATTAAGAAGTGGAATTGGTGATGAGAAAAATTGGAAAAATATTGCTGACAATATGCGTAAAGATTTAA TTGTATTTTTTCAAGCTTATAGTGAGATAGGAAAAAATATTAAAGATAGAGATATACCAGCTATAGGATTAATATATCAT TTTATAAAGGAAAAGGATTTAAATAGTATAGAAAAATGCTGGTTAGATTATAAAGAAGAGGGTAAAATTTATTTTAAAAC AATTCAGGATAGATATATAAGACAAGTAAAAGCTTTAAATTATGTAAGAGAGAATGTAAACGGTATTTCCGATTATATTG TTGGTATTGATGCGGCTAGTAGTGAAAATGATACAGAACCTTGGGTATTTGCCCCTGTATATGAAAAAGCAAGAAATAGC GATACGCATAAAATAATTTATAAAAATAATCCACATAAAAGAATTAGAAATTTAGGATTTACTTTTCATGTTGGGGAAGA TTTTAGACATATATTAACGGGATTAAGAAGAATAGATGAAGTCATAGAACATTTTAAATTTCATGCTGGAGATAGAATAG GCCATGCTATTGCATTAGGAATAGAAGTGGACAAATGGGCAATAAAAAATAAAGTTATCATATTACCTAGAATAGAATAT TTGGAAAATTTACTCTGGGTATGGGGAATACATAAAGCTGGAGAAAAAATAGAATATCTAGATGCATCTTATCTTGAGAA AAAAATTTTTGTACAAGCAGAAAAAATTTATAAACACATGGAAGGTATAACAGTATTCAATTTATGGAAAGCTTACCAGA GTAAATTTAAAGTTTTTAGTAAGTCTAATGAGTTTAATGAGGATAGTAGTGAAAAGAATGATGCTATTAATAAACTATTT TGTTGGAGAGTAAAAAATGAATATGCTCAAATGTGGAATACTGAAAAATTAGTTCATGCTCAGCATTGCAAATGTTATCT TAAATTTATGTTAGAACCAATTCAAATTAGTATAACTGATGAAGAGATTAAAATAATAAAATATATTCAAAAAATAATGC TAAAGAAGGTTGGAAGTAAAGGCATTGTAGTTGAAACTAATCCAACCTCTAATACTGCAATAGGACAAATAGAGAATATA TTTCAACACTATATTTTAAATTTAAATCATCATGGACTTAAAGATATAGAACAATGCAATGATTTAATGGTTACTATTAA TACAGATGATCCAAGTGTATTTAATACTAATATTAATAATGAATTTGCATATATATTTTATTCATTGAAAGAAAAGGGAT ATAATACATCTCAGATACTATATTGGATAGATCAAGTAAGAGAAGTTGGTCTAAATTCAAGTTTCATAGAAACGAGAACT TTGAATAATGATAAAAGGCTTGAGGAATTAGATGAGATTATAGAAGGATTAGAAAATTTAGAAATTTTGGATGATGTTTA A
Upstream 100 bases:
>100_bases AGCAGTAAAGTATATAAGAATAAAAAAGATTACAATGGATTCAAAAAATATATAAAAGATAAAATTAATATATAATTAAA AGTTATTAGAGGGAATAAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAATGAGACGAAGTAATAATTTATGTTACTTTGTCTCATTTTTTATATATGTTTCGTATAAGAACAAAAGACATTCTT TGTCTTTTAATTTACAATGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 906; Mature: 906
Protein sequence:
>906_residues MLNGKMSLRIKLLTLPFSEIKFYDHDYIDDLAKCKDNKSYEKKCFGKCLKNIYSIINIKNNIYNLDEINLLMRSFYDKDE MDEYFKKNNNISDFYLAHLSKLSKIFLSHRNGKISLKYWKTKDEEDILGPYSGIYKIALWNLLNRKFTIDLLVLLYLLDN GMEDEYYLSGYHSLVVLDDLQLEQILNKGVAETHLHLKAGINFILSWQDLMCLKEEKYKNKEISFYDQIIGRNIGLENYV KAIAILRIVMSLFLREKTDKKFSLYVIENFKELNDLNKLIESLYNGENLLEKKFSYKSIYEELKMEKDIKQIGSPRTGSW SEDLAQKDIIYSILNLNISEDYSTVENIFLFRCLKHIKKSSNDLYFSKLFWQYIRVKNEVFQLKIQGNGIKGLEYFKNFY HRSTTTNYSNKETIGLVIHTQLENSNLKKLELRSGIGDEKNWKNIADNMRKDLIVFFQAYSEIGKNIKDRDIPAIGLIYH FIKEKDLNSIEKCWLDYKEEGKIYFKTIQDRYIRQVKALNYVRENVNGISDYIVGIDAASSENDTEPWVFAPVYEKARNS DTHKIIYKNNPHKRIRNLGFTFHVGEDFRHILTGLRRIDEVIEHFKFHAGDRIGHAIALGIEVDKWAIKNKVIILPRIEY LENLLWVWGIHKAGEKIEYLDASYLEKKIFVQAEKIYKHMEGITVFNLWKAYQSKFKVFSKSNEFNEDSSEKNDAINKLF CWRVKNEYAQMWNTEKLVHAQHCKCYLKFMLEPIQISITDEEIKIIKYIQKIMLKKVGSKGIVVETNPTSNTAIGQIENI FQHYILNLNHHGLKDIEQCNDLMVTINTDDPSVFNTNINNEFAYIFYSLKEKGYNTSQILYWIDQVREVGLNSSFIETRT LNNDKRLEELDEIIEGLENLEILDDV
Sequences:
>Translated_906_residues MLNGKMSLRIKLLTLPFSEIKFYDHDYIDDLAKCKDNKSYEKKCFGKCLKNIYSIINIKNNIYNLDEINLLMRSFYDKDE MDEYFKKNNNISDFYLAHLSKLSKIFLSHRNGKISLKYWKTKDEEDILGPYSGIYKIALWNLLNRKFTIDLLVLLYLLDN GMEDEYYLSGYHSLVVLDDLQLEQILNKGVAETHLHLKAGINFILSWQDLMCLKEEKYKNKEISFYDQIIGRNIGLENYV KAIAILRIVMSLFLREKTDKKFSLYVIENFKELNDLNKLIESLYNGENLLEKKFSYKSIYEELKMEKDIKQIGSPRTGSW SEDLAQKDIIYSILNLNISEDYSTVENIFLFRCLKHIKKSSNDLYFSKLFWQYIRVKNEVFQLKIQGNGIKGLEYFKNFY HRSTTTNYSNKETIGLVIHTQLENSNLKKLELRSGIGDEKNWKNIADNMRKDLIVFFQAYSEIGKNIKDRDIPAIGLIYH FIKEKDLNSIEKCWLDYKEEGKIYFKTIQDRYIRQVKALNYVRENVNGISDYIVGIDAASSENDTEPWVFAPVYEKARNS DTHKIIYKNNPHKRIRNLGFTFHVGEDFRHILTGLRRIDEVIEHFKFHAGDRIGHAIALGIEVDKWAIKNKVIILPRIEY LENLLWVWGIHKAGEKIEYLDASYLEKKIFVQAEKIYKHMEGITVFNLWKAYQSKFKVFSKSNEFNEDSSEKNDAINKLF CWRVKNEYAQMWNTEKLVHAQHCKCYLKFMLEPIQISITDEEIKIIKYIQKIMLKKVGSKGIVVETNPTSNTAIGQIENI FQHYILNLNHHGLKDIEQCNDLMVTINTDDPSVFNTNINNEFAYIFYSLKEKGYNTSQILYWIDQVREVGLNSSFIETRT LNNDKRLEELDEIIEGLENLEILDDV >Mature_906_residues MLNGKMSLRIKLLTLPFSEIKFYDHDYIDDLAKCKDNKSYEKKCFGKCLKNIYSIINIKNNIYNLDEINLLMRSFYDKDE MDEYFKKNNNISDFYLAHLSKLSKIFLSHRNGKISLKYWKTKDEEDILGPYSGIYKIALWNLLNRKFTIDLLVLLYLLDN GMEDEYYLSGYHSLVVLDDLQLEQILNKGVAETHLHLKAGINFILSWQDLMCLKEEKYKNKEISFYDQIIGRNIGLENYV KAIAILRIVMSLFLREKTDKKFSLYVIENFKELNDLNKLIESLYNGENLLEKKFSYKSIYEELKMEKDIKQIGSPRTGSW SEDLAQKDIIYSILNLNISEDYSTVENIFLFRCLKHIKKSSNDLYFSKLFWQYIRVKNEVFQLKIQGNGIKGLEYFKNFY HRSTTTNYSNKETIGLVIHTQLENSNLKKLELRSGIGDEKNWKNIADNMRKDLIVFFQAYSEIGKNIKDRDIPAIGLIYH FIKEKDLNSIEKCWLDYKEEGKIYFKTIQDRYIRQVKALNYVRENVNGISDYIVGIDAASSENDTEPWVFAPVYEKARNS DTHKIIYKNNPHKRIRNLGFTFHVGEDFRHILTGLRRIDEVIEHFKFHAGDRIGHAIALGIEVDKWAIKNKVIILPRIEY LENLLWVWGIHKAGEKIEYLDASYLEKKIFVQAEKIYKHMEGITVFNLWKAYQSKFKVFSKSNEFNEDSSEKNDAINKLF CWRVKNEYAQMWNTEKLVHAQHCKCYLKFMLEPIQISITDEEIKIIKYIQKIMLKKVGSKGIVVETNPTSNTAIGQIENI FQHYILNLNHHGLKDIEQCNDLMVTINTDDPSVFNTNINNEFAYIFYSLKEKGYNTSQILYWIDQVREVGLNSSFIETRT LNNDKRLEELDEIIEGLENLEILDDV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 106880; Mature: 106880
Theoretical pI: Translated: 7.37; Mature: 7.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNGKMSLRIKLLTLPFSEIKFYDHDYIDDLAKCKDNKSYEKKCFGKCLKNIYSIINIKN CCCCCEEEEEEEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NIYNLDEINLLMRSFYDKDEMDEYFKKNNNISDFYLAHLSKLSKIFLSHRNGKISLKYWK CCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEC TKDEEDILGPYSGIYKIALWNLLNRKFTIDLLVLLYLLDNGMEDEYYLSGYHSLVVLDDL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEEEECHH QLEQILNKGVAETHLHLKAGINFILSWQDLMCLKEEKYKNKEISFYDQIIGRNIGLENYV HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHH KAIAILRIVMSLFLREKTDKKFSLYVIENFKELNDLNKLIESLYNGENLLEKKFSYKSIY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH EELKMEKDIKQIGSPRTGSWSEDLAQKDIIYSILNLNISEDYSTVENIFLFRCLKHIKKS HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SNDLYFSKLFWQYIRVKNEVFQLKIQGNGIKGLEYFKNFYHRSTTTNYSNKETIGLVIHT CCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEE QLENSNLKKLELRSGIGDEKNWKNIADNMRKDLIVFFQAYSEIGKNIKDRDIPAIGLIYH EECCCCCCEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH FIKEKDLNSIEKCWLDYKEEGKIYFKTIQDRYIRQVKALNYVRENVNGISDYIVGIDAAS HHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEECCC SENDTEPWVFAPVYEKARNSDTHKIIYKNNPHKRIRNLGFTFHVGEDFRHILTGLRRIDE CCCCCCCEEEEHHHHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHH VIEHFKFHAGDRIGHAIALGIEVDKWAIKNKVIILPRIEYLENLLWVWGIHKAGEKIEYL HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEHHEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH DASYLEKKIFVQAEKIYKHMEGITVFNLWKAYQSKFKVFSKSNEFNEDSSEKNDAINKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH CWRVKNEYAQMWNTEKLVHAQHCKCYLKFMLEPIQISITDEEIKIIKYIQKIMLKKVGSK HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GIVVETNPTSNTAIGQIENIFQHYILNLNHHGLKDIEQCNDLMVTINTDDPSVFNTNINN CEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEECCCCC EFAYIFYSLKEKGYNTSQILYWIDQVREVGLNSSFIETRTLNNDKRLEELDEIIEGLENL CEEEEEEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC EILDDV HHHCCC >Mature Secondary Structure MLNGKMSLRIKLLTLPFSEIKFYDHDYIDDLAKCKDNKSYEKKCFGKCLKNIYSIINIKN CCCCCEEEEEEEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NIYNLDEINLLMRSFYDKDEMDEYFKKNNNISDFYLAHLSKLSKIFLSHRNGKISLKYWK CCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEC TKDEEDILGPYSGIYKIALWNLLNRKFTIDLLVLLYLLDNGMEDEYYLSGYHSLVVLDDL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEEEECHH QLEQILNKGVAETHLHLKAGINFILSWQDLMCLKEEKYKNKEISFYDQIIGRNIGLENYV HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHH KAIAILRIVMSLFLREKTDKKFSLYVIENFKELNDLNKLIESLYNGENLLEKKFSYKSIY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH EELKMEKDIKQIGSPRTGSWSEDLAQKDIIYSILNLNISEDYSTVENIFLFRCLKHIKKS HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SNDLYFSKLFWQYIRVKNEVFQLKIQGNGIKGLEYFKNFYHRSTTTNYSNKETIGLVIHT CCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEE QLENSNLKKLELRSGIGDEKNWKNIADNMRKDLIVFFQAYSEIGKNIKDRDIPAIGLIYH EECCCCCCEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH FIKEKDLNSIEKCWLDYKEEGKIYFKTIQDRYIRQVKALNYVRENVNGISDYIVGIDAAS HHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEECCC SENDTEPWVFAPVYEKARNSDTHKIIYKNNPHKRIRNLGFTFHVGEDFRHILTGLRRIDE CCCCCCCEEEEHHHHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHH VIEHFKFHAGDRIGHAIALGIEVDKWAIKNKVIILPRIEYLENLLWVWGIHKAGEKIEYL HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEHHEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH DASYLEKKIFVQAEKIYKHMEGITVFNLWKAYQSKFKVFSKSNEFNEDSSEKNDAINKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH CWRVKNEYAQMWNTEKLVHAQHCKCYLKFMLEPIQISITDEEIKIIKYIQKIMLKKVGSK HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GIVVETNPTSNTAIGQIENIFQHYILNLNHHGLKDIEQCNDLMVTINTDDPSVFNTNINN CEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEECCCCC EFAYIFYSLKEKGYNTSQILYWIDQVREVGLNSSFIETRTLNNDKRLEELDEIIEGLENL CEEEEEEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC EILDDV HHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA