Definition | Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_012563 |
Length | 4,155,278 |
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The map label for this gene is 226947905
Identifier: 226947905
GI number: 226947905
Start: 818195
End: 821743
Strand: Direct
Name: 226947905
Synonym: CLM_0763
Alternate gene names: NA
Gene position: 818195-821743 (Clockwise)
Preceding gene: 226947904
Following gene: 226947906
Centisome position: 19.69
GC content: 20.71
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAATAAAAGATAAATAAAATTTGTTTTAAGATTTCAAAATTTGTAAATATATAGTAAGATAATATAGAAGATAAAGTT TTTATAAGGGGATGAGGGAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAAAGTTATTAGAGGGAATAAACATGCTAAATGGAAAAATGAGTTTAAGAATTAAGTTGTTAACACTTCCTTTTTCTG AAATTAAGTTTTATGATCAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1182; Mature: 1181
Protein sequence:
>1182_residues MTVEKESLKIGARVLDKSDLEALLPTYGNIFEQIDKFRDKAKELNDKKSDEKKEYNNIFSILGGRGTGKTSVLLTVKKQI ENDDVYGYDIVLPLIVPDDMGENSDTLGWIITYISKQVEEVNNGYIEHLRERENRKKKEDLFEKYCIKKEEVPLKKYLKK LQESYYFRKPAYYEILIKEYIGKREYIGDTKEALEADQNLIKNFLLCIEELIKVKRELNGQREPLIYFFFDDVDISAKRG FEVLISIMRYLNHPNVVIFISGDYNVFLETVTLQFLKNEDLLKKDLMGKSFILNSEDVNKIKLDNFDSTALELRKNRSYD FLKKIMPPAFRYEMPLLSNKQKCEFKYTKGNNSESETLLKLIEDNFFKSDKSDEFIKYNENILYDYFEIFDDTPRGLINT YYYLWEMVGNEWEVQHIKQFLDIIVNSSVELEKYKSIIYEIINIKEKIKIENKNDSYSKIEYYIDYNYLENIFKSNENMD EEDLYINNYKMCFKLFVLAHFFENILVLQNKILSEKNPKQTHGTELLVKILNSVNGNSKLYPNLSDVKKLLYLHHLLSSE ISPINMKRIFSSDLEKDRYLVYLYIKQLKQMHLKDEDEALASVLNNIYFKDKEWVKNIINKISKYSQSSVSIYNNIKNER IYKLREKNFNECHLIEEYLKNFETLINDIEKQNNIKKELEEELEKELEKELEKIDFNNNISNDFRVVLDEIKNQCLNNKK IYDLTVERKDLIIKQEKIKRNIEQDNVKLQLVEQQFPEKDIKDLVYIRNRINERQLELENFTDNEVVKNTWNQFENNIKY VSSKDIYIDEEKYEDKEKVYFNPKEVIENYFNIKIDVPKSVLIIKNEYGFLSNTKEIIKEYFKKLEELNLLRKYNIPDIK SIQLEQEILSNDLSEIKERIELLDKKLKDINEGESNKYKMVYQQSFFKEINLANVEEINSLNIEEINSANSKKINSISKV DIVKDILDILDNSDKSEENVLVELNDLLEYNLEKFKRSSLKNNIVLSKKAIRVLINLKELKISPIVDRYILEILNDEDSI DLNEYNEILDRIYIQAKHNFRDDKFLKNRNYEFYPKKIYNDKEDVLRDIRILKNEINLIQNNNYEGFIGEEEIDRIILKT KIEIITIYYLKIETFLKIKKYKENTSTQNIKKELNNLISSKVYKNKKDYNGFKKYIKDKINI
Sequences:
>Translated_1182_residues MTVEKESLKIGARVLDKSDLEALLPTYGNIFEQIDKFRDKAKELNDKKSDEKKEYNNIFSILGGRGTGKTSVLLTVKKQI ENDDVYGYDIVLPLIVPDDMGENSDTLGWIITYISKQVEEVNNGYIEHLRERENRKKKEDLFEKYCIKKEEVPLKKYLKK LQESYYFRKPAYYEILIKEYIGKREYIGDTKEALEADQNLIKNFLLCIEELIKVKRELNGQREPLIYFFFDDVDISAKRG FEVLISIMRYLNHPNVVIFISGDYNVFLETVTLQFLKNEDLLKKDLMGKSFILNSEDVNKIKLDNFDSTALELRKNRSYD FLKKIMPPAFRYEMPLLSNKQKCEFKYTKGNNSESETLLKLIEDNFFKSDKSDEFIKYNENILYDYFEIFDDTPRGLINT YYYLWEMVGNEWEVQHIKQFLDIIVNSSVELEKYKSIIYEIINIKEKIKIENKNDSYSKIEYYIDYNYLENIFKSNENMD EEDLYINNYKMCFKLFVLAHFFENILVLQNKILSEKNPKQTHGTELLVKILNSVNGNSKLYPNLSDVKKLLYLHHLLSSE ISPINMKRIFSSDLEKDRYLVYLYIKQLKQMHLKDEDEALASVLNNIYFKDKEWVKNIINKISKYSQSSVSIYNNIKNER IYKLREKNFNECHLIEEYLKNFETLINDIEKQNNIKKELEEELEKELEKELEKIDFNNNISNDFRVVLDEIKNQCLNNKK IYDLTVERKDLIIKQEKIKRNIEQDNVKLQLVEQQFPEKDIKDLVYIRNRINERQLELENFTDNEVVKNTWNQFENNIKY VSSKDIYIDEEKYEDKEKVYFNPKEVIENYFNIKIDVPKSVLIIKNEYGFLSNTKEIIKEYFKKLEELNLLRKYNIPDIK SIQLEQEILSNDLSEIKERIELLDKKLKDINEGESNKYKMVYQQSFFKEINLANVEEINSLNIEEINSANSKKINSISKV DIVKDILDILDNSDKSEENVLVELNDLLEYNLEKFKRSSLKNNIVLSKKAIRVLINLKELKISPIVDRYILEILNDEDSI DLNEYNEILDRIYIQAKHNFRDDKFLKNRNYEFYPKKIYNDKEDVLRDIRILKNEINLIQNNNYEGFIGEEEIDRIILKT KIEIITIYYLKIETFLKIKKYKENTSTQNIKKELNNLISSKVYKNKKDYNGFKKYIKDKINI >Mature_1181_residues TVEKESLKIGARVLDKSDLEALLPTYGNIFEQIDKFRDKAKELNDKKSDEKKEYNNIFSILGGRGTGKTSVLLTVKKQIE NDDVYGYDIVLPLIVPDDMGENSDTLGWIITYISKQVEEVNNGYIEHLRERENRKKKEDLFEKYCIKKEEVPLKKYLKKL QESYYFRKPAYYEILIKEYIGKREYIGDTKEALEADQNLIKNFLLCIEELIKVKRELNGQREPLIYFFFDDVDISAKRGF EVLISIMRYLNHPNVVIFISGDYNVFLETVTLQFLKNEDLLKKDLMGKSFILNSEDVNKIKLDNFDSTALELRKNRSYDF LKKIMPPAFRYEMPLLSNKQKCEFKYTKGNNSESETLLKLIEDNFFKSDKSDEFIKYNENILYDYFEIFDDTPRGLINTY YYLWEMVGNEWEVQHIKQFLDIIVNSSVELEKYKSIIYEIINIKEKIKIENKNDSYSKIEYYIDYNYLENIFKSNENMDE EDLYINNYKMCFKLFVLAHFFENILVLQNKILSEKNPKQTHGTELLVKILNSVNGNSKLYPNLSDVKKLLYLHHLLSSEI SPINMKRIFSSDLEKDRYLVYLYIKQLKQMHLKDEDEALASVLNNIYFKDKEWVKNIINKISKYSQSSVSIYNNIKNERI YKLREKNFNECHLIEEYLKNFETLINDIEKQNNIKKELEEELEKELEKELEKIDFNNNISNDFRVVLDEIKNQCLNNKKI YDLTVERKDLIIKQEKIKRNIEQDNVKLQLVEQQFPEKDIKDLVYIRNRINERQLELENFTDNEVVKNTWNQFENNIKYV SSKDIYIDEEKYEDKEKVYFNPKEVIENYFNIKIDVPKSVLIIKNEYGFLSNTKEIIKEYFKKLEELNLLRKYNIPDIKS IQLEQEILSNDLSEIKERIELLDKKLKDINEGESNKYKMVYQQSFFKEINLANVEEINSLNIEEINSANSKKINSISKVD IVKDILDILDNSDKSEENVLVELNDLLEYNLEKFKRSSLKNNIVLSKKAIRVLINLKELKISPIVDRYILEILNDEDSID LNEYNEILDRIYIQAKHNFRDDKFLKNRNYEFYPKKIYNDKEDVLRDIRILKNEINLIQNNNYEGFIGEEEIDRIILKTK IEIITIYYLKIETFLKIKKYKENTSTQNIKKELNNLISSKVYKNKKDYNGFKKYIKDKINI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 141336; Mature: 141204
Theoretical pI: Translated: 5.36; Mature: 5.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTVEKESLKIGARVLDKSDLEALLPTYGNIFEQIDKFRDKAKELNDKKSDEKKEYNNIFS CCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH ILGGRGTGKTSVLLTVKKQIENDDVYGYDIVLPLIVPDDMGENSDTLGWIITYISKQVEE HHCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VNNGYIEHLRERENRKKKEDLFEKYCIKKEEVPLKKYLKKLQESYYFRKPAYYEILIKEY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH IGKREYIGDTKEALEADQNLIKNFLLCIEELIKVKRELNGQREPLIYFFFDDVDISAKRG CCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHCC FEVLISIMRYLNHPNVVIFISGDYNVFLETVTLQFLKNEDLLKKDLMGKSFILNSEDVNK HHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEECCCCCCE IKLDNFDSTALELRKNRSYDFLKKIMPPAFRYEMPLLSNKQKCEFKYTKGNNSESETLLK EECCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHH LIEDNFFKSDKSDEFIKYNENILYDYFEIFDDTPRGLINTYYYLWEMVGNEWEVQHIKQF HHHHHHCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH LDIIVNSSVELEKYKSIIYEIINIKEKIKIENKNDSYSKIEYYIDYNYLENIFKSNENMD HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCC EEDLYINNYKMCFKLFVLAHFFENILVLQNKILSEKNPKQTHGTELLVKILNSVNGNSKL CCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE YPNLSDVKKLLYLHHLLSSEISPINMKRIFSSDLEKDRYLVYLYIKQLKQMHLKDEDEAL CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHH ASVLNNIYFKDKEWVKNIINKISKYSQSSVSIYNNIKNERIYKLREKNFNECHLIEEYLK HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NFETLINDIEKQNNIKKELEEELEKELEKELEKIDFNNNISNDFRVVLDEIKNQCLNNKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCE IYDLTVERKDLIIKQEKIKRNIEQDNVKLQLVEQQFPEKDIKDLVYIRNRINERQLELEN EEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCC FTDNEVVKNTWNQFENNIKYVSSKDIYIDEEKYEDKEKVYFNPKEVIENYFNIKIDVPKS CCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEECHHHCCCCHHEEECHHHHHHHHHEEEEECCCE VLIIKNEYGFLSNTKEIIKEYFKKLEELNLLRKYNIPDIKSIQLEQEILSNDLSEIKERI EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELLDKKLKDINEGESNKYKMVYQQSFFKEINLANVEEINSLNIEEINSANSKKINSISKV HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHH DIVKDILDILDNSDKSEENVLVELNDLLEYNLEKFKRSSLKNNIVLSKKAIRVLINLKEL HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHH KISPIVDRYILEILNDEDSIDLNEYNEILDRIYIQAKHNFRDDKFLKNRNYEFYPKKIYN CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHCC DKEDVLRDIRILKNEINLIQNNNYEGFIGEEEIDRIILKTKIEIITIYYLKIETFLKIKK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHHHHHHHHH YKENTSTQNIKKELNNLISSKVYKNKKDYNGFKKYIKDKINI HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure TVEKESLKIGARVLDKSDLEALLPTYGNIFEQIDKFRDKAKELNDKKSDEKKEYNNIFS CCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH ILGGRGTGKTSVLLTVKKQIENDDVYGYDIVLPLIVPDDMGENSDTLGWIITYISKQVEE HHCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VNNGYIEHLRERENRKKKEDLFEKYCIKKEEVPLKKYLKKLQESYYFRKPAYYEILIKEY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH IGKREYIGDTKEALEADQNLIKNFLLCIEELIKVKRELNGQREPLIYFFFDDVDISAKRG CCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHCC FEVLISIMRYLNHPNVVIFISGDYNVFLETVTLQFLKNEDLLKKDLMGKSFILNSEDVNK HHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEECCCCCCE IKLDNFDSTALELRKNRSYDFLKKIMPPAFRYEMPLLSNKQKCEFKYTKGNNSESETLLK EECCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHH LIEDNFFKSDKSDEFIKYNENILYDYFEIFDDTPRGLINTYYYLWEMVGNEWEVQHIKQF HHHHHHCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH LDIIVNSSVELEKYKSIIYEIINIKEKIKIENKNDSYSKIEYYIDYNYLENIFKSNENMD HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCC EEDLYINNYKMCFKLFVLAHFFENILVLQNKILSEKNPKQTHGTELLVKILNSVNGNSKL CCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE YPNLSDVKKLLYLHHLLSSEISPINMKRIFSSDLEKDRYLVYLYIKQLKQMHLKDEDEAL CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHH ASVLNNIYFKDKEWVKNIINKISKYSQSSVSIYNNIKNERIYKLREKNFNECHLIEEYLK HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH NFETLINDIEKQNNIKKELEEELEKELEKELEKIDFNNNISNDFRVVLDEIKNQCLNNKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCE IYDLTVERKDLIIKQEKIKRNIEQDNVKLQLVEQQFPEKDIKDLVYIRNRINERQLELEN EEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCC FTDNEVVKNTWNQFENNIKYVSSKDIYIDEEKYEDKEKVYFNPKEVIENYFNIKIDVPKS CCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEECHHHCCCCHHEEECHHHHHHHHHEEEEECCCE VLIIKNEYGFLSNTKEIIKEYFKKLEELNLLRKYNIPDIKSIQLEQEILSNDLSEIKERI EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELLDKKLKDINEGESNKYKMVYQQSFFKEINLANVEEINSLNIEEINSANSKKINSISKV HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHH DIVKDILDILDNSDKSEENVLVELNDLLEYNLEKFKRSSLKNNIVLSKKAIRVLINLKEL HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHH KISPIVDRYILEILNDEDSIDLNEYNEILDRIYIQAKHNFRDDKFLKNRNYEFYPKKIYN CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHCC DKEDVLRDIRILKNEINLIQNNNYEGFIGEEEIDRIILKTKIEIITIYYLKIETFLKIKK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHHHHHHHHH YKENTSTQNIKKELNNLISSKVYKNKKDYNGFKKYIKDKINI HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA