Definition Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome.
Accession NC_012032
Length 5,268,950

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The map label for this gene is 222527337

Identifier: 222527337

GI number: 222527337

Start: 5105964

End: 5108984

Strand: Reverse

Name: 222527337

Synonym: Chy400_4123

Alternate gene names: NA

Gene position: 5108984-5105964 (Counterclockwise)

Preceding gene: 222527343

Following gene: 222527335

Centisome position: 96.96

GC content: 53.82

Gene sequence:

>3021_bases
ATGCAGGTCAGGCTTGATGACCAGGAAGTGACGGCTTTTCGTTCGGTGAAAAATCGAGCCTTACTGGCCTACCTGTCTGT
AGAAGCTCATCACCCTCATGACCGCTCCGTCCTGGCCGGCATGTTCTGGCCGGATCATCCCGAAACGGCAGCCCGCCTTA
ATCTGCGTCAAGCGCTCTTCGCCTTGCGTAAACTGCTGAATGTTGATGGCACTGAGTATATTCAGGTCGACTCAGGCACT
GTTCGCTTCAACGCACGTGCTGATGTCTGGATCGATGTCGTCGCATTGACCGACCTGCTCGCAGTTTGCGAGCGCCACCC
GCACGCTGATCGCGCCGATTGTCCAATTTGTGTGATGCATCTGGCCGAGGCCGTGGCATGCTACCGTGGCGATTTTCTCA
GTGAAATGTTCGTCGGTGACAGCTTTGCTGTTGAAGAGTGGATTCTGCTCAAACGGGAGTGGTTGCGCCATCAGGTTCTG
GACGCACTGGACGATCTGACCACATTTTATCTGCGCCAGGCAGCGTATGACCAGGCATATCGCTACGCATGGCGTCAGAT
AGAACTGGATCCGTTGAATGAAAATGCGCATCGCCAGGTAATGTTAGCCCAGGCGCTGGCAGGTCATCGCAGTGCCGCCT
TGAGCCAATATGAGCATTGTCGTCAGGTTCTGGCTCAGGACTTAGGTGTCGAACCGGCGATTGAAACGGTGCTTCTGGCC
GAGTCAATTCGCACCGGTGACCTCAAACCGTCTGGTGTGACAGGGGAAGCAAGGGAAAACACTGATTTCAGCTCCCCAAA
CAGGCATAATCTGCCGGTGGTACAAACCCCATTGATCGGTCGTCAACTTGAACTAGATCATCTCCGGCAGTGGTTGCTGG
CGCCTGACGAGCGACTGATTGTACTCGTTGGCGAGGGTGGGGTTGGGAAGTCGCGGCTGGCCCTTGCTGCGGCACGAATG
GTCGTGCAACATTTTCGTGATGGGGTCTGGTTTGTTCCTCTGGTTGGGATTGGAACAGATGCAAGGGTGGTTGAAACCGA
TACGCTACGCGAATTGCTGGCCACAACTATTGCAGGGAGCATCGGTCTCACATTGCACGGGAAGACTGACCCATGCACGC
AATTGTTAAACTACCTGTCAGGGCGCGAAATATTGATCTGGCTCGATAACTTTGAGCACTTGTTACCGGCAACCGAGCTG
TTATGGGCAATCGTCCAGTCGGCACCACGAGTGACTATACTGGTGACTTCGCGTGAGCGGCTGCATTTTCAGTCTGAACG
TATCCTCCAGCTAACAGGTTTACCGGTTCCGGCAGCGGATGCATTAGATAGCGATACATTCGATAGTGTAAAACTGTTTG
TAGCGCGTGCGTGCCGGGTTTGGCCGGCATTTACGCTCAATGAAGCAAACCTTGCTGCGATTGTTCAGATTTGTCGTCTG
CTTGAAGGATTACCGTTGGGGATTGAACTGGCAGCTTCGTGGGTAGAGCAATTCACACCGATGGAGATTGCTGCTGCTAT
TGCCACAAACGTCGATATGCTTGCCACTACTTTCCAGGATTTTCCCGAACGTCATCGCAGTGTGCGCGCAACGTTTATCT
ATTCCTGGCGTCTACTTTCACCCGGTGAGCAGACGACATTAGCGCAGCTTGCTGTCTTTCAGGGCACGTGGAGTCGCGAG
GCGGCGTTAAGGGTGACGCAGGCTTCGCTGGCGGATCTGGTTGCTCTGGTTCACAAATCGCTGGTGCAGGTCGTAGCCCC
AGGACGCTATACACTGCACACGCTGGTGCGCCATCTGGCTGCTGAACAGGTAGCAGCGATGCCCACTATCGAGCGAGTAG
CCCGTGATCGCCATTGCTCGTACTACAGCGAGCTATTGGCAGCTCACGAAACACATTTGCGCGGTGATCATCAGTCTACT
GCGCTAACAACCCTGGATGCCGAACGTCCAAACATCCAGGTTGCCTGGGAGTGGGCAATTCAGACTGCCAGACGGGATGA
TTTGGCCCAGGCGGCACGCAGCCTTCATCTCTTCTACAAGTATCGCAATTACTTTCAAGAAGGTAAAGAACTCTTTGCCA
GAGCACTCGATAGCTCACACCAGTGGCCTGATACATCAGCCTGGCAAAACCTACGGGGACGGTTACTGGTCTGTATGGGA
GATTTTGCGTTACATTTGGGGCAATATGCAGAAGCAGATCGTCTGCTTGAACAGAGCCTGACATTGTTGCACGATGTTCC
AGATGGAACAAGAGAGACGGCGTTAGACATTGCTCACGCAATGGCGTACCTGGGTCTGGTGAAAGAACGGCAGGGTGATT
ATACAGCGGCCAAAATAATGTATCAGGCAAGCCTTGATCGTTACCGGTTGCTCAATGATCGATCTGGCATGACAACGGCA
CTCCGTTCTATTGCCAGTGTCGCCGAAGGTCTGGCTCAATATGCAGAGGCAGAAGGTCTGCTTCACGAGAGTCTGGCACT
CTCGCAGGAGATTGGCAATCGGCGTGAGTCGGCACTCACACTCAACTTACTTGGCATCGTGACCGAAATGCAGCAACGGT
ATACCGAAGCATGTCACTATTACCGGCAAAGTCTGCAACTCTTCTCCGAGATTGGTGAACGCTGGGGGATGCATTTGCCC
TTGGGGAATCTCGGTGATGTTGCATTCACCCTCGGCAACTATCAGGATGCTAAAAGCTACTATTGCGCTGCATTAAAGCT
GTTGCTGACAAGCTGGGCAGTTCCGTACATGCTTATTCAGATTTATCGTGTTGCTGCGGTACTGGCCGCGGAAGATCGGG
CTGAACAGGCTGTCGAACTTTTGCAATTACCGCTACACCACCCGGCTCTCGATCAGGCGTTTCGCGAGCGGGCTGAAGCC
CTTAATGCCAGCCTGACGGCAATGCTACCCCCAGATCGTCTGGCTGCGGCTAAGGTGCGTGGTCGCGGTCGAACACTCGT
GCAGGTGGTGAACGCAATTGCCGACCTCATGCCATCCTTCGCTCACCAGGAGACCTATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAGAGGTACCGTTAACGGATCGTTAGCGCTCTTTCAAACGGACGTGTGGCCTGATATAATGTCGCTATGAAACGCCTCT
CCATCTCTCTACTTGGCTCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGCTCCATATTTGTGGTATGCCTGAGCGAGGCGCTGCCGTTCATACTGCTACGCAGTGTTGCAAGGGTTCTCCAATTGG
TCAGCGTATCGTCACACCGC

Product: transcriptional activator domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1006; Mature: 1006

Protein sequence:

>1006_residues
MQVRLDDQEVTAFRSVKNRALLAYLSVEAHHPHDRSVLAGMFWPDHPETAARLNLRQALFALRKLLNVDGTEYIQVDSGT
VRFNARADVWIDVVALTDLLAVCERHPHADRADCPICVMHLAEAVACYRGDFLSEMFVGDSFAVEEWILLKREWLRHQVL
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ESIRTGDLKPSGVTGEARENTDFSSPNRHNLPVVQTPLIGRQLELDHLRQWLLAPDERLIVLVGEGGVGKSRLALAAARM
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DFALHLGQYAEADRLLEQSLTLLHDVPDGTRETALDIAHAMAYLGLVKERQGDYTAAKIMYQASLDRYRLLNDRSGMTTA
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LNASLTAMLPPDRLAAAKVRGRGRTLVQVVNAIADLMPSFAHQETY

Sequences:

>Translated_1006_residues
MQVRLDDQEVTAFRSVKNRALLAYLSVEAHHPHDRSVLAGMFWPDHPETAARLNLRQALFALRKLLNVDGTEYIQVDSGT
VRFNARADVWIDVVALTDLLAVCERHPHADRADCPICVMHLAEAVACYRGDFLSEMFVGDSFAVEEWILLKREWLRHQVL
DALDDLTTFYLRQAAYDQAYRYAWRQIELDPLNENAHRQVMLAQALAGHRSAALSQYEHCRQVLAQDLGVEPAIETVLLA
ESIRTGDLKPSGVTGEARENTDFSSPNRHNLPVVQTPLIGRQLELDHLRQWLLAPDERLIVLVGEGGVGKSRLALAAARM
VVQHFRDGVWFVPLVGIGTDARVVETDTLRELLATTIAGSIGLTLHGKTDPCTQLLNYLSGREILIWLDNFEHLLPATEL
LWAIVQSAPRVTILVTSRERLHFQSERILQLTGLPVPAADALDSDTFDSVKLFVARACRVWPAFTLNEANLAAIVQICRL
LEGLPLGIELAASWVEQFTPMEIAAAIATNVDMLATTFQDFPERHRSVRATFIYSWRLLSPGEQTTLAQLAVFQGTWSRE
AALRVTQASLADLVALVHKSLVQVVAPGRYTLHTLVRHLAAEQVAAMPTIERVARDRHCSYYSELLAAHETHLRGDHQST
ALTTLDAERPNIQVAWEWAIQTARRDDLAQAARSLHLFYKYRNYFQEGKELFARALDSSHQWPDTSAWQNLRGRLLVCMG
DFALHLGQYAEADRLLEQSLTLLHDVPDGTRETALDIAHAMAYLGLVKERQGDYTAAKIMYQASLDRYRLLNDRSGMTTA
LRSIASVAEGLAQYAEAEGLLHESLALSQEIGNRRESALTLNLLGIVTEMQQRYTEACHYYRQSLQLFSEIGERWGMHLP
LGNLGDVAFTLGNYQDAKSYYCAALKLLLTSWAVPYMLIQIYRVAAVLAAEDRAEQAVELLQLPLHHPALDQAFRERAEA
LNASLTAMLPPDRLAAAKVRGRGRTLVQVVNAIADLMPSFAHQETY
>Mature_1006_residues
MQVRLDDQEVTAFRSVKNRALLAYLSVEAHHPHDRSVLAGMFWPDHPETAARLNLRQALFALRKLLNVDGTEYIQVDSGT
VRFNARADVWIDVVALTDLLAVCERHPHADRADCPICVMHLAEAVACYRGDFLSEMFVGDSFAVEEWILLKREWLRHQVL
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ESIRTGDLKPSGVTGEARENTDFSSPNRHNLPVVQTPLIGRQLELDHLRQWLLAPDERLIVLVGEGGVGKSRLALAAARM
VVQHFRDGVWFVPLVGIGTDARVVETDTLRELLATTIAGSIGLTLHGKTDPCTQLLNYLSGREILIWLDNFEHLLPATEL
LWAIVQSAPRVTILVTSRERLHFQSERILQLTGLPVPAADALDSDTFDSVKLFVARACRVWPAFTLNEANLAAIVQICRL
LEGLPLGIELAASWVEQFTPMEIAAAIATNVDMLATTFQDFPERHRSVRATFIYSWRLLSPGEQTTLAQLAVFQGTWSRE
AALRVTQASLADLVALVHKSLVQVVAPGRYTLHTLVRHLAAEQVAAMPTIERVARDRHCSYYSELLAAHETHLRGDHQST
ALTTLDAERPNIQVAWEWAIQTARRDDLAQAARSLHLFYKYRNYFQEGKELFARALDSSHQWPDTSAWQNLRGRLLVCMG
DFALHLGQYAEADRLLEQSLTLLHDVPDGTRETALDIAHAMAYLGLVKERQGDYTAAKIMYQASLDRYRLLNDRSGMTTA
LRSIASVAEGLAQYAEAEGLLHESLALSQEIGNRRESALTLNLLGIVTEMQQRYTEACHYYRQSLQLFSEIGERWGMHLP
LGNLGDVAFTLGNYQDAKSYYCAALKLLLTSWAVPYMLIQIYRVAAVLAAEDRAEQAVELLQLPLHHPALDQAFRERAEA
LNASLTAMLPPDRLAAAKVRGRGRTLVQVVNAIADLMPSFAHQETY

Specific function: Unknown

COG id: COG3903

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR016032
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR000792
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112777; Mature: 112777

Theoretical pI: Translated: 6.14; Mature: 6.14

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQVRLDDQEVTAFRSVKNRALLAYLSVEAHHPHDRSVLAGMFWPDHPETAARLNLRQALF
CCEECCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ALRKLLNVDGTEYIQVDSGTVRFNARADVWIDVVALTDLLAVCERHPHADRADCPICVMH
HHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
LAEAVACYRGDFLSEMFVGDSFAVEEWILLKREWLRHQVLDALDDLTTFYLRQAAYDQAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYAWRQIELDPLNENAHRQVMLAQALAGHRSAALSQYEHCRQVLAQDLGVEPAIETVLLA
HHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ESIRTGDLKPSGVTGEARENTDFSSPNRHNLPVVQTPLIGRQLELDHLRQWLLAPDERLI
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEE
VLVGEGGVGKSRLALAAARMVVQHFRDGVWFVPLVGIGTDARVVETDTLRELLATTIAGS
EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHCC
IGLTLHGKTDPCTQLLNYLSGREILIWLDNFEHLLPATELLWAIVQSAPRVTILVTSRER
CCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHH
LHFQSERILQLTGLPVPAADALDSDTFDSVKLFVARACRVWPAFTLNEANLAAIVQICRL
HHHHHHHHHEEECCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHH
LEGLPLGIELAASWVEQFTPMEIAAAIATNVDMLATTFQDFPERHRSVRATFIYSWRLLS
HCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEEEEEC
PGEQTTLAQLAVFQGTWSREAALRVTQASLADLVALVHKSLVQVVAPGRYTLHTLVRHLA
CCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AEQVAAMPTIERVARDRHCSYYSELLAAHETHLRGDHQSTALTTLDAERPNIQVAWEWAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHH
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DFALHLGQYAEADRLLEQSLTLLHDVPDGTRETALDIAHAMAYLGLVKERQGDYTAAKIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
YQASLDRYRLLNDRSGMTTALRSIASVAEGLAQYAEAEGLLHESLALSQEIGNRRESALT
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
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YCAALKLLLTSWAVPYMLIQIYRVAAVLAAEDRAEQAVELLQLPLHHPALDQAFRERAEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LNASLTAMLPPDRLAAAKVRGRGRTLVQVVNAIADLMPSFAHQETY
HCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MQVRLDDQEVTAFRSVKNRALLAYLSVEAHHPHDRSVLAGMFWPDHPETAARLNLRQALF
CCEECCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ALRKLLNVDGTEYIQVDSGTVRFNARADVWIDVVALTDLLAVCERHPHADRADCPICVMH
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LAEAVACYRGDFLSEMFVGDSFAVEEWILLKREWLRHQVLDALDDLTTFYLRQAAYDQAY
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HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEE
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LHFQSERILQLTGLPVPAADALDSDTFDSVKLFVARACRVWPAFTLNEANLAAIVQICRL
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LEGLPLGIELAASWVEQFTPMEIAAAIATNVDMLATTFQDFPERHRSVRATFIYSWRLLS
HCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEEEEEC
PGEQTTLAQLAVFQGTWSREAALRVTQASLADLVALVHKSLVQVVAPGRYTLHTLVRHLA
CCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AEQVAAMPTIERVARDRHCSYYSELLAAHETHLRGDHQSTALTTLDAERPNIQVAWEWAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEH
DFALHLGQYAEADRLLEQSLTLLHDVPDGTRETALDIAHAMAYLGLVKERQGDYTAAKIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
YQASLDRYRLLNDRSGMTTALRSIASVAEGLAQYAEAEGLLHESLALSQEIGNRRESALT
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LNLLGIVTEMQQRYTEACHYYRQSLQLFSEIGERWGMHLPLGNLGDVAFTLGNYQDAKSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHEECCCCHHHHHH
YCAALKLLLTSWAVPYMLIQIYRVAAVLAAEDRAEQAVELLQLPLHHPALDQAFRERAEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LNASLTAMLPPDRLAAAKVRGRGRTLVQVVNAIADLMPSFAHQETY
HCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]