| Definition | Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012032 |
| Length | 5,268,950 |
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The map label for this gene is 222527060
Identifier: 222527060
GI number: 222527060
Start: 4784102
End: 4785976
Strand: Reverse
Name: 222527060
Synonym: Chy400_3839
Alternate gene names: NA
Gene position: 4785976-4784102 (Counterclockwise)
Preceding gene: 222527061
Following gene: 222527057
Centisome position: 90.83
GC content: 57.07
Gene sequence:
>1875_bases ATGATAGCGGTGAGGCGCTGGTATCTGTTTGTGAGTGCCACGATTGGCCTCCAGGGCTTCACATGGTCGTTGATCTGGTT GCTCTACGGAATTCTGGTTGCCGATGAACAGCCGGTTATCGAGGCGACAGCGCTGCAACTGGCGGCCATACTGGTCTGTT TGCCGCTCTGGTTGGGGCATTGGTTGTGGGGTGAACGGCTGGCGCGACGTGATCGGGACGAACGAGCTTCGGCGATACGA AAACTCTATCTCTACGGCAACCTGACCCTGTTTTTGATTGCACTAATTGGAAGTGTTTTCGATCTGCTGACAGCAATACT GCGGTTTATCTTACGCATCCCAGGCGGCGACCGCGTTGGGCAGTTTGAATATGGGATCATTGCGTCATCGATCCTTGGTG TGCTCTTTGCCTACCACAGTGTCGTTGCCCGTAACGATCTCCATCAGGCACCGTTGACCGGTGGTGGTGCATTGGTGAGG CGTCTCTACCTGTTGTTTGCCGCCGGGGTTGGTCTGGCTGTCTGGGCAAGTAGTATTACGACGTTGGCTCAGCAAATAGC CAATGCCTTCGGCGGTTCCCTTTCGCTGCCGATCTTGCCCGAACTCATCGCCTCCACAATCATCGGTCTGGTCGTCTGGC TTGGTCACTGGTGGCGTGCGCAACAGCTTTTTGCCAGTGCGGAAGAAGATGAACGGGCATCAGTGTTGCGCAAGTTTTAC CTCTACCTGGTGATTGTGGTGAGCAGTCTGGCAGCAGTGACAAATGCAACCATCCTGCTGGCCGGGGTGTTTCGCCAAAT GGTGGGATTGACGGTAACCGGTAGCCCGCTAGATGTGCTGATCTCATCGGTTGTCTTCCTTGTCATCGCCCTGTATCACA GTCAGGTCTTGCGGGCCGATGCAGCGGTCATTCCCGAAGCTCCCCGTCAGGCCGGGGTGCGGCGTGTGGCATGGTACCTG GTGGCAGCCGTCGGGCAACTGGCTCTGGTTGGTGGTCTGGGTGGAATGTTGAGTGTGATCATTCGAGGTGTGGCCGGAGC CGAGACAACATCCGATCTCCGCGAACCACTGTCCTGGTTTGGGGCGATGCTGATTGTCGGGCTGGCAGTCTGGGCAGTGT GCTGGCGTCGGATACAGCGCATATCCAGCGCTACGGGTGAGGCAGGTGTGGCCGAGCGTAGCTCACTCACACGCCGTATC TACCTCTTCGGCTTCTTGTTCGTCGCCTCATTGACGCTTTTGCTGGCGATGATGTACATCCTCTTCCGCATCATCAGTAT CGCACTGGGTGAGCCGTTTGCCGGTTCGCTGCTGGCCGACATTGCCCAGGCGTTGGCCTTCGCGCTGATTGCTAGTGGTG TGCTGGCAACTCACGGGCTTGCGCTACGATCTGACACGCGGGTGCGTGAGGAAGCAGCGCTGGCGAAACAGGCGCAGACG CGGGTCGCTGTTGTCGCCGATGATGGTCTGGCCAATCAGATTGCCACTGAATTGCGCGCACAATTTCCACAACTGGTCAT CTACGTCAGGGATCAGTCTGCCGAAGCTGAACAGCAACTAGCGAACGCTAACCTGATCGTTGGCACGTGGCGCCAGACTG AGAATCCACAGTGGTTGAATCGCTATCCGGCGCGTAAATTGCTGGTACCGCTGACCGATACGAACTGGATGTGGGTGGGA GTGGAGCCGATGACGGGGACTGAGATTGCCCGTCAACTGGCAGATGCTGTGCGTCAGGTGCTGGCCGGTGAGTCATTGCG CCCCAAACGCGCAGTCACTGCCGGTACGATTGTGGCAGTAGTGGTTGGAGTAGTTTTGGTGGTTTCGTTGTTAAGCGGAT CACTGGTATTTCTGATCGCCCTGTTCTCGTTTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTACTGTTGAGCTTCTGCAACACGAGGGTAGCTGGAAATTAATTGCGAATGACGATTGGCGCACGTGGCAGTGGTGCTGG GGGCAAGAGGGAGGCTGCTC
Downstream 100 bases:
>100_bases GGAGAATCTGTGTCAACTATGGACACCGGGGCATGGGTAGGAGCGACATACGCTTCATCTCAATGCAAACGTCTGTCAAA TGGTGAGGACGGAAGCAAAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 624; Mature: 624
Protein sequence:
>624_residues MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGHWLWGERLARRDRDERASAIR KLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVGQFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVR RLYLLFAAGVGLAVWASSITTLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRADAAVIPEAPRQAGVRRVAWYL VAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWFGAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRI YLFGFLFVASLTLLLAMMYILFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLNRYPARKLLVPLTDTNWMWVG VEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAVVVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF
Sequences:
>Translated_624_residues MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGHWLWGERLARRDRDERASAIR KLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVGQFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVR RLYLLFAAGVGLAVWASSITTLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRADAAVIPEAPRQAGVRRVAWYL VAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWFGAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRI YLFGFLFVASLTLLLAMMYILFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLNRYPARKLLVPLTDTNWMWVG VEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAVVVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF >Mature_624_residues MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGHWLWGERLARRDRDERASAIR KLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVGQFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVR RLYLLFAAGVGLAVWASSITTLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRADAAVIPEAPRQAGVRRVAWYL VAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWFGAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRI YLFGFLFVASLTLLLAMMYILFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLNRYPARKLLVPLTDTNWMWVG VEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAVVVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67729; Mature: 67729
Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGH CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLWGERLARRDRDERASAIRKLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVRRLYLLFAAGVGLAVWASSIT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAVIPEAPRQAGVRRVAWYLVAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWF HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH GAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRIYLFGFLFVASLTLLLAMMYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHC RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLN CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHH RYPARKLLVPLTDTNWMWVGVEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAV HCCCHHEEEEEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH VVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MIAVRRWYLFVSATIGLQGFTWSLIWLLYGILVADEQPVIEATALQLAAILVCLPLWLGH CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLWGERLARRDRDERASAIRKLYLYGNLTLFLIALIGSVFDLLTAILRFILRIPGGDRVG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QFEYGIIASSILGVLFAYHSVVARNDLHQAPLTGGGALVRRLYLLFAAGVGLAVWASSIT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLAQQIANAFGGSLSLPILPELIASTIIGLVVWLGHWWRAQQLFASAEEDERASVLRKFY HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LYLVIVVSSLAAVTNATILLAGVFRQMVGLTVTGSPLDVLISSVVFLVIALYHSQVLRAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAVIPEAPRQAGVRRVAWYLVAAVGQLALVGGLGGMLSVIIRGVAGAETTSDLREPLSWF HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH GAMLIVGLAVWAVCWRRIQRISSATGEAGVAERSSLTRRIYLFGFLFVASLTLLLAMMYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFRIISIALGEPFAGSLLADIAQALAFALIASGVLATHGLALRSDTRVREEAALAKQAQT HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHC RVAVVADDGLANQIATELRAQFPQLVIYVRDQSAEAEQQLANANLIVGTWRQTENPQWLN CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHH RYPARKLLVPLTDTNWMWVGVEPMTGTEIARQLADAVRQVLAGESLRPKRAVTAGTIVAV HCCCHHEEEEEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH VVGVVLVVSLLSGSLVFLIALFSF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA