Definition Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011753
Length 3,299,303

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The map label for this gene is 218709358

Identifier: 218709358

GI number: 218709358

Start: 1475653

End: 1477425

Strand: Direct

Name: 218709358

Synonym: VS_1367

Alternate gene names: NA

Gene position: 1475653-1477425 (Clockwise)

Preceding gene: 218709356

Following gene: 218709359

Centisome position: 44.73

GC content: 42.92

Gene sequence:

>1773_bases
ATGACCGACCAGATAGCTTCTTTCATTGCATCATTTAGTGCAAATGCAATATCCGACGCATTTATCCTGATTATTGCAGC
ATTAATGATAGTTTCCATTGTTCTTTCTGCTATTGGAAAAGCTCCTAGATTGACAGGTAGTACAGCCAACCTATTAACTT
CTCTCGGTATCTTAGGTACTTTTGCGGGAATCGTGGTTGGGTTAATGGACTTTGACCCTAAGAACATTGATGGCAGTATA
GAATCCCTGTTATCCGGCCTTAAGACTGCGTTTTTAACAAGCTTAGTTGGTATGGCTGGATCGATCGTGTACAAAGCAAT
ATTGGGTGTCTTGCCTAAACGTGTAGAGTCAATGGAGAAAGCTGTAGGACCAGATGAAATCTACGCCGTGATGTCTCAGC
AATTAGAATCGTCAAATAAGCAATTGGAATCTTCTTCAGAGTTATTGTCTGCCATCAGGGGAGACAGTGATTCATCTCTA
ACATCTCAAATCAAGAACTTACGAACAGATGTCACCGATGGCAACAGACAACTCAATAGTCATTTGGAAAACTTTTTGCA
ATCAAATGAAAAGTTTAGAAGCGAGCTATGGGTAAAAATGGATGAATTTGGCGAGCTACTTTCGAAGTCTGCAACAGAGC
AAGTTATTAATGCGCTGAAAGAAGTTATTGTCGAGTTTAACGATAAGCTGACTGAGCAGTTTGGTGAGAACTTCAAGCGC
CTGGATGAGTCGGTGAAAAAACTAGTGGATTGGCAAGAAAACTACAAGCTTCAGCTAGAAGATATGGCAAACAAGTATCA
GCTTGGTGTAGACGCAATTTCTTCAACTGAGAAATCTGTAGCTAGCATTAATGAACGAGCTGAGTCCATTCCACAGACAA
TGGAAAAACTTCACCATGTAATGGAGATCGGGCACGGTCAAGTTACGGAGCTGGAGCATCGCCTAGAGGCATTTAAGGAC
TTACGTGACAAGGCTGTCGAAGCAATGCCTCAGATTCGTGAGCAAATGGACAGCACTATGGCTGTGATTGGAAACTCGGT
TAAGGCTGCTTCTACGCACTACGAGTCGATGTTAGTCGAGTCTCAGAAAATCATTGATAACTTTAGTACTACAGCCAATC
AGAGCGTTGAGACTATGCGCACCAACTTGGAAGAAGGAGCTGTTAAAGTATCGAGTGAGCTTGAGACCAGAGCGGTTGAA
ATTGGTGGGCGTCTTGCAGAAGCTTCAAACGATATCACGGACAATGTTACTAGTGCATCTGGTGCGCTTCAAAACAGTGC
ATCTTATCTAACCGATAACTCAGATCGAATCAAAGAACAGCTTGAAGATGCCATTACAGAATTAAACTCTCAATTACGCG
TCCTCGTTGCTGACATCAAAGACGACGCTAAAGAAACGGGTAATGTCCTCAAGTCTGCGAACCAAGAGCTACTATCGAGC
ACGCGTGATATTCAAACTGAGACGACTCAAGCGATTACAAAACTCCACGATCGCTTAGAGACCACTCTCGAAGATGTCTT
CCAGATCCAAGCTCAAGCTGTTAAGCGTACATTTGATAGTTTGGAAGACCAAATTGTTGATTCAGTCGGTAAAACTGGTA
ACGCAGTAGAGAAGCAAGTCGAAGTGCTTGATATCCAAATGCAGCAGGAAATTAACCGCACTATGAACGAAATGGGTGAG
GCTTTGGCAACGATCACGCAGCAGTTCACTCGAGATTATCAGAAGCTTGTTCGAGAAATGTCTAATGTGGTCAACGCTGG
AGCAACAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCAGTGTTATAGGTAAATAGCACAATAATTTTATTGCGGAACCCTATGTTGTAAATGTAGAATTCCGCGCGTTTAAACT
CACATCTATAGAAAATCCCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGATGGAAAAGTTGTTTGGTTCTCAAAAGCCCAATGAAGGAAGTGGTGAACATTGGATGTCTGTGTCCGACCTTATGGCT
GGACTCATGATGGTTTTCCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 590; Mature: 589

Protein sequence:

>590_residues
MTDQIASFIASFSANAISDAFILIIAALMIVSIVLSAIGKAPRLTGSTANLLTSLGILGTFAGIVVGLMDFDPKNIDGSI
ESLLSGLKTAFLTSLVGMAGSIVYKAILGVLPKRVESMEKAVGPDEIYAVMSQQLESSNKQLESSSELLSAIRGDSDSSL
TSQIKNLRTDVTDGNRQLNSHLENFLQSNEKFRSELWVKMDEFGELLSKSATEQVINALKEVIVEFNDKLTEQFGENFKR
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LRDKAVEAMPQIREQMDSTMAVIGNSVKAASTHYESMLVESQKIIDNFSTTANQSVETMRTNLEEGAVKVSSELETRAVE
IGGRLAEASNDITDNVTSASGALQNSASYLTDNSDRIKEQLEDAITELNSQLRVLVADIKDDAKETGNVLKSANQELLSS
TRDIQTETTQAITKLHDRLETTLEDVFQIQAQAVKRTFDSLEDQIVDSVGKTGNAVEKQVEVLDIQMQQEINRTMNEMGE
ALATITQQFTRDYQKLVREMSNVVNAGATV

Sequences:

>Translated_590_residues
MTDQIASFIASFSANAISDAFILIIAALMIVSIVLSAIGKAPRLTGSTANLLTSLGILGTFAGIVVGLMDFDPKNIDGSI
ESLLSGLKTAFLTSLVGMAGSIVYKAILGVLPKRVESMEKAVGPDEIYAVMSQQLESSNKQLESSSELLSAIRGDSDSSL
TSQIKNLRTDVTDGNRQLNSHLENFLQSNEKFRSELWVKMDEFGELLSKSATEQVINALKEVIVEFNDKLTEQFGENFKR
LDESVKKLVDWQENYKLQLEDMANKYQLGVDAISSTEKSVASINERAESIPQTMEKLHHVMEIGHGQVTELEHRLEAFKD
LRDKAVEAMPQIREQMDSTMAVIGNSVKAASTHYESMLVESQKIIDNFSTTANQSVETMRTNLEEGAVKVSSELETRAVE
IGGRLAEASNDITDNVTSASGALQNSASYLTDNSDRIKEQLEDAITELNSQLRVLVADIKDDAKETGNVLKSANQELLSS
TRDIQTETTQAITKLHDRLETTLEDVFQIQAQAVKRTFDSLEDQIVDSVGKTGNAVEKQVEVLDIQMQQEINRTMNEMGE
ALATITQQFTRDYQKLVREMSNVVNAGATV
>Mature_589_residues
TDQIASFIASFSANAISDAFILIIAALMIVSIVLSAIGKAPRLTGSTANLLTSLGILGTFAGIVVGLMDFDPKNIDGSIE
SLLSGLKTAFLTSLVGMAGSIVYKAILGVLPKRVESMEKAVGPDEIYAVMSQQLESSNKQLESSSELLSAIRGDSDSSLT
SQIKNLRTDVTDGNRQLNSHLENFLQSNEKFRSELWVKMDEFGELLSKSATEQVINALKEVIVEFNDKLTEQFGENFKRL
DESVKKLVDWQENYKLQLEDMANKYQLGVDAISSTEKSVASINERAESIPQTMEKLHHVMEIGHGQVTELEHRLEAFKDL
RDKAVEAMPQIREQMDSTMAVIGNSVKAASTHYESMLVESQKIIDNFSTTANQSVETMRTNLEEGAVKVSSELETRAVEI
GGRLAEASNDITDNVTSASGALQNSASYLTDNSDRIKEQLEDAITELNSQLRVLVADIKDDAKETGNVLKSANQELLSST
RDIQTETTQAITKLHDRLETTLEDVFQIQAQAVKRTFDSLEDQIVDSVGKTGNAVEKQVEVLDIQMQQEINRTMNEMGEA
LATITQQFTRDYQKLVREMSNVVNAGATV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64900; Mature: 64769

Theoretical pI: Translated: 4.39; Mature: 4.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTDQIASFIASFSANAISDAFILIIAALMIVSIVLSAIGKAPRLTGSTANLLTSLGILGT
CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FAGIVVGLMDFDPKNIDGSIESLLSGLKTAFLTSLVGMAGSIVYKAILGVLPKRVESMEK
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVGPDEIYAVMSQQLESSNKQLESSSELLSAIRGDSDSSLTSQIKNLRTDVTDGNRQLNS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
HLENFLQSNEKFRSELWVKMDEFGELLSKSATEQVINALKEVIVEFNDKLTEQFGENFKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDESVKKLVDWQENYKLQLEDMANKYQLGVDAISSTEKSVASINERAESIPQTMEKLHHV
HHHHHHHHHCHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MEIGHGQVTELEHRLEAFKDLRDKAVEAMPQIREQMDSTMAVIGNSVKAASTHYESMLVE
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
SQKIIDNFSTTANQSVETMRTNLEEGAVKVSSELETRAVEIGGRLAEASNDITDNVTSAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHH
GALQNSASYLTDNSDRIKEQLEDAITELNSQLRVLVADIKDDAKETGNVLKSANQELLSS
HHHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRDIQTETTQAITKLHDRLETTLEDVFQIQAQAVKRTFDSLEDQIVDSVGKTGNAVEKQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
EVLDIQMQQEINRTMNEMGEALATITQQFTRDYQKLVREMSNVVNAGATV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TDQIASFIASFSANAISDAFILIIAALMIVSIVLSAIGKAPRLTGSTANLLTSLGILGT
CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FAGIVVGLMDFDPKNIDGSIESLLSGLKTAFLTSLVGMAGSIVYKAILGVLPKRVESMEK
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVGPDEIYAVMSQQLESSNKQLESSSELLSAIRGDSDSSLTSQIKNLRTDVTDGNRQLNS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
HLENFLQSNEKFRSELWVKMDEFGELLSKSATEQVINALKEVIVEFNDKLTEQFGENFKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDESVKKLVDWQENYKLQLEDMANKYQLGVDAISSTEKSVASINERAESIPQTMEKLHHV
HHHHHHHHHCHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MEIGHGQVTELEHRLEAFKDLRDKAVEAMPQIREQMDSTMAVIGNSVKAASTHYESMLVE
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
SQKIIDNFSTTANQSVETMRTNLEEGAVKVSSELETRAVEIGGRLAEASNDITDNVTSAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHH
GALQNSASYLTDNSDRIKEQLEDAITELNSQLRVLVADIKDDAKETGNVLKSANQELLSS
HHHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRDIQTETTQAITKLHDRLETTLEDVFQIQAQAVKRTFDSLEDQIVDSVGKTGNAVEKQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
EVLDIQMQQEINRTMNEMGEALATITQQFTRDYQKLVREMSNVVNAGATV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA