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The map label for this gene is ynfM [C]

Identifier: 21672825

GI number: 21672825

Start: 622078

End: 623319

Strand: Reverse

Name: ynfM [C]

Synonym: BUsg567

Alternate gene names: 21672825

Gene position: 623319-622078 (Counterclockwise)

Preceding gene: 30410829

Following gene: 21672824

Centisome position: 97.17

GC content: 25.12

Gene sequence:

>1242_bases
ATGGATATATATACATATAAAAAACATATTTTATTTAAAAAATGTTTTTTATACTTTTGGAAAATAAAAAATGTTATTAA
AAAAAAAAATACAAAAAAATTTAATCAAATTGTTTTATCTCTTTTTTTAGGCGGTTTTTCTAGTTTTTCTATTTTATATT
GTGTTCAGTCTATTTTACCAGTATTTTCTAAACAATTTTGTTTAACTGCAACAGAGAGTAGTTTATCTTTATCAGCAGCA
ACAGCTACAATGTCAATTGGGACACTATTTATTGGACCCTTATCAGATAGAATTGGTAGAAAGTCAATTATGTCTTCTTC
TTTATTAATAGCAGCAGTACTCACTATTATATGTTCTATTAGCAATAATTGGACAGTTATTGTCTTTCTTCGTGCCCTAA
CTGGACTAGCTCTAAGTGGTGTTGTCGCAGTTGCCATGACTTATATTGTTGAAGAAGTACATCCAAATTCTGTATCATTT
TGCATGGGATTGTATATCAGCGGAAATACGATAGGAGGATGCTCTGGAAGAATATTAAGTAGTATTTTAGCAGAATATTT
TTCTTGGCATATTGCATTTATAGTTATTGGTTTTTTTTCTTTAATGTCATCTTGTCTTTTTTTATATTTTTTACCATCTT
CAAAAAATTTTTATCCTATTTCTATAGATTTTAATAAATTTTTAAAAAATTTTTATTTGCATTTAAAAAATCCAACATTG
TTAATCTTATTTGCAATAGGATTTATGTTAATGGGTAGTTTTATTACAATTTTTAATTATATTAGCTATCGATTAATGTT
ATCACCATTTTTTTTGTCTTCTTCAAATATAGGATTTTTATCTATTATTTATTTGACCGGAGTTTACAGTTCTCCTAAAG
CTGGAATTTTAATAAATCAATATAATCGTAGCAGTATATTAAGAATAGCATTATTACTGATGATTTTAGGTTTATTAATG
ACACAATATAATGAAATTTTCATAATCATTTTAGGATTAGTGATATTTTCAAGTGGTTTTTTTGCATCTCATTCTATTGC
AAGCAGTTGGATTGGTTTCCATGCAAAAATCGCTAAAGTTCAAGCAACTTCTTTATATTTGTTTTTCTATTATTTAGGAT
CAAGTATTTTTGGCACATTCGGAGGATTTTTTTGGTTTTATTTAAAATGGATAGGTATTTCATCCTTTATTATTATAATT
TTAATTTTCGCAATTTTATTATCTTTAAAATTAAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATAATGTTAAGGTAGATTTATTAGGTGGTAATTTAATAATTAAATGGAAAGGTTTTAATTATCCTCTTTATATGATAGG
GACAGCTTGTCATATTTACG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAGTTTTTTAAAATAATTACTTTCCTCTAACAAGGTTTCTCACAGATAATAAACTTAGTTCAATTCATCAAAATGGCT
TAAAGGTTATGCTATATTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 413; Mature: 413

Protein sequence:

>413_residues
MDIYTYKKHILFKKCFLYFWKIKNVIKKKNTKKFNQIVLSLFLGGFSSFSILYCVQSILPVFSKQFCLTATESSLSLSAA
TATMSIGTLFIGPLSDRIGRKSIMSSSLLIAAVLTIICSISNNWTVIVFLRALTGLALSGVVAVAMTYIVEEVHPNSVSF
CMGLYISGNTIGGCSGRILSSILAEYFSWHIAFIVIGFFSLMSSCLFLYFLPSSKNFYPISIDFNKFLKNFYLHLKNPTL
LILFAIGFMLMGSFITIFNYISYRLMLSPFFLSSSNIGFLSIIYLTGVYSSPKAGILINQYNRSSILRIALLLMILGLLM
TQYNEIFIIILGLVIFSSGFFASHSIASSWIGFHAKIAKVQATSLYLFFYYLGSSIFGTFGGFFWFYLKWIGISSFIIII
LIFAILLSLKLKK

Sequences:

>Translated_413_residues
MDIYTYKKHILFKKCFLYFWKIKNVIKKKNTKKFNQIVLSLFLGGFSSFSILYCVQSILPVFSKQFCLTATESSLSLSAA
TATMSIGTLFIGPLSDRIGRKSIMSSSLLIAAVLTIICSISNNWTVIVFLRALTGLALSGVVAVAMTYIVEEVHPNSVSF
CMGLYISGNTIGGCSGRILSSILAEYFSWHIAFIVIGFFSLMSSCLFLYFLPSSKNFYPISIDFNKFLKNFYLHLKNPTL
LILFAIGFMLMGSFITIFNYISYRLMLSPFFLSSSNIGFLSIIYLTGVYSSPKAGILINQYNRSSILRIALLLMILGLLM
TQYNEIFIIILGLVIFSSGFFASHSIASSWIGFHAKIAKVQATSLYLFFYYLGSSIFGTFGGFFWFYLKWIGISSFIIII
LIFAILLSLKLKK
>Mature_413_residues
MDIYTYKKHILFKKCFLYFWKIKNVIKKKNTKKFNQIVLSLFLGGFSSFSILYCVQSILPVFSKQFCLTATESSLSLSAA
TATMSIGTLFIGPLSDRIGRKSIMSSSLLIAAVLTIICSISNNWTVIVFLRALTGLALSGVVAVAMTYIVEEVHPNSVSF
CMGLYISGNTIGGCSGRILSSILAEYFSWHIAFIVIGFFSLMSSCLFLYFLPSSKNFYPISIDFNKFLKNFYLHLKNPTL
LILFAIGFMLMGSFITIFNYISYRLMLSPFFLSSSNIGFLSIIYLTGVYSSPKAGILINQYNRSSILRIALLLMILGLLM
TQYNEIFIIILGLVIFSSGFFASHSIASSWIGFHAKIAKVQATSLYLFFYYLGSSIFGTFGGFFWFYLKWIGISSFIIII
LIFAILLSLKLKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787880, Length=391, Percent_Identity=50.383631713555, Blast_Score=408, Evalue=1e-115,
Organism=Escherichia coli, GI87082404, Length=234, Percent_Identity=26.9230769230769, Blast_Score=62, Evalue=8e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y567_BUCAP (Q8K902)

Other databases:

- EMBL:   AE013218
- RefSeq:   NP_660892.1
- ProteinModelPortal:   Q8K902
- EnsemblBacteria:   EBBUCT00000000358
- GeneID:   1005625
- GenomeReviews:   AE013218_GR
- KEGG:   bas:BUsg567
- GeneTree:   EBGT00050000007973
- HOGENOM:   HBG699254
- OMA:   IYIMANS
- ProtClustDB:   CLSK316272
- BioCyc:   BAPH198804:BUSG567-MONOMER
- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR005829

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1; SSF103473 MFS_gen_substrate_transporter

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46362; Mature: 46362

Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16

Prosite motif: PS50850 MFS; PS00216 SUGAR_TRANSPORT_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xbd505c8)-; HASH(0xc82b40c)-; HASH(0x95cb6c8)-; HASH(0xc3057e0)-; HASH(0xc159f54)-; HASH(0xc917160)-; HASH(0xc291c8c)-; HASH(0xc409a44)-; HASH(0xcc4a18c)-; HASH(0xc877078)-; HASH(0xb6d09d0)-; HASH(0xb60a520)-;

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDIYTYKKHILFKKCFLYFWKIKNVIKKKNTKKFNQIVLSLFLGGFSSFSILYCVQSILP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
VFSKQFCLTATESSLSLSAATATMSIGTLFIGPLSDRIGRKSIMSSSLLIAAVLTIICSI
HHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNNWTVIVFLRALTGLALSGVVAVAMTYIVEEVHPNSVSFCMGLYISGNTIGGCSGRILS
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHEEEEEECCCCCCCHHHHHH
SILAEYFSWHIAFIVIGFFSLMSSCLFLYFLPSSKNFYPISIDFNKFLKNFYLHLKNPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHEEECCCHH
LILFAIGFMLMGSFITIFNYISYRLMLSPFFLSSSNIGFLSIIYLTGVYSSPKAGILINQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEC
YNRSSILRIALLLMILGLLMTQYNEIFIIILGLVIFSSGFFASHSIASSWIGFHAKIAKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QATSLYLFFYYLGSSIFGTFGGFFWFYLKWIGISSFIIIILIFAILLSLKLKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
>Mature Secondary Structure
MDIYTYKKHILFKKCFLYFWKIKNVIKKKNTKKFNQIVLSLFLGGFSSFSILYCVQSILP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
VFSKQFCLTATESSLSLSAATATMSIGTLFIGPLSDRIGRKSIMSSSLLIAAVLTIICSI
HHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNNWTVIVFLRALTGLALSGVVAVAMTYIVEEVHPNSVSFCMGLYISGNTIGGCSGRILS
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHEEEEEECCCCCCCHHHHHH
SILAEYFSWHIAFIVIGFFSLMSSCLFLYFLPSSKNFYPISIDFNKFLKNFYLHLKNPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHEEECCCHH
LILFAIGFMLMGSFITIFNYISYRLMLSPFFLSSSNIGFLSIIYLTGVYSSPKAGILINQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEC
YNRSSILRIALLLMILGLLMTQYNEIFIIILGLVIFSSGFFASHSIASSWIGFHAKIAKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QATSLYLFFYYLGSSIFGTFGGFFWFYLKWIGISSFIIIILIFAILLSLKLKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12089438