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The map label for this gene is 209695110

Identifier: 209695110

GI number: 209695110

Start: 1715448

End: 1716902

Strand: Direct

Name: 209695110

Synonym: VSAL_I1609

Alternate gene names: NA

Gene position: 1715448-1716902 (Clockwise)

Preceding gene: 209695109

Following gene: 209695111

Centisome position: 51.59

GC content: 42.96

Gene sequence:

>1455_bases
ATGACACATTCAAAGCCTCTACGATCATTTGCTTTAGCCTTAGCCCCTATCGCTGTAATGTTTGGTCTGCTTGCAATAGG
ATATGGCCTACTCGGCCTACAAATTGAAGCCTTATTACTTACCTCTGCTACCTTTACTGGTTTCATCGCTTATAAAATGG
GATACAACTGGGATGAAATAATGAATTCCATTGTAGAGAAACTAGCGAAAGCGATGCCTGTTATTTTAATTCTCGTTTCT
GTTGGTGGCCTAATCGCAAGTTGGATGATCAGTGGCACCATTCCCTACATGGTCTATTGGGGCCTTAAAGTCATTAGCCC
TCAATACATTTTAATCGCCGCTTTCTTTGTGACTAGCGTCGTCTCTGTGTGTACTGGTACATCATGGGGCTCAGCAGGAA
CCGTTGGTGTTGCGCTAATGGGCGTTGCCGCAGGTCTTGATGTTTCAATGGCAGCAGCGGCTGGTGCCGTCGTTTCTGGT
GCGTATTTTGGCGATAAAATATCCCCACTTTCTGATTCAACTAACTTTGCACCGATCGTCTCTGGTACTACGTTATACGA
ACACATCCAACACATGCTCTACACGACCTTACCGGGATTCGTTATTGCATCTATTGTATTCTTCTTTGCAGGTCAATATG
GCGATGTAGCAAGTGTAAGCGAGCCTCAAAAAGTACTCGATATCCTTGCGGGATTAGAAAGCCTATATAACCTTAATATT
CTATTAATTGTGCCACCAATCATGATCTTATGGGGTGCGTTTACTAAAAAACCAGTACTTCCATTGATGCTTGCCGCTTC
TGCTTTAGCGATTGTTATTGGCATTTTCGTGCAAGGTTTTAGCTTACAACAAGCACTGCAAGCGTTTGTTAATGGCTTTA
ATATCGATATGCTAAACGCAAATGGCCACACTACTGATGGCTTAGTTCCTGACATTGCAAAACTGCTTAACCGTGGTGGC
CTATTCTCTATGATGAGCACCATTCTTCTTGTGTTCTGTGCCTTCGCTTTCGCAGGTATTCTAAGTTTAACTGGCGCACT
CAATGTGGTTCTAGGTCGATTCTTGCACCTGATTCACAGTACAGGTCAATTAATTCTATCAACCGTTATCGCTACAATTA
CAGTGGTATTTACAACTTCTGATGGCAAATTAGCGCTATTAATTCCGGGTGAATTATTCCAAGACGCTTACCGTAAAATG
GGATTAGATACCAAAAATCTATCTCGAACGATTGAAGATGCCGGCACCATTATCGAACCATTGGTTCCTTGGACAGCGGC
AGGAATTTACATGGCAAGTACATTAGGCGTAGCAACGCTTGATTACCTACCATGGGCAATTCAATGTTACACCGGCGTGA
TCTTCGCCATCATTTATGGATTTACTGGCTTTGGCATTGCAAAAGCACCCGTAACTCAAGACAACGACTCACTATCTCCT
GTTGAAGTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATGAGGGTGTTACTTATCTCTTACATTCTAATTAATAGAACTCTTACTATGGCCTCATAAAAACAAAACAACCCTACGT
CTGTTTACGAGGAATACACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTATCCCATGACAACTTCTTTTAATTGCATTCATAACCGTTGTAATACCGGCTCATTAAAATGGGACTTCATGAAAGA
AAAACTCGGATTAGACGGCA

Product: sodium/proton antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 484; Mature: 483

Protein sequence:

>484_residues
MTHSKPLRSFALALAPIAVMFGLLAIGYGLLGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEIMNSIVEKLAKAMPVILILVS
VGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSVVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSMAAAAGAVVSG
AYFGDKISPLSDSTNFAPIVSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASIVFFFAGQYGDVASVSEPQKVLDILAGLESLYNLNI
LLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALAIVIGIFVQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNANGHTTDGLVPDIAKLLNRGG
LFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHSTGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQDAYRKM
GLDTKNLSRTIEDAGTIIEPLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLSP
VEVK

Sequences:

>Translated_484_residues
MTHSKPLRSFALALAPIAVMFGLLAIGYGLLGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEIMNSIVEKLAKAMPVILILVS
VGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSVVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSMAAAAGAVVSG
AYFGDKISPLSDSTNFAPIVSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASIVFFFAGQYGDVASVSEPQKVLDILAGLESLYNLNI
LLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALAIVIGIFVQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNANGHTTDGLVPDIAKLLNRGG
LFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHSTGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQDAYRKM
GLDTKNLSRTIEDAGTIIEPLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLSP
VEVK
>Mature_483_residues
THSKPLRSFALALAPIAVMFGLLAIGYGLLGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEIMNSIVEKLAKAMPVILILVSV
GGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSVVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSMAAAAGAVVSGA
YFGDKISPLSDSTNFAPIVSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASIVFFFAGQYGDVASVSEPQKVLDILAGLESLYNLNIL
LIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALAIVIGIFVQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNANGHTTDGLVPDIAKLLNRGGL
FSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHSTGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQDAYRKMG
LDTKNLSRTIEDAGTIIEPLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLSPV
EVK

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51272; Mature: 51141

Theoretical pI: Translated: 5.58; Mature: 5.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCC
>Mature Secondary Structure 
THSKPLRSFALALAPIAVMFGLLAIGYGLLGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
MNSIVEKLAKAMPVILILVSVGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSMAAAAGAVVSGAYFGDKISPLSDSTNFAPIV
HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASIVFFFAGQYGDVASVSEPQKVLDILAGLESLYNLNI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALAIVIGIFVQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNA
EEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECC
NGHTTDGLVPDIAKLLNRGGLFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHS
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQDAYRKMGLDTKNLSRTIEDAGTIIEP
HHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLSP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VEVK
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]