Definition Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome.
Accession NC_010793
Length 2,008,987

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The map label for this gene is 189184649

Identifier: 189184649

GI number: 189184649

Start: 1765315

End: 1766790

Strand: Reverse

Name: 189184649

Synonym: OTT_1742

Alternate gene names: NA

Gene position: 1766790-1765315 (Counterclockwise)

Preceding gene: 189184650

Following gene: 189184647

Centisome position: 87.94

GC content: 28.32

Gene sequence:

>1476_bases
ATGTCGCATTATAAAAGTACATTATTTATATTATTATTGCTTTGTTTATTAGCTTTTACACAAAATCAAGGCTATGCTCA
ATTGCAGTTAGAAAGATTCAATTTAAGGCTTGGAATAGAATCTGAAAGTATTTCTAATACAGATATTGCTATTGCGTCAG
AAATTGCTGCAAAGATGCATGTAAGTTTGTTTCTTAAACATGTACCTGCTGACCAAAAATTAAATGCCTTATCTGATGGG
GTTGTTGACATTATTTCTAGCTCAGAAATTCCTCCTGATATTAAGGAATATGCTTACTTATCATCTATTCCACATCGTTA
TGAAAATTATTCGTTGTTTGTATTAGGCGAGAAAAATTTAGAATTTAGTGATAGCTCTGAATTTGCTGATCTTATTAGGT
TTCATGGGTTTCGTCTTGGAGTAATGAAGAATTATGTTTATAAAGATAATGAAATTAGCAAATTGATTCAAAGTCCAGAC
AATCAGGATATAATATTTGAATACGAAACTAATGATGAAGCATTAAAAGCTCTATTAAATAATGAAATTGATGGATGGAT
TACAATAACCTCTTCAGGAGTAGCTTCTGTAGTTCAGTGTTATCATGCTATAAATAGAATAAAGCACATTGTTATTACGA
ATAAAGTGCCTGTATATTTTATGTTTAATAAAAAAACTTTGCCTATCGGGTTAATAACAGATCTGAAGAGAGAAATAGAG
AAATTTGAAGCTAAAACTGTTAAAAGCAGAATTTATTTGTTTTTATTAATTGAATCTATTCATTCAAGTTGGTTTTATGG
GTTAAGTATTATTGCAGGAATATTATTTACCTTACCAAGTATTATTTTAGCCTTAACAAACAATTCTTCTTTGTTTAGCA
TAATAATGCTAGCATTGTTACCTGCAAGTTTCAGTAATATTGCATTAGACATAATAATGCATAAGCAGTCACAAGGAGTT
TTTTCTAATCCAATATATATATATTGCAATCTCATTATTGTGTTAATAGGATTTTTTTTAGTAAGATTATTAGGATGGCA
AGGTAGTAAAATAAAGTGTGATCAAAACTTTTTAAGTTATTTATTTGTCATATGTGATGCTTTGGTGCAGTCTATATTTA
TGATAGTGGGAATTATTGTATCATTAATGATTCCAATGTATCCAATAATGTTATGGGGGCCTGTGTTTGTATTATTATTT
TCTAGTATAGGATGTATTGTTAGGAGTGTATTGTGTAGATATAACGCAATACAAGATGTTTATAGTGAAATTAATTTTAT
GGTTATTGTAATATGGACTGTTATTTTTCTCAATTGCCTTGACTATCAATATAATGAGTTAAATCTAGAAAAAATGCAAT
ATGATATTGTAATAGCAATTTTAGGCGTCTTTATTACTAGCACAGCTATACATTATTTACTATGGAAAAAAAGATTGCTG
AACAACAAAATTTGCAATTGGGCTAGTTTTAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAATTACAAGACGGAGTACGACAAGCTACAATTGATTCTTAATTGATATTAGCTGCATTTTTTACTGTTTAAAATTTTAT
GTGATTATTAAGCTTATATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAGAACTCGATATGAGTAGAATGATGTAAAGTCGGTAGAACATAGATTAATATCGAACTCTGGATCATATACTTGCTA
AAGTATAAAAGCTAAAAATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 491; Mature: 490

Protein sequence:

>491_residues
MSHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMHVSLFLKHVPADQKLNALSDG
VVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNLEFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPD
NQDIIFEYETNDEALKALLNNEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE
KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALLPASFSNIALDIIMHKQSQGV
FSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSYLFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLF
SSIGCIVRSVLCRYNAIQDVYSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL
NNKICNWASFR

Sequences:

>Translated_491_residues
MSHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMHVSLFLKHVPADQKLNALSDG
VVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNLEFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPD
NQDIIFEYETNDEALKALLNNEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE
KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALLPASFSNIALDIIMHKQSQGV
FSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSYLFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLF
SSIGCIVRSVLCRYNAIQDVYSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL
NNKICNWASFR
>Mature_490_residues
SHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMHVSLFLKHVPADQKLNALSDGV
VDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNLEFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPDN
QDIIFEYETNDEALKALLNNEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIEK
FEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALLPASFSNIALDIIMHKQSQGVF
SNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSYLFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLFS
SIGCIVRSVLCRYNAIQDVYSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLLN
NKICNWASFR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56102; Mature: 55971

Theoretical pI: Translated: 6.84; Mature: 6.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
VSLFLKHVPADQKLNALSDGVVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNL
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCC
EFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPDNQDIIFEYETNDEALKALLN
CCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHC
NEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
PASFSNIALDIIMHKQSQGVFSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSY
HCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHH
LFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLFSSIGCIVRSVLCRYNAIQDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNKICNWASFR
HCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SHYKSTLFILLLLCLLAFTQNQGYAQLQLERFNLRLGIESESISNTDIAIASEIAAKMH
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
VSLFLKHVPADQKLNALSDGVVDIISSSEIPPDIKEYAYLSSIPHRYENYSLFVLGEKNL
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCC
EFSDSSEFADLIRFHGFRLGVMKNYVYKDNEISKLIQSPDNQDIIFEYETNDEALKALLN
CCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHC
NEIDGWITITSSGVASVVQCYHAINRIKHIVITNKVPVYFMFNKKTLPIGLITDLKREIE
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
KFEAKTVKSRIYLFLLIESIHSSWFYGLSIIAGILFTLPSIILALTNNSSLFSIIMLALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
PASFSNIALDIIMHKQSQGVFSNPIYIYCNLIIVLIGFFLVRLLGWQGSKIKCDQNFLSY
HCCHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHH
LFVICDALVQSIFMIVGIIVSLMIPMYPIMLWGPVFVLLFSSIGCIVRSVLCRYNAIQDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSEINFMVIVIWTVIFLNCLDYQYNELNLEKMQYDIVIAILGVFITSTAIHYLLWKKRLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNKICNWASFR
HCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA