| Definition | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010793 |
| Length | 2,008,987 |
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The map label for this gene is 189183596
Identifier: 189183596
GI number: 189183596
Start: 714880
End: 717465
Strand: Direct
Name: 189183596
Synonym: OTT_0689
Alternate gene names: NA
Gene position: 714880-717465 (Clockwise)
Preceding gene: 189183595
Following gene: 189183597
Centisome position: 35.58
GC content: 27.38
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTAGTGTAATAGTAATATAAAATTAAAATATATAAAAAATGGGCAATAAATCAGAGTTAATTGAGATTTTTTTGAATG ACTATAACAACTTTGAAAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 861; Mature: 860
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_861_residues MSKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLSSHKKQRIQQSNLLDENIFKD WFMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILRDWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKW IKYHDNDVLYNDKSEYLAINYICNIEWTPRGTINYLQTARNILARDDNGLSNDQKYRLACNYCLEDSITNYAQKVNLASY LQTISIYSKPMVYFWTSHTYSTNIDSTTADVKTIDALVSDYNNRNRTNIDTNTYIFNILIEDNCHKAMNCVPIEYIWNRL SYEEQLKKITLAINKINNREFRSLLLSQLDYEQQKKIFQNSYFLSITLMRFLNDLLLSDYFLPIAYNALNIMPEKSFFYL IEAVADRIGPSLYSKIYDDNHYKFIFKELWQFAPKRLKEYVLECNNTDLIQNFIVFKLFLNDEINNDIDIAKLVLADANA THKNNIMFCGSLQCGVKKCSDLIIKNQWNFLDTFIKLLISSTEDINTLKQELIKDHGYQITIHFYQKQEYDKAEHFLKWC LESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEHYFQWCASNDLKIINELKESIPQKWFQEVIFKLIEQDQYEL LDQILNWCFSNDQEKINNCKNSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDI YSVCIYQLQKYKFELADKSVSWAALSHEEIALFKNKLLGSEDIKYIVTYYLAEPDKLQLLIKWFSPSIYAITNFKEIISN KSYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNVENITSNDQSAVNAIGELALNI >Mature_860_residues SKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLSSHKKQRIQQSNLLDENIFKDW FMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILRDWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKWI KYHDNDVLYNDKSEYLAINYICNIEWTPRGTINYLQTARNILARDDNGLSNDQKYRLACNYCLEDSITNYAQKVNLASYL QTISIYSKPMVYFWTSHTYSTNIDSTTADVKTIDALVSDYNNRNRTNIDTNTYIFNILIEDNCHKAMNCVPIEYIWNRLS YEEQLKKITLAINKINNREFRSLLLSQLDYEQQKKIFQNSYFLSITLMRFLNDLLLSDYFLPIAYNALNIMPEKSFFYLI EAVADRIGPSLYSKIYDDNHYKFIFKELWQFAPKRLKEYVLECNNTDLIQNFIVFKLFLNDEINNDIDIAKLVLADANAT HKNNIMFCGSLQCGVKKCSDLIIKNQWNFLDTFIKLLISSTEDINTLKQELIKDHGYQITIHFYQKQEYDKAEHFLKWCL ESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEHYFQWCASNDLKIINELKESIPQKWFQEVIFKLIEQDQYELL DQILNWCFSNDQEKINNCKNSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDIY SVCIYQLQKYKFELADKSVSWAALSHEEIALFKNKLLGSEDIKYIVTYYLAEPDKLQLLIKWFSPSIYAITNFKEIISNK SYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNVENITSNDQSAVNAIGELALNI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101944; Mature: 101813
Theoretical pI: Translated: 6.30; Mature: 6.30
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.3 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 2.3 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLS CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH SHKKQRIQQSNLLDENIFKDWFMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILR HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCHHHHHH DWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKWIKYHDNDVLYNDKSEYLAIN HHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCEEEEE YICNIEWTPRGTINYLQTARNILARDDNGLSNDQKYRLACNYCLEDSITNYAQKVNLASY EEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQTISIYSKPMVYFWTSHTYSTNIDSTTADVKTIDALVSDYNNRNRTNIDTNTYIFNILI HHHHHHHCCCEEEEEECCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE EDNCHKAMNCVPIEYIWNRLSYEEQLKKITLAINKINNREFRSLLLSQLDYEQQKKIFQN ECCCHHHHCCEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC SYFLSITLMRFLNDLLLSDYFLPIAYNALNIMPEKSFFYLIEAVADRIGPSLYSKIYDDN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCC HYKFIFKELWQFAPKRLKEYVLECNNTDLIQNFIVFKLFLNDEINNDIDIAKLVLADANA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCC THKNNIMFCGSLQCGVKKCSDLIIKNQWNFLDTFIKLLISSTEDINTLKQELIKDHGYQI CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE TIHFYQKQEYDKAEHFLKWCLESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEH EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHH YFQWCASNDLKIINELKESIPQKWFQEVIFKLIEQDQYELLDQILNWCFSNDQEKINNCK HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH NSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDI HHHEEECCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH YSVCIYQLQKYKFELADKSVSWAALSHEEIALFKNKLLGSEDIKYIVTYYLAEPDKLQLL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHH IKWFSPSIYAITNFKEIISNKSYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNV HHHHCCCEEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENITSNDQSAVNAIGELALNI HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SKRKNENQISSTSNDNVYKKRKYDEKENSITKNTNLQKKRKYGEDENSVTNDDNIQSLS CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH SHKKQRIQQSNLLDENIFKDWFMVPLKHIASTNIVIRLWINQSTINQISNLFNHSADILR HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCHHHHHH DWRKLKNSINDKILMLQLPESITQQLVSINKFIGTELYKWIKYHDNDVLYNDKSEYLAIN HHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCEEEEE YICNIEWTPRGTINYLQTARNILARDDNGLSNDQKYRLACNYCLEDSITNYAQKVNLASY EEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQTISIYSKPMVYFWTSHTYSTNIDSTTADVKTIDALVSDYNNRNRTNIDTNTYIFNILI HHHHHHHCCCEEEEEECCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE EDNCHKAMNCVPIEYIWNRLSYEEQLKKITLAINKINNREFRSLLLSQLDYEQQKKIFQN ECCCHHHHCCEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC SYFLSITLMRFLNDLLLSDYFLPIAYNALNIMPEKSFFYLIEAVADRIGPSLYSKIYDDN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCC HYKFIFKELWQFAPKRLKEYVLECNNTDLIQNFIVFKLFLNDEINNDIDIAKLVLADANA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCC THKNNIMFCGSLQCGVKKCSDLIIKNQWNFLDTFIKLLISSTEDINTLKQELIKDHGYQI CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE TIHFYQKQEYDKAEHFLKWCLESDEKIKTFKKELASKEFSCKILESIVTSNKSDFIEIEH EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHH YFQWCASNDLKIINELKESIPQKWFQEVIFKLIEQDQYELLDQILNWCFSNDQEKINNCK HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH NSFYTTKRSNSYYCFSYLIYRLIEKDDSFQLLDKFVKWCFTDIQKINQFKKWILCPQDDI HHHEEECCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH YSVCIYQLQKYKFELADKSVSWAALSHEEIALFKNKLLGSEDIKYIVTYYLAEPDKLQLL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHH IKWFSPSIYAITNFKEIISNKSYYSYCSESLDRYLQECENIDHSIKNDVKDIVENLLLNV HHHHCCCEEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENITSNDQSAVNAIGELALNI HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA