Definition Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome.
Accession NC_010793
Length 2,008,987

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The map label for this gene is 189183529

Identifier: 189183529

GI number: 189183529

Start: 641860

End: 644685

Strand: Direct

Name: 189183529

Synonym: OTT_0622

Alternate gene names: NA

Gene position: 641860-644685 (Clockwise)

Preceding gene: 189183528

Following gene: 189183533

Centisome position: 31.95

GC content: 30.47

Gene sequence:

>2826_bases
ATGAAAATCAAACTTAAGAACGCTGTTGAGAAAGCTCTTGATCATCTATTAAAAAATCAAGAGCAGACAGCAGCCTGTAT
AATTTATTCAATTAGTAATAATGATTCTGTAGTATTCCAAATACTATTAAAGGAAATGAAAGTTCGGCAATATAATACAT
TAATACTACCTCAAAATCAGTGGAAAGCTTTAATTGAGCATTTTGCAATGCAAGATAAGTATCATTGGTCTCTAAGAGCG
CTAAGCCGACTTTTTCCATCGCTAATTACAGATTATGCATATGAAGCAGTACATTATGCAGCTTACTTTAAAGCAAACAA
AAATCTTAAGCTCCTATTAAATCCTAAATTTAATCTTGATCTCAATGCATTAAGTCCTGGTAATGGCAATACTATCCTTG
GTAATGCAATATTAGGTGGTAACCTAGAAGGTGTAAAGCTATTATTAAAAATGAATAGTGTAGACTATACAAAACCAAAT
AGTTGCAACTTTAGACCAATTCATGTTGCAATATGGAAGGATGAGATTGACGTTCAATCTCCACAATGTATATATACAAC
AACCCTTAGAATACATTATAGACTTAAAGGACAAACTAAACTATTAAATACTCATTGCAAATTCAAAGCTCAATCATTAC
AAATGCAGTTGTTTTCTCGGCAACTTTGTGAGAATCCATTCCAAATAGAAGATCATAATCAAAATGATTTTCAAACATGT
ACAATCCTTTTTATCAAAGTATTATCCTGCAAATCTCAAAAATATTTTCTAAAATTATTAGAATCTACTTCCAAAATATT
GACATCAAGCAGTTTTGGATTAGATCACAAAGGACATGTTCTAAACTTTCTATCTTTTTCTGCTACATGCTTTGAACTTA
CAGATAAGGCTCAAACAGCACTAGAGAATCTATTAAATACTGTTATTATTCCACAAAATGAAACCCTTATACAAATAGAT
AAACTTCATGCTCTATACTGTTATATGATATCTAGGGCTTGTAATGAACTAAATGTGGATAAAGCAAGTTATTACGCAGA
ATTACTATTTAATCCAGCAGCAGTAGTTAATCCAGAGGATAAAGCAGAAGCATGTATTAGTTTAGCATTTCTTTATGAAT
CACTATATATCTCACGTAAAGCTATATCCTATCTTGATAAAGCTATAGAAATTTGCAGATCCAGTTTATTACCAAGACTA
GCTACTAAATGTTTTAGAGCATTGGTTAATAAAATTAATATTTATCAAGCATGTAATAAGGAACAAGACGCAAACGAGTG
TATACAGCATGGTAGCTTACCTAAATCTTTGAAAGATTTGTGTTTAATAACTCAGCAATTAAAATTTAAACAACATACTT
CTTTCAAAGTTACAGATCTTGTAAAAGAAGTAGCTGAATTAGAAGAATTATCACGTATTAACTTTAATGATGCAGCTAGT
ATAGTGAAACATAATGAATTAAAAGAAAATCTAGGCTGGAAATATCAATACTTTGTTAATACTTATGTTTTTATATGTAC
TCATGCGCAAGATTTACAAACTCTCACCCATGCTATTCAAATTGCAGAATCTGGGCTGAATTTATTTCCTGACCCAGCAG
TAGCTTTCTCGATAATCAAAAACACGTTATCAATTTATGCTAAAGCAGAGTTATATGATGAAGGAATACAATTTTTACAA
AAATACAGCACACAATATCCTACATCACAACCGCATATATTATATCATAAATATGTACTATACAGTAATAGTGCTAATAG
TGCTAATAATGATAATAGTGCTAAACATGCTAAACATGCTAAACATGCTAAACGTAAGTTAGCAAGCAAATTTCTTAAAG
AACTTGAGCAAAAGTCACAGAATAGTAAAGTATGTTCAATTTTATACAGTAAAGCAAAAGAACTTGATCAAATTGTTATG
CAAAAAAAGATCAAGCATCAATCTGATAATGAAGATACAATATTAGCAGCATTACAAGCTTTGTTTCAGCAGGAAGTTAA
TTCAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTTGACAAGTATTCTTTGCAAGAAAATGTCGAGTACCAATCTAGTGATGAAGATA
GTATCTTAGAAGCATTAGCCGGGCTTTTTCAAGCAGAATCTCAAAATGAGATAGAGGTAGACTTAAATATTACACATTGG
CATATTGATGATCAAAGAATAATATCCTCTAATAATACTACATCCATAGCCAATAGCTCATCTTTTATAAACTCAAATGG
ATTATTTGCAATTATTGATGAAAAGATATTACGGCAGCTTGACATTGTTACAAAGCAACAATGTCAAGCTGCATTAGAAA
AAGGTATAATACATAGACAAAAAAAATGCAGTGGAATAAAAATTTTAAACCTGAAAGATAATAAGGTAATAGAATTAAAA
CTTGTTAGCAGGGATTTGCGCCTTATTGCTACTACTCTTTACATAAATCCAGAGAATAAAATTCTAATAATATTTAACAA
ATTAGCTACTCATTCTACTCTTCAAAAAAATATAGTCAAAAGTAAGTATATTACTAAAAACTCTATATGCCCTGTCAATT
GCAGTGAAGAAGATAAATTTAAAAATAGAACAGAAAAATCGTTCATACAACCAGAGGAAAGCACTGCTACTGCACAATCA
TGTTCATTAAGCGAACAAATTCATGCAAAAGTTGAAACCAAGTGCATGATTGATGAATTTACAACATTAGATATAACTGA
TACAAGCGATTTAGCAGAAAGTCATTGTGAAGATAATGAAGACAGAGAAATAGTAGGTAGCAGCGAAGATGAAGGCTTTT
TGTTATCTGGAAGAAGCTTATTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAGATAAACCAATGTTGAATTTTAGCTTTATCTTAACCTCCATTGCTTTTGAAAGCACTAATACTGAACAAGATTATTT
ATTTTATATAAAATTGTATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACAAGTTTGATATAAGAAATAGAGCATAAAGTAGATGGATTAAGCATTACAGCAATTTTAAAATAACTAATTATGTTTA
AGTATTCCTTACACAAAAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 941; Mature: 941

Protein sequence:

>941_residues
MKIKLKNAVEKALDHLLKNQEQTAACIIYSISNNDSVVFQILLKEMKVRQYNTLILPQNQWKALIEHFAMQDKYHWSLRA
LSRLFPSLITDYAYEAVHYAAYFKANKNLKLLLNPKFNLDLNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPN
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KYSTQYPTSQPHILYHKYVLYSNSANSANNDNSAKHAKHAKHAKRKLASKFLKELEQKSQNSKVCSILYSKAKELDQIVM
QKKIKHQSDNEDTILAALQALFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW
HIDDQRIISSNNTTSIANSSSFINSNGLFAIIDEKILRQLDIVTKQQCQAALEKGIIHRQKKCSGIKILNLKDNKVIELK
LVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVKSKYITKNSICPVNCSEEDKFKNRTEKSFIQPEESTATAQS
CSLSEQIHAKVETKCMIDEFTTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL

Sequences:

>Translated_941_residues
MKIKLKNAVEKALDHLLKNQEQTAACIIYSISNNDSVVFQILLKEMKVRQYNTLILPQNQWKALIEHFAMQDKYHWSLRA
LSRLFPSLITDYAYEAVHYAAYFKANKNLKLLLNPKFNLDLNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPN
SCNFRPIHVAIWKDEIDVQSPQCIYTTTLRIHYRLKGQTKLLNTHCKFKAQSLQMQLFSRQLCENPFQIEDHNQNDFQTC
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QKKIKHQSDNEDTILAALQALFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW
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LVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVKSKYITKNSICPVNCSEEDKFKNRTEKSFIQPEESTATAQS
CSLSEQIHAKVETKCMIDEFTTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL
>Mature_941_residues
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QKKIKHQSDNEDTILAALQALFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW
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LVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVKSKYITKNSICPVNCSEEDKFKNRTEKSFIQPEESTATAQS
CSLSEQIHAKVETKCMIDEFTTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107210; Mature: 107210

Theoretical pI: Translated: 7.00; Mature: 7.00

Prosite motif: PS50297 ANK_REP_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.7 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.7 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIKLKNAVEKALDHLLKNQEQTAACIIYSISNNDSVVFQILLKEMKVRQYNTLILPQNQ
CEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHH
WKALIEHFAMQDKYHWSLRALSRLFPSLITDYAYEAVHYAAYFKANKNLKLLLNPKFNLD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEECCCCCEE
LNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPNSCNFRPIHVAIWKDEIDVQS
EEEECCCCCCEEEECCEECCCCHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCC
PQCIYTTTLRIHYRLKGQTKLLNTHCKFKAQSLQMQLFSRQLCENPFQIEDHNQNDFQTC
CCEEEEEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCHHHHH
TILFIKVLSCKSQKYFLKLLESTSKILTSSSFGLDHKGHVLNFLSFSATCFELTDKAQTA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LENLLNTVIIPQNETLIQIDKLHALYCYMISRACNELNVDKASYYAELLFNPAAVVNPED
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KAEACISLAFLYESLYISRKAISYLDKAIEICRSSLLPRLATKCFRALVNKINIYQACNK
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHH
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LFQQEVNSEEEEEEEVDKYSLQENVEYQSSDEDSILEALAGLFQAESQNEIEVDLNITHW
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KKCSGIKILNLKDNKVIELKLVSRDLRLIATTLYINPENKILIIFNKLATHSTLQKNIVK
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HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECC
TTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL
EEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHH
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LNALSPGNGNTILGNAILGGNLEGVKLLLKMNSVDYTKPNSCNFRPIHVAIWKDEIDVQS
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HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEEECC
TTLDITDTSDLAESHCEDNEDREIVGSSEDEGFLLSGRSLL
EEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA