Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is spoIIE [H]

Identifier: 188584720

GI number: 188584720

Start: 92567

End: 95068

Strand: Direct

Name: spoIIE [H]

Synonym: Nther_0078

Alternate gene names: 188584720

Gene position: 92567-95068 (Clockwise)

Preceding gene: 188584719

Following gene: 188584721

Centisome position: 2.92

GC content: 34.41

Gene sequence:

>2502_bases
TTGGCTTATGAAACTGAATATATTAAAACTTATGAAAGAACCTATAAACAAGCTTATCAACCTTTAGATACTTCTAAAAG
TGCTACTCCACGTACAAAATTGTTGGTGACTTTTTGGGAAAAATTCCGTGAATTATTTATTAAATTATTTAACGGTGTCA
CAAGTTTATCAACTCTATATTTATTAACGGGTTTTTTACTTGGACGAGCTGAGGTTAGAGGTGGTCTAATACCATTGGTG
TTAGCATATTTACTAGCACTAAGGCTTGAAAAAGCCAGTTATTTTTCGGCTGCATTTATTGGGTCTCTAATAGGTATCCA
ATTGACCCACGGGATAGAAGGAACTGTTACTGTTATTATACCAGCAATGATTTATTTACTGTGGGAAAGAAGAAGTCTTG
GGAACAAACCAAAAATAGGAACTGTTATATTCGTTGCTTCTTTTATGGTAACTTCATGGTTTTACGGTGGACTGCCTGGA
AGTTTTCCTTTTAACCTGCTACCTTTAGCCATAGAGGGTGGTTTATTGGTAATCTTTGCTGTCTTGCTAATGCCTGGTTT
GCAATTTATTGAGTCAAAGAGGAAAACTGATAACATTGAAAAAGAAGAAATAGTTAGCATTATTTTGTTAGCATCCATGG
CTTTTATGGGTTTACAAGGTATTATGATTGGCCCTTATTCAATTCCAAGATTGGTGAGTTTATTAGCTGTGCTAATTGTT
GGATATAGGTATGGCGGAGGACAAGGTGCCGCGGCTGGCGCTATATTAGGCACTATAACTAGTTTCTATAGTCTGTCCCA
AATTAGCATTGGAGCGTTAACTTTAAGCGGTCTATTGGCTGGTATTTTTAAAGATTTTGGGAAGTTGAGCTCGACTTTTG
CATTCATTTTTTCATCTGGGTTAGTGGTATTTTACCTTGGAGAGCCCTTTGTTATGCTGCACTTTTTACAAGAAATTTTA
ATTATTTCTGTAATATTCTTAGTAATTCCTGAAAGATTTTTCTATAAAATTACACCTTCTCCAATCTCTCATGGATCTAA
AATGGTAAGTGATAGAAAGATGGATCAAATTATCAATCATAAATTTTATGAATTTGCTAGCTTATTCTCCGATATGGCTA
AAGTATTTGAACCTAATTCAAATGAACAAGATTATCATGACAGTAGTGAAATTGAAGATTTTGTCCAAACTGTAGTCAAC
CAGGTTTGTGGTGGATGTTCCAAAGTATCTTATTGTTGGGAGAAAAACTTTTTTGTAACTTATAAAAACTTTTTAAATGT
GATAAGCAAGGTGGATAGTGGAAAAAAATTACACAGAGACGAATTACCCGAATACTTACAAGAATCTTGTATTAGACCGT
CTTTACTATTGGAAAATGCTGGCAGTGTATTTGATGACTATCAATTAGAGCATAATAAGGCTAAAAGTAGTGCAGCAGAA
AATAAAAAATTATTATCTGAACAAATGTTTGCACTATCAGAACTTTTTAATAAAATGGCCAAGTTTAAAGTTGTTGATTC
CAGTAATAACAGGGAATTAGAACAAGAAATTAGATCGGCCATTGAAAACAAGAATTTTGTTTGTGAAGAAATTTGTGTAA
CAGGTAAGGTTCAAGAAGATTTAACTATAGAGCTAATAATAAATTGTTCCGGGACTAAACAAGAAGATATTAAAGAAATA
TCAACATTAGTATCAGAGGTCGTAGGTGAAAAACTGTCACCTGTAACTTGGGACCTATATCGTGAAGACTCCAAAATAAA
TAACCATTACTTTATAAGGTTAAGAGCAGAACAACAGTTGCAAGTTATTACTGGTTGTATCCAGATCAATAAAGAAGGTG
AACCTTTATCTGGAGATACTTACATGTCAAGGGAGCTATCAACTGGAGAACACTTGCTATTATTAAGTGATGGAATGGGG
TCTGGGTCTAAAGCTAACGAGGAAAGTGAAGCCACTGTTAACTTAATTACTAAATTACTAAATTATGGTTATGATAAACA
AATGGTGATAAGGTCGGTTAACTCGCTATTAGCTACTATCAATCGAGTAGATAGTTTTGCCACAGTAGATATGGCGTTAA
TTGACTTGTATACTGGTATTGGGGAATTTTGCAAGGCGGGAGCTGTTTCTTCCTTTATTTCAACTGCTGAAGGGGTAGAA
AAGGTAGAAGCTTCCTCGTTACCTGCTGGTATCATAGAGTCAGTTGAACCTAAAAAAATGACATATAGTTTAAAACCAGG
CGATTATTTATATATGGTGAGTGATGGTGTCTTTGATATGGGTGACGGTGAAAAATGGTTTGAGAAAGCAATTTCTAATT
TAAAATCAAAGGACCCCCAAGAAATGGCAGAAGAACTCCTGGAAAAAGTGAAGCGCAGATATAGTTATGGAGACTTCCCT
GACGATGTAACTATTTTAATCGCTAAAATCACAAGTAATTCTAAGGAATCTGAATTGGACTCTCAAACTATGGGATTAGA
TATATGGGAAAAGATAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAAAAAAATTTGACTTATACTAAAGTTTTGACATTCTTCCAGTTCCTCACCCTTTATAATTGTTAAGCACACAATCAAA
GTTTAAGGTGGGTGAGGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAGCAGGAATTAAATAAAAAATGACGAATTAACGTATATATGAAAGGATAGTATGAGGGGATTACTATGAAAGAAAA
AGTTTATCAAAACATTTTTG

Product: stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase

Products: NA

Alternate protein names: Stage II sporulation protein H [H]

Number of amino acids: Translated: 833; Mature: 832

Protein sequence:

>833_residues
MAYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLYLLTGFLLGRAEVRGGLIPLV
LAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVIIPAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPG
SFPFNLLPLAIEGGLLVIFAVLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV
GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSGLVVFYLGEPFVMLHFLQEIL
IISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINHKFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVN
QVCGGCSKVSYCWEKNFFVTYKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE
NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQEDLTIELIINCSGTKQEDIKEI
STLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQLQVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMG
SGSKANEESEATVNLITKLLNYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE
KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQEMAEELLEKVKRRYSYGDFP
DDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN

Sequences:

>Translated_833_residues
MAYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLYLLTGFLLGRAEVRGGLIPLV
LAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVIIPAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPG
SFPFNLLPLAIEGGLLVIFAVLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV
GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSGLVVFYLGEPFVMLHFLQEIL
IISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINHKFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVN
QVCGGCSKVSYCWEKNFFVTYKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE
NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQEDLTIELIINCSGTKQEDIKEI
STLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQLQVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMG
SGSKANEESEATVNLITKLLNYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE
KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQEMAEELLEKVKRRYSYGDFP
DDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN
>Mature_832_residues
AYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLYLLTGFLLGRAEVRGGLIPLVL
AYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVIIPAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPGS
FPFNLLPLAIEGGLLVIFAVLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIVG
YRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSGLVVFYLGEPFVMLHFLQEILI
ISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINHKFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVNQ
VCGGCSKVSYCWEKNFFVTYKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAEN
KKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQEDLTIELIINCSGTKQEDIKEIS
TLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQLQVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMGS
GSKANEESEATVNLITKLLNYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVEK
VEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQEMAEELLEKVKRRYSYGDFPD
DVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN

Specific function: Normally needed for pro-sigma E processing during sporulation but can be bypassed in vegetative cells. Activates spoIIAA by dephosphorylation [H]

COG id: COG2208

COG function: function code TK; Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Note=Polar septum [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 PP2C-like domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001932
- InterPro:   IPR014221
- InterPro:   IPR010822 [H]

Pfam domain/function: PF07228 SpoIIE [H]

EC number: =3.1.3.16 [H]

Molecular weight: Translated: 93003; Mature: 92872

Theoretical pI: Translated: 4.94; Mature: 4.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLTGFLLGRAEVRGGLIPLVLAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVII
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHH
PAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPGSFPFNLLPLAIEGGLLVIFA
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHH
VLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV
HHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHH
GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSG
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LVVFYLGEPFVMLHFLQEILIISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINH
CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVNQVCGGCSKVSYCWEKNFFVT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEEE
YKNFLNVISKVDSGKKLHRDELPEYLQESCIRPSLLLENAGSVFDDYQLEHNKAKSSAAE
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKKLLSEQMFALSELFNKMAKFKVVDSSNNRELEQEIRSAIENKNFVCEEICVTGKVQED
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCC
LTIELIINCSGTKQEDIKEISTLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQL
CEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEECHHHH
QVITGCIQINKEGEPLSGDTYMSRELSTGEHLLLLSDGMGSGSKANEESEATVNLITKLL
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
NYGYDKQMVIRSVNSLLATINRVDSFATVDMALIDLYTGIGEFCKAGAVSSFISTAEGVE
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQ
HHHHHCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH
EMAEELLEKVKRRYSYGDFPDDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
AYETEYIKTYERTYKQAYQPLDTSKSATPRTKLLVTFWEKFRELFIKLFNGVTSLSTLY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLTGFLLGRAEVRGGLIPLVLAYLLALRLEKASYFSAAFIGSLIGIQLTHGIEGTVTVII
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PAMIYLLWERRSLGNKPKIGTVIFVASFMVTSWFYGGLPGSFPFNLLPLAIEGGLLVIFA
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHCCCHHHHHH
VLLMPGLQFIESKRKTDNIEKEEIVSIILLASMAFMGLQGIMIGPYSIPRLVSLLAVLIV
HHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHH
GYRYGGGQGAAAGAILGTITSFYSLSQISIGALTLSGLLAGIFKDFGKLSSTFAFIFSSG
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LVVFYLGEPFVMLHFLQEILIISVIFLVIPERFFYKITPSPISHGSKMVSDRKMDQIINH
CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KFYEFASLFSDMAKVFEPNSNEQDYHDSSEIEDFVQTVVNQVCGGCSKVSYCWEKNFFVT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEEE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCC
LTIELIINCSGTKQEDIKEISTLVSEVVGEKLSPVTWDLYREDSKINNHYFIRLRAEQQL
CEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEECHHHH
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HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVEASSLPAGIIESVEPKKMTYSLKPGDYLYMVSDGVFDMGDGEKWFEKAISNLKSKDPQ
HHHHHCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCHH
EMAEELLEKVKRRYSYGDFPDDVTILIAKITSNSKESELDSQTMGLDIWEKIN
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 8830262; 9384377; 2832371; 8113187; 7570023 [H]