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The map label for this gene is yoeA [H]

Identifier: 187935384

GI number: 187935384

Start: 1648025

End: 1649398

Strand: Reverse

Name: yoeA [H]

Synonym: CLL_A1589

Alternate gene names: 187935384

Gene position: 1649398-1648025 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187932452

Following gene: 187934272

Centisome position: 43.4

GC content: 29.62

Gene sequence:

>1374_bases
ATGACAAAAGATATGACAAATGGAAATCCAACTAAGTTAATACTATTTTTTTCTATTCCCTTATTAATAGGAAATATATT
TCAACAACTTTATAGTATGGTTGATACTATTATTGTTGGAAGATTTTTAGGTATACAATCGCTTGCTGCCGTTGGAGCTA
CAGGTTCTATATTCTTTTTAATAATAGGGTTTATAGTTGGAATTGCCAGTGGATTTTCAGTTATTGTTTCTCAAAAATTC
GGTGCTAATGATGAAGAGGGTGTAAGAAATTCTGTTGCAACCTCTATAATGCTATGTATCATCATAACCATAATAATAAC
TACTTTAAGTCTTTTATTTTCTAAATCAATGCTAAATTTACTAAATACACCAGAAGATATTATAAATAGTGCTAATGCCT
ATATAAGTATAATTTATGCTGGAATTGGTGCTACCTTTTTCTATAATATGATTTCAGGTATATTAAGAGCTCTAGGTGAT
AGTAAAACACCATTGTACTTTTTAATTATTTCTTCAATTTTAAATATAATCTTAGACTTAGTGTTTATACTTAATCTATC
CATGGGGGTAGCTGGAGCAGCATATGCTACAGTAATTTCTCAAGCTATTTCTGGCATATTATGCTTGATCTATGTTTATA
AAAAATTTCCTATCTTAAAATTAAAAAAACACAATTGGAAATTTGATAAAAAATTTGCAATTGAACATCTAAATATAGGA
CTACCTATGGCTCTTCAATTTTCAATTACAGCAATTGGAGTTATGGTTATCCAAAGATCTCTTAATGCATTTGGTTCAAC
TATTATAGCTGCTTATACAGCCTCTTCTAAGGTTGAACAACTTGTAATGCAACCAGCTATTACTTTTGGAATAACTATGG
CAACTTATGCTGGTCAAAACTTAGGTGCTGGCAAAATTCATCGTATAAAAGAAGGCGTAAAAAAATGCTGTATTATTTCA
ACAATTATAAGTGTTATAGCCGGAATAATTGTTGTTTTATTTGGGAAATCTTTCACAAAATTATTTATTGATACTCCAGA
TCCTAATGTTTTAGCAGCATCACAACATTACCTTAACATAGTTTCTGTATTTTTTATTTTCCTTGGATTACTATTTATAT
ATAGAAATACTTTACAAGGAATTGGCGATGGCTTTGTGCCTATGATGGCTGGTGTAGCTGAATTATTAGTAAGAGTTATT
GTAGCATTCACATTGCCTACAATAATTGGATATACTGGTATATGTTTAGCAAGTCCAATAGCTTGGATTGCAGCTTGCAT
ACCTCTAGCCATAAAATACTATAAAACTATAAATAAGATGAGTATTAATAATTCAGATTATTTAAAAACAGAATCAACTC
AGCTTCTTGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTATTATTTTATATATAACTTAACCTGTATAATATAGAATTACTAATAATTTTAGATCTCATACTTATTTAATAATT
TTTTCGAAAGGAGATAACTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAATAGTATTTTAAATAAATTCCTTGGATAAAGTAAATATTCCAAGGAGTTTTATTTTACTACTTTATAATATTATA
AACGACCAACTTACAGTCTT

Product: Na+-driven multidrug efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 457; Mature: 456

Protein sequence:

>457_residues
MTKDMTNGNPTKLILFFSIPLLIGNIFQQLYSMVDTIIVGRFLGIQSLAAVGATGSIFFLIIGFIVGIASGFSVIVSQKF
GANDEEGVRNSVATSIMLCIIITIIITTLSLLFSKSMLNLLNTPEDIINSANAYISIIYAGIGATFFYNMISGILRALGD
SKTPLYFLIISSILNIILDLVFILNLSMGVAGAAYATVISQAISGILCLIYVYKKFPILKLKKHNWKFDKKFAIEHLNIG
LPMALQFSITAIGVMVIQRSLNAFGSTIIAAYTASSKVEQLVMQPAITFGITMATYAGQNLGAGKIHRIKEGVKKCCIIS
TIISVIAGIIVVLFGKSFTKLFIDTPDPNVLAASQHYLNIVSVFFIFLGLLFIYRNTLQGIGDGFVPMMAGVAELLVRVI
VAFTLPTIIGYTGICLASPIAWIAACIPLAIKYYKTINKMSINNSDYLKTESTQLLG

Sequences:

>Translated_457_residues
MTKDMTNGNPTKLILFFSIPLLIGNIFQQLYSMVDTIIVGRFLGIQSLAAVGATGSIFFLIIGFIVGIASGFSVIVSQKF
GANDEEGVRNSVATSIMLCIIITIIITTLSLLFSKSMLNLLNTPEDIINSANAYISIIYAGIGATFFYNMISGILRALGD
SKTPLYFLIISSILNIILDLVFILNLSMGVAGAAYATVISQAISGILCLIYVYKKFPILKLKKHNWKFDKKFAIEHLNIG
LPMALQFSITAIGVMVIQRSLNAFGSTIIAAYTASSKVEQLVMQPAITFGITMATYAGQNLGAGKIHRIKEGVKKCCIIS
TIISVIAGIIVVLFGKSFTKLFIDTPDPNVLAASQHYLNIVSVFFIFLGLLFIYRNTLQGIGDGFVPMMAGVAELLVRVI
VAFTLPTIIGYTGICLASPIAWIAACIPLAIKYYKTINKMSINNSDYLKTESTQLLG
>Mature_456_residues
TKDMTNGNPTKLILFFSIPLLIGNIFQQLYSMVDTIIVGRFLGIQSLAAVGATGSIFFLIIGFIVGIASGFSVIVSQKFG
ANDEEGVRNSVATSIMLCIIITIIITTLSLLFSKSMLNLLNTPEDIINSANAYISIIYAGIGATFFYNMISGILRALGDS
KTPLYFLIISSILNIILDLVFILNLSMGVAGAAYATVISQAISGILCLIYVYKKFPILKLKKHNWKFDKKFAIEHLNIGL
PMALQFSITAIGVMVIQRSLNAFGSTIIAAYTASSKVEQLVMQPAITFGITMATYAGQNLGAGKIHRIKEGVKKCCIIST
IISVIAGIIVVLFGKSFTKLFIDTPDPNVLAASQHYLNIVSVFFIFLGLLFIYRNTLQGIGDGFVPMMAGVAELLVRVIV
AFTLPTIIGYTGICLASPIAWIAACIPLAIKYYKTINKMSINNSDYLKTESTQLLG

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=415, Percent_Identity=23.3734939759036, Blast_Score=74, Evalue=2e-14,
Organism=Escherichia coli, GI1790477, Length=396, Percent_Identity=23.2323232323232, Blast_Score=68, Evalue=2e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49497; Mature: 49366

Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKDMTNGNPTKLILFFSIPLLIGNIFQQLYSMVDTIIVGRFLGIQSLAAVGATGSIFFL
CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
IIGFIVGIASGFSVIVSQKFGANDEEGVRNSVATSIMLCIIITIIITTLSLLFSKSMLNL
HHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNTPEDIINSANAYISIIYAGIGATFFYNMISGILRALGDSKTPLYFLIISSILNIILDL
HCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VFILNLSMGVAGAAYATVISQAISGILCLIYVYKKFPILKLKKHNWKFDKKFAIEHLNIG
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCC
LPMALQFSITAIGVMVIQRSLNAFGSTIIAAYTASSKVEQLVMQPAITFGITMATYAGQN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LGAGKIHRIKEGVKKCCIISTIISVIAGIIVVLFGKSFTKLFIDTPDPNVLAASQHYLNI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEECCCCCEEECHHHHHHH
VSVFFIFLGLLFIYRNTLQGIGDGFVPMMAGVAELLVRVIVAFTLPTIIGYTGICLASPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AWIAACIPLAIKYYKTINKMSINNSDYLKTESTQLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TKDMTNGNPTKLILFFSIPLLIGNIFQQLYSMVDTIIVGRFLGIQSLAAVGATGSIFFL
CCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
IIGFIVGIASGFSVIVSQKFGANDEEGVRNSVATSIMLCIIITIIITTLSLLFSKSMLNL
HHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNTPEDIINSANAYISIIYAGIGATFFYNMISGILRALGDSKTPLYFLIISSILNIILDL
HCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VFILNLSMGVAGAAYATVISQAISGILCLIYVYKKFPILKLKKHNWKFDKKFAIEHLNIG
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCC
LPMALQFSITAIGVMVIQRSLNAFGSTIIAAYTASSKVEQLVMQPAITFGITMATYAGQN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LGAGKIHRIKEGVKKCCIISTIISVIAGIIVVLFGKSFTKLFIDTPDPNVLAASQHYLNI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEECCCCCEEECHHHHHHH
VSVFFIFLGLLFIYRNTLQGIGDGFVPMMAGVAELLVRVIVAFTLPTIIGYTGICLASPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AWIAACIPLAIKYYKTINKMSINNSDYLKTESTQLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]