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The map label for this gene is yeeO [C]

Identifier: 187918340

GI number: 187918340

Start: 497907

End: 499253

Strand: Direct

Name: yeeO [C]

Synonym: BH0473

Alternate gene names: 187918340

Gene position: 497907-499253 (Clockwise)

Preceding gene: 187918339

Following gene: 187918342

Centisome position: 53.98

GC content: 30.22

Gene sequence:

>1347_bases
ATGTCAATAAGTAGGACTAAAATTAGAAAATTAATATTGGAAGACAATTTATATCGAGTGCTTTTAGTTATCAGTTTTCC
TATCGTGGCAACTAATGTGTTTCAGGCTTTTTATGAATTTGCAGATATGTTTTATGTTGGGAAGCTTGGGGCTATGCCGC
TTGCTGCATTATCTCTTACTGGGCCTATTAATTTCCTTATTATGGTTTTTGCTATGGGAATGGCTACAGGAAGCGTATCG
TTAATGTCTAGATGTATTGGGGAAGAGACTTTTGCTAAGTTTTCAAAATATGCAGGGCAATTGATATTTTTAAATTTTGT
ATTGTCTTTATTTGTTACAGTTTTAGTTTTAATATTTATAGATCTTATTTTAGATGTTATGGGTGTAAGTGGCGAGCTTA
AAGAGCTTGCAAAATCTTATTTTTATGTTGTAATCTATGCGATACCCATAATGTTTTTAAGTATTGCTGTTGTATACATA
TTAAATGCTCAAGGCGAGACTGTCATTTCAATGATGCTAATTTTGGTTGCAAATATTATTAATTTTATTCTTGATCCAAT
TTTAATGTTTACTTGTAATTTAGGTATTGCTGGTGCTGCTTGGTCTACTCTTTTTGCAAAATTAATGACAGTTTTTTCTT
ATCTTTTTTTTACTTATAGACTAAATTGTGGACTTAAAGTGCGCTTAAAGGATATTGTTCCAGATATTGCTATAATAAAA
AATATTATTAACTTAGGTCTTCCAGCGGCTTTTGGCCATGTTATGGCTTCTTTGTCGTTTTTAATTTTTAATTATATTGT
AATTCAAATTGGCTCAAAATTTTTAGCTGCTTATGGCATGGCCAATAATATTATTTCTTTTTTACTTCTTCCTGGAATGA
GTATTGGTACTGGAATTGTTTCAATTGTTGGACAAAATCTTGGTGCAAAAAATATTAGCAGGGTAGAAGATACTTTAAAA
AAGGGATTTCTTGTTACCTTAATAATAATGATCACAGTTGCATCGTTCATAATATCTTTTAGAGAGATTATAATAAAGAT
TTTCACAGATGATTTAGAAGTTTTTGATTATGCTAATCGTTATTTATTATTGGCATCAATTGGAACTGTTGGATTTGGAT
TGCAACAAGTTTTTTTTGGAGGATTGATAGGCGTAGGACTTACAAAGATTGTTATGATTGTTAGTTGTATTCGTCTTTGG
ATTGTTCGCTTGCCAGTTGTGTTTATCTTTCAATATTTTGGAGTTATAGAAGATTCGTTGGGATATGCTTTTATAATTTC
AAATTATGTGGCTTTAATTATTGTGTTGTGTTTGACTTTTACTAGATATTGGATGAAAATACAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCTATTTTATTTATTTGTTTTTTTAGAGTTGAATAAAAGCGTGCTTTTTCATAAAACTTGCCAATTTGTCAGTATAAT
AGAATGCAAGGTATATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTAATTTATAAATTGGGATTGATTTACATCATATTTTAACTTAAGTTCTTTAGTTCAAGATGCTAAGGGCTTGCCAAA
GAGCATTATTTTTAATAATT

Product: Na+ driven multidrug efflux pump

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 448; Mature: 447

Protein sequence:

>448_residues
MSISRTKIRKLILEDNLYRVLLVISFPIVATNVFQAFYEFADMFYVGKLGAMPLAALSLTGPINFLIMVFAMGMATGSVS
LMSRCIGEETFAKFSKYAGQLIFLNFVLSLFVTVLVLIFIDLILDVMGVSGELKELAKSYFYVVIYAIPIMFLSIAVVYI
LNAQGETVISMMLILVANIINFILDPILMFTCNLGIAGAAWSTLFAKLMTVFSYLFFTYRLNCGLKVRLKDIVPDIAIIK
NIINLGLPAAFGHVMASLSFLIFNYIVIQIGSKFLAAYGMANNIISFLLLPGMSIGTGIVSIVGQNLGAKNISRVEDTLK
KGFLVTLIIMITVASFIISFREIIIKIFTDDLEVFDYANRYLLLASIGTVGFGLQQVFFGGLIGVGLTKIVMIVSCIRLW
IVRLPVVFIFQYFGVIEDSLGYAFIISNYVALIIVLCLTFTRYWMKIQ

Sequences:

>Translated_448_residues
MSISRTKIRKLILEDNLYRVLLVISFPIVATNVFQAFYEFADMFYVGKLGAMPLAALSLTGPINFLIMVFAMGMATGSVS
LMSRCIGEETFAKFSKYAGQLIFLNFVLSLFVTVLVLIFIDLILDVMGVSGELKELAKSYFYVVIYAIPIMFLSIAVVYI
LNAQGETVISMMLILVANIINFILDPILMFTCNLGIAGAAWSTLFAKLMTVFSYLFFTYRLNCGLKVRLKDIVPDIAIIK
NIINLGLPAAFGHVMASLSFLIFNYIVIQIGSKFLAAYGMANNIISFLLLPGMSIGTGIVSIVGQNLGAKNISRVEDTLK
KGFLVTLIIMITVASFIISFREIIIKIFTDDLEVFDYANRYLLLASIGTVGFGLQQVFFGGLIGVGLTKIVMIVSCIRLW
IVRLPVVFIFQYFGVIEDSLGYAFIISNYVALIIVLCLTFTRYWMKIQ
>Mature_447_residues
SISRTKIRKLILEDNLYRVLLVISFPIVATNVFQAFYEFADMFYVGKLGAMPLAALSLTGPINFLIMVFAMGMATGSVSL
MSRCIGEETFAKFSKYAGQLIFLNFVLSLFVTVLVLIFIDLILDVMGVSGELKELAKSYFYVVIYAIPIMFLSIAVVYIL
NAQGETVISMMLILVANIINFILDPILMFTCNLGIAGAAWSTLFAKLMTVFSYLFFTYRLNCGLKVRLKDIVPDIAIIKN
IINLGLPAAFGHVMASLSFLIFNYIVIQIGSKFLAAYGMANNIISFLLLPGMSIGTGIVSIVGQNLGAKNISRVEDTLKK
GFLVTLIIMITVASFIISFREIIIKIFTDDLEVFDYANRYLLLASIGTVGFGLQQVFFGGLIGVGLTKIVMIVSCIRLWI
VRLPVVFIFQYFGVIEDSLGYAFIISNYVALIIVLCLTFTRYWMKIQ

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=401, Percent_Identity=21.6957605985037, Blast_Score=79, Evalue=7e-16,
Organism=Escherichia coli, GI48994890, Length=416, Percent_Identity=21.1538461538462, Blast_Score=70, Evalue=4e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49781; Mature: 49650

Theoretical pI: Translated: 9.14; Mature: 9.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
5.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SISRTKIRKLILEDNLYRVLLVISFPIVATNVFQAFYEFADMFYVGKLGAMPLAALSLT
CCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC
GPINFLIMVFAMGMATGSVSLMSRCIGEETFAKFSKYAGQLIFLNFVLSLFVTVLVLIFI
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLILDVMGVSGELKELAKSYFYVVIYAIPIMFLSIAVVYILNAQGETVISMMLILVANII
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NFILDPILMFTCNLGIAGAAWSTLFAKLMTVFSYLFFTYRLNCGLKVRLKDIVPDIAIIK
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHCCHHHHHH
NIINLGLPAAFGHVMASLSFLIFNYIVIQIGSKFLAAYGMANNIISFLLLPGMSIGTGIV
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SIVGQNLGAKNISRVEDTLKKGFLVTLIIMITVASFIISFREIIIKIFTDDLEVFDYANR
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
YLLLASIGTVGFGLQQVFFGGLIGVGLTKIVMIVSCIRLWIVRLPVVFIFQYFGVIEDSL
EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GYAFIISNYVALIIVLCLTFTRYWMKIQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]