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The map label for this gene is uvrA

Identifier: 170762395

GI number: 170762395

Start: 127734

End: 130565

Strand: Direct

Name: uvrA

Synonym: UPA3_0105

Alternate gene names: 170762395

Gene position: 127734-130565 (Clockwise)

Preceding gene: 170761898

Following gene: 170762072

Centisome position: 16.99

GC content: 29.63

Gene sequence:

>2832_bases
ATGGACAAAATTATCATTAAAGGCGCTAGAGAAAATAATTTAAAAAATATTGATCTAGAAATTCCTAAAAATAAACTAGT
TGTTATTACAGGTGTTTCAGGATCAGGTAAATCATCGCTTGCTTTTGATACGATTTTTGCTGAAGGAAAACGTCGTTATT
TTGAATCACTTTCAAGTTATGCCCGCCAGTTTTTAGGTGGAAATGATAAAGCTGATGTTGAAAGTATTGAAGGTTTATCA
CCAACCATTGCTGTTGATCAAAAATCAACAAATCAAAATCCAAGATCAATTGTTGGGACAATTACAGAAATCTATGATTA
TTTACGAGTTTTATTTGCTCGTGTTGGAACACCTTTTTGTCCAAATGGGCATGGTCAAATTAAATCACAAACTCCAAAAC
AAATTGCTGATTTCTTATTTAGCTTATCACCTAAAAGTAAAATACAAATTCTTGCACCAATTGAAATTAAAAAAGGTTAT
AAAATTAATGATGTTTTAAATAATTTAAGAAATCAAGGTTATTTAAGAGTTTTAGTTAATAATGAAGTTTATCAATTAGA
TGAAAATTTGCCTCAATTTTTAGATAACAAAAAAACAGATGTTGCAATCATTGTTGATCGTTTAATTTTAAATATTGATC
ACCAAACAAAAACACGAGCACTAGATGCTATTGAATTTGCTTTAAATTATAGTGGGGGAGAAATTGCATTTAAGGTTAAT
GATGATATTCATTACTTTACACAAAACGATGTTTGTCAAGTTTGTGGTTTTAAAATTAAAGAAATTGAACCAACATTATT
TTCATTTAATTCACCAATTGGTGCTTGTGAACAGTGTAAAGGGCTAGGATATAATTATGTTCCTGATGAGCGTAAAATGA
TCCCTAATCCAAATTTATCAATTAACGAAGGCGGTTTAGATTATTTTAAAAACACTGTTAATACAACTAATCTTGATTGA
CAACGTTTTAATTCAATTATTAAACACTATAAAATTGATAAAACTAAACCTTTAAAAGAATTAGATCGTAAAGAAATAGA
TTTATTACTATATGGATCAGATGAAGCAATTGAGATTGATATAACTTCTGCAAATAATAAAAAGTATTCATCAATAGATT
ATGTTGAGGGGGTTTTAGAATTAGTTAATCGTCGTTATCAAGAGACATCAAGTGAATTAGCCCGTGAACATTACAATAAA
TACATGAGTGAAAAAGTTTGTAAATCATGTAAAGGCAAAAAACTATCTTCACAAGCTTTATCGGTTTTAATTAATAAAAT
TAACATTATTGATTTTATTGAAAAAAACATTGATGAGGCGATTGATTTTTTATTACACTTAGATTTGAATGAAGCACAAA
CAAAAATTGCCAATCCAATTTTAAAAGAAGTTTTAGATCGTTTAGGATTTTTAAAAAATGTTGGTTTAGAATATTTAACT
TTAGCTCGTCCTGCATCAAGTTTATCAGGGGGCGAAGCACAACGGATTCGTTTAGCCACTCAAATCGGCTCTAAACTAAC
AGGTATTTTATATGTACTTGATGAACCATCAATTGGTTTGCATCAACGCGATAACGATAAATTAATTAATACATTAAAAG
AAATGCGTGATTTAGGTAATACAGTTATAGTTGTTGAACATGATGAAGAAACAATGCTAGCAGCTGATTATTTAATAGAT
ATTGGTCCTCAAGCTGGAGTTAATGGTGGTTATGTAATAGCAGCTGGAACACCACAAGAAGTAATGCAAAATCCTAATTC
ACTAACAGGACAATATTTATCAAAACAAAAAGATATTTTAGTTCCTAAAACACGAAGAAGTGGTAATGGTCATAAAGTTA
TTTTAAAAGGTGCAAAACATAATAATTTAAAAAATGTTGATTTAACAATTCCTTTAGGTAAATTCATTTGTGTTACTGGA
GTTTCAGGATCTGGTAAATCATCACTAATTTTAGAAACATTAGTTAAAGCTATTGAATACACTAATTTTAATCCTTTTGT
AATTCCAGGCGAGTATAAAGATTTAATTGGCGCATCGAATGTTGATAAAATCGTTGTCGTTAATCAAGATGCAATTGGTA
GAACTACGAGATCAAATCCAGCTACTTATGTTGGGGTATTTGATGATATTAGAACAGTATTTGAAAATACAATTGAAGCT
AAAGCACGTGGCTATAGTAAAAGTCGTTTTTCTTTTAATATTAAAGGAGGCCGTTGTGAACGTTGTTGGGGGGATGGTAC
GATTCGCATTGAGATGCACTTTTTACCAGATGTTTATATAAGTTGTGAAGAATGTCATGGAAAACGTTATAACGATGAAA
CACTTCAAGTTAAATTTAAAGGTAAATCAATTTATGATGTACTAAAAATGCCAATCGATGAAGCTTTAGTATTTTTTGAA
AATTATCCTGGTATTCATCGTAAACTACAATTATTAGTTGATGTTGGTTTAGGATATTTAGAGTTAGGAGCCTCTTCAAC
TTCATTATCAGGGGGCGAAGCACAACGTATTAAGTTAGCTAAGTTTTTACAACGTAAGCCAACAGGAAAAACATTATTTG
TTTTAGATGAACCAACAACAGGACTGCATATTGATGATGTAGCTAAATTAATTAAAATTTTAGATAAAATTGTTGATGGA
GGAGACACTGTTTTAGTTATAGAACACAATCTTGATTTAATTAAGGTTGCAGATTATATTATTGATATTGGCCCTGAAGG
TGGTAATAAAGGTGGTAAAATTATAGCTACTGGTACTCCAGAGCAATTACTAAGTAAAAAGGACATATCTTATACTGCTC
AATATTTAGAAAAGTATTTAAAAAAGAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATATGTTTTTTATATTATATATTAAATTGTTATCATTTAAAATGATATAAATAAAATACAATTTTTATTATTAAAAAC
AATAACTATTAGGTATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTATGAAACATAAGACAAAAAAAATAACGCTTTTAATAGCAGGAATTACTTTAACTTCATTATGTACAATTTTTGCTA
TTACAGCTTGTAGTAAGCAA

Product: excinuclease ABC subunit A

Products: NA

Alternate protein names: UvrA protein; Excinuclease ABC subunit A [H]

Number of amino acids: Translated: 943; Mature: 943

Protein sequence:

>943_residues
MDKIIIKGARENNLKNIDLEIPKNKLVVITGVSGSGKSSLAFDTIFAEGKRRYFESLSSYARQFLGGNDKADVESIEGLS
PTIAVDQKSTNQNPRSIVGTITEIYDYLRVLFARVGTPFCPNGHGQIKSQTPKQIADFLFSLSPKSKIQILAPIEIKKGY
KINDVLNNLRNQGYLRVLVNNEVYQLDENLPQFLDNKKTDVAIIVDRLILNIDHQTKTRALDAIEFALNYSGGEIAFKVN
DDIHYFTQNDVCQVCGFKIKEIEPTLFSFNSPIGACEQCKGLGYNYVPDERKMIPNPNLSINEGGLDYFKNTVNTTNLDW
QRFNSIIKHYKIDKTKPLKELDRKEIDLLLYGSDEAIEIDITSANNKKYSSIDYVEGVLELVNRRYQETSSELAREHYNK
YMSEKVCKSCKGKKLSSQALSVLINKINIIDFIEKNIDEAIDFLLHLDLNEAQTKIANPILKEVLDRLGFLKNVGLEYLT
LARPASSLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGILYVLDEPSIGLHQRDNDKLINTLKEMRDLGNTVIVVEHDEETMLAADYLID
IGPQAGVNGGYVIAAGTPQEVMQNPNSLTGQYLSKQKDILVPKTRRSGNGHKVILKGAKHNNLKNVDLTIPLGKFICVTG
VSGSGKSSLILETLVKAIEYTNFNPFVIPGEYKDLIGASNVDKIVVVNQDAIGRTTRSNPATYVGVFDDIRTVFENTIEA
KARGYSKSRFSFNIKGGRCERCWGDGTIRIEMHFLPDVYISCEECHGKRYNDETLQVKFKGKSIYDVLKMPIDEALVFFE
NYPGIHRKLQLLVDVGLGYLELGASSTSLSGGEAQRIKLAKFLQRKPTGKTLFVLDEPTTGLHIDDVAKLIKILDKIVDG
GDTVLVIEHNLDLIKVADYIIDIGPEGGNKGGKIIATGTPEQLLSKKDISYTAQYLEKYLKKN

Sequences:

>Translated_943_residues
MDKIIIKGARENNLKNIDLEIPKNKLVVITGVSGSGKSSLAFDTIFAEGKRRYFESLSSYARQFLGGNDKADVESIEGLS
PTIAVDQKSTNQNPRSIVGTITEIYDYLRVLFARVGTPFCPNGHGQIKSQTPKQIADFLFSLSPKSKIQILAPIEIKKGY
KINDVLNNLRNQGYLRVLVNNEVYQLDENLPQFLDNKKTDVAIIVDRLILNIDHQTKTRALDAIEFALNYSGGEIAFKVN
DDIHYFTQNDVCQVCGFKIKEIEPTLFSFNSPIGACEQCKGLGYNYVPDERKMIPNPNLSINEGGLDYFKNTVNTTNLD*
QRFNSIIKHYKIDKTKPLKELDRKEIDLLLYGSDEAIEIDITSANNKKYSSIDYVEGVLELVNRRYQETSSELAREHYNK
YMSEKVCKSCKGKKLSSQALSVLINKINIIDFIEKNIDEAIDFLLHLDLNEAQTKIANPILKEVLDRLGFLKNVGLEYLT
LARPASSLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGILYVLDEPSIGLHQRDNDKLINTLKEMRDLGNTVIVVEHDEETMLAADYLID
IGPQAGVNGGYVIAAGTPQEVMQNPNSLTGQYLSKQKDILVPKTRRSGNGHKVILKGAKHNNLKNVDLTIPLGKFICVTG
VSGSGKSSLILETLVKAIEYTNFNPFVIPGEYKDLIGASNVDKIVVVNQDAIGRTTRSNPATYVGVFDDIRTVFENTIEA
KARGYSKSRFSFNIKGGRCERCWGDGTIRIEMHFLPDVYISCEECHGKRYNDETLQVKFKGKSIYDVLKMPIDEALVFFE
NYPGIHRKLQLLVDVGLGYLELGASSTSLSGGEAQRIKLAKFLQRKPTGKTLFVLDEPTTGLHIDDVAKLIKILDKIVDG
GDTVLVIEHNLDLIKVADYIIDIGPEGGNKGGKIIATGTPEQLLSKKDISYTAQYLEKYLKKN
>Mature_943_residues
MDKIIIKGARENNLKNIDLEIPKNKLVVITGVSGSGKSSLAFDTIFAEGKRRYFESLSSYARQFLGGNDKADVESIEGLS
PTIAVDQKSTNQNPRSIVGTITEIYDYLRVLFARVGTPFCPNGHGQIKSQTPKQIADFLFSLSPKSKIQILAPIEIKKGY
KINDVLNNLRNQGYLRVLVNNEVYQLDENLPQFLDNKKTDVAIIVDRLILNIDHQTKTRALDAIEFALNYSGGEIAFKVN
DDIHYFTQNDVCQVCGFKIKEIEPTLFSFNSPIGACEQCKGLGYNYVPDERKMIPNPNLSINEGGLDYFKNTVNTTNLD*
QRFNSIIKHYKIDKTKPLKELDRKEIDLLLYGSDEAIEIDITSANNKKYSSIDYVEGVLELVNRRYQETSSELAREHYNK
YMSEKVCKSCKGKKLSSQALSVLINKINIIDFIEKNIDEAIDFLLHLDLNEAQTKIANPILKEVLDRLGFLKNVGLEYLT
LARPASSLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGILYVLDEPSIGLHQRDNDKLINTLKEMRDLGNTVIVVEHDEETMLAADYLID
IGPQAGVNGGYVIAAGTPQEVMQNPNSLTGQYLSKQKDILVPKTRRSGNGHKVILKGAKHNNLKNVDLTIPLGKFICVTG
VSGSGKSSLILETLVKAIEYTNFNPFVIPGEYKDLIGASNVDKIVVVNQDAIGRTTRSNPATYVGVFDDIRTVFENTIEA
KARGYSKSRFSFNIKGGRCERCWGDGTIRIEMHFLPDVYISCEECHGKRYNDETLQVKFKGKSIYDVLKMPIDEALVFFE
NYPGIHRKLQLLVDVGLGYLELGASSTSLSGGEAQRIKLAKFLQRKPTGKTLFVLDEPTTGLHIDDVAKLIKILDKIVDG
GDTVLVIEHNLDLIKVADYIIDIGPEGGNKGGKIIATGTPEQLLSKKDISYTAQYLEKYLKKN

Specific function: The UvrABC repair system catalyzes the recognition and processing of DNA lesions. UvrA is an ATPase and a DNA-binding protein. A damage recognition complex composed of 2 UvrA and 2 UvrB subunits scans DNA for abnormalities. When the presence of a lesion h

COG id: COG0178

COG function: function code L; Excinuclease ATPase subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 ABC transporter domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI2367343, Length=947, Percent_Identity=50.1583949313622, Blast_Score=912, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003439
- InterPro:   IPR017871
- InterPro:   IPR013815
- InterPro:   IPR004602 [H]

Pfam domain/function: PF00005 ABC_tran [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105023; Mature: 105023

Theoretical pI: Translated: 7.52; Mature: 7.52

Prosite motif: PS00211 ABC_TRANSPORTER_1 ; PS50893 ABC_TRANSPORTER_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKIIIKGARENNLKNIDLEIPKNKLVVITGVSGSGKSSLAFDTIFAEGKRRYFESLSSY
CCCEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ARQFLGGNDKADVESIEGLSPTIAVDQKSTNQNPRSIVGTITEIYDYLRVLFARVGTPFC
HHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PNGHGQIKSQTPKQIADFLFSLSPKSKIQILAPIEIKKGYKINDVLNNLRNQGYLRVLVN
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
NEVYQLDENLPQFLDNKKTDVAIIVDRLILNIDHQTKTRALDAIEFALNYSGGEIAFKVN
CCEEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEEC
DDIHYFTQNDVCQVCGFKIKEIEPTLFSFNSPIGACEQCKGLGYNYVPDERKMIPNPNLS
CCEEEECCCCHHHHCCCEEEECCCHHEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCE
INEGGLDYFKNTVNTTNLDQRFNSIIKHYKIDKTKPLKELDRKEIDLLLYGSDEAIEIDI
ECCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEE
TSANNKKYSSIDYVEGVLELVNRRYQETSSELAREHYNKYMSEKVCKSCKGKKLSSQALS
ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VLINKINIIDFIEKNIDEAIDFLLHLDLNEAQTKIANPILKEVLDRLGFLKNVGLEYLTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
ARPASSLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGILYVLDEPSIGLHQRDNDKLINTLKEMRDLGNT
ECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCE
VIVVEHDEETMLAADYLIDIGPQAGVNGGYVIAAGTPQEVMQNPNSLTGQYLSKQKDILV
EEEEECCCCCEEEEHHHEECCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEC
PKTRRSGNGHKVILKGAKHNNLKNVDLTIPLGKFICVTGVSGSGKSSLILETLVKAIEYT
CCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
NFNPFVIPGEYKDLIGASNVDKIVVVNQDAIGRTTRSNPATYVGVFDDIRTVFENTIEAK
CCCCEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
ARGYSKSRFSFNIKGGRCERCWGDGTIRIEMHFLPDVYISCEECHGKRYNDETLQVKFKG
HCCCCCCEEEEEECCCCCCEECCCCEEEEEEEECCCEEEEHHHHCCCCCCCCEEEEEECC
KSIYDVLKMPIDEALVFFENYPGIHRKLQLLVDVGLGYLELGASSTSLSGGEAQRIKLAK
CHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHH
FLQRKPTGKTLFVLDEPTTGLHIDDVAKLIKILDKIVDGGDTVLVIEHNLDLIKVADYII
HHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEHHHE
DIGPEGGNKGGKIIATGTPEQLLSKKDISYTAQYLEKYLKKN
EECCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDKIIIKGARENNLKNIDLEIPKNKLVVITGVSGSGKSSLAFDTIFAEGKRRYFESLSSY
CCCEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ARQFLGGNDKADVESIEGLSPTIAVDQKSTNQNPRSIVGTITEIYDYLRVLFARVGTPFC
HHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PNGHGQIKSQTPKQIADFLFSLSPKSKIQILAPIEIKKGYKINDVLNNLRNQGYLRVLVN
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
NEVYQLDENLPQFLDNKKTDVAIIVDRLILNIDHQTKTRALDAIEFALNYSGGEIAFKVN
CCEEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEEC
DDIHYFTQNDVCQVCGFKIKEIEPTLFSFNSPIGACEQCKGLGYNYVPDERKMIPNPNLS
CCEEEECCCCHHHHCCCEEEECCCHHEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCE
INEGGLDYFKNTVNTTNLDQRFNSIIKHYKIDKTKPLKELDRKEIDLLLYGSDEAIEIDI
ECCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEE
TSANNKKYSSIDYVEGVLELVNRRYQETSSELAREHYNKYMSEKVCKSCKGKKLSSQALS
ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VLINKINIIDFIEKNIDEAIDFLLHLDLNEAQTKIANPILKEVLDRLGFLKNVGLEYLTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
ARPASSLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGILYVLDEPSIGLHQRDNDKLINTLKEMRDLGNT
ECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCE
VIVVEHDEETMLAADYLIDIGPQAGVNGGYVIAAGTPQEVMQNPNSLTGQYLSKQKDILV
EEEEECCCCCEEEEHHHEECCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEC
PKTRRSGNGHKVILKGAKHNNLKNVDLTIPLGKFICVTGVSGSGKSSLILETLVKAIEYT
CCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
NFNPFVIPGEYKDLIGASNVDKIVVVNQDAIGRTTRSNPATYVGVFDDIRTVFENTIEAK
CCCCEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
ARGYSKSRFSFNIKGGRCERCWGDGTIRIEMHFLPDVYISCEECHGKRYNDETLQVKFKG
HCCCCCCEEEEEECCCCCCEECCCCEEEEEEEECCCEEEEHHHHCCCCCCCCEEEEEECC
KSIYDVLKMPIDEALVFFENYPGIHRKLQLLVDVGLGYLELGASSTSLSGGEAQRIKLAK
CHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHH
FLQRKPTGKTLFVLDEPTTGLHIDDVAKLIKILDKIVDGGDTVLVIEHNLDLIKVADYII
HHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEHHHE
DIGPEGGNKGGKIIATGTPEQLLSKKDISYTAQYLEKYLKKN
EECCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: DNA [C]

Specific reaction: Protein + DNA = Protein-DNA [C]

General reaction: Hydrolase; Acting on ester bonds [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11048724 [H]