Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is 170756382

Identifier: 170756382

GI number: 170756382

Start: 1171619

End: 1172992

Strand: Reverse

Name: 170756382

Synonym: CLD_3505

Alternate gene names: NA

Gene position: 1172992-1171619 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170757417

Following gene: 170756037

Centisome position: 29.63

GC content: 23.14

Gene sequence:

>1374_bases
ATGGAAAAACAACAAATATTACAGATTTGTCGATTTTTATCAGGATACTCAACAATGATTTTTCTATATACAATCAAATA
CTATTTCTATAAAAATTTTTTAGGATTTAAAAATAAAGTTTGGCATTTTACTTTATGTGCATTATTAGTAACAGTTATTG
ATTTTTATATGATGAAAACAATATCCCTACTATGGAGTATAATTATAAATAATATAATTTGGCTACTAATTATATGTTTT
TTATGTAATGGTAATTTCTTAATGAAATTTTATGCTGTTATTCTTGAAGAAGCAGCATTACTACTTATTAATCTAACTTT
TTTAACCTTTGATTTTACAATTTTGCCTGCTATTCATAACATTAATGTATCTTTTAATAAACATATAATTATTAGTTTTA
TGACTAACATTATTAATGATCTTATACGTTATACTATATTATTTGTATTTTTAAAAAACATTTGTAAATTTCTAAATTTG
AAAGAAAAATCAATAAAATTATATGAAAACTTATTTTTGCTCATTCCTTGTTTATCAATTTATAGTTTAGGACTTATTTT
TTATATCATTCAGCCTATTAATATTGATAATAAAAGATACTATTTACCTTATATTTTTCCTAAAATTTATTATACCCTCC
CCTTTATAAGTTTTGCTTTATTAGTATCATTATTAATTATGGCCTATACCTTTAAAAAAATGCTTGAAGGCCAATTAGAA
GAGAAGAAAAACCTTCTCATGGAACAACAATTTAAGCTACAGCTTACTCATAGCAACAACATAGAAATGCTTTATAAAGG
GATAAGAGGCATAATCCACGATATGAATAATCATGTTTCCTGTTTGAAAAATTTAGCTGCTACTAATAACATTGAAGATA
TAAAAAAGTATCTTATAAATATTGATGAAACCATAAGCAAACTTGATTTTAAAATAAAAACGGGGAATTCTATATCTGAT
GCAGTAATAAATGAAAAATATAACATTGCTAAAACTAATAAAATAGAGTTTATATGCGATTTCCTATTACCCAAAGAAAC
CCTATTAGAGCCTGTAGATTTATGCATTATTTTAAGTAACGCATTGGACAATGCCCTTGAAGCGTGTATGAGAATTACAG
ATAGTAATCTTCAAAAAAAAATATGTATAAAATCTTACATAAAAAATATGTATTTAATAATTGAAATTTCTAACAGTGCT
ACAGATAAAATTCAATATGCCGAAAATAAAATTATCAGCACAAAAACTGATAAAAATAACCATGGTATAGGAATTTCTAA
CATAAAAACTGTTGCAAAAAAATATAATGGCATAGTTGATATACTAGAAGAAAAACATAAATTTATTATTAATATTATGC
TTAAAATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAACCTTAATAAACTCAGATAAAATATATGTTTCAAAATATAGATTAGATGATTTTTCAAAGGCCTTTATGTATTATTTA
AAAAATGAGGTTCAGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATAACATATAATGACTTATATAAAATTCATATATATATTCCTTAAAAATCATATAATAAGTATCTCTTTTATATAAAA
ATCTACATAAAAAATAAAAG

Product: sensor histidine kinase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 457; Mature: 457

Protein sequence:

>457_residues
MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHNINVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK

Sequences:

>Translated_457_residues
MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHNINVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
>Mature_457_residues
MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHNINVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK

Specific function: Unknown

COG id: COG2972

COG function: function code T; Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53427; Mature: 53427

Theoretical pI: Translated: 9.22; Mature: 9.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
INVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLIN
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN
HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC
HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MEKQQILQICRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPAIHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
INVSFNKHIIISFMTNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLGLIFYIIQPINIDNKRYYLPYIFPKIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLIN
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN
HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC
HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA