Definition Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome.
Accession NC_009997
Length 5,347,283

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The map label for this gene is 160874517

Identifier: 160874517

GI number: 160874517

Start: 1674924

End: 1677086

Strand: Reverse

Name: 160874517

Synonym: Sbal195_1399

Alternate gene names: NA

Gene position: 1677086-1674924 (Counterclockwise)

Preceding gene: 160874519

Following gene: 160874516

Centisome position: 31.36

GC content: 45.72

Gene sequence:

>2163_bases
ATGCAAAAACTCACGGTTATTTTATTTACTTTGTTGCTGTCACTGCCTTTTAGCGTTCAAAGCCGAGATCTCGAAGCTGA
TGAGGTGGAGTTAAGAGAATCGCCACAGCAAATGTATGATGTACTCAACAAATCCATTTCCTTCCCCCTTGCGTTCCAAA
ACCGTGACCAATTTGAGCGTGCAGCCCAAGAACAAGGCTACAGCCCAATCGAATTTGAACAGATTTTGTATCTGCTGACT
CGGCTGAATATGGAGCCGAACGTGAAAACTAAGGTCGGTTTTCAAGACGCAAAAAGCTTGATTGAACTCTTATCCACTGC
GGCGCAATCGCCCTACGAACTGGCTATGGTCGCCATGTTGAATGGTCGTTACCTTGGCCGTACCGAACAGAAATATCAAG
AAGCGATTGGCCTATATAATGAAGCGCTCACTCGCATCAACGACAGTTATGACATCGAAGCATTGATTCTTAAGCACAAT
ATTCATGAGCACTTAGGCGGCTTACATTTATTGATCCGTCAAGAAGTACCGGCGCTGATGCACTTCCATACATACCGCGA
CATTGCCTATAAGCTCAGAAACGATTACTTAATCGCGGCGGCTGAAGCAAGACTGGGGTTCTATTACAATTTTAATCAGC
AGCTCACCAAATCATTGCAGCATTACAATGAAGCGATTCGGATCTCCAATCGTTCTAATTACCCGGCGATGAAAACCAAT
CTGCAATTGCAACTTTCTAAGGTATATCGCGATTTAAAGCAGTGGGATGAAGCCCTTAAAAATGCCCACGAAGCCGCTGC
CGGTTTTAAAAAAATGGGCAATGACACCTATCTTTCAAGCTGTATGACAGTAATCGCTATGGTGTATGGCGAACAAGGGG
ATTGGAATAAAGCGATTGATTACTACCTTAATGCCCAGCAATTAGATGCCAAACGCGGTAACTATATTGCCCAAGGCCTT
AATTTCCACAATCTTGGGCAAGCCTACTCAAATATTAATGACAATGTTAACGCCCTAAAATATTTACTGATGGCCAATCA
AATATTCAAAGAAAAACAAAGCCATCACTATCAGGTTTATAACGAACTCTTAATTGGCGAAATCGCACAAACCAACCAAG
ATTGGCCGCTAATGATGACCCATGCCGACATCGCATTGGCATTGGCTATCGACTTAAAACTCGTCAATGAACAAAAAGCC
GCGCTCACACTGATTGCCTCGGCGTCGCAAAAATTAGGGGAATTAACCAAAACCATCGATGCCCAAACCCGTATCATAGA
GCTAGGTAACACCCTTGCAGAGAAAGAGAAAGACTCCCCAGTGTCGACCTCAGCCCTTGCGGAGCAACAGCTCAAACTTG
AGCTCAACATGGTTCAGGGAAAACTTGCCGAGACAGTGAAGGAAAGCAACAGCACCCACACGCTACTGCTCATCAGCTGC
CTCATTGCCGGACTCTTACTGCTGGTGATTGCGTATATGTTGCATCATCGCCGCAAAACCATGGCAAAAAACGCCGCATT
AACTCAATTGAGCCTACAGGAACCCTTCACCCATAACTTAGGCTATGCGGCGCTATTAGCGCACTTAAGCTATAATCAAA
CTCAAGCGTCGACGACTGCCCTAGGGATTATCGCCTTCCCCGCCCAGCTCACGACCGACCTCGACTATGGCCAATATTTT
AGTGATGCAGTAACAGCGCAACTGGCCACTCATCTAACCGATGCGCTCGCAGCACCTGTGTATGTGATACGCCAAGGGGT
ATTTGCAGTGCGTTTCACCCAAGCCGTTGAGCCAACGCACGTGCTCAGCCAAATACGCCAGAAACTCGACCAACAGCACA
TCGTCCATCATTTCCGGCTTGGTTTTGCCAACTTGCCACTGTTAGCGAAATCAGAAATCAAAATGGCCGCAAAATTAAAG
TTCGAAACCGTGCAGATGGCGCTCGCCTGTGCCCGCAGTTTAGAGGGCAATAACGATTATTTTGTCGCCCTCAGAGCACT
CGATTTTGTCCCTCTAAGCTTATTTGCCAATCCGTTATTTTTACACCTTGAAAAAGGCATTGAGCGCGGGTTAATCAGAT
TAGATACCAACGGAAATAAAGAAGATGTTCGCTGGCCTTGCTGGGAAAATAACCAAGATAGGCAATTACTGGAAAATATT
TGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCCAAGTATAACAAGTCGATGTAGCATCCTCATTAGGCGCTAACAAAAGCTAACAAAATAAGTTCCTTGACTTAAGG
AATGAGGAATCACAGTTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAATATCAGCAATTAATCACAGAGTCATAGGAAAATCGCATTTGCACTCTACGCCCAGTGTTATAACATTAGTATCATA
TGAGTTAACAGCTAATCTGG

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: TPR Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720

Protein sequence:

>720_residues
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT
RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN
IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL
NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA
ALTLIASASQKLGELTKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF
SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK
FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI

Sequences:

>Translated_720_residues
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT
RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN
IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL
NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA
ALTLIASASQKLGELTKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF
SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK
FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
>Mature_720_residues
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT
RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN
IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL
NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA
ALTLIASASQKLGELTKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF
SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK
FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81600; Mature: 81600

Theoretical pI: Translated: 6.78; Mature: 6.78

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFER
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH
AAQEQGYSPIEFEQILYLLTRLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAML
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
NGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHNIHEHLGGLHLLIRQEVPALM
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
HFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCC
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YYLNAQQLDAKRGNYIAQGLNFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVY
HHCCHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKAALTLIASASQKLGELTKTID
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHE
LGIIAFPAQLTTDLDYGQYFSDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTH
EEHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH
VLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLKFETVQMALACARSLEGNNDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
FVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
EEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFER
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH
AAQEQGYSPIEFEQILYLLTRLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAML
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
NGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHNIHEHLGGLHLLIRQEVPALM
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
HFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYNEAIRISNRSNYPAMKTN
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCC
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YYLNAQQLDAKRGNYIAQGLNFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVY
HHCCHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKAALTLIASASQKLGELTKTID
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKTMAKNAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLSYNQTQASTTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHE
LGIIAFPAQLTTDLDYGQYFSDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTH
EEHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH
VLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLKFETVQMALACARSLEGNNDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
FVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
EEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA