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The map label for this gene is cstA

Identifier: 15672391

GI number: 15672391

Start: 413148

End: 415502

Strand: Direct

Name: cstA

Synonym: L13150

Alternate gene names: 15672391

Gene position: 413148-415502 (Clockwise)

Preceding gene: 15672390

Following gene: 15672392

Centisome position: 17.46

GC content: 38.98

Gene sequence:

>2355_bases
ATGAAAGATATTGGAAACTCTTCAAACTTTACCGAAGAAGAAGAGCTATTTTTGTTGCGAAATAAACAAGGAAAAATTGT
CGGAATTAAAGATTTAAAGCAGGCAAATTTTCAAGAAACAATGAAAGACTGGAAAAAACATTTACCAAAACCTAGTCTTC
TATCAATTATCATTTGGGTGGCGGTCGCTTTACTAGGTGGTCTTGCTTGGTCGTTGATTGCTCTGGCTCAAGGAGAGACG
ATTAATGCGATTTGGTTTGTTATTGCAGCAGTTTGTTCTTATTTGATTGGCTATCGTTTTTATGCTTTATATATTCAACG
TAAGATTATGCGTCCAAATGATTTACGGGCAACTCCTTCGGAAAGCCATAATGACGGAAAAGAATTCGACCCAACCAATC
GAGTTGTTTTATTCGGTCACCATTTTGCTTCAATTGCTGGAGCTGGGCCTTTGGTTGGACCAGTTTTAGCGGCACAAATG
GGTTACTTACCAGGGACAATTTGGATTATTTTCGGAGTTATTTTTGCCGGAGGGGTACAAGATATGCTTGTTCTCTGGTA
TTCTCATCGTCGTCGAGCAAAATCTATTGGGGCAATGGCTCATGATGAAGTTGGCAGATTTGCTGGTGGCTTGACTTCAT
TTATTGTATTTATCATGACAATGATTGTTCTTGCTGTTTTAGCTTTGATTTGTGTGACGGCGATGGCAAATTCTGCTTGG
GCAGTCTTTTCGATTGGGATGACCATCCCAATTGCCTTGTTAATGGGAATTTATTTGAAATATATTCGCCCAGGGCATGT
GAATGAAATTTCAGCGATTGGTTTTATTCTCCTTTTAGTTGCTATTTTTGGTGGCCGTTGGGTTTCGGAATCTTCATTTG
CGCATATTTTCATGCTTTCGCCAACTGCTTTAGTTTGGTGGGTCATGGGCTATACTTTTATTGCAGCCATTATCCCCGCT
TGGATTTTACTTACGCCTCGTGATTACTTATCCATGTTTATGAAAATAGGTACAATTGCTGTTTTAGCAATAGCTGTAGT
TGGTGTGCGTCCAGATGTTACGATTCCAGCTCTGACTAATTTTGCACATAATACAGATGGTCCTGCTTTTGCTGGTTCCC
TCTTTCCCTTCTTATTTGTTACGATTGCCTGTGGAGCCTTGTCTGGTTTCCATGTAATGATGTCTTCTGGAACAACGCCT
CATTTGATTGCTAAAGAGTCACAAACGCGAATGATTGGTTATGGTGGGATGCTCTTTGAATCATTTGTTGCTATTATGGC
TTTAGTCGCTGCGATTTCTCTTAATCCTGGAATTTATTATTCTATGAATACCCCTCAAGCTAGTATTCAAAAACTCGCAG
CTTCAAGTTATCAAGCAGATAAAAGTGCCGAATATAATGCTGCCAAAGCAATTCCAAATGTAGCCATGATGCCTGATGGT
TCAAAACTCAGTATTGACTGGGAAGGAACGACTGGTGAAAAAGCACTTGAGCAAGTGGCAAAAGATGTAGGTGAACAATC
AATCGTTTCACGGACTGGTGGTGCACCAACTTTAGCCGTTTCAATGTCAAATATTCTACATAAGGTTCCACTTATTGGTG
GGACAAATATGATGGGATTCTGGTATCATTTTGCGATTATGTTTGAGGTGCTCTTTATCCTGTCAGCTGTTTCAGCGGCA
ACAAAATCGACTCGTTATTTACTTAATGATGCCCTGCGTGGCTTCAAAAAATTAGGTCGCTTAGGTGATGATGATTGGTT
ACCTAGTAAAATTATAACGACAGCAGTGATTGTTGGAGTTTGGGGTGCTTTGCTTTTGATGGGCGTTTCTGATCCGAATG
GTGGAATAAAAATCATGTATCCGCTCTTTGGGATTTCTAATCAATTAATTGCGGCGGTAGCTCTGGCTATTGTTTGTGTC
ATGGTTATCCGTAAAGGTTATCTTAAATGGGTTTGGATTCCAGCACTTCCTTTAGTTTGGGATGTTTGTGTAACTTTTGC
GGCCAGTTGGCAAAAAATCTTTTCAAATGATGTCAATATTGGTTACTTTGCTTCTTATTCAGCAGCAAAAGCCCAAGTGG
CTTCTGGTAAATTATCTGGTCTAGCATTAACGAATGCGCAAGCAACCATGCGTAATACAATGATTCAAGGAAGTCTGTCA
GTCATTTTCTTACTTTGTGTGGCTATATTATTAGTCATCTGTGCCTTTAAAGTTGCTAAAATTTTAAGAACAAATGAAGT
TGGTGATAAATTTAGCTCAGAAGAAGTTTTTGAAGAATCAAATCTTTTTGAAACTTCAAGTTTCTGGCCTAGTAAGCTTG
AACATAAGGTTTTAAAAAGTAAAGTTAATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGATTAAATAGTGCTAAAATATTATTGTAATCGGTTACATTTTTGTTTTAAAAAATATGGAAGGTCAAATGCATTAATAA
TTGCATAGGAATAGAGGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGAAAATAAAAGTTACTGACAGGATTTCTGTCAGTAACTTTTTATTTATAATATAATCACTGACTTCAACGTTGAACAG
CTGTCAGTAATTTTTTCTAA

Product: carbon starvation protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 784; Mature: 784

Protein sequence:

>784_residues
MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET
INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM
GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA
WILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP
HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG
SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGFWYHFAIMFEVLFILSAVSAA
TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV
MVIRKGYLKWVWIPALPLVWDVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS
VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKSKVNE

Sequences:

>Translated_784_residues
MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET
INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM
GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA
WILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP
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TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV
MVIRKGYLKWVWIPALPLVWDVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS
VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKSKVNE
>Mature_784_residues
MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET
INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM
GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA
WILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP
HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG
SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGFWYHFAIMFEVLFILSAVSAA
TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV
MVIRKGYLKWVWIPALPLVWDVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS
VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKSKVNE

Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=676, Percent_Identity=46.7455621301775, Blast_Score=614, Evalue=1e-177,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=714, Percent_Identity=44.3977591036415, Blast_Score=589, Evalue=1e-169,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 85325; Mature: 85325

Theoretical pI: Translated: 9.31; Mature: 9.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWV
CCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
AVALLGGLAWSLIALAQGETINAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
ESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGTIWIIFGVIFAGGVQ
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH
DMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLS
HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC
PTALVWWVMGYTFIAAIIPAWILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
FAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTPHLIAKESQTRMIGYGGMLFE
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEEEECCHHHHH
SFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEECCCC
SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGF
CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
WYHFAIMFEVLFILSAVSAATKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
WGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCVMVIRKGYLKWVWIPALPLVW
HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHH
DVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KVNE
HCCC
>Mature Secondary Structure
MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWV
CCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
AVALLGGLAWSLIALAQGETINAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPS
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ESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGTIWIIFGVIFAGGVQ
CCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH
DMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLS
HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC
PTALVWWVMGYTFIAAIIPAWILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTN
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FAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTPHLIAKESQTRMIGYGGMLFE
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEEEECCHHHHH
SFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEECCCC
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CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
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VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KVNE
HCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]