Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_001318 |
Length | 910,724 |
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The map label for this gene is 15594597
Identifier: 15594597
GI number: 15594597
Start: 259000
End: 261303
Strand: Direct
Name: 15594597
Synonym: BB0252
Alternate gene names: NA
Gene position: 259000-261303 (Clockwise)
Preceding gene: 15594596
Following gene: 15594599
Centisome position: 28.44
GC content: 26.96
Gene sequence:
>2304_bases ATGGACTTTGAAGGTCTAAGCATTAGATATAAAGGAATTATATTCACAATATTTATCTTAATTACTATTTTTTTAGGATT TTTTTTGAAAAATCTTAAATTCGATGCAAACATCTTAAAACTTATACCCAAGACCAAAGAAACTGAAAGCTTAATAGACA TTGATAAAAGTAATTCACTTTTATCTACAATAGTAATATTTCAGGATAAAAAAAATATCTTCAATAAAAAAAATTTTGAA ACAATAAACAGCGTAATCAGTGAAATAACCAAAATTTTAAAAGTATCTCCAAATGCCGTTACAAGCATATTTTCTTATTT CCCACAATTTAAAAAAGAAATCTACACTGATAAAGATATAGAAGAAATAAAAAGCAAAATAAAGTCAACTCCATTTGTAA AAAACACATTCTTAGGCAACTCAGAAAATTTAATATACTTCATAATAATCCCATCAGAGAGTGACCAAATCAACTTCAGT AGAAATTTAAAAACTGAACTTGATGAGATGGAAAAAACAATTAAAAAATATGAAACTGACGATTTAAAGTTGTATCTTAC GGGGGATTTAATAGTAAGAGAAAAAATCTTAAACTACATGGTTGAAGACTTCAAAATCTTAGGGCCTCTTGCTACTTTTG TAGTAATAATTTCACTCTATCTTATTATAAAAAATCTAATTGGCGCATTAATTCCTATTTTTATTGCATTATTATCATTG ATTTGGACTTTTGGAATTAAAGGGCTTGTACAATCCCCTATTACAGTGCCAGAAACTTCAATGATTGTTTTACTTATTTC AATCGGATGCGCCAATGCTGTACATATAATAAATGAAATATTTAAATTAATAAAAAAAGAACAGCTCTCAAAAGAATCCA TAAAAGCAACAATTAAAAAACTTAAAACACCCATCCTGCTAACATCTTTTACAACTGCATTTGGATTTTTATCTCTTACA ACCTCTTCAATTAATGCCTACAAAACAATGGGTATTTTCATGTCAATTGGAGTAATTATYTCAATGATAATCTCATTAAC CGTTTTACCTGGAATAATAACATTAATCCCATTTGCAAAAAAAAAGTCTTTTGAAAAAGAAAAAGAAAATAAACTAAATA AAATATCCTTCCTTGAAAGACTTGCCAAACTAAATACGCAAATAACAAAATCTATATTAAAAAGAAAATATACATCCTCT ATAATGGTCCTCATCATACTGGGAATTTCTTTTGTAGGTCTTTTAAAAATCGAAATCAATTTTGATGAAAAAGATTACTT TAAAGAAAGCACAAGTGTAAAAAAAACATTAAACCTAATGCAAAAAGAAATGGGGGGAATATCGATTTTCAAAATAGAAA TTGAAGGCAGGCCCGGTGAATTTAAAAATGCTAAAGCAATGCAAATATTAGACTTAATTACAGATAAGCTTGATGCATTT TCTGCAAAAACTCAATCTAGTTCTATTAATGGCATTTTAAAATTTACAAATTTTAAAATTAAAAAAGAATCCCCACTAGA GTATAAACTGCCTGAAAATAAAATTATACTAAACAAACTAATAAATTTGATAGATAAAAGCGATTGGACTAAGGACAATA AAAGAATGTACATTAACGATGACTGGTCATTAATATCTATCATAGTAAGAATTGAAGACAACTCAACCGAAGGAATAAAA AAATTTGAAAAATATGCTATTAACACAATTAATGAATATATGAAAAATAATAAATATCATTTCTCAGGTGTTTATGATAA GGTATTAATAGCTAAAACAATGGTAAAAGAACAGGTTATAAACATTATAACAACTCTTGGATCAATAACACTACTACTTA TGTTTTTCTTTAAATCTATAAAAACCGGAATAATTATTGCAATCCCAGTAGCATGGTCAGTGTTTTTAAACTTTGCTGTA ATGAGATTATTTGGGATAACCTTAAACCCCGCAACGGCAACAATTGCATCTGTAAGCATGGGAGTAGGAGTAGATTATTC AATTCATTTTTTCAATACATTTATTTTACAATACCAAAAAAATCAAATCTACAAAACTGCACTTCTTGAATCAATACCCA ATGTATTTAATGGAATATTTGCAAATTCTATTTCTGTTGGAATAGGATTTTTAACTCTAACATTTTCGTCTTATAAAATA ATATCAACTCTTGGAGCAATAATTGCTTTTACAATGCTAACGACATCTCTTGCATCACTAACTCTTCTTCCATTATTAAT TTATTTATTTAAACCTAGAGTAAAGCTAGCCTCAAACAACAATTTTAAAAAATTAAAACAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCAAAATAAAATCAAACTTATTAAATAAAAAAATAGTAAAAATAATTGTAATTAAAAACAAGCTTGTCAACATAGTGATA AAGTAAAAAAGAGGCGTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAATGACCTCGCGCATATTATCTACAAGATAAAAATTAATTCCGCTCTTAATGTTAGTAGGAATCTCTTCTAAATCCA CTCTATTTGCCTTAGGAACA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; RND Superfamily Exporter; Integral Membrane Protein; Exporter Of RND Superfamily Protein; Exporter Of RND Superfamily; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Exporters Of RND Superfamily; Inner Membrane Transporter; MMPL Domain Protein; Mmpl Family; Histidine Kinase; HAE1 Family Efflux Transporter; MMPL Domain-Containing Protein; Exporter; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; Transporter RND Superfamily
Number of amino acids: Translated: 767; Mature: 767
Protein sequence:
>767_residues MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE TINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFS RNLKTELDEMEKTIKKYETDDLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKKLKTPILLTSFTTAFGFLSLT TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAKKKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSS IMVLIILGISFVGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYINDDWSLISIIVRIEDNSTEGIK KFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVINIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ
Sequences:
>Translated_767_residues MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE TINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFS RNLKTELDEMEKTIKKYETDDLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKKLKTPILLTSFTTAFGFLSLT TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAKKKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSS IMVLIILGISFVGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYINDDWSLISIIVRIEDNSTEGIK KFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVINIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ >Mature_767_residues MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE TINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFS RNLKTELDEMEKTIKKYETDDLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKKLKTPILLTSFTTAFGFLSLT TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAKKKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSS IMVLIILGISFVGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYINDDWSLISIIVRIEDNSTEGIK KFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVINIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ
Specific function: Unknown
COG id: COG1033
COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 86973; Mature: 86973
Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20
Prosite motif: PS50156 SSD
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH EEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFSRNLKTELDEMEKTIKKYETD HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC DLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKK HHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTPILLTSFTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAK HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSSIMVLIILGISFVGLLKIEIN HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYIND HCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC DWSLISIIVRIEDNSTEGIKKFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVI CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH GVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHECCHHHH ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHCC >Mature Secondary Structure MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH EEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFSRNLKTELDEMEKTIKKYETD HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC DLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKK HHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTPILLTSFTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAK HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSSIMVLIILGISFVGLLKIEIN HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYIND HCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC DWSLISIIVRIEDNSTEGIKKFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVI CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH GVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHECCHHHH ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA