Definition Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome.
Accession NC_001318
Length 910,724

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The map label for this gene is 15594597

Identifier: 15594597

GI number: 15594597

Start: 259000

End: 261303

Strand: Direct

Name: 15594597

Synonym: BB0252

Alternate gene names: NA

Gene position: 259000-261303 (Clockwise)

Preceding gene: 15594596

Following gene: 15594599

Centisome position: 28.44

GC content: 26.96

Gene sequence:

>2304_bases
ATGGACTTTGAAGGTCTAAGCATTAGATATAAAGGAATTATATTCACAATATTTATCTTAATTACTATTTTTTTAGGATT
TTTTTTGAAAAATCTTAAATTCGATGCAAACATCTTAAAACTTATACCCAAGACCAAAGAAACTGAAAGCTTAATAGACA
TTGATAAAAGTAATTCACTTTTATCTACAATAGTAATATTTCAGGATAAAAAAAATATCTTCAATAAAAAAAATTTTGAA
ACAATAAACAGCGTAATCAGTGAAATAACCAAAATTTTAAAAGTATCTCCAAATGCCGTTACAAGCATATTTTCTTATTT
CCCACAATTTAAAAAAGAAATCTACACTGATAAAGATATAGAAGAAATAAAAAGCAAAATAAAGTCAACTCCATTTGTAA
AAAACACATTCTTAGGCAACTCAGAAAATTTAATATACTTCATAATAATCCCATCAGAGAGTGACCAAATCAACTTCAGT
AGAAATTTAAAAACTGAACTTGATGAGATGGAAAAAACAATTAAAAAATATGAAACTGACGATTTAAAGTTGTATCTTAC
GGGGGATTTAATAGTAAGAGAAAAAATCTTAAACTACATGGTTGAAGACTTCAAAATCTTAGGGCCTCTTGCTACTTTTG
TAGTAATAATTTCACTCTATCTTATTATAAAAAATCTAATTGGCGCATTAATTCCTATTTTTATTGCATTATTATCATTG
ATTTGGACTTTTGGAATTAAAGGGCTTGTACAATCCCCTATTACAGTGCCAGAAACTTCAATGATTGTTTTACTTATTTC
AATCGGATGCGCCAATGCTGTACATATAATAAATGAAATATTTAAATTAATAAAAAAAGAACAGCTCTCAAAAGAATCCA
TAAAAGCAACAATTAAAAAACTTAAAACACCCATCCTGCTAACATCTTTTACAACTGCATTTGGATTTTTATCTCTTACA
ACCTCTTCAATTAATGCCTACAAAACAATGGGTATTTTCATGTCAATTGGAGTAATTATYTCAATGATAATCTCATTAAC
CGTTTTACCTGGAATAATAACATTAATCCCATTTGCAAAAAAAAAGTCTTTTGAAAAAGAAAAAGAAAATAAACTAAATA
AAATATCCTTCCTTGAAAGACTTGCCAAACTAAATACGCAAATAACAAAATCTATATTAAAAAGAAAATATACATCCTCT
ATAATGGTCCTCATCATACTGGGAATTTCTTTTGTAGGTCTTTTAAAAATCGAAATCAATTTTGATGAAAAAGATTACTT
TAAAGAAAGCACAAGTGTAAAAAAAACATTAAACCTAATGCAAAAAGAAATGGGGGGAATATCGATTTTCAAAATAGAAA
TTGAAGGCAGGCCCGGTGAATTTAAAAATGCTAAAGCAATGCAAATATTAGACTTAATTACAGATAAGCTTGATGCATTT
TCTGCAAAAACTCAATCTAGTTCTATTAATGGCATTTTAAAATTTACAAATTTTAAAATTAAAAAAGAATCCCCACTAGA
GTATAAACTGCCTGAAAATAAAATTATACTAAACAAACTAATAAATTTGATAGATAAAAGCGATTGGACTAAGGACAATA
AAAGAATGTACATTAACGATGACTGGTCATTAATATCTATCATAGTAAGAATTGAAGACAACTCAACCGAAGGAATAAAA
AAATTTGAAAAATATGCTATTAACACAATTAATGAATATATGAAAAATAATAAATATCATTTCTCAGGTGTTTATGATAA
GGTATTAATAGCTAAAACAATGGTAAAAGAACAGGTTATAAACATTATAACAACTCTTGGATCAATAACACTACTACTTA
TGTTTTTCTTTAAATCTATAAAAACCGGAATAATTATTGCAATCCCAGTAGCATGGTCAGTGTTTTTAAACTTTGCTGTA
ATGAGATTATTTGGGATAACCTTAAACCCCGCAACGGCAACAATTGCATCTGTAAGCATGGGAGTAGGAGTAGATTATTC
AATTCATTTTTTCAATACATTTATTTTACAATACCAAAAAAATCAAATCTACAAAACTGCACTTCTTGAATCAATACCCA
ATGTATTTAATGGAATATTTGCAAATTCTATTTCTGTTGGAATAGGATTTTTAACTCTAACATTTTCGTCTTATAAAATA
ATATCAACTCTTGGAGCAATAATTGCTTTTACAATGCTAACGACATCTCTTGCATCACTAACTCTTCTTCCATTATTAAT
TTATTTATTTAAACCTAGAGTAAAGCTAGCCTCAAACAACAATTTTAAAAAATTAAAACAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAAAATAAAATCAAACTTATTAAATAAAAAAATAGTAAAAATAATTGTAATTAAAAACAAGCTTGTCAACATAGTGATA
AAGTAAAAAAGAGGCGTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAATGACCTCGCGCATATTATCTACAAGATAAAAATTAATTCCGCTCTTAATGTTAGTAGGAATCTCTTCTAAATCCA
CTCTATTTGCCTTAGGAACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; RND Superfamily Exporter; Integral Membrane Protein; Exporter Of RND Superfamily Protein; Exporter Of RND Superfamily; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Exporters Of RND Superfamily; Inner Membrane Transporter; MMPL Domain Protein; Mmpl Family; Histidine Kinase; HAE1 Family Efflux Transporter; MMPL Domain-Containing Protein; Exporter; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; Transporter RND Superfamily

Number of amino acids: Translated: 767; Mature: 767

Protein sequence:

>767_residues
MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE
TINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFS
RNLKTELDEMEKTIKKYETDDLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL
IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKKLKTPILLTSFTTAFGFLSLT
TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAKKKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSS
IMVLIILGISFVGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF
SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYINDDWSLISIIVRIEDNSTEGIK
KFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVINIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV
MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ

Sequences:

>Translated_767_residues
MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE
TINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFS
RNLKTELDEMEKTIKKYETDDLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL
IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKKLKTPILLTSFTTAFGFLSLT
TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAKKKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSS
IMVLIILGISFVGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF
SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYINDDWSLISIIVRIEDNSTEGIK
KFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVINIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV
MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ
>Mature_767_residues
MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE
TINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFS
RNLKTELDEMEKTIKKYETDDLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL
IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKKLKTPILLTSFTTAFGFLSLT
TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAKKKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSS
IMVLIILGISFVGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF
SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYINDDWSLISIIVRIEDNSTEGIK
KFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVINIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV
MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86973; Mature: 86973

Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL
CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH
LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI
HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFSRNLKTELDEMEKTIKKYETD
HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKK
HHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKTPILLTSFTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSSIMVLIILGISFVGLLKIEIN
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE
FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYIND
HCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC
DWSLISIIVRIEDNSTEGIKKFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVI
CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
GVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHECCHHHH
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MDFEGLSIRYKGIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL
CCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH
LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVISEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI
HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EEIKSKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDQINFSRNLKTELDEMEKTIKKYETD
HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLATFVVIISLYLIIKNLIGALIPIFIALLSL
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWTFGIKGLVQSPITVPETSMIVLLISIGCANAVHIINEIFKLIKKEQLSKESIKATIKK
HHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKTPILLTSFTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMIISLTVLPGIITLIPFAK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KKSFEKEKENKLNKISFLERLAKLNTQITKSILKRKYTSSIMVLIILGISFVGLLKIEIN
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE
FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIEIEGRPGEFKNAKAMQILDLITDKLDAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKTQSSSINGILKFTNFKIKKESPLEYKLPENKIILNKLINLIDKSDWTKDNKRMYIND
HCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC
DWSLISIIVRIEDNSTEGIKKFEKYAINTINEYMKNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVKEQVI
CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIITTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
GVGVDYSIHFFNTFILQYQKNQIYKTALLESIPNVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSSYKI
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHECCHHHH
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVKLASNNNFKKLKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA