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Definition Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome.
Accession NC_009707
Length 1,845,106

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The map label for this gene is 153952509

Identifier: 153952509

GI number: 153952509

Start: 998546

End: 1000207

Strand: Direct

Name: 153952509

Synonym: JJD26997_1143

Alternate gene names: NA

Gene position: 998546-1000207 (Clockwise)

Preceding gene: 153951218

Following gene: 153951389

Centisome position: 54.12

GC content: 28.46

Gene sequence:

>1662_bases
ATGGGAACAAGTTTAAACGAGTTAAAAACCGGTAGAGAAAAACTTCAAATCATAAATCAAGTTTTAGCGAGAATTTCAAA
TGTTGCTACTGCTTTGGATAATACTAGAATAGAAGAAATTGTAGGCTTAAAAGAACAAGTGAATAACTTTCATACTCAGA
TTTTGGAGCTTAAAAATTCAGTTATAGAAAATAGCGAACTTACACAAAGCAATGCTGATTTTGTTAAAAGTAAAAAAAAT
GAAATCGAAAGAATAAGCAATGAAATAAACGATACTTTAAACAATATAGAAAATATCTATAATAACATGATAGAGTCGCA
AAGAAATATAAACAATGGCGTTAATATGGTTAAAGAAAAATATCCTGAACTTAAGGAGTTTAATAAAAATTTTGAAATCA
TAAAAATAAAACTCAAAGAATATGATGATATAGCTACCCATTTTAATGCAGGACTTGAAAAAATAGAAGAAAATAAAAAT
CTTACCCGATCTTATCTAGATTTATCCATAGGGCTTAAAGAGCAAATTTTACAAGAATTAGAACACGCACAAAGCATTAA
AGATGATTTGCATTCGAATATAGAGCTTGTAAATAATCTTGTTTCAAATATCAGAGCAACAAAGAATGAGATTGTATCCA
TAAGCAATGATTTTAAAAATGTAAAATCAGAAATACAAGATACAGTTAATGACGCTGAGACAACGATAAAACTTAAAATA
AACACTATTCTTTTTGAAAATCAAAGATTAAATCAGAACATGATTGATTTGTTAAAGCGTTGCACAAGATTAGAAAATCA
AATAGTAGAAAAATATGAAGATATTTTACAAGTAGAAGATCTTATAAACTCCTCTCAGTCAATGATAAACGATTTAAGAC
AAGCAGTAGAACAAAGCGAACAAATAAGCGAAGATATGAGAAGTTTTACAGCCATTATCAAGGATTTTAAAACAGAAATT
GCTAATCTAAAAGCAGATTTAGAAAGCTATAACGAAAGATTAAAAGGACAGCTTGATTTAAAAGCGACACAAATAAACTC
AAGCATAGATGCTAAGGTTTCAAGTATTGAGACTTTAAAAAATCAAATTGAAGCCTATGTAGAAACCCATAATAACACTA
TAGATACAGCTTTAGCTAATTTTATAGAAAGATCAAGCATAGCCAATGAAGATTTAGGAAGATTAGTAGAAGTAGCAAGA
ACTGAACTTGCTAATGATAAAACGGCTATTGAAAGCTATTTGTTAGAGCTTAAACAAAGCATTATCAATGCCATGAAGAA
AGTATCTAGTGATATTACAGATGAAACAAGTGGAATACTGGCTCAAAAAAATCAAATAGAACTCATCATAGCACAGGGAA
GATCAGCTTTAGATACTTTAAATAATGAGCTTAATTCCAATCATCAAAACAAGCTTAATGAATTTAATTTGAATGCTAAT
GAAAAATTAGCTTCCATTCATTCACTCCGTGAAGAAAGCATAGCCAATATACAAAGTAAAACAGATGAAAATATAGGCAG
ATTAGAGACTCTTAGCGAAGAAAAGCTGGCTAAATTTGATGAAATTATAAGAGACAATTTGGGTGTAATTTATTCTCGCA
TTTTTTCAATAGAAAATGTTTTTCTTGATAAGAAAATAATTAAATTAAGTTATAAGGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGCTTATTTAGAGGATAAAAAATGGCTTTTAGCTATGGATGATTTGCTTTTCTTTTGTGAAAAGAGGATTAAAGACAGT
GATTATTACGAGGGTTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGAATGGCGATTTTAGAACGAGTTGCAAATGATTTAAATTTGGCATCACAAAGCTTGCAAGAGTTAAGAGAAAAATATGA
TGGTGCTTTGGATTTACTGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 553; Mature: 552

Protein sequence:

>553_residues
MGTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNSVIENSELTQSNADFVKSKKN
EIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEKYPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKN
LTRSYLDLSIGLKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI
NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEI
ANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLKNQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVAR
TELANDKTAIESYLLELKQSIINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN
EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENVFLDKKIIKLSYKE

Sequences:

>Translated_553_residues
MGTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNSVIENSELTQSNADFVKSKKN
EIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEKYPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKN
LTRSYLDLSIGLKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI
NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEI
ANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLKNQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVAR
TELANDKTAIESYLLELKQSIINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN
EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENVFLDKKIIKLSYKE
>Mature_552_residues
GTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNSVIENSELTQSNADFVKSKKNE
IERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEKYPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKNL
TRSYLDLSIGLKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKIN
TILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEIA
NLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLKNQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVART
ELANDKTAIESYLLELKQSIINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNANE
KLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENVFLDKKIIKLSYKE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63192; Mature: 63061

Theoretical pI: Translated: 4.65; Mature: 4.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIENSELTQSNADFVKSKKNEIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEK
HHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKNLTRSYLDLSIGLKEQILQEL
CCCHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
EHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEE
NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSE
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QISEDMRSFTAIIKDFKTEIANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
NQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVARTELANDKTAIESYLLELKQS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
IINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCH
EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLDKKIIKLSYKE
HHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GTSLNELKTGREKLQIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFHTQILELKNS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIENSELTQSNADFVKSKKNEIERISNEINDTLNNIENIYNNMIESQRNINNGVNMVKEK
HHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YPELKEFNKNFEIIKIKLKEYDDIATHFNAGLEKIEENKNLTRSYLDLSIGLKEQILQEL
CCCHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
EHAQSIKDDLHSNIELVNNLVSNIRATKNEIVSISNDFKNVKSEIQDTVNDAETTIKLKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEE
NTILFENQRLNQNMIDLLKRCTRLENQIVEKYEDILQVEDLINSSQSMINDLRQAVEQSE
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QISEDMRSFTAIIKDFKTEIANLKADLESYNERLKGQLDLKATQINSSIDAKVSSIETLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
NQIEAYVETHNNTIDTALANFIERSSIANEDLGRLVEVARTELANDKTAIESYLLELKQS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
IINAMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGRSALDTLNNELNSNHQNKLNEFNLNAN
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCH
EKLASIHSLREESIANIQSKTDENIGRLETLSEEKLAKFDEIIRDNLGVIYSRIFSIENV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLDKKIIKLSYKE
HHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA