Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146300444

Identifier: 146300444

GI number: 146300444

Start: 3203874

End: 3206420

Strand: Reverse

Name: 146300444

Synonym: Fjoh_2693

Alternate gene names: NA

Gene position: 3206420-3203874 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146300445

Following gene: 146300443

Centisome position: 52.59

GC content: 27.05

Gene sequence:

>2547_bases
ATGATGAAGAATTATTCTTTTTTTGAACTAATTAATCAGTATATTATAGAAATTCCTATAATACAAAGAGATTACGCCCA
AGGTAGAGAGCAAGAAAATGTTACTTACATTCGAGAAAAATTTGTCTCCAATTTAGTTAGCAGTATAATAAAAGGAGAGC
CTATACATTTAGGTTTTATTTATGGAAAGGTTGAAGGTAAAGATGAGCTTGAGAAAATGAAATTGCATTCAGAAGCTGTC
GAAAAACTTTTAAGTACTGTAAAACAATATGCCAATCAATTTAACATTAATGTAGACTCAACAATTAGCACCGAAGTAAT
TACTTTAAAAAATACTTTACGTTTTATTCCGTTAGACGGACAGCAAAGATTAACCACTTTATTTCTACTATATTGGTACA
TCAATATGCGAAAAGGAAATGGTCATGGTAATTGGTTAACCAATTTTAAATACAACAATCGAAAATCAGCATTGGCTTTT
TTTGATGAGTTATCTAGTAATGATAATATTCTTAAAATCCGAAGTGATATTGATAGTAAAAATAAAATAAATATAAAAGA
TCAAATAAGTAAGTATATCTGGTATTTATCTAAATGGGATTACGACGCAACAGTTAACGGTGCGATTGTAATGCTAGAGC
AAATACACAAAGAATTTTCTAAATCACCAGAACTAAACTTTAAAGAAATAGAATTAAAAACACTTTCATTTACGTTTGAT
TTTTTTGATTTGCATGAACTGAATCAATCAGATGAGTTATATATAAAAATGAATGAAAGAGGAAAACAATTGACCGATTT
TGAGCATTTCAAAGCTTGGTTGCAAAATTTTACTGAGAAAAAATATGATTCTGGAGAACAAAAGATTTTTTTAAGAGATT
TTTGGGTAAAGATTGATACTATTTGGTTAGATTTTTTTTGGAAAAATTTAGATGTTGACTACACAGGGCTTGATGATTTA
TATTTCAATTTTTTGAAGACAATGGCATTAAACTATCATTTAGGCAGTGGCAAAGAAAGAGAAATACCTGATTTTTTAAA
AAGTCTTGTCCAAGATATACGAAATACTGATTCTTATGATAGAGAAAAAGTGCAATATATTCCTATTAGTAAATTTTTAA
GTAAAATAAAACGAGAAGATCACAATGACTTTTTATTTGAATTATTTTCTTACGAAGCTTTAGAATTTATTACTGATGCT
TTTAATGCTTTGTTTAAGCTAAGTGAGAATATGGAATTTACAGTTGCAATAACTGAAGTAACAACAAAACCTTTTGCTTC
GAATTCTATCCTAAATGCTTACATAAAGAAGAGTTCCTTTACATTGAACTTATGGGATCACGCAATGTATTATGCTATTA
TAAAATATTTTCAAAAAGTTCAATCATGTAAAATTACTCATTTAAAAAATTGGTTGCGAATTTTAAGAAATATAATTTAT
AATACTTACATCCAAAATCCCGAAAACCTATATATAGCCTTGAATACCATTGACAATTTGTTTAATGAACATTTTTTAGA
CTCAGTTTTACTTAGTGATATAATAAATGCTGACAACTTTGAATTAAGGTTTTTCAATCAAAACCAACTTAATGAGGAAA
AGACTAAAGGTCGTTTACTTAAAAATGAACAATGGCATTCTTGTATTGACAAGCTGGAAAAACACCCATATTTTTACGGA
CAAATTAATTTTATTTTTAATTTGTGTCAATCTGACGGAGGTGATAACTATAACTATGAGCAATTTGAAAGTTATTCTAA
AGTATTATATTTATTATTTGAAAAAGATACCGAAGAATTTTTGTTACAAAGGGCTTTGTTATCTCTAGGAGATTATTTGA
TAAAAGTTAATTCAAATTGGACGTTCTGTAAAACTGATACAGATTCTTTGCGTAGTAGAAATGAAAACTGGAGAAGAGTT
TTTATACAAGATGATAAATTAAAAATATTAGAACTTCTAATCTTAGAAATTATCAAGAGAGAAAATATACGTTTAGATTT
CAATTCTATTTTAATAGATATTATAAATTCTCACCAATACAATATTGATCAATGGGAATATTACTTTGTTGAATCTGCCT
ACCCGTTGCAGCAATCTAAATTGATGGAGATTAGATGGAACAATAATGATGATATACGATTGCTACCTGCAAAAACAATA
ATCGGTTATCATTTAGAACTTAGAACTATTTTTTTATTAAAATTTATATATAAGAAATTAATAAATATTGAGCCATTTGA
AAAAATCGAGTTCCTTTGGGACAAAGGTAGCACTGGGCATCCAGGTATCTCAATAACTGGATATGAATTTAGCAATAAAA
CATATAGACTAGATATTAGGTATTCTCTTAATAAAAACATTTATGACTTTTGTTTTTATAATGAAGCAGACATAATTAGA
AATAGATTAGCAAATCAACTGATAGTAAATAATCTGACTGATTATAATTATGATGATAACTTTAAACATTATTTTAAACA
AATCCATTTCAGCAACATTGTGCAAGAAATTCAAACATTATGCACTAATCTGAAAACAATATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTCAGATAAAATTACCATGAACTACTGGAATACTATGGATAGAGAAGCATATGTGGAAGATATAAAAAATAAAATAAAA
CAATTTTTAGGTGTACCGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAACATAGAACATTATGTCTATTCGCAAACCACAAATAGAAAATGATCAAACATTTACTTTATATTTAAATTTCTTAA
AAACAGTATAAATACCTGCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 848; Mature: 848

Protein sequence:

>848_residues
MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFIYGKVEGKDELEKMKLHSEAV
EKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDGQQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAF
FDELSSNDNILKIRSDIDSKNKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD
FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDTIWLDFFWKNLDVDYTGLDDL
YFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYDREKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDA
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QINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEFLLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRV
FIQDDKLKILELLILEIIKRENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI
IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIRYSLNKNIYDFCFYNEADIIR
NRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTLCTNLKTIS

Sequences:

>Translated_848_residues
MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFIYGKVEGKDELEKMKLHSEAV
EKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDGQQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAF
FDELSSNDNILKIRSDIDSKNKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD
FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDTIWLDFFWKNLDVDYTGLDDL
YFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYDREKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDA
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NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLLKNEQWHSCIDKLEKHPYFYG
QINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEFLLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRV
FIQDDKLKILELLILEIIKRENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI
IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIRYSLNKNIYDFCFYNEADIIR
NRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTLCTNLKTIS
>Mature_848_residues
MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFIYGKVEGKDELEKMKLHSEAV
EKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDGQQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAF
FDELSSNDNILKIRSDIDSKNKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD
FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDTIWLDFFWKNLDVDYTGLDDL
YFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYDREKVQYIPISKFLSKIKREDHNDFLFELFSYEALEFITDA
FNALFKLSENMEFTVAITEVTTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY
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QINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEFLLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRV
FIQDDKLKILELLILEIIKRENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI
IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIRYSLNKNIYDFCFYNEADIIR
NRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTLCTNLKTIS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101489; Mature: 101489

Theoretical pI: Translated: 6.08; Mature: 6.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFI
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
YGKVEGKDELEKMKLHSEAVEKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDG
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCEEEEECCC
QQRLTTLFLLYWYINMRKGNGHGNWLTNFKYNNRKSALAFFDELSSNDNILKIRSDIDSK
HHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEECEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCC
NKINIKDQISKYIWYLSKWDYDATVNGAIVMLEQIHKEFSKSPELNFKEIELKTLSFTFD
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEE
FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDT
HHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHH
IWLDFFWKNLDVDYTGLDDLYFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYD
HEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
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CCCEEEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEE
TTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY
ECCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTYIQNPENLYIALNTIDNLFNEHFLDSVLLSDIINADNFELRFFNQNQLNEEKTKGRLL
HHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCC
KNEQWHSCIDKLEKHPYFYGQINFIFNLCQSDGGDNYNYEQFESYSKVLYLLFEKDTEEF
CCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHH
LLQRALLSLGDYLIKVNSNWTFCKTDTDSLRSRNENWRRVFIQDDKLKILELLILEIIKR
HHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC
ENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI
CCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHH
IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEE
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EECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CTNLKTIS
HHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MMKNYSFFELINQYIIEIPIIQRDYAQGREQENVTYIREKFVSNLVSSIIKGEPIHLGFI
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
YGKVEGKDELEKMKLHSEAVEKLLSTVKQYANQFNINVDSTISTEVITLKNTLRFIPLDG
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCEEEEECCC
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CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEE
FFDLHELNQSDELYIKMNERGKQLTDFEHFKAWLQNFTEKKYDSGEQKIFLRDFWVKIDT
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IWLDFFWKNLDVDYTGLDDLYFNFLKTMALNYHLGSGKEREIPDFLKSLVQDIRNTDSYD
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TTKPFASNSILNAYIKKSSFTLNLWDHAMYYAIIKYFQKVQSCKITHLKNWLRILRNIIY
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HHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC
ENIRLDFNSILIDIINSHQYNIDQWEYYFVESAYPLQQSKLMEIRWNNNDDIRLLPAKTI
CCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHH
IGYHLELRTIFLLKFIYKKLINIEPFEKIEFLWDKGSTGHPGISITGYEFSNKTYRLDIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEE
YSLNKNIYDFCFYNEADIIRNRLANQLIVNNLTDYNYDDNFKHYFKQIHFSNIVQEIQTL
EECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CTNLKTIS
HHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA