| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is Not Available
Identifier: 13358039
GI number: 13358039
Start: 546042
End: 548519
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU476
Alternate gene names: NA
Gene position: 548519-546042 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358040
Following gene: 13358038
Centisome position: 72.97
GC content: 22.44
Gene sequence:
>2478_bases ATGAAATTAACCAAATCACAACAAAAAGCTGTTAGTCAATTAGTTAATTGTTATTTAGAAAGCGTGAATAACAATAAAAA AGAAATTATTGATTTTCAAGCACCAACAGGATCTGGTAAAACCTTTATTATTACCAATACTATTAATGAAATTATTAAGA CAAACAAAGCTAATGGTAGTCCTCAAAAATTAATTTTTGTAATTGCGACTTTATCATCAGCTGATTTACCATTTCAATTA GAACAAAATATGAATGAGTATAAATATTATATTAATGGTTTATTTGATGTCGAACTTAAAGAATCACCATCTTCTAAAAG TGCTAAAAAAGATAGTTCTTACAATATTTTAGCTGAAGAAAATAAAGTAATTATTTTTGGGTCTTCTTCATTTGGTAAAG GAAGAATTATTACAGAAGAAGGAATTTTAGATGCTTTTTTAGATGAAATTAAATCACAAGGATATACATTAGTTTATATC CGTGATGAAGCTCATCATGGCGGTAATGTTAATAAAACAAAAATATTTGAAGATTTTGATGAAAAAATACACAAAAATTC TTTTAAAAAAGAAGAAACACGATTTGAATATAAAATTCAAGAAGCAGCATCTTTTATTATTAAAATGACAGCAACTCCTA AAGGAATTCATAAATTAGTATTCATTGATGAAAAAGATTTAATGGATGATGATACAAAATTGTTAAAAGATGAACATGTT TATAATCTAGAAATTAAAGAACTAAAAGAAGAAAACATTGATGATGAACTATTATTAACAACTGCTTGTGAGCAATTTTT AAAAATCAAAGAGCAATATTCAAAAGCAAAAGAGTTAAAAAATATTCGTCCAGCCATGTTAATTCAAGTTGAAAATGAAC CTAATAAAGAACCACAAAAAAGCGAATTTTTAGATAAAATTGAAAAAATTATTAAAATTTTAGAAAAACATAATTTATCA TGAGTTAAATACTTTTCTAATGATAAAGAGGTTCAAACTAATATTTTAATTAATAAAAAAAATAATAAAATTTCTCTAAA AGAAATTTCTAAAAAGACTTCAAATGTGGATGTAATTTTGTTTAAAATTGGTCCTGCAACTGGTTGAAATATTCCGCGTG CTTGCATGTTAGTACAATTGCGAAACGTTTCTTCAAAAAATTTATCAGTACAAACAATTGGAAGAATTAAGCGTTTTCCA AATCCTAGCTTTGACAAAAACGAAATTAGCTATAATTCCATATCAAATCAATATTTTATTTATTCTAATATTATTTCAGA AGATAAAATTCGTCAAACTTTGATTTTAAAAGACAAATATAAAAATGATAGATTTTTTTATGGCGAAATTAATCAAGAGA AAATTAATAACTATTTAAATGGAGAAACTTATAAAGAAGAAATAGTAGAGAAGTTTGAAGATTCAATTAGTAATTTTGAA TACTATGTTAATGAGGAATATCGTGAAAATTTTGTAAAAAATCAATACTTAGAAGGCGAAACTTCAAAAATTGAAGGTAA AACACGTGTTTATACTAAAATTAAAAATTCAATCGAACTTGAACTTTATATTATTGAACAATTAAGAAAATACAAACATC TATTTCCTCAAAAAATTATTGATTTTCTTGAAACGAAGTTTAATGAGTGAGAAAAAAGATGAAAATTAAACATAAGCATC AACATGTATTGATATGTTATTATTAAAGAATATCTTGATCAAATTGAAAAAATATATAAAAATTCATTAGAACAAATGAA AAAAGATAATCATGAATTACTTTTTAAATTGCAAAATAATAAAAATTTACCTAATCAAAATGAAATTTTTATTCCCATTG AAAAATATAAAAAATGTGAAAACATGTTAGATTTAAATGTTTGTGATAAGTATGCATATAAAGATCTTAAAGAACAAAAT CACTATTTTGATTCTTTAACTGAATCTAAATTTGCAAATCGTTTCCTTTCATTATCAAATGATAATGATAAAATTAAAAA TAATGTTGAACTTTGGACTAAAAATCCTGTTTTTCATGGATTAAAATATCAATATTTTAATGAAGATGGTCAAATAAGTA ATTCATACCCTGATTTTATTTTAAAAATAAAAACACATGATCAAAAAGATCATTATTTATATATTGAAGTAAAAAATTTA TATAGTGATTATGATTATGAAAAAACAAAATTATTAATTGAATCATATCAACGATATATTGAAAATAAAAACAATAACGA TAATTTAATATTAGATGAATTAGACAAAGCAGAAATTACGATTTTAGTTTGTTATATTAATATGAAAAATCAAAAAGATT TTTATTTTTATGGAGCTAGTTCAAATGATGTTTTAAATAAAAAAGTTAATTTTGATCTTTTAAAAAAGACAAGTATTAAC AAAACTCCAGAACAACTAGTTGCGAATAAAGCAAAATTTATTATTGACATTAAACATTTATTAGATTTCTTACTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAATAATACAAGTCAATCAAGTTTATTTGAAAATAACCAACGCGAATTATTAATTAATTTAAGTACACTAAAACCAATT GAAAAAAAGGAATAAAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAACATCTAACTTTAGATCAATCTACTTTAGGATAAAACTAGAGTAGATTTTTATTTTAATAATGTTAAAATATTTAAAC GTTTAATTTGAATAATACTT
Product: ATP/GTP-binding protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 825; Mature: 825
Protein sequence:
>825_residues MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS WVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATGWNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNEWEKRWKLNISI NMYWYVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKKTSIN KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
Sequences:
>Translated_825_residues MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS *VKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATG*NIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNE*EKR*KLNISI NMY*YVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKKTSIN KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL >Mature_825_residues MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS *VKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATG*NIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNE*EKR*KLNISI NMY*YVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKKTSIN KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 96490; Mature: 96490
Theoretical pI: Translated: 7.60; Mature: 7.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCC PQKLIFVIATLSSADLPFQLEQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEE CCEEEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECC NKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYIRDEAHHGGNVNKTKIFEDFD CEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH EKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCE YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQK EECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHH SEFLDKIEKIIKILEKHNLSVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHCCCCCCEEEEE KIGPATGNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFPNPSFDKNEISYNSISNQYFIYS EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE NIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFEYY CCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE VNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDF ECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LETKFNEEKRKLNISINMYYVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPN HHHHCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC QNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQNHYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKI CCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH KNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNLYSDYD CCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHCCCC YEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCC NKKVNFDLLKKTSINKTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL CCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGS CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCC PQKLIFVIATLSSADLPFQLEQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEE CCEEEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECC NKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYIRDEAHHGGNVNKTKIFEDFD CEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH EKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCE YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQK EECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHH SEFLDKIEKIIKILEKHNLSVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHCCCCCCEEEEE KIGPATGNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFPNPSFDKNEISYNSISNQYFIYS EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE NIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFEYY CCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE VNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDF ECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LETKFNEEKRKLNISINMYYVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPN HHHHCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC QNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQNHYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKI CCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH KNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNLYSDYD CCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHCCCC YEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCC NKKVNFDLLKKTSINKTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL CCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA