Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 13358039

GI number: 13358039

Start: 546042

End: 548519

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU476

Alternate gene names: NA

Gene position: 548519-546042 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358040

Following gene: 13358038

Centisome position: 72.97

GC content: 22.44

Gene sequence:

>2478_bases
ATGAAATTAACCAAATCACAACAAAAAGCTGTTAGTCAATTAGTTAATTGTTATTTAGAAAGCGTGAATAACAATAAAAA
AGAAATTATTGATTTTCAAGCACCAACAGGATCTGGTAAAACCTTTATTATTACCAATACTATTAATGAAATTATTAAGA
CAAACAAAGCTAATGGTAGTCCTCAAAAATTAATTTTTGTAATTGCGACTTTATCATCAGCTGATTTACCATTTCAATTA
GAACAAAATATGAATGAGTATAAATATTATATTAATGGTTTATTTGATGTCGAACTTAAAGAATCACCATCTTCTAAAAG
TGCTAAAAAAGATAGTTCTTACAATATTTTAGCTGAAGAAAATAAAGTAATTATTTTTGGGTCTTCTTCATTTGGTAAAG
GAAGAATTATTACAGAAGAAGGAATTTTAGATGCTTTTTTAGATGAAATTAAATCACAAGGATATACATTAGTTTATATC
CGTGATGAAGCTCATCATGGCGGTAATGTTAATAAAACAAAAATATTTGAAGATTTTGATGAAAAAATACACAAAAATTC
TTTTAAAAAAGAAGAAACACGATTTGAATATAAAATTCAAGAAGCAGCATCTTTTATTATTAAAATGACAGCAACTCCTA
AAGGAATTCATAAATTAGTATTCATTGATGAAAAAGATTTAATGGATGATGATACAAAATTGTTAAAAGATGAACATGTT
TATAATCTAGAAATTAAAGAACTAAAAGAAGAAAACATTGATGATGAACTATTATTAACAACTGCTTGTGAGCAATTTTT
AAAAATCAAAGAGCAATATTCAAAAGCAAAAGAGTTAAAAAATATTCGTCCAGCCATGTTAATTCAAGTTGAAAATGAAC
CTAATAAAGAACCACAAAAAAGCGAATTTTTAGATAAAATTGAAAAAATTATTAAAATTTTAGAAAAACATAATTTATCA
TGAGTTAAATACTTTTCTAATGATAAAGAGGTTCAAACTAATATTTTAATTAATAAAAAAAATAATAAAATTTCTCTAAA
AGAAATTTCTAAAAAGACTTCAAATGTGGATGTAATTTTGTTTAAAATTGGTCCTGCAACTGGTTGAAATATTCCGCGTG
CTTGCATGTTAGTACAATTGCGAAACGTTTCTTCAAAAAATTTATCAGTACAAACAATTGGAAGAATTAAGCGTTTTCCA
AATCCTAGCTTTGACAAAAACGAAATTAGCTATAATTCCATATCAAATCAATATTTTATTTATTCTAATATTATTTCAGA
AGATAAAATTCGTCAAACTTTGATTTTAAAAGACAAATATAAAAATGATAGATTTTTTTATGGCGAAATTAATCAAGAGA
AAATTAATAACTATTTAAATGGAGAAACTTATAAAGAAGAAATAGTAGAGAAGTTTGAAGATTCAATTAGTAATTTTGAA
TACTATGTTAATGAGGAATATCGTGAAAATTTTGTAAAAAATCAATACTTAGAAGGCGAAACTTCAAAAATTGAAGGTAA
AACACGTGTTTATACTAAAATTAAAAATTCAATCGAACTTGAACTTTATATTATTGAACAATTAAGAAAATACAAACATC
TATTTCCTCAAAAAATTATTGATTTTCTTGAAACGAAGTTTAATGAGTGAGAAAAAAGATGAAAATTAAACATAAGCATC
AACATGTATTGATATGTTATTATTAAAGAATATCTTGATCAAATTGAAAAAATATATAAAAATTCATTAGAACAAATGAA
AAAAGATAATCATGAATTACTTTTTAAATTGCAAAATAATAAAAATTTACCTAATCAAAATGAAATTTTTATTCCCATTG
AAAAATATAAAAAATGTGAAAACATGTTAGATTTAAATGTTTGTGATAAGTATGCATATAAAGATCTTAAAGAACAAAAT
CACTATTTTGATTCTTTAACTGAATCTAAATTTGCAAATCGTTTCCTTTCATTATCAAATGATAATGATAAAATTAAAAA
TAATGTTGAACTTTGGACTAAAAATCCTGTTTTTCATGGATTAAAATATCAATATTTTAATGAAGATGGTCAAATAAGTA
ATTCATACCCTGATTTTATTTTAAAAATAAAAACACATGATCAAAAAGATCATTATTTATATATTGAAGTAAAAAATTTA
TATAGTGATTATGATTATGAAAAAACAAAATTATTAATTGAATCATATCAACGATATATTGAAAATAAAAACAATAACGA
TAATTTAATATTAGATGAATTAGACAAAGCAGAAATTACGATTTTAGTTTGTTATATTAATATGAAAAATCAAAAAGATT
TTTATTTTTATGGAGCTAGTTCAAATGATGTTTTAAATAAAAAAGTTAATTTTGATCTTTTAAAAAAGACAAGTATTAAC
AAAACTCCAGAACAACTAGTTGCGAATAAAGCAAAATTTATTATTGACATTAAACATTTATTAGATTTCTTACTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATAATACAAGTCAATCAAGTTTATTTGAAAATAACCAACGCGAATTATTAATTAATTTAAGTACACTAAAACCAATT
GAAAAAAAGGAATAAAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAACATCTAACTTTAGATCAATCTACTTTAGGATAAAACTAGAGTAGATTTTTATTTTAATAATGTTAAAATATTTAAAC
GTTTAATTTGAATAATACTT

Product: ATP/GTP-binding protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 825; Mature: 825

Protein sequence:

>825_residues
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL
EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI
RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS
WVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATGWNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP
NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE
YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNEWEKRWKLNISI
NMYWYVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN
HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL
YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKKTSIN
KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL

Sequences:

>Translated_825_residues
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL
EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI
RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS
*VKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATG*NIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP
NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE
YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNE*EKR*KLNISI
NMY*YVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN
HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL
YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKKTSIN
KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
>Mature_825_residues
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGSPQKLIFVIATLSSADLPFQL
EQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEENKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYI
RDEAHHGGNVNKTKIFEDFDEKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQKSEFLDKIEKIIKILEKHNLS
*VKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILFKIGPATG*NIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFP
NPSFDKNEISYNSISNQYFIYSNIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFE
YYVNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDFLETKFNE*EKR*KLNISI
NMY*YVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPNQNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQN
HYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKIKNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNL
YSDYDYEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVLNKKVNFDLLKKTSIN
KTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96490; Mature: 96490

Theoretical pI: Translated: 7.60; Mature: 7.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCC
PQKLIFVIATLSSADLPFQLEQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEE
CCEEEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECC
NKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYIRDEAHHGGNVNKTKIFEDFD
CEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
EKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCE
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQK
EECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHH
SEFLDKIEKIIKILEKHNLSVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHCCCCCCEEEEE
KIGPATGNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFPNPSFDKNEISYNSISNQYFIYS
EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
NIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFEYY
CCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
VNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDF
ECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LETKFNEEKRKLNISINMYYVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPN
HHHHCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
QNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQNHYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKI
CCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
KNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNLYSDYD
CCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHCCCC
YEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCC
NKKVNFDLLKKTSINKTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
CCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MKLTKSQQKAVSQLVNCYLESVNNNKKEIIDFQAPTGSGKTFIITNTINEIIKTNKANGS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCCC
PQKLIFVIATLSSADLPFQLEQNMNEYKYYINGLFDVELKESPSSKSAKKDSSYNILAEE
CCEEEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECC
NKVIIFGSSSFGKGRIITEEGILDAFLDEIKSQGYTLVYIRDEAHHGGNVNKTKIFEDFD
CEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
EKIHKNSFKKEETRFEYKIQEAASFIIKMTATPKGIHKLVFIDEKDLMDDDTKLLKDEHV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCE
YNLEIKELKEENIDDELLLTTACEQFLKIKEQYSKAKELKNIRPAMLIQVENEPNKEPQK
EECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHH
SEFLDKIEKIIKILEKHNLSVKYFSNDKEVQTNILINKKNNKISLKEISKKTSNVDVILF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHCCCCCCEEEEE
KIGPATGNIPRACMLVQLRNVSSKNLSVQTIGRIKRFPNPSFDKNEISYNSISNQYFIYS
EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
NIISEDKIRQTLILKDKYKNDRFFYGEINQEKINNYLNGETYKEEIVEKFEDSISNFEYY
CCCCHHHHHHHEEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
VNEEYRENFVKNQYLEGETSKIEGKTRVYTKIKNSIELELYIIEQLRKYKHLFPQKIIDF
ECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LETKFNEEKRKLNISINMYYVIIKEYLDQIEKIYKNSLEQMKKDNHELLFKLQNNKNLPN
HHHHCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
QNEIFIPIEKYKKCENMLDLNVCDKYAYKDLKEQNHYFDSLTESKFANRFLSLSNDNDKI
CCCEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
KNNVELWTKNPVFHGLKYQYFNEDGQISNSYPDFILKIKTHDQKDHYLYIEVKNLYSDYD
CCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHCCCC
YEKTKLLIESYQRYIENKNNNDNLILDELDKAEITILVCYINMKNQKDFYFYGASSNDVL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCC
NKKVNFDLLKKTSINKTPEQLVANKAKFIIDIKHLLDFLL
CCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA