Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358038

GI number: 13358038

Start: 544036

End: 545886

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU475

Alternate gene names: NA

Gene position: 545886-544036 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358039

Following gene: 13358027

Centisome position: 72.62

GC content: 21.07

Gene sequence:

>1851_bases
ATGAAACACAAAAAATACAAATCAATTTGATTGAAACTAAGTATGATTAGTGCTATACCTTTGTTAGCAACAATAATTAC
AACTTGTGCAAAAGTTGATACAAAACAAAAAGCTAAAGAAGAATTACAATCAAGTTTAAATAAAGCTGTTTTATTAAAAG
AAATAGTTGATCAATCATCTTATGAAGATTTTAAAAAGATATATAATCAAACTCTTAAATCAAATTTAGAAAACATTAAT
AAATTATCAGAGCAAAAATTAAAACAAGAACAACAAACAATTAAAAATTTAATTACACAAGTTAGTGTTTTAAATGAATT
AGATTCAATCAAAAACATGAGTGATTTAATAGATGTTGTTGAATTAGAAAACACTAAAAAACAATTACAAGATTTTTTAA
ATCAATATGAAAAATTACTTAATCAAGCAAGTGTTGATACTACAATAATTGATAAACTAAAATCTGATGCTCATCAAAAA
AGATTAGACACCAAAGCTTTAATTCAAAAAACAATTTTAGATTTAGCTAATAAAATTAAAAGCCTAATTAAAACATCTGG
ATTAAATAAAAACATTGTTGAGCTTGAAAATGATATTCAAAAATTAGTTAATAATGACACAAAAGCTAATTTTAAAAAAC
TATATGAAGATTTTAAATTAATTTACACTAAATTAAATGATATTAATGACTTAATTAACAAAGAACTAAAAGCTTTACCT
TTTATTAAAAAATTAGATGATATAGTTAATGTTATTAATACTATTTATGAACAAAATCATCATTTTCTATGATTTGATCA
AACTAAATTAACAAATTTAAGACAAATTTTAATAAAGAATATAAATCATGTATTAAATGTTAAAAAGACATTAGAGATCA
AAGAAATTAAAACTTTAACTAATCAACTTTTGGTTGACCTTCAAAATTACTTAGAAGGTTTAAAAATGATTGCGTTAGAA
AGTGAAAATAGTGTTAACAAATTAATCAGTATTATTGAATCATTACAACCAGATGATTATAATCCTTACTATAGTATTGA
AAAACAAGAAAATAAGCAAAAAGATGAAAACAATTCTCAAGCAACATATAATGGTTTAGAACACCAAATTAAAAGTTTAA
AATCAATCATTAACTTATTTGATTTTAACATTACTAATTTATCAATTGATGCAATCTATAATCTTAATGATGAATTAATT
AAAAAATTTCAAAAAGCTAATTCACAAATTAATGATGTTGTGATTAAAATTAAACAAACCATTTTATCAAATTTTAAACA
AATTTATTTATTTAAGTACTTCATTAAACATTTAAAAGAGTTTAATATTGAATTAAATAATGAAAACGATCCAATAAAAA
AAGCTAATCGAATTCAAACCATTCAAGAAGTCTTAAAAAGTTATGAAAAGGATTTATTTTTAAATACTAAAATTAATTTA
AAACTTGCTCCAAACGAAGTATTAACAGTAAATAATCTTGAAAAAATTGATTTAACATATGCTTCTGATTCGCTGCAAAA
ACCACAAGAATTAATCGCTTATTTAGAATTAAATAATAATCAAGAAAGAGAATTTAGCAAAGAACTTGAAAATCTTAGTG
TTAGAGTTTTTACTATCATTGATAAAAAACTTTATATTCCCAAAGCTAAAGAATTAATTGATGAAAGCAAAAAAATTATT
CAAACAAAAAATGAACATACAAATAATAAAGCAAAATTACAACGATTAGAAAAATTCACTAGTTTTGTTGAACAAGGAAT
AAGTAATGAAAATGTTTCTTCTTATACTCTTAATCTTTATATTCAAAGATTAACAAAACTGATTGAAGAAATTAAAAAAC
CACAGCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAATAATGTTAAAATATTTAAACGTTTAATTTGAATAATACTTAAATAACTAAGAAGTTAAGCTAGTAATTGAATAAT
TAATTATTGGAGTTTTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGCTAAATAATATCAAAACTCCTCTAAAGAACTTTTTCTAGTAGAGGAGTTTTGATATCTTACTATATTAATAAAAAT
TAATGATTATGAAGGATAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 616

Protein sequence:

>616_residues
MKHKKYKSIWLKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN
KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK
RLDTKALIQKTILDLANKIKSLIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP
FIKKLDDIVNVINTIYEQNHHFLWFDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQLLVDLQNYLEGLKMIALE
SENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQATYNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELI
KKFQKANSQINDVVIKIKQTILSNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINL
KLAPNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDKKLYIPKAKELIDESKKII
QTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQRLTKLIEEIKKPQH

Sequences:

>Translated_616_residues
MKHKKYKSI*LKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN
KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK
RLDTKALIQKTILDLANKIKSLIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP
FIKKLDDIVNVINTIYEQNHHFL*FDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQLLVDLQNYLEGLKMIALE
SENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQATYNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELI
KKFQKANSQINDVVIKIKQTILSNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINL
KLAPNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDKKLYIPKAKELIDESKKII
QTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQRLTKLIEEIKKPQH
>Mature_616_residues
MKHKKYKSI*LKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN
KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK
RLDTKALIQKTILDLANKIKSLIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP
FIKKLDDIVNVINTIYEQNHHFL*FDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQLLVDLQNYLEGLKMIALE
SENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQATYNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELI
KKFQKANSQINDVVIKIKQTILSNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINL
KLAPNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDKKLYIPKAKELIDESKKII
QTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQRLTKLIEEIKKPQH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71529; Mature: 71529

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
0.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
0.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHKKYKSILKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
EDFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLDTKALIQKTILDLANKIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPF
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKKLDDIVNVINTIYEQNHHFLFDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVDLQNYLEGLKMIALESENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQAT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHH
YNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELIKKFQKANSQINDVVIKIKQTIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
SNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINLKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECEEEEEE
APNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDK
CCCCEEEECCCHHEEEEECCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEECC
KLYIPKAKELIDESKKIIQTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQ
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
RLTKLIEEIKKPQH
HHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHKKYKSILKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
EDFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLDTKALIQKTILDLANKIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPF
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKKLDDIVNVINTIYEQNHHFLFDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVDLQNYLEGLKMIALESENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQAT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHH
YNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELIKKFQKANSQINDVVIKIKQTIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
SNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINLKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECEEEEEE
APNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDK
CCCCEEEECCCHHEEEEECCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEECC
KLYIPKAKELIDESKKIIQTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQ
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
RLTKLIEEIKKPQH
HHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA