| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358038
GI number: 13358038
Start: 544036
End: 545886
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU475
Alternate gene names: NA
Gene position: 545886-544036 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358039
Following gene: 13358027
Centisome position: 72.62
GC content: 21.07
Gene sequence:
>1851_bases ATGAAACACAAAAAATACAAATCAATTTGATTGAAACTAAGTATGATTAGTGCTATACCTTTGTTAGCAACAATAATTAC AACTTGTGCAAAAGTTGATACAAAACAAAAAGCTAAAGAAGAATTACAATCAAGTTTAAATAAAGCTGTTTTATTAAAAG AAATAGTTGATCAATCATCTTATGAAGATTTTAAAAAGATATATAATCAAACTCTTAAATCAAATTTAGAAAACATTAAT AAATTATCAGAGCAAAAATTAAAACAAGAACAACAAACAATTAAAAATTTAATTACACAAGTTAGTGTTTTAAATGAATT AGATTCAATCAAAAACATGAGTGATTTAATAGATGTTGTTGAATTAGAAAACACTAAAAAACAATTACAAGATTTTTTAA ATCAATATGAAAAATTACTTAATCAAGCAAGTGTTGATACTACAATAATTGATAAACTAAAATCTGATGCTCATCAAAAA AGATTAGACACCAAAGCTTTAATTCAAAAAACAATTTTAGATTTAGCTAATAAAATTAAAAGCCTAATTAAAACATCTGG ATTAAATAAAAACATTGTTGAGCTTGAAAATGATATTCAAAAATTAGTTAATAATGACACAAAAGCTAATTTTAAAAAAC TATATGAAGATTTTAAATTAATTTACACTAAATTAAATGATATTAATGACTTAATTAACAAAGAACTAAAAGCTTTACCT TTTATTAAAAAATTAGATGATATAGTTAATGTTATTAATACTATTTATGAACAAAATCATCATTTTCTATGATTTGATCA AACTAAATTAACAAATTTAAGACAAATTTTAATAAAGAATATAAATCATGTATTAAATGTTAAAAAGACATTAGAGATCA AAGAAATTAAAACTTTAACTAATCAACTTTTGGTTGACCTTCAAAATTACTTAGAAGGTTTAAAAATGATTGCGTTAGAA AGTGAAAATAGTGTTAACAAATTAATCAGTATTATTGAATCATTACAACCAGATGATTATAATCCTTACTATAGTATTGA AAAACAAGAAAATAAGCAAAAAGATGAAAACAATTCTCAAGCAACATATAATGGTTTAGAACACCAAATTAAAAGTTTAA AATCAATCATTAACTTATTTGATTTTAACATTACTAATTTATCAATTGATGCAATCTATAATCTTAATGATGAATTAATT AAAAAATTTCAAAAAGCTAATTCACAAATTAATGATGTTGTGATTAAAATTAAACAAACCATTTTATCAAATTTTAAACA AATTTATTTATTTAAGTACTTCATTAAACATTTAAAAGAGTTTAATATTGAATTAAATAATGAAAACGATCCAATAAAAA AAGCTAATCGAATTCAAACCATTCAAGAAGTCTTAAAAAGTTATGAAAAGGATTTATTTTTAAATACTAAAATTAATTTA AAACTTGCTCCAAACGAAGTATTAACAGTAAATAATCTTGAAAAAATTGATTTAACATATGCTTCTGATTCGCTGCAAAA ACCACAAGAATTAATCGCTTATTTAGAATTAAATAATAATCAAGAAAGAGAATTTAGCAAAGAACTTGAAAATCTTAGTG TTAGAGTTTTTACTATCATTGATAAAAAACTTTATATTCCCAAAGCTAAAGAATTAATTGATGAAAGCAAAAAAATTATT CAAACAAAAAATGAACATACAAATAATAAAGCAAAATTACAACGATTAGAAAAATTCACTAGTTTTGTTGAACAAGGAAT AAGTAATGAAAATGTTTCTTCTTATACTCTTAATCTTTATATTCAAAGATTAACAAAACTGATTGAAGAAATTAAAAAAC CACAGCATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTAATAATGTTAAAATATTTAAACGTTTAATTTGAATAATACTTAAATAACTAAGAAGTTAAGCTAGTAATTGAATAAT TAATTATTGGAGTTTTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGCTAAATAATATCAAAACTCCTCTAAAGAACTTTTTCTAGTAGAGGAGTTTTGATATCTTACTATATTAATAAAAAT TAATGATTATGAAGGATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 616
Protein sequence:
>616_residues MKHKKYKSIWLKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK RLDTKALIQKTILDLANKIKSLIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP FIKKLDDIVNVINTIYEQNHHFLWFDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQLLVDLQNYLEGLKMIALE SENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQATYNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELI KKFQKANSQINDVVIKIKQTILSNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINL KLAPNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDKKLYIPKAKELIDESKKII QTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQRLTKLIEEIKKPQH
Sequences:
>Translated_616_residues MKHKKYKSI*LKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK RLDTKALIQKTILDLANKIKSLIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP FIKKLDDIVNVINTIYEQNHHFL*FDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQLLVDLQNYLEGLKMIALE SENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQATYNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELI KKFQKANSQINDVVIKIKQTILSNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINL KLAPNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDKKLYIPKAKELIDESKKII QTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQRLTKLIEEIKKPQH >Mature_616_residues MKHKKYKSI*LKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK RLDTKALIQKTILDLANKIKSLIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP FIKKLDDIVNVINTIYEQNHHFL*FDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQLLVDLQNYLEGLKMIALE SENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQATYNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELI KKFQKANSQINDVVIKIKQTILSNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINL KLAPNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDKKLYIPKAKELIDESKKII QTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQRLTKLIEEIKKPQH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71529; Mature: 71529
Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKHKKYKSILKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH EDFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLDTKALIQKTILDLANKIKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPF HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKKLDDIVNVINTIYEQNHHFLFDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQ HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVDLQNYLEGLKMIALESENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQAT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHH YNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELIKKFQKANSQINDVVIKIKQTIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH SNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINLKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECEEEEEE APNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDK CCCCEEEECCCHHEEEEECCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEECC KLYIPKAKELIDESKKIIQTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQ HHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH RLTKLIEEIKKPQH HHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKHKKYKSILKLSMISAIPLLATIITTCAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH EDFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLDTKALIQKTILDLANKIKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKTSGLNKNIVELENDIQKLVNNDTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPF HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKKLDDIVNVINTIYEQNHHFLFDQTKLTNLRQILIKNINHVLNVKKTLEIKEIKTLTNQ HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVDLQNYLEGLKMIALESENSVNKLISIIESLQPDDYNPYYSIEKQENKQKDENNSQAT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHH YNGLEHQIKSLKSIINLFDFNITNLSIDAIYNLNDELIKKFQKANSQINDVVIKIKQTIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH SNFKQIYLFKYFIKHLKEFNIELNNENDPIKKANRIQTIQEVLKSYEKDLFLNTKINLKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECEEEEEE APNEVLTVNNLEKIDLTYASDSLQKPQELIAYLELNNNQEREFSKELENLSVRVFTIIDK CCCCEEEECCCHHEEEEECCHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEECC KLYIPKAKELIDESKKIIQTKNEHTNNKAKLQRLEKFTSFVEQGISNENVSSYTLNLYIQ HHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH RLTKLIEEIKKPQH HHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA