Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358006

GI number: 13358006

Start: 504656

End: 506542

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU443

Alternate gene names: NA

Gene position: 506542-504656 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358007

Following gene: 13358005

Centisome position: 67.38

GC content: 19.82

Gene sequence:

>1887_bases
ATGAAACACAAAAAATACAAATGAATTTGATTAAAACTAAGTATGATTAGTGCTATACCTTTGTTAGCAACAATAATTAC
AGCTTGTGCAAAAGTTGATACAAAACAAAAAGCTAAAGAAGAATTACAATCAAGTTTAAATAAAGCTGTTTTATTAAAAG
AAATAGTTGATCAATCATCTTATGAAGATTTTAAAAAGATATATAATCAAACTCTTAAATCAAATTTAGAAAACATTAAT
AAATTATCAGAGCAAAAATTAAAACAAGAACAACAAACAATTAAAAATTTAATTACACAAGTTAGTGTTTTAAATGAATT
AGATTCAATCAAAAACATGAGTGATTTAATAGATGTTGTTGAATTAGAAAACACTAAAAAACAATTACAAGATTTTTTAA
ATCAATATGAAAAATTACTTAATCAAGCAAGTGTTGATACTACAATAATTGATAAACTAAAATCTGATGCTCATCAAAAA
AGATTGCACACTAAAGCTTTAATTCAAAAAACAATTTTAGATTTAGCTAATAAAATTAAAAATTTAATTAAAACATCTGG
ATCAAATAAAAATATTGTCGAGATTGAAAGTGATATTCAAAAATTAGTTAATAATAACACAAAAGCTAATTTTAAAAAAC
TATATGAAGATTTTAAATTAATTTACACTAAATTAAATGATATTAATGATTTAATTAACAAAGAACTAAAAGCTTTACCT
TTTATTAAAAAATTAGATGATATTGTTAATGTTATTAATACTATTTACCAACAAAATTATAGTTTTTTATGATTTGATCA
ATTAAAATTAACTAATTTAAAACAAAATCTAAACAAGAATATCACTAATATTGTTAATGTTAAAAAATCATTAGATATTG
AACAAATTAAATCTTTAACTAATAAATTATTAAATGATTTACAAAATTATTTACAAGGTTTAAATACAATTGCATTAGAT
AGTGAAAATAGTATTAATAAATTAATTAGTATTATTCAATCATTAAAACCAGACGATTACAATCCTTACTATAGTATTGA
AAAACAACAAAATATCCAAAAAGACAAAAACAATAGTTCAAAAGCTACATATAATGGTTTAGAAAATCAAATTGAAAATT
TACAATCAATTATTAGTTTATTTAGCTTTAATACAAATAGCTTAACGATTGATAGTGCAAATAATCTTAATAATGAATTA
ACTAAAAAATTTGAAGATGCTAATACTAAAATTAGTTCAATTGTTGATCAAATCAAACAAACAATTCTATCAAACTTTAA
AAAAACTTATTTATTCAAAGATTTCATTAAACATCTAAAAGAATTTAATACTAAAGTTAATAGTGAAAATGATCAAGCAA
AGAAAACTAATAAAACCCAAACAATTCAAGATGTTTTAAATAGTTATAAAAATGATCCTTGAATAAATACTAAAGTCAGT
TTAAAACTTAGTGCAAATCAAACATTAACAATTGATAATCTAGAAAATATTGATTTAGCTTATTCTAATGATTTTTTATT
AAAACCAAAAGAGTTAATTAACTATTTAAAATTAGATAATAATCAAGAAAGGGTGTTCACAAAAGATATTGAAAATTTTA
GTGTTAAGATTTTTACGATTGTTGATAAAAAATTATATATTCCTGAAGCTAAAGAATTAATTGAAGAAAGTAAGAAAATT
ACTGAAACAAAAAATGGAAAAACAAATAACGAATCTAAAGTAGAAAGATTAAAAAAATTTACTAAATTTGTTGAACAAGG
AATTAACAATAATAATGTGTCTTCTTATACGTTAGATCTTTATAATAAAAAACTAAAAAAACTAATTGAAGAAGTTAAAA
AAATACAAAATGGAACTTCGCAAAAGATTGAAAATAATAGTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAATAATGTTAAAATATTTAAACGTTTAATTTGAATAATACTTAAATAACTAAGAAGTTAAGCTAGTAATTGAATAAT
TAATTCTTGGAGTTTTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCGATTACACAAAACCATTTTTAGATTGTTTTAATAGTATTTATTTAAAAAAGTTATTTTATTTACTAAAAAGTATTA
ATTTAAAGGTGTTTTTGCAT

Product: membrane lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628

Protein sequence:

>628_residues
MKHKKYKWIWLKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN
KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK
RLHTKALIQKTILDLANKIKNLIKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP
FIKKLDDIVNVINTIYQQNYSFLWFDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKLLNDLQNYLQGLNTIALD
SENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKATYNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNEL
TKKFEDANTKISSIVDQIKQTILSNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDPWINTKVS
LKLSANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKKLYIPEAKELIEESKKI
TETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKKLKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK

Sequences:

>Translated_628_residues
MKHKKYK*I*LKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN
KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK
RLHTKALIQKTILDLANKIKNLIKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP
FIKKLDDIVNVINTIYQQNYSFL*FDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKLLNDLQNYLQGLNTIALD
SENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKATYNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNEL
TKKFEDANTKISSIVDQIKQTILSNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDP*INTKVS
LKLSANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKKLYIPEAKELIEESKKI
TETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKKLKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK
>Mature_628_residues
MKHKKYK*I*LKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN
KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK
RLHTKALIQKTILDLANKIKNLIKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP
FIKKLDDIVNVINTIYQQNYSFL*FDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKLLNDLQNYLQGLNTIALD
SENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKATYNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNEL
TKKFEDANTKISSIVDQIKQTILSNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDP*INTKVS
LKLSANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKKLYIPEAKELIEESKKI
TETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKKLKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71937; Mature: 71937

Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
0.5 %Met     (Translated Protein)
0.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
0.5 %Met     (Mature Protein)
0.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHKKYKILKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
DFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLHTKALIQKTILDLANKIKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPFI
HHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKLDDIVNVINTIYQQNYSFLFDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LNDLQNYLQGLNTIALDSENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKAT
HHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHH
YNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNELTKKFEDANTKISSIVDQIKQTIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
SNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDPINTKVSLKLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEE
ANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKK
CCCEEEECCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEECCH
LYIPEAKELIEESKKITETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHKKYKILKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
DFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLHTKALIQKTILDLANKIKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPFI
HHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKLDDIVNVINTIYQQNYSFLFDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LNDLQNYLQGLNTIALDSENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKAT
HHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHH
YNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNELTKKFEDANTKISSIVDQIKQTIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
SNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDPINTKVSLKLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEE
ANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKK
CCCEEEECCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEECCH
LYIPEAKELIEESKKITETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA