Definition | Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009089 |
Length | 4,290,252 |
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The map label for this gene is 126698565
Identifier: 126698565
GI number: 126698565
Start: 1144782
End: 1146020
Strand: Direct
Name: 126698565
Synonym: CD0981
Alternate gene names: NA
Gene position: 1144782-1146020 (Clockwise)
Preceding gene: 126698564
Following gene: 126698566
Centisome position: 26.68
GC content: 24.37
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 412; Mature: 412
Protein sequence:
>412_residues MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLFNLNVFAISQDNSKHILFSAI ISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSAMSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNV ERFIYSQFSLIFFIVIANKMKGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVATIPVILTLLALCFCVLSVIEN SEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFAVIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFI EILNIGIKSYPV
Sequences:
>Translated_412_residues MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLFNLNVFAISQDNSKHILFSAI ISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSAMSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNV ERFIYSQFSLIFFIVIANKMKGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVATIPVILTLLALCFCVLSVIEN SEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFAVIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFI EILNIGIKSYPV >Mature_412_residues MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLFNLNVFAISQDNSKHILFSAI ISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSAMSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNV ERFIYSQFSLIFFIVIANKMKGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVATIPVILTLLALCFCVLSVIEN SEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFAVIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFI EILNIGIKSYPV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46958; Mature: 46958
Theoretical pI: Translated: 9.35; Mature: 9.35
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 4.1 %Met (Translated Protein) 5.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 4.1 %Met (Mature Protein) 5.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEE NLNVFAISQDNSKHILFSAIISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSA EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH MSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNVERFIYSQFSLIFFIVIANKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVAT HHHHHHHHCCHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCEEH IPVILTLLALCFCVLSVIENSEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHH VIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFIEILNIGIKSYPV HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHCCCC >Mature Secondary Structure MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEE NLNVFAISQDNSKHILFSAIISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSA EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH MSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNVERFIYSQFSLIFFIVIANKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVAT HHHHHHHHCCHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCEEH IPVILTLLALCFCVLSVIENSEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHH VIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFIEILNIGIKSYPV HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA