Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

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The map label for this gene is 126698565

Identifier: 126698565

GI number: 126698565

Start: 1144782

End: 1146020

Strand: Direct

Name: 126698565

Synonym: CD0981

Alternate gene names: NA

Gene position: 1144782-1146020 (Clockwise)

Preceding gene: 126698564

Following gene: 126698566

Centisome position: 26.68

GC content: 24.37

Gene sequence:

>1239_bases
ATGGATGGTGATATATTGATGAGTAAAATATTAAAATATAAAAACGAGATGTTTTTGTTTATATTAGTTGTAATAACTTA
CTTAATAATAACTAAGATATTTTTTTCTAAGACTACTATATTTTATGATTTAAACAATACTTATGATGTATTGTTAGATA
CAGATACAGGAGTTTTATTCAATTTAAATGTATTTGCTATAAGTCAAGACAATAGTAAGCACATATTGTTTTCAGCAATT
ATATCAATTTTTGCATATCCAATATACCTATTTTGTACTTCAATAGCAAATCCTGGGACAACAGATTTTAATAGTGCCTA
TGGGTTTGGACTAATTTGTCTACAAATAATAACTAGTGCTATGTCAATAACTTTAGTCTTTAATCATATTAAAAAGATAA
AAATGCAGAGATTAACTTTAATTTTACTTACTATGATAATGATATTTTCTTTTCCACAGTTATTTATGACTTTAAATGTA
GAGAGATTTATATATAGCCAATTTTCATTAATATTTTTCATAGTTATTGCAAATAAGATGAAAGGAAAAAATTCTTATTT
GATAGAATTAGCAGCTATTCCTCTATTTGGAATAACTATTAGTAATATATATTTGTATTTTTTTAATATGATATTTGAGT
TTAAATTAAAAATAGGAAAAATGTTAAAACATTTAATTACATTTATCCTAATGGCATATATTTGTGTAGTTTCAACGAAG
TCTTATGAGAGTTTTATGAACCTTGGAAATGTAATACAGTATGATACGAAATTTATAAGTGGAGAACCAATTTTGGAAAA
GATTGCAATGATTATAGAGAGATTACTGTACTCGGTTTTTTATTTTCCTGGAGCAAGTATTAAAAAAGGGTTATTTTTGC
AAAATGGAGAAGTTGCTACAATACCAGTAATTCTTACATTATTAGCTTTATGTTTTTGTGTTTTATCAGTTATTGAAAAT
TCAGAAAAAAGAGTTCCTAAGCTATGTATGGGAATAATTATATTCAATCTAACTTTACATGGTATAGTAGGATATAATCT
AGTCAATTCAAGTATTATGGCTATAAATTTTAGTTTTGCAGTTATAATTTTATTGGCTTACTTTACGAAAGCGCTTAGAA
AAAATGAAAAGAATATGTATAATATATTTCTATCGCTGTTATTGGTTACTATAGTAATCAGTAATGTCAATGGATTTATA
GAAATTTTAAACATAGGGATAAAATCATATCCTGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAGTTATTCAATTACAATAAAACAAGTAAGAACATTATGAAGATGGCTATTAAATATAAGGAATAAATTGTAGGTGT
CAGCAAATCCTATATAATGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAATATTGAAAGGGTAGTAAGTTTATGAAACAGACCAATACAAGTATAAGGCTTCTTACTAAAATTTCAGATTATA
TAAAGTTAATGAGAATAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 412; Mature: 412

Protein sequence:

>412_residues
MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLFNLNVFAISQDNSKHILFSAI
ISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSAMSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNV
ERFIYSQFSLIFFIVIANKMKGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK
SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVATIPVILTLLALCFCVLSVIEN
SEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFAVIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFI
EILNIGIKSYPV

Sequences:

>Translated_412_residues
MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLFNLNVFAISQDNSKHILFSAI
ISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSAMSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNV
ERFIYSQFSLIFFIVIANKMKGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK
SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVATIPVILTLLALCFCVLSVIEN
SEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFAVIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFI
EILNIGIKSYPV
>Mature_412_residues
MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLFNLNVFAISQDNSKHILFSAI
ISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSAMSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNV
ERFIYSQFSLIFFIVIANKMKGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK
SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVATIPVILTLLALCFCVLSVIEN
SEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFAVIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFI
EILNIGIKSYPV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46958; Mature: 46958

Theoretical pI: Translated: 9.35; Mature: 9.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
5.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEE
NLNVFAISQDNSKHILFSAIISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSA
EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
MSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNVERFIYSQFSLIFFIVIANKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVAT
HHHHHHHHCCHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCEEH
IPVILTLLALCFCVLSVIENSEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHH
VIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFIEILNIGIKSYPV
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MDGDILMSKILKYKNEMFLFILVVITYLIITKIFFSKTTIFYDLNNTYDVLLDTDTGVLF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEE
NLNVFAISQDNSKHILFSAIISIFAYPIYLFCTSIANPGTTDFNSAYGFGLICLQIITSA
EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
MSITLVFNHIKKIKMQRLTLILLTMIMIFSFPQLFMTLNVERFIYSQFSLIFFIVIANKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KGKNSYLIELAAIPLFGITISNIYLYFFNMIFEFKLKIGKMLKHLITFILMAYICVVSTK
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SYESFMNLGNVIQYDTKFISGEPILEKIAMIIERLLYSVFYFPGASIKKGLFLQNGEVAT
HHHHHHHHCCHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCEEH
IPVILTLLALCFCVLSVIENSEKRVPKLCMGIIIFNLTLHGIVGYNLVNSSIMAINFSFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHH
VIILLAYFTKALRKNEKNMYNIFLSLLLVTIVISNVNGFIEILNIGIKSYPV
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA