Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9301, complete genome. |
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Accession | NC_009091 |
Length | 1,641,879 |
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The map label for this gene is 126696810
Identifier: 126696810
GI number: 126696810
Start: 1239448
End: 1241553
Strand: Reverse
Name: 126696810
Synonym: P9301_14721
Alternate gene names: NA
Gene position: 1241553-1239448 (Counterclockwise)
Preceding gene: 126696812
Following gene: 126696809
Centisome position: 75.62
GC content: 31.53
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GGTCGATTTTCATGATTTTTTTTAATAACTCTGTAAGACCATGTGAAAAAATTTTTTAACTTGATAAAATTTGTCTAAGA ATTTTCAATAGGATATTTGC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTACAAACTTCAAGATCATCTATAATAATTAAAATTACTTTTTAATAATGTTTGATGAACTCTCGTCACGCTTTGAAGAC GCAGTAAAGGGTTTAAGAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701
Protein sequence:
>701_residues MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS SNREVAGLILLWESGSAKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIHLLQ RMGKLENRRKELEEDLLALLPFRILDLLSRDLNDQESHKKGLSMLENLIIKRGGLEGDNKSVYKDYLNQQDFEAFFQQIK PFLTVQEQIDLFIELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLIGCLDLLLADIDQASA RFSSSSDENLQDWLNNYPGNKLEAICTYCKNWLQNDVLVGYRDIDSKDVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNRIAIRSNF QNQQVEKETSTKTTEDFDNLLGNIDERRLPWPGGIKQDYENAEIKENEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAELKFSFGEFL NDKKIIYQSPYLVYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQEEVIAEKPLISKDKNQKISEKNIIQEIKKNPSSKLNSIPE KSTSIISYEFKELNSPSPSLEDIRNLINGWLLSKSNYLAGKSEINLSKIVSKGLIDRTIEERENDIKKGIYKEINSQIRK IDLESQTSSRIVVLVELNYLERIVKNSGEFVNETSLTPLKVRYILGFSNKSWKLVDFVSGL
Sequences:
>Translated_701_residues MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS SNREVAGLILLWESGSAKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIHLLQ RMGKLENRRKELEEDLLALLPFRILDLLSRDLNDQESHKKGLSMLENLIIKRGGLEGDNKSVYKDYLNQQDFEAFFQQIK PFLTVQEQIDLFIELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLIGCLDLLLADIDQASA RFSSSSDENLQDWLNNYPGNKLEAICTYCKNWLQNDVLVGYRDIDSKDVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNRIAIRSNF QNQQVEKETSTKTTEDFDNLLGNIDERRLPWPGGIKQDYENAEIKENEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAELKFSFGEFL NDKKIIYQSPYLVYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQEEVIAEKPLISKDKNQKISEKNIIQEIKKNPSSKLNSIPE KSTSIISYEFKELNSPSPSLEDIRNLINGWLLSKSNYLAGKSEINLSKIVSKGLIDRTIEERENDIKKGIYKEINSQIRK IDLESQTSSRIVVLVELNYLERIVKNSGEFVNETSLTPLKVRYILGFSNKSWKLVDFVSGL >Mature_701_residues MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS SNREVAGLILLWESGSAKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIHLLQ RMGKLENRRKELEEDLLALLPFRILDLLSRDLNDQESHKKGLSMLENLIIKRGGLEGDNKSVYKDYLNQQDFEAFFQQIK PFLTVQEQIDLFIELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLIGCLDLLLADIDQASA RFSSSSDENLQDWLNNYPGNKLEAICTYCKNWLQNDVLVGYRDIDSKDVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNRIAIRSNF QNQQVEKETSTKTTEDFDNLLGNIDERRLPWPGGIKQDYENAEIKENEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAELKFSFGEFL NDKKIIYQSPYLVYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQEEVIAEKPLISKDKNQKISEKNIIQEIKKNPSSKLNSIPE KSTSIISYEFKELNSPSPSLEDIRNLINGWLLSKSNYLAGKSEINLSKIVSKGLIDRTIEERENDIKKGIYKEINSQIRK IDLESQTSSRIVVLVELNYLERIVKNSGEFVNETSLTPLKVRYILGFSNKSWKLVDFVSGL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80643; Mature: 80643
Theoretical pI: Translated: 5.07; Mature: 5.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 1.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 1.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ESRREYENLLLNGNSGLDFSSNREVAGLILLWESGSAKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIHLLQRMGKLENRRKELEEDLLALL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFRILDLLSRDLNDQESHKKGLSMLENLIIKRGGLEGDNKSVYKDYLNQQDFEAFFQQIK HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH PFLTVQEQIDLFIELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SMPLIGCLDLLLADIDQASARFSSSSDENLQDWLNNYPGNKLEAICTYCKNWLQNDVLVG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE YRDIDSKDVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNRIAIRSNFQNQQVEKETSTKTTEDFDNL EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LGNIDERRLPWPGGIKQDYENAEIKENEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAELKFSFGEFL HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NDKKIIYQSPYLVYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQEEVIAEKPLISKDKNQKISE CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHH KNIIQEIKKNPSSKLNSIPEKSTSIISYEFKELNSPSPSLEDIRNLINGWLLSKSNYLAG HHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KSEINLSKIVSKGLIDRTIEERENDIKKGIYKEINSQIRKIDLESQTSSRIVVLVELNYL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHH ERIVKNSGEFVNETSLTPLKVRYILGFSNKSWKLVDFVSGL HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ESRREYENLLLNGNSGLDFSSNREVAGLILLWESGSAKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSNAADFLHEGIHLLQRMGKLENRRKELEEDLLALL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFRILDLLSRDLNDQESHKKGLSMLENLIIKRGGLEGDNKSVYKDYLNQQDFEAFFQQIK HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH PFLTVQEQIDLFIELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SMPLIGCLDLLLADIDQASARFSSSSDENLQDWLNNYPGNKLEAICTYCKNWLQNDVLVG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE YRDIDSKDVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKSNRIAIRSNFQNQQVEKETSTKTTEDFDNL EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LGNIDERRLPWPGGIKQDYENAEIKENEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAELKFSFGEFL HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NDKKIIYQSPYLVYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQEEVIAEKPLISKDKNQKISE CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHH KNIIQEIKKNPSSKLNSIPEKSTSIISYEFKELNSPSPSLEDIRNLINGWLLSKSNYLAG HHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KSEINLSKIVSKGLIDRTIEERENDIKKGIYKEINSQIRKIDLESQTSSRIVVLVELNYL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHH ERIVKNSGEFVNETSLTPLKVRYILGFSNKSWKLVDFVSGL HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA