Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 123965529

GI number: 123965529

Start: 269391

End: 270971

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: P9515_02941

Alternate gene names: 123965529

Gene position: 270971-269391 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123965534

Following gene: 123965526

Centisome position: 15.9

GC content: 29.1

Gene sequence:

>1581_bases
ATGAATTCATATTTAAAAAACAATATAGTATCAATTTCCTTTGCCACATCCCTAAGTAAAGCTGCGGGTTGTATTAGACA
AATATTTATAGCTGCGGCCTTTGGGGTTGGAACAACATATGATGCGTTCAATTATGCTTACATAATTCCTGGGTTTTTAC
TTATTCTTATTGGAGGTATTAACGGTCCATTACATAATGCTGTTGTAGCCGTAATAACCCCTCTTAATAAGCGCGATGGG
GCTATTGTTCTAACAAAAGTAAGTATTAAATTAACTTTTTTATTTTTTTTATTAGGAATAATTATATTTTTTAATTCCGA
TTTTTTTATAAATTTTATAGGTCCAAATTTAAGTATCGAATCCAAATCAATTGCAAGTTACCAACTAAAATTACTAACTC
CTTGCATCCCTTTATCAGCTTTTATAGGTTTAAGTTTTGGAGCTCTCAATTCAAGAAATAAATTTTTCTTATCCAGTATA
AGTCCAGCTTTTACAAGTCTTACAACAATTTTATTTATTACAATCAGTTGGATTATAAATTCTCAAAATACAACTTCCAA
TAATTTTTTTTATACAGGATTACTAGCTTCAGCAACCTTGACAGGTACTTGCATTCAATTCGTTATACAACTCTGGGAAA
TAAATAAGATCGGCTTATTAAGATTTAAATTAGGAGTCCAATCAGTTAACAGTGAAGAGAAAAGAATCTTAAAATTGATC
GCGCCTGCATCAATTTCATCAGGTTTAGGACAAATAAATGTTTTTATCGATATGTTTTTCGCTTCAAGTTTTCAAGGAGC
TGCATCAGGTTTAGCCTACGGTAACTTTCTTATACAAGCGCCACTTGGAATCTTATCAAACGTTTTAATTTTGCCACTAC
TCCCAAAGTTTTCAAGATTCCAGAGTAATCAAGAAATTAGAGCTCTAGAAAAAAGTTTAATCTCAGGAATAGAATACTGT
TTTTTAACAACTCTTTTTTTAACGGGTTTTTTCATCACATTTAATAATCAGATAGTGCAGTTTGTTTTTCAAAGAGGTGC
TTTTAATTCTGAGGCAGTTTCTTTAGTAAAAAATATTTTAATTGCCTATGCTGTTGGAATTCCGTTTTATCTTTACAGAG
ATTTATTGGTAAGAACTTACTACTCTATTGAGAAACCCAAGTTACCCTTTCAATTATCTTTAGGAGGAATAATACTGAAT
GTTTTTTTTGATTGGTTTTTACTTGGAGCTCCAATACATAATTTTGGAAATTTATTACCTTATAATTTTGGTGTAATTGG
GATAATCCTTTCTTCAGGACTAGTTAATTTAATTATTTGTATTTTTCTTTCTGCAAATTTTAATGTTTATAAAATCAAAA
TATCTATACCTATTTTATTAAAGAGGATTTTTCTTATTTCATTAGCTTGCTTAATTACCAGCACAACTTGCTACGCCATA
ATCAAAGATTTCGATGAATTAAACTCGAACATTTTGAGTTTAATAATATTAATTATTGGATTTTTAGCTTTTTCGATAAT
TTATTTTTCGATAACCAGATTATTAGGGGTTAATAAATTAAAACTACCAATTAAAATGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTCAAAATTAATGATCCGATCATCCATAGATATTCTATAAAATAAAATAAAATATAATTGACTATATATCTTCTTAGAA
AAAATTTTAATCAATATCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAACATTCATAAATTATCAAGTATTTCCTCTAAATCACAAATTTGAGATGAAGTTATCAACTTAGATAATTGAATTGTT
TGATCTCCATCCCCTATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 526

Protein sequence:

>526_residues
MNSYLKNNIVSISFATSLSKAAGCIRQIFIAAAFGVGTTYDAFNYAYIIPGFLLILIGGINGPLHNAVVAVITPLNKRDG
AIVLTKVSIKLTFLFFLLGIIIFFNSDFFINFIGPNLSIESKSIASYQLKLLTPCIPLSAFIGLSFGALNSRNKFFLSSI
SPAFTSLTTILFITISWIINSQNTTSNNFFYTGLLASATLTGTCIQFVIQLWEINKIGLLRFKLGVQSVNSEEKRILKLI
APASISSGLGQINVFIDMFFASSFQGAASGLAYGNFLIQAPLGILSNVLILPLLPKFSRFQSNQEIRALEKSLISGIEYC
FLTTLFLTGFFITFNNQIVQFVFQRGAFNSEAVSLVKNILIAYAVGIPFYLYRDLLVRTYYSIEKPKLPFQLSLGGIILN
VFFDWFLLGAPIHNFGNLLPYNFGVIGIILSSGLVNLIICIFLSANFNVYKIKISIPILLKRIFLISLACLITSTTCYAI
IKDFDELNSNILSLIILIIGFLAFSIIYFSITRLLGVNKLKLPIKM

Sequences:

>Translated_526_residues
MNSYLKNNIVSISFATSLSKAAGCIRQIFIAAAFGVGTTYDAFNYAYIIPGFLLILIGGINGPLHNAVVAVITPLNKRDG
AIVLTKVSIKLTFLFFLLGIIIFFNSDFFINFIGPNLSIESKSIASYQLKLLTPCIPLSAFIGLSFGALNSRNKFFLSSI
SPAFTSLTTILFITISWIINSQNTTSNNFFYTGLLASATLTGTCIQFVIQLWEINKIGLLRFKLGVQSVNSEEKRILKLI
APASISSGLGQINVFIDMFFASSFQGAASGLAYGNFLIQAPLGILSNVLILPLLPKFSRFQSNQEIRALEKSLISGIEYC
FLTTLFLTGFFITFNNQIVQFVFQRGAFNSEAVSLVKNILIAYAVGIPFYLYRDLLVRTYYSIEKPKLPFQLSLGGIILN
VFFDWFLLGAPIHNFGNLLPYNFGVIGIILSSGLVNLIICIFLSANFNVYKIKISIPILLKRIFLISLACLITSTTCYAI
IKDFDELNSNILSLIILIIGFLAFSIIYFSITRLLGVNKLKLPIKM
>Mature_526_residues
MNSYLKNNIVSISFATSLSKAAGCIRQIFIAAAFGVGTTYDAFNYAYIIPGFLLILIGGINGPLHNAVVAVITPLNKRDG
AIVLTKVSIKLTFLFFLLGIIIFFNSDFFINFIGPNLSIESKSIASYQLKLLTPCIPLSAFIGLSFGALNSRNKFFLSSI
SPAFTSLTTILFITISWIINSQNTTSNNFFYTGLLASATLTGTCIQFVIQLWEINKIGLLRFKLGVQSVNSEEKRILKLI
APASISSGLGQINVFIDMFFASSFQGAASGLAYGNFLIQAPLGILSNVLILPLLPKFSRFQSNQEIRALEKSLISGIEYC
FLTTLFLTGFFITFNNQIVQFVFQRGAFNSEAVSLVKNILIAYAVGIPFYLYRDLLVRTYYSIEKPKLPFQLSLGGIILN
VFFDWFLLGAPIHNFGNLLPYNFGVIGIILSSGLVNLIICIFLSANFNVYKIKISIPILLKRIFLISLACLITSTTCYAI
IKDFDELNSNILSLIILIIGFLAFSIIYFSITRLLGVNKLKLPIKM

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=421, Percent_Identity=23.9904988123515, Blast_Score=90, Evalue=4e-19,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58124; Mature: 58124

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNSYLKNNIVSISFATSLSKAAGCIRQIFIAAAFGVGTTYDAFNYAYIIPGFLLILIGGI
CCCCHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
NGPLHNAVVAVITPLNKRDGAIVLTKVSIKLTFLFFLLGIIIFFNSDFFINFIGPNLSIE
CCCHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEC
SKSIASYQLKLLTPCIPLSAFIGLSFGALNSRNKFFLSSISPAFTSLTTILFITISWIIN
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
SQNTTSNNFFYTGLLASATLTGTCIQFVIQLWEINKIGLLRFKLGVQSVNSEEKRILKLI
CCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECHHCCCHHHHHHHHHH
APASISSGLGQINVFIDMFFASSFQGAASGLAYGNFLIQAPLGILSNVLILPLLPKFSRF
CCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
QSNQEIRALEKSLISGIEYCFLTTLFLTGFFITFNNQIVQFVFQRGAFNSEAVSLVKNIL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
IAYAVGIPFYLYRDLLVRTYYSIEKPKLPFQLSLGGIILNVFFDWFLLGAPIHNFGNLLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
YNFGVIGIILSSGLVNLIICIFLSANFNVYKIKISIPILLKRIFLISLACLITSTTCYAI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKDFDELNSNILSLIILIIGFLAFSIIYFSITRLLGVNKLKLPIKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCC
>Mature Secondary Structure
MNSYLKNNIVSISFATSLSKAAGCIRQIFIAAAFGVGTTYDAFNYAYIIPGFLLILIGGI
CCCCHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
NGPLHNAVVAVITPLNKRDGAIVLTKVSIKLTFLFFLLGIIIFFNSDFFINFIGPNLSIE
CCCHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEC
SKSIASYQLKLLTPCIPLSAFIGLSFGALNSRNKFFLSSISPAFTSLTTILFITISWIIN
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
SQNTTSNNFFYTGLLASATLTGTCIQFVIQLWEINKIGLLRFKLGVQSVNSEEKRILKLI
CCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECHHCCCHHHHHHHHHH
APASISSGLGQINVFIDMFFASSFQGAASGLAYGNFLIQAPLGILSNVLILPLLPKFSRF
CCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
QSNQEIRALEKSLISGIEYCFLTTLFLTGFFITFNNQIVQFVFQRGAFNSEAVSLVKNIL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
IAYAVGIPFYLYRDLLVRTYYSIEKPKLPFQLSLGGIILNVFFDWFLLGAPIHNFGNLLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
YNFGVIGIILSSGLVNLIICIFLSANFNVYKIKISIPILLKRIFLISLACLITSTTCYAI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKDFDELNSNILSLIILIIGFLAFSIIYFSITRLLGVNKLKLPIKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8590279; 8905231 [H]