Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
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Accession | NC_008709 |
Length | 4,559,598 |
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The map label for this gene is 119946787
Identifier: 119946787
GI number: 119946787
Start: 3914631
End: 3916697
Strand: Reverse
Name: 119946787
Synonym: Ping_3180
Alternate gene names: NA
Gene position: 3916697-3914631 (Counterclockwise)
Preceding gene: 119946788
Following gene: 119946785
Centisome position: 85.9
GC content: 44.7
Gene sequence:
>2067_bases TTGCCCGGATCCCATGATGAAGATGGTGCTCCTCGTTGGCTGCTATATGACAGTGTCCGCAATTGCTATTTTACTCTGGC AGAATCGGCACTGGATCTGATTCGTTATTGGTCTCCAGGTGTGACTGCTGATCTGATGTCACAGGATCTTGAAAGCCGGA AATTATTCTATGATTCAACAGAAATTCGTGCATTTGCTGATTTTTTGATTGTTAATCATCTGGTGGCGGCTCGTTCTAAA GAGGCTTGCGATTATTTTTCAAAGCAGAAGAATGCCAGACGTAAGGGGATTTGGAGCTGGATGCTGCACAATTATCTTTT TGTACGGATCCCGTTACTGCGACCGGATCCTTTACTCAGTAAAATGGTGCCCAAGCTTGCTTGGTTATTTAGCCCTAAAA CGCATTGGACATTATTACTATTAGGGCTGCTGGGCGCATTACTGGTATTGCGACAATGGGACACTTTCAGTTCAACTTTT GTTTATTTCTTTAGCTTTGAAGGAATGATCCTCTATGCCTTGACCCTTGTTGTGGTGAAAAGTGCTCATGAGTTTGGTCA TGCACTGGTTGCACACCGGTTAGGATGCAGAGTTGCCTCAATGGGGGTGGCATTGTTAGTTATGTTACCGATACTGTATA CGGACACGACTGATGCATGGAAACTGCGCTCTAAAAGGGATCGTCTGAGCATTGTCACGGCAGGGGTACGGACCGAGCTG TATCTGGCTCTGTTTGCCACTTTTATGTGGTCCGTCTTGGCGGATGGTCCATGGCGTAGTGCCGCATTTTTTGTTGCAAC GACCAGCTGGGTGACCTCATTGCTGGTGAATATAAGCCCTTTTCTTAGGTTTGATGGTTATTATGCGCTTTCAGATCTGC TGGGTATTGAAAACTTGCAGCAGCGGGCATTTGCACTGGGTCGTTGGCAACTTCGTCGATTTCTTTGGGGGATTGATGAT CCCCTTCCCGAACCGCATCCTAGATCGCGGGCGAGGTTGTTAATTGTGTATGCCTGGTGTGTCTGGGTATACCGTTTTTT TCTTTTTCTTGGCATTGCACTGTTGGTTTACCATTTCTTTTTTAAGGTATTGGGGCTCCTGCTTTTCGCTGTCGAACTTA TTTGGTTTATTGTTATGCCGGTTGTTAGAGAGCTTAAAATATGGCGACAACGTCATGCTGATTTTAATTTTACGCCATTG CGTTTACTGGGGTGGGCATTGCCTGTTATTGCTTTTATTTTTGCAATACTGCCTTTGCCGACAGAGGTTTCCATTCCAGC AGTTATCAAGGCTGAATATTCTCAATTTCTATTTGCACCCGAAGCCGCACAGGTTGATACGCTTTATGCCGATATAGGTG AACAGGTGCAGACTGAGCAATTATTATTACGTCTGAAAGCGCCAGAGCTGGAGAATGCTATCCGTCAAATCAAGGAGAAG TTGCAGTTGGCAGAGCTTCTGCTCTCAAGGCAGGCCACTTCATTTGAAGAAAGAGAGCAACAAGTCAATAATCGGGAACG GATCAGGCAACTCCAAGTGCAGTTAGCGGGATTTTATAGCAGACAACAATTACTTGAAATTCGGTCTCCTTACTCTGGAT ATCTATCAGCGATGGAAATACTTAGGCCGGAGCAATGGGTTGGTAAAGATCAATTGTTGCTAACCTTGGTTGACCCGGAA TCTCTTAAAATAGAAGGGTTTGTCGATGAGCGCGATCTTAACCTTTTATCGATAGGCAGCAGCGGCGTTTTTATCAGTAA TTCAGGTGAAGATAAGGGTATTCCTGTCATTTTGGAGGATATTGATATCAGTGCTATTGCCTCGCTTCCTTACCCTGAGT TAGGGTCTGGCACAGGCGGTTCAGTGGCTGTTCGTTATACAGATAAGAAACTAATTCCAGAAATGGCTCATTATCGGATC AGTGTCAGCCTTGATAAACGGCCAGATGCCGACAGAGAATTTCTGCGTCAGCCAGGTATACTGGTTATAGAAGGAAAGAA ACAAAGTTGGTTATGGAAACAGTGCAAGCGAATTATATCGATTGCCTTTAGAGAATCTGGATTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTGTTCTTTTATCTGTTCCGCCGTCCGGTCACAACTTTTAGACAGTGGTTAGGGTGGTAGAGCCGGGTTTACCTGCTC TTAGGCAGGATCTGAAATTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAACATTGATGCTGTCGATGGTTGTGGGGCATTCACCCCTTTTTTATGATTCATTGAACTTATTAAAAATGAAAATAAA TGTCTGTTTTTTCCGTTTTT
Product: peptidase M50
Products: NA
Alternate protein names: M50 Family Peptidase; Peptidase; Peptidase Family M; HlyD Domain-Containing Protein; Membrane-Fusion Protein; Membrane-Fusion Protein Contains Peptidase Family; Integral Membrane Protein; Transmembrane Protein; Membrane-Fusion Domain; Zn-Dependent Protease; Zinc Metallopeptidase; Secretion Protein HlyD Family Protein; Membrane Zinc Metallopeptidase
Number of amino acids: Translated: 688; Mature: 687
Protein sequence:
>688_residues MPGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDSTEIRAFADFLIVNHLVAARSK EACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLSKMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTF VYFFSFEGMILYALTLVVVKSAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQQRAFALGRWQLRRFLWGIDD PLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFFFKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPL RLLGWALPVIAFIFAILPLPTEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEILRPEQWVGKDQLLLTLVDPE SLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILEDIDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRI SVSLDKRPDADREFLRQPGILVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF
Sequences:
>Translated_688_residues MPGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDSTEIRAFADFLIVNHLVAARSK EACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLSKMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTF VYFFSFEGMILYALTLVVVKSAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQQRAFALGRWQLRRFLWGIDD PLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFFFKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPL RLLGWALPVIAFIFAILPLPTEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEILRPEQWVGKDQLLLTLVDPE SLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILEDIDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRI SVSLDKRPDADREFLRQPGILVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF >Mature_687_residues PGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDSTEIRAFADFLIVNHLVAARSKE ACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLSKMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTFV YFFSFEGMILYALTLVVVKSAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTELY LALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQQRAFALGRWQLRRFLWGIDDP LPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFFFKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPLR LLGWALPVIAFIFAILPLPTEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEKL QLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEILRPEQWVGKDQLLLTLVDPES LKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILEDIDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRIS VSLDKRPDADREFLRQPGILVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78981; Mature: 78850
Theoretical pI: Translated: 8.76; Mature: 8.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDST CCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH EIRAFADFLIVNHLVAARSKEACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCHHHH KMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTFVYFFSFEGMILYALTLVVVK HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHH SAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQ HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH QRAFALGRWQLRRFLWGIDDPLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPLRLLGWALPVIAFIFAILPLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK CCCCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEI HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LRPEQWVGKDQLLLTLVDPESLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILED HCCHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCEEEEC IDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRISVSLDKRPDADREFLRQPGI CCHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCE LVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure PGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDST CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH EIRAFADFLIVNHLVAARSKEACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCHHHH KMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTFVYFFSFEGMILYALTLVVVK HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHH SAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQ HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH QRAFALGRWQLRRFLWGIDDPLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPLRLLGWALPVIAFIFAILPLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK CCCCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEI HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LRPEQWVGKDQLLLTLVDPESLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILED HCCHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCEEEEC IDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRISVSLDKRPDADREFLRQPGI CCHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCE LVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA