Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is 119946787

Identifier: 119946787

GI number: 119946787

Start: 3914631

End: 3916697

Strand: Reverse

Name: 119946787

Synonym: Ping_3180

Alternate gene names: NA

Gene position: 3916697-3914631 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119946788

Following gene: 119946785

Centisome position: 85.9

GC content: 44.7

Gene sequence:

>2067_bases
TTGCCCGGATCCCATGATGAAGATGGTGCTCCTCGTTGGCTGCTATATGACAGTGTCCGCAATTGCTATTTTACTCTGGC
AGAATCGGCACTGGATCTGATTCGTTATTGGTCTCCAGGTGTGACTGCTGATCTGATGTCACAGGATCTTGAAAGCCGGA
AATTATTCTATGATTCAACAGAAATTCGTGCATTTGCTGATTTTTTGATTGTTAATCATCTGGTGGCGGCTCGTTCTAAA
GAGGCTTGCGATTATTTTTCAAAGCAGAAGAATGCCAGACGTAAGGGGATTTGGAGCTGGATGCTGCACAATTATCTTTT
TGTACGGATCCCGTTACTGCGACCGGATCCTTTACTCAGTAAAATGGTGCCCAAGCTTGCTTGGTTATTTAGCCCTAAAA
CGCATTGGACATTATTACTATTAGGGCTGCTGGGCGCATTACTGGTATTGCGACAATGGGACACTTTCAGTTCAACTTTT
GTTTATTTCTTTAGCTTTGAAGGAATGATCCTCTATGCCTTGACCCTTGTTGTGGTGAAAAGTGCTCATGAGTTTGGTCA
TGCACTGGTTGCACACCGGTTAGGATGCAGAGTTGCCTCAATGGGGGTGGCATTGTTAGTTATGTTACCGATACTGTATA
CGGACACGACTGATGCATGGAAACTGCGCTCTAAAAGGGATCGTCTGAGCATTGTCACGGCAGGGGTACGGACCGAGCTG
TATCTGGCTCTGTTTGCCACTTTTATGTGGTCCGTCTTGGCGGATGGTCCATGGCGTAGTGCCGCATTTTTTGTTGCAAC
GACCAGCTGGGTGACCTCATTGCTGGTGAATATAAGCCCTTTTCTTAGGTTTGATGGTTATTATGCGCTTTCAGATCTGC
TGGGTATTGAAAACTTGCAGCAGCGGGCATTTGCACTGGGTCGTTGGCAACTTCGTCGATTTCTTTGGGGGATTGATGAT
CCCCTTCCCGAACCGCATCCTAGATCGCGGGCGAGGTTGTTAATTGTGTATGCCTGGTGTGTCTGGGTATACCGTTTTTT
TCTTTTTCTTGGCATTGCACTGTTGGTTTACCATTTCTTTTTTAAGGTATTGGGGCTCCTGCTTTTCGCTGTCGAACTTA
TTTGGTTTATTGTTATGCCGGTTGTTAGAGAGCTTAAAATATGGCGACAACGTCATGCTGATTTTAATTTTACGCCATTG
CGTTTACTGGGGTGGGCATTGCCTGTTATTGCTTTTATTTTTGCAATACTGCCTTTGCCGACAGAGGTTTCCATTCCAGC
AGTTATCAAGGCTGAATATTCTCAATTTCTATTTGCACCCGAAGCCGCACAGGTTGATACGCTTTATGCCGATATAGGTG
AACAGGTGCAGACTGAGCAATTATTATTACGTCTGAAAGCGCCAGAGCTGGAGAATGCTATCCGTCAAATCAAGGAGAAG
TTGCAGTTGGCAGAGCTTCTGCTCTCAAGGCAGGCCACTTCATTTGAAGAAAGAGAGCAACAAGTCAATAATCGGGAACG
GATCAGGCAACTCCAAGTGCAGTTAGCGGGATTTTATAGCAGACAACAATTACTTGAAATTCGGTCTCCTTACTCTGGAT
ATCTATCAGCGATGGAAATACTTAGGCCGGAGCAATGGGTTGGTAAAGATCAATTGTTGCTAACCTTGGTTGACCCGGAA
TCTCTTAAAATAGAAGGGTTTGTCGATGAGCGCGATCTTAACCTTTTATCGATAGGCAGCAGCGGCGTTTTTATCAGTAA
TTCAGGTGAAGATAAGGGTATTCCTGTCATTTTGGAGGATATTGATATCAGTGCTATTGCCTCGCTTCCTTACCCTGAGT
TAGGGTCTGGCACAGGCGGTTCAGTGGCTGTTCGTTATACAGATAAGAAACTAATTCCAGAAATGGCTCATTATCGGATC
AGTGTCAGCCTTGATAAACGGCCAGATGCCGACAGAGAATTTCTGCGTCAGCCAGGTATACTGGTTATAGAAGGAAAGAA
ACAAAGTTGGTTATGGAAACAGTGCAAGCGAATTATATCGATTGCCTTTAGAGAATCTGGATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTGTTCTTTTATCTGTTCCGCCGTCCGGTCACAACTTTTAGACAGTGGTTAGGGTGGTAGAGCCGGGTTTACCTGCTC
TTAGGCAGGATCTGAAATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAACATTGATGCTGTCGATGGTTGTGGGGCATTCACCCCTTTTTTATGATTCATTGAACTTATTAAAAATGAAAATAAA
TGTCTGTTTTTTCCGTTTTT

Product: peptidase M50

Products: NA

Alternate protein names: M50 Family Peptidase; Peptidase; Peptidase Family M; HlyD Domain-Containing Protein; Membrane-Fusion Protein; Membrane-Fusion Protein Contains Peptidase Family; Integral Membrane Protein; Transmembrane Protein; Membrane-Fusion Domain; Zn-Dependent Protease; Zinc Metallopeptidase; Secretion Protein HlyD Family Protein; Membrane Zinc Metallopeptidase

Number of amino acids: Translated: 688; Mature: 687

Protein sequence:

>688_residues
MPGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDSTEIRAFADFLIVNHLVAARSK
EACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLSKMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTF
VYFFSFEGMILYALTLVVVKSAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL
YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQQRAFALGRWQLRRFLWGIDD
PLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFFFKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPL
RLLGWALPVIAFIFAILPLPTEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK
LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEILRPEQWVGKDQLLLTLVDPE
SLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILEDIDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRI
SVSLDKRPDADREFLRQPGILVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF

Sequences:

>Translated_688_residues
MPGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDSTEIRAFADFLIVNHLVAARSK
EACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLSKMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTF
VYFFSFEGMILYALTLVVVKSAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL
YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQQRAFALGRWQLRRFLWGIDD
PLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFFFKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPL
RLLGWALPVIAFIFAILPLPTEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK
LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEILRPEQWVGKDQLLLTLVDPE
SLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILEDIDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRI
SVSLDKRPDADREFLRQPGILVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF
>Mature_687_residues
PGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDSTEIRAFADFLIVNHLVAARSKE
ACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLSKMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTFV
YFFSFEGMILYALTLVVVKSAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTELY
LALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQQRAFALGRWQLRRFLWGIDDP
LPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFFFKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPLR
LLGWALPVIAFIFAILPLPTEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEKL
QLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEILRPEQWVGKDQLLLTLVDPES
LKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILEDIDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRIS
VSLDKRPDADREFLRQPGILVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78981; Mature: 78850

Theoretical pI: Translated: 8.76; Mature: 8.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDST
CCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH
EIRAFADFLIVNHLVAARSKEACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCHHHH
KMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTFVYFFSFEGMILYALTLVVVK
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
SAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
QRAFALGRWQLRRFLWGIDDPLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPLRLLGWALPVIAFIFAILPLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TEVSIPAVIKAEYSQFLFAPEAAQVDTLYADIGEQVQTEQLLLRLKAPELENAIRQIKEK
CCCCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
LRPEQWVGKDQLLLTLVDPESLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILED
HCCHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCEEEEC
IDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRISVSLDKRPDADREFLRQPGI
CCHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCE
LVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
PGSHDEDGAPRWLLYDSVRNCYFTLAESALDLIRYWSPGVTADLMSQDLESRKLFYDST
CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCH
EIRAFADFLIVNHLVAARSKEACDYFSKQKNARRKGIWSWMLHNYLFVRIPLLRPDPLLS
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KMVPKLAWLFSPKTHWTLLLLGLLGALLVLRQWDTFSSTFVYFFSFEGMILYALTLVVVK
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
SAHEFGHALVAHRLGCRVASMGVALLVMLPILYTDTTDAWKLRSKRDRLSIVTAGVRTEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
YLALFATFMWSVLADGPWRSAAFFVATTSWVTSLLVNISPFLRFDGYYALSDLLGIENLQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
QRAFALGRWQLRRFLWGIDDPLPEPHPRSRARLLIVYAWCVWVYRFFLFLGIALLVYHFF
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FKVLGLLLFAVELIWFIVMPVVRELKIWRQRHADFNFTPLRLLGWALPVIAFIFAILPLP
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LQLAELLLSRQATSFEEREQQVNNRERIRQLQVQLAGFYSRQQLLEIRSPYSGYLSAMEI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
LRPEQWVGKDQLLLTLVDPESLKIEGFVDERDLNLLSIGSSGVFISNSGEDKGIPVILED
HCCHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCEEEEC
IDISAIASLPYPELGSGTGGSVAVRYTDKKLIPEMAHYRISVSLDKRPDADREFLRQPGI
CCHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCE
LVIEGKKQSWLWKQCKRIISIAFRESGF
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA