Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yfbS [C]

Identifier: 119944562

GI number: 119944562

Start: 1000111

End: 1001838

Strand: Direct

Name: yfbS [C]

Synonym: Ping_0799

Alternate gene names: 119944562

Gene position: 1000111-1001838 (Clockwise)

Preceding gene: 119944561

Following gene: 119944563

Centisome position: 21.93

GC content: 41.84

Gene sequence:

>1728_bases
ATGAATATTGACTCCTATTTTGTTTTATCTGTTTTTGTCGGGACGATTATTGGCTTAATTAAGTTTCAACAGCGTCCTGC
TTTTGTTTTTGGTATTACGCTGCTGATTTTGTTTGTCTCTAATATGGTGAGTACTGAACAGGTTGTGTCAAGTTTTGCTA
ATCAGGGATTGCTGACCTTAATACTGTTACTGGTTTGTTCACTTGCCCTTGAAAAAACCCGATTTTTACGGATGATTGCA
ACTAAGGTTATTCATAAAAGCTATGGAAAAACCTTTTTTCATTTGTTCAGTTTTACGGTTTTATCTTCCGCCTTATTAAA
TAATACCGCCGTAGTATCCACTATGTTGGCACCGATCCGCAATAACCCTCACCATGCTGGCAGTAAATTATTGTTGCCGC
TGTCCTATGCCGCTATTCTCGGTGGTACGCTGACCCTTGTTGGTACCTCTACTAACTTAATTGTGAACAGTTTGGTGATA
GGCGCAGGATTACCTCCCCTTTCTTTTTTTGATTTCACCCTGGTTGGCATCTGTCTGGTTATTACTTGTGGCATCGCGTT
ATGGTTTTTATCACGCTTTTTACCAGAACATCATGTTAATTCTGAAGTGCTGAAAACTTACTTTATAGATGCGAAAGTGG
GCGAAAAATCGACCTTAGTGGGTAAAACCATTGAGGAGAATGGTTTTCGCCAGTTAGAATCATTATTTCTTGTTGAGATT
GTGCGCGCCGAGCATTTGCTTAGCCCGGTGCCGCCTACCGAGGTATTGCAGATAAATGACCGCTTAATTTTTAGTGGTGA
TGTGGCCAAAGTTCAGCAATTAAATCAATTTGATGGTTTGTCTATTTTTGCTCATCATCAGGGCTTGCGGCTTGATAATC
TAACTGAAGTGGTTATTCGTCCTGAAAGTGTCTTACTGGGTAGAACGTTAAAAAAAGCCGGGTTTCGTGCTTTATTTGAT
GCGGCCGTGGTTGCCATTAAGCGTGATGGGGAAAATTTATCCGGCAAGCTGGGTGAAGTGACTTTAAACGCGGGTGATTA
TCTGGTCTTAGCGGTTGGTGACGATTTTAAATCACGGCGTAATATCAGTAAAAACTTCATTTTGGTCAGCGGTGTTGAAC
TTGATTCAATGCTTAGTGGTGGCAAGGCGTTACTCGCTATATTAGGTTTTTTTGCGGCTATTCTCGGCTCGGCATTGGGT
CTTTTTACTCTGTTTAAAGGTCTGATTATTTTACTCGGATTACTGATTTTGACCGGCAGTGTCTCATCGGGTGAGTTATT
ACGCAGGTTGCCCGCCGAGCTATGGTTAATTATCTCCTCTGCCTTGGCGCTTTCTTATTCATTAAAAAATAGTGGATTAC
TGGATGTCTTCTCGGTTTTTATGGACAATTATGCGCTTGGCATCTCACCGTTATTTGCGCTGGTTATTATCTATATTTTG
ACCTGGTTGTTAACTGAGCTGGTAACCAATAACGCTGCAGCTGCACTGATTTTTCCTATCGCCTATGGTTTGGCGGTCAC
CCTGGATGCTAACCCAATGGCCTTTATTATGGCCGTCGCCTTTGGTGCCAGTGGTAGTTTTGTCAGCCCCTACGGTTATC
AAACTAACCTGATGGTCTTTAACGCCGGGCAATACAAGTTAATTGATTTTGTAAAAATCGGCTTACCCGTCAGTATTATT
TATGGTGTTGTTGCCGTCACTGCGATTACGCTGGTTTTTGGATTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCTGTCTGCTGATTATATGGCTGTCGGTTGTCGGCTGTCTGTTTTCAGTCGATAGCTGATGACTGATAGCTGATGACTG
ATAACTGATGGCTGACTTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCGGCGATCAGCCGATTGCCGTCAGCTTTCAGTTTTCTGCTGTCAGCTGATAGCCGTCAGCGGTTTGCTTTCAGCTGTT
AGCTGATAACCGTCAGCCGA

Product: potasium uptake protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 575; Mature: 575

Protein sequence:

>575_residues
MNIDSYFVLSVFVGTIIGLIKFQQRPAFVFGITLLILFVSNMVSTEQVVSSFANQGLLTLILLLVCSLALEKTRFLRMIA
TKVIHKSYGKTFFHLFSFTVLSSALLNNTAVVSTMLAPIRNNPHHAGSKLLLPLSYAAILGGTLTLVGTSTNLIVNSLVI
GAGLPPLSFFDFTLVGICLVITCGIALWFLSRFLPEHHVNSEVLKTYFIDAKVGEKSTLVGKTIEENGFRQLESLFLVEI
VRAEHLLSPVPPTEVLQINDRLIFSGDVAKVQQLNQFDGLSIFAHHQGLRLDNLTEVVIRPESVLLGRTLKKAGFRALFD
AAVVAIKRDGENLSGKLGEVTLNAGDYLVLAVGDDFKSRRNISKNFILVSGVELDSMLSGGKALLAILGFFAAILGSALG
LFTLFKGLIILLGLLILTGSVSSGELLRRLPAELWLIISSALALSYSLKNSGLLDVFSVFMDNYALGISPLFALVIIYIL
TWLLTELVTNNAAAALIFPIAYGLAVTLDANPMAFIMAVAFGASGSFVSPYGYQTNLMVFNAGQYKLIDFVKIGLPVSII
YGVVAVTAITLVFGL

Sequences:

>Translated_575_residues
MNIDSYFVLSVFVGTIIGLIKFQQRPAFVFGITLLILFVSNMVSTEQVVSSFANQGLLTLILLLVCSLALEKTRFLRMIA
TKVIHKSYGKTFFHLFSFTVLSSALLNNTAVVSTMLAPIRNNPHHAGSKLLLPLSYAAILGGTLTLVGTSTNLIVNSLVI
GAGLPPLSFFDFTLVGICLVITCGIALWFLSRFLPEHHVNSEVLKTYFIDAKVGEKSTLVGKTIEENGFRQLESLFLVEI
VRAEHLLSPVPPTEVLQINDRLIFSGDVAKVQQLNQFDGLSIFAHHQGLRLDNLTEVVIRPESVLLGRTLKKAGFRALFD
AAVVAIKRDGENLSGKLGEVTLNAGDYLVLAVGDDFKSRRNISKNFILVSGVELDSMLSGGKALLAILGFFAAILGSALG
LFTLFKGLIILLGLLILTGSVSSGELLRRLPAELWLIISSALALSYSLKNSGLLDVFSVFMDNYALGISPLFALVIIYIL
TWLLTELVTNNAAAALIFPIAYGLAVTLDANPMAFIMAVAFGASGSFVSPYGYQTNLMVFNAGQYKLIDFVKIGLPVSII
YGVVAVTAITLVFGL
>Mature_575_residues
MNIDSYFVLSVFVGTIIGLIKFQQRPAFVFGITLLILFVSNMVSTEQVVSSFANQGLLTLILLLVCSLALEKTRFLRMIA
TKVIHKSYGKTFFHLFSFTVLSSALLNNTAVVSTMLAPIRNNPHHAGSKLLLPLSYAAILGGTLTLVGTSTNLIVNSLVI
GAGLPPLSFFDFTLVGICLVITCGIALWFLSRFLPEHHVNSEVLKTYFIDAKVGEKSTLVGKTIEENGFRQLESLFLVEI
VRAEHLLSPVPPTEVLQINDRLIFSGDVAKVQQLNQFDGLSIFAHHQGLRLDNLTEVVIRPESVLLGRTLKKAGFRALFD
AAVVAIKRDGENLSGKLGEVTLNAGDYLVLAVGDDFKSRRNISKNFILVSGVELDSMLSGGKALLAILGFFAAILGSALG
LFTLFKGLIILLGLLILTGSVSSGELLRRLPAELWLIISSALALSYSLKNSGLLDVFSVFMDNYALGISPLFALVIIYIL
TWLLTELVTNNAAAALIFPIAYGLAVTLDANPMAFIMAVAFGASGSFVSPYGYQTNLMVFNAGQYKLIDFVKIGLPVSII
YGVVAVTAITLVFGL

Specific function: Unknown

COG id: COG0471

COG function: function code P; Di- and tricarboxylate transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 RCK C-terminal domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788629, Length=576, Percent_Identity=23.7847222222222, Blast_Score=112, Evalue=8e-26,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI17551790, Length=145, Percent_Identity=29.6551724137931, Blast_Score=68, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001898
- InterPro:   IPR006037 [H]

Pfam domain/function: PF00939 Na_sulph_symp; PF02080 TrkA_C [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62138; Mature: 62138

Theoretical pI: Translated: 8.70; Mature: 8.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIDSYFVLSVFVGTIIGLIKFQQRPAFVFGITLLILFVSNMVSTEQVVSSFANQGLLTL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHH
ILLLVCSLALEKTRFLRMIATKVIHKSYGKTFFHLFSFTVLSSALLNNTAVVSTMLAPIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHC
NNPHHAGSKLLLPLSYAAILGGTLTLVGTSTNLIVNSLVIGAGLPPLSFFDFTLVGICLV
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ITCGIALWFLSRFLPEHHVNSEVLKTYFIDAKVGEKSTLVGKTIEENGFRQLESLFLVEI
HHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VRAEHLLSPVPPTEVLQINDRLIFSGDVAKVQQLNQFDGLSIFAHHQGLRLDNLTEVVIR
HHHHHHCCCCCCCCEEEECCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHEEC
PESVLLGRTLKKAGFRALFDAAVVAIKRDGENLSGKLGEVTLNAGDYLVLAVGDDFKSRR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHHC
NISKNFILVSGVELDSMLSGGKALLAILGFFAAILGSALGLFTLFKGLIILLGLLILTGS
CCCCCEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VSSGELLRRLPAELWLIISSALALSYSLKNSGLLDVFSVFMDNYALGISPLFALVIIYIL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TWLLTELVTNNAAAALIFPIAYGLAVTLDANPMAFIMAVAFGASGSFVSPYGYQTNLMVF
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
NAGQYKLIDFVKIGLPVSIIYGVVAVTAITLVFGL
ECCCEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNIDSYFVLSVFVGTIIGLIKFQQRPAFVFGITLLILFVSNMVSTEQVVSSFANQGLLTL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHH
ILLLVCSLALEKTRFLRMIATKVIHKSYGKTFFHLFSFTVLSSALLNNTAVVSTMLAPIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHC
NNPHHAGSKLLLPLSYAAILGGTLTLVGTSTNLIVNSLVIGAGLPPLSFFDFTLVGICLV
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ITCGIALWFLSRFLPEHHVNSEVLKTYFIDAKVGEKSTLVGKTIEENGFRQLESLFLVEI
HHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VRAEHLLSPVPPTEVLQINDRLIFSGDVAKVQQLNQFDGLSIFAHHQGLRLDNLTEVVIR
HHHHHHCCCCCCCCEEEECCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHEEC
PESVLLGRTLKKAGFRALFDAAVVAIKRDGENLSGKLGEVTLNAGDYLVLAVGDDFKSRR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHHC
NISKNFILVSGVELDSMLSGGKALLAILGFFAAILGSALGLFTLFKGLIILLGLLILTGS
CCCCCEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VSSGELLRRLPAELWLIISSALALSYSLKNSGLLDVFSVFMDNYALGISPLFALVIIYIL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TWLLTELVTNNAAAALIFPIAYGLAVTLDANPMAFIMAVAFGASGSFVSPYGYQTNLMVF
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
NAGQYKLIDFVKIGLPVSIIYGVVAVTAITLVFGL
ECCCEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]