Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is 119944216

Identifier: 119944216

GI number: 119944216

Start: 554907

End: 556457

Strand: Direct

Name: 119944216

Synonym: Ping_0438

Alternate gene names: NA

Gene position: 554907-556457 (Clockwise)

Preceding gene: 119944215

Following gene: 119944217

Centisome position: 12.17

GC content: 36.56

Gene sequence:

>1551_bases
ATGACGACAGATTCACTTGGGAAGACCAAAGAAGATTTAACAGGGCAAGATCGCTTTGCTTGGAATTTAATGGTGAGTTG
GGTTAGTCAGCTTGTCCTTGTTTTTTCTGGTTTTATTATGCCACGTTTAGTGGATGATAAAGTTGGGCAAGATTTACTTG
GAATTTGGGATTTTGGTTGGTCTTTTGTTAGTTATTTAAGTTTAGTTGGCTTGGGAATGGGGGCATGTTTCAATCGCTAT
ATTGCAAAGCATCGTTCATCTGGTGACTTTTTTTCACTTAACAAAGTGGCAAACTCAGCTGTTTTTGTGCAATTAATTTT
TTCTACTGTTACTGCTCTATGTACCATCTCTTTCTACTTGCTATTACCAATTTATTTTAGTGATGTGCTACAAGAAAATA
TCGCAACTGCACAGTGGGTGGTGTTGTTTTTAGGGTTGAGTGTATCGGTACAAATGATAGCAGGCTCAGCAAGCGGGTTA
TTAACAGGTTACCACCGTTGGGATATTCACAATGCCTTACATGCAGGAGACAGCTTTTTTTCATTAATTTTGATGGTTAT
TGCGCTGTATTTTACAGATCTAAATGTTGCTGGGATGGCAATTGGTTATTTGCTTTCAACCATTTTATTTGAAACTTTAC
GCTTTGTTTTTGTTAATAAGTTATGTAAAGAATTTAAGTTTGATTTACGTATGGCTAATTTTATAAGTTGCAAAGAGATG
CTGGTGTTTGGCATTAAAAGCATGCTTTCGAATGTTCCACCCATTCTCTTATTACAAACAATTAGCATTATGCTAGTGAG
TGCTATCGGGCCTGCTGCATTAGCTGTTTTTGCAAGACCAATGGCATTAACTAAGCAAGTCAAAACCTTTATGACTAAGT
TTACGTTAATGCTCACACCTACTACTAGTTCTATGCAGGGATCTGGCGATATTAAGGCTATCCAGTCTCTTTTTATCAGT
ACAACAAAACTCAGTTTTGCGTTTACGTTACCTAGTTTAGGGTTTTTATTTATTTATGGTGATGTCGTTTTATACTACTG
GATGGGTAGTGAATATGCACTATCCTCGTTAGTAATGATTTTAGCTCTTGGTCAGGTACTGCCAATGGGACAAGATACCT
CTATTCGAATCTTGATGGGCATGAACCAACATGGAAGAATTTCTCTTTTTGCTTTCATCTCTGTATTTGCTTTTTTCGCG
GTAGGTCTTCTTTTTTCCGGTGTCAATGATTGGGAATTAACCACTGCTGCCCTATTATTTGTTGTGCCGATGAATATTGT
TTATGGCCTTATTGTGCCAATTTATACATGTCGGGAATTAGAATTGTCATGGTTCAGTTATGTGCAAAGCAGCTTTATCA
GGCCAGTTATATATGTTATTCCATTTTTGGCCTTACTTTATTGGTCTCGTCAAGCTTTTGAGGCTAAAGATATTATTACA
GCATCAGTAACTTTTTTCTTTGCGGGTATAGTCACCATCATTATCTATTTCGTTTATTTAGTTCCCAATAAAATGCAGCA
AAAACTTCTGCTTCGTTGTAAATTTCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGACCGCTGGAAAGAACAGTTGAGTAAAACGGAGCTTAAGTGTTTTTATGATGTGGTCGGTGAGTACCATAATTCACTCG
GCTACACGGAATAGAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAATTATTTTAAAATATATTTATTAAGGTTAACTAAATATGGATGTTAGTTTACGAAAGTACCCGTACCCTTATAGTGC
AATGCTGGCTATTTGTAGTG

Product: transporter of NadC family protein

Products: NA

Alternate protein names: Transporter Of NADC Family Protein

Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 515

Protein sequence:

>516_residues
MTTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGWSFVSYLSLVGLGMGACFNRY
IAKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYLLLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGL
LTGYHRWDIHNALHAGDSFFSLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEM
LVFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTPTTSSMQGSGDIKAIQSLFIS
TTKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMILALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFA
VGLLFSGVNDWELTTAALLFVVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIIT
ASVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ

Sequences:

>Translated_516_residues
MTTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGWSFVSYLSLVGLGMGACFNRY
IAKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYLLLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGL
LTGYHRWDIHNALHAGDSFFSLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEM
LVFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTPTTSSMQGSGDIKAIQSLFIS
TTKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMILALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFA
VGLLFSGVNDWELTTAALLFVVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIIT
ASVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ
>Mature_515_residues
TTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGWSFVSYLSLVGLGMGACFNRYI
AKHRSSGDFFSLNKVANSAVFVQLIFSTVTALCTISFYLLLPIYFSDVLQENIATAQWVVLFLGLSVSVQMIAGSASGLL
TGYHRWDIHNALHAGDSFFSLILMVIALYFTDLNVAGMAIGYLLSTILFETLRFVFVNKLCKEFKFDLRMANFISCKEML
VFGIKSMLSNVPPILLLQTISIMLVSAIGPAALAVFARPMALTKQVKTFMTKFTLMLTPTTSSMQGSGDIKAIQSLFIST
TKLSFAFTLPSLGFLFIYGDVVLYYWMGSEYALSSLVMILALGQVLPMGQDTSIRILMGMNQHGRISLFAFISVFAFFAV
GLLFSGVNDWELTTAALLFVVPMNIVYGLIVPIYTCRELELSWFSYVQSSFIRPVIYVIPFLALLYWSRQAFEAKDIITA
SVTFFFAGIVTIIIYFVYLVPNKMQQKLLLRCKFQ

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57761; Mature: 57630

Theoretical pI: Translated: 8.69; Mature: 8.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TTDSLGKTKEDLTGQDRFAWNLMVSWVSQLVLVFSGFIMPRLVDDKVGQDLLGIWDFGW
CCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA