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The map label for this gene is cyoB [H]

Identifier: 116515214

GI number: 116515214

Start: 327820

End: 329793

Strand: Reverse

Name: cyoB [H]

Synonym: BCc_290

Alternate gene names: 116515214

Gene position: 329793-327820 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116515215

Following gene: 116515213

Centisome position: 79.2

GC content: 25.89

Gene sequence:

>1974_bases
ATGTTTGGAAAATTAACAATTAATTCAATACCATATCATGAACCAATTATTATAGGAACTTGTTTTTTAATTTTTCTTTT
TTCATTATTAGTATGTGTATATATTACATATGTGAAAAAATGGAAATATTTATGGAATGAATGGTTTACTTCTGTTGATC
ATAAAAAAATTTCTGTTATGTATTTTATTTTATCTTTTGTTATGTTTCTTAGAGGTTTTTCAGATGCAATAATTATGAGA
TTACAACAATTTTTTTCATCATTACCAGAGCATACTAGTATTTTTTCATCTGATCATTATGATCAAGTGTTTACAGCTCA
TGGAGTAATTATGATTTTTTTTGTTGCAATGCCATTAGTAATAGGTTTAATGAATTTAGTAATTCCTTTACAAATTGGAG
CTAGAGATCTCGCTTTTCCTGTTCTTAATAATATAAGTTTTTGGCTAACTGCTAGTTCATCAGTATTATTAATGATTTCT
TTAGGAGTAGGAGAATTTGCTAAAACTGGTTGGTTAGGATATCCTCCATTATCTGGAATTATATACAGTCCGGGTGTAGG
AGTTGATTATTGGATTTGGGTTTTACAAATCTCTGGTATTGGAACAATATTAACATCTATAAATTTTATAGTAACAATTA
TTAATCTTCGTGCTCCTGGTATGTCAATGTTTAAATTACCTGTTTTTACTTGGACTTCTTTATGTACTAATATTCTTATT
TTAATTTCTTTTCCAGTTTTATTTATTACATTATTATTTTTATCATTAGATAGATATGCTGGTTTTCATTTTTTTACAAA
TGATTTGGGTGGAAATATGATGTTATATGTTAATTTGATTTGGATATGGGGACATCCAGAAGTTTACATATTGATTCTAC
CTATATTTGGTATTTTTTCTGAAGTTGTTTCAACATTTTCAGAAAAATCATTATTTGGATATATTTCTTTAATTTGGGCA
ACAATTGTTATTACTGTTTTATCATTCATTGTATGGTTACATCATTTTTTTACAATGGGTTCAGGGGCTAATGTTAATTC
TTTTTTTAGCATTACTACAATGATTATAGCTATTCCTACTGGAGTAAAGATTTTTAATTGGTTGTTTACTATGTTTCGTG
GACGTATTAGATTCCATTCTTCTATGTTATGGACTATTGGGTTTCTAATTAGTTTTACAATTGGAGGAATGGCTGGAGTA
TTATTATCAATACCTCCTATTGATTTTGTACTTCATAATAGTTTATTTTTAGTTGCACATTTTCATAATGTTATCATAGG
TGGTGTTGTTTTTGGTTGTTTTGCTGGAATTACTTATTGGTTTCCAAAAATTTTTGGATTTAAATTAAATGAATATTGGG
GAAAATGTGCTTTTGTTTTTTGGATAACAGGTTTTTTTACAGCGTTTATGCCACTATATATACTTGGTTGTATGGGAATG
ACACGTAGATTAAGTCAAAATATTGACTGTGAATATCATGGGTTATTGACTATTTCTGCTATTGGTGTGTTTTTTATTTT
TTTAGGTATTTTATTTCAAATTATACAAATAATTGTTTCAATTAAAAATCGTAATACATTAGAATATAAAGATAATACTG
GTGATCCTTGGAATGGAAGAACATTAGAATGGTCTATTCCTTCTCCTCCACCAATATATAATTTTGCAATTATACCACAA
ATAAAAACTATAGATAATTTTTGGTTTGATAAAGTAAATAATAAGGGTAATATAAAAAATAATATTTTTACAAAAATTCA
TATGCCAAGTAATTCTTATTTTGGTATTGCAATTGGTTGTTGTTCTACTTTTTTTGGTTTTTCTATTGTTTGGCATATCT
GGTGGTTAGTATGGGTTTCATTGTTTGGCATTTTTTTTATTTTATTAAAAAAATTTTTTACATTTGATAAAGGATATTTT
ATTTCAATAAAAAAAATAAAAGATATTGAAAACAAACATTTATTAAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATAAAATAATTAAAATATTTAATTCTTGTCATAATACATAATTAAATGTTTTTTCTAAAAATAATATTTATACTTTTT
TATTATAAGGATTGTTTCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTAAATTTCATTTATTAAGTAATATTTTTATATAAGGAATTAATATGAATAATAAAAAAGATTATGTTTCATATTCT
TCACTAAAAAATAATAGTAT

Product: CyoB

Products: NA

Alternate protein names: Cytochrome o subunit 1; Cytochrome o ubiquinol oxidase subunit 1; Oxidase BO(3) subunit 1; Ubiquinol oxidase chain A; Ubiquinol oxidase polypeptide I [H]

Number of amino acids: Translated: 657; Mature: 657

Protein sequence:

>657_residues
MFGKLTINSIPYHEPIIIGTCFLIFLFSLLVCVYITYVKKWKYLWNEWFTSVDHKKISVMYFILSFVMFLRGFSDAIIMR
LQQFFSSLPEHTSIFSSDHYDQVFTAHGVIMIFFVAMPLVIGLMNLVIPLQIGARDLAFPVLNNISFWLTASSSVLLMIS
LGVGEFAKTGWLGYPPLSGIIYSPGVGVDYWIWVLQISGIGTILTSINFIVTIINLRAPGMSMFKLPVFTWTSLCTNILI
LISFPVLFITLLFLSLDRYAGFHFFTNDLGGNMMLYVNLIWIWGHPEVYILILPIFGIFSEVVSTFSEKSLFGYISLIWA
TIVITVLSFIVWLHHFFTMGSGANVNSFFSITTMIIAIPTGVKIFNWLFTMFRGRIRFHSSMLWTIGFLISFTIGGMAGV
LLSIPPIDFVLHNSLFLVAHFHNVIIGGVVFGCFAGITYWFPKIFGFKLNEYWGKCAFVFWITGFFTAFMPLYILGCMGM
TRRLSQNIDCEYHGLLTISAIGVFFIFLGILFQIIQIIVSIKNRNTLEYKDNTGDPWNGRTLEWSIPSPPPIYNFAIIPQ
IKTIDNFWFDKVNNKGNIKNNIFTKIHMPSNSYFGIAIGCCSTFFGFSIVWHIWWLVWVSLFGIFFILLKKFFTFDKGYF
ISIKKIKDIENKHLLKK

Sequences:

>Translated_657_residues
MFGKLTINSIPYHEPIIIGTCFLIFLFSLLVCVYITYVKKWKYLWNEWFTSVDHKKISVMYFILSFVMFLRGFSDAIIMR
LQQFFSSLPEHTSIFSSDHYDQVFTAHGVIMIFFVAMPLVIGLMNLVIPLQIGARDLAFPVLNNISFWLTASSSVLLMIS
LGVGEFAKTGWLGYPPLSGIIYSPGVGVDYWIWVLQISGIGTILTSINFIVTIINLRAPGMSMFKLPVFTWTSLCTNILI
LISFPVLFITLLFLSLDRYAGFHFFTNDLGGNMMLYVNLIWIWGHPEVYILILPIFGIFSEVVSTFSEKSLFGYISLIWA
TIVITVLSFIVWLHHFFTMGSGANVNSFFSITTMIIAIPTGVKIFNWLFTMFRGRIRFHSSMLWTIGFLISFTIGGMAGV
LLSIPPIDFVLHNSLFLVAHFHNVIIGGVVFGCFAGITYWFPKIFGFKLNEYWGKCAFVFWITGFFTAFMPLYILGCMGM
TRRLSQNIDCEYHGLLTISAIGVFFIFLGILFQIIQIIVSIKNRNTLEYKDNTGDPWNGRTLEWSIPSPPPIYNFAIIPQ
IKTIDNFWFDKVNNKGNIKNNIFTKIHMPSNSYFGIAIGCCSTFFGFSIVWHIWWLVWVSLFGIFFILLKKFFTFDKGYF
ISIKKIKDIENKHLLKK
>Mature_657_residues
MFGKLTINSIPYHEPIIIGTCFLIFLFSLLVCVYITYVKKWKYLWNEWFTSVDHKKISVMYFILSFVMFLRGFSDAIIMR
LQQFFSSLPEHTSIFSSDHYDQVFTAHGVIMIFFVAMPLVIGLMNLVIPLQIGARDLAFPVLNNISFWLTASSSVLLMIS
LGVGEFAKTGWLGYPPLSGIIYSPGVGVDYWIWVLQISGIGTILTSINFIVTIINLRAPGMSMFKLPVFTWTSLCTNILI
LISFPVLFITLLFLSLDRYAGFHFFTNDLGGNMMLYVNLIWIWGHPEVYILILPIFGIFSEVVSTFSEKSLFGYISLIWA
TIVITVLSFIVWLHHFFTMGSGANVNSFFSITTMIIAIPTGVKIFNWLFTMFRGRIRFHSSMLWTIGFLISFTIGGMAGV
LLSIPPIDFVLHNSLFLVAHFHNVIIGGVVFGCFAGITYWFPKIFGFKLNEYWGKCAFVFWITGFFTAFMPLYILGCMGM
TRRLSQNIDCEYHGLLTISAIGVFFIFLGILFQIIQIIVSIKNRNTLEYKDNTGDPWNGRTLEWSIPSPPPIYNFAIIPQ
IKTIDNFWFDKVNNKGNIKNNIFTKIHMPSNSYFGIAIGCCSTFFGFSIVWHIWWLVWVSLFGIFFILLKKFFTFDKGYF
ISIKKIKDIENKHLLKK

Specific function: Cytochrome o terminal oxidase complex is the component of the aerobic respiratory chain that predominates when cells are grown at high aeration. This ubiquinol oxidase shows proton pump activity across the membrane in addition to the electron transfer [H]

COG id: COG0843

COG function: function code C; Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831109, Length=513, Percent_Identity=38.5964912280702, Blast_Score=333, Evalue=2e-91,
Organism=Escherichia coli, GI1786634, Length=653, Percent_Identity=65.0842266462481, Blast_Score=891, Evalue=0.0,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6226519, Length=537, Percent_Identity=38.9199255121043, Blast_Score=332, Evalue=1e-91,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6226524, Length=329, Percent_Identity=44.0729483282675, Blast_Score=244, Evalue=4e-65,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6226523, Length=253, Percent_Identity=37.9446640316205, Blast_Score=131, Evalue=3e-31,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000883
- InterPro:   IPR014207 [H]

Pfam domain/function: PF00115 COX1 [H]

EC number: 1.10.3.-

Molecular weight: Translated: 75331; Mature: 75331

Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36

Prosite motif: PS50855 COX1 ; PS00077 COX1_CUB

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFGKLTINSIPYHEPIIIGTCFLIFLFSLLVCVYITYVKKWKYLWNEWFTSVDHKKISVM
CCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YFILSFVMFLRGFSDAIIMRLQQFFSSLPEHTSIFSSDHYDQVFTAHGVIMIFFVAMPLV
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLMNLVIPLQIGARDLAFPVLNNISFWLTASSSVLLMISLGVGEFAKTGWLGYPPLSGI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCE
IYSPGVGVDYWIWVLQISGIGTILTSINFIVTIINLRAPGMSMFKLPVFTWTSLCTNILI
EECCCCCHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISFPVLFITLLFLSLDRYAGFHFFTNDLGGNMMLYVNLIWIWGHPEVYILILPIFGIFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHH
EVVSTFSEKSLFGYISLIWATIVITVLSFIVWLHHFFTMGSGANVNSFFSITTMIIAIPT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
GVKIFNWLFTMFRGRIRFHSSMLWTIGFLISFTIGGMAGVLLSIPPIDFVLHNSLFLVAH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHEEHH
FHNVIIGGVVFGCFAGITYWFPKIFGFKLNEYWGKCAFVFWITGFFTAFMPLYILGCMGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRRLSQNIDCEYHGLLTISAIGVFFIFLGILFQIIQIIVSIKNRNTLEYKDNTGDPWNGR
HHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCC
TLEWSIPSPPPIYNFAIIPQIKTIDNFWFDKVNNKGNIKNNIFTKIHMPSNSYFGIAIGC
EEEEECCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEHHHHH
CSTFFGFSIVWHIWWLVWVSLFGIFFILLKKFFTFDKGYFISIKKIKDIENKHLLKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHCCCHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MFGKLTINSIPYHEPIIIGTCFLIFLFSLLVCVYITYVKKWKYLWNEWFTSVDHKKISVM
CCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YFILSFVMFLRGFSDAIIMRLQQFFSSLPEHTSIFSSDHYDQVFTAHGVIMIFFVAMPLV
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLMNLVIPLQIGARDLAFPVLNNISFWLTASSSVLLMISLGVGEFAKTGWLGYPPLSGI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCE
IYSPGVGVDYWIWVLQISGIGTILTSINFIVTIINLRAPGMSMFKLPVFTWTSLCTNILI
EECCCCCHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISFPVLFITLLFLSLDRYAGFHFFTNDLGGNMMLYVNLIWIWGHPEVYILILPIFGIFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHH
EVVSTFSEKSLFGYISLIWATIVITVLSFIVWLHHFFTMGSGANVNSFFSITTMIIAIPT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
GVKIFNWLFTMFRGRIRFHSSMLWTIGFLISFTIGGMAGVLLSIPPIDFVLHNSLFLVAH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHEEHH
FHNVIIGGVVFGCFAGITYWFPKIFGFKLNEYWGKCAFVFWITGFFTAFMPLYILGCMGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRRLSQNIDCEYHGLLTISAIGVFFIFLGILFQIIQIIVSIKNRNTLEYKDNTGDPWNGR
HHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCC
TLEWSIPSPPPIYNFAIIPQIKTIDNFWFDKVNNKGNIKNNIFTKIHMPSNSYFGIAIGC
EEEEECCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEHHHHH
CSTFFGFSIVWHIWWLVWVSLFGIFFILLKKFFTFDKGYFISIKKIKDIENKHLLKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHCCCHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: Protoheme IX (Heme B55 and B562); Copper B. [C]

Metal ions: Fe; Cu [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: Oxidoreductases [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]