Definition Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri), complete genome.
Accession NC_008513
Length 416,380

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The map label for this gene is nuoN

Identifier: 116515050

GI number: 116515050

Start: 124666

End: 126111

Strand: Direct

Name: nuoN

Synonym: BCc_109

Alternate gene names: 116515050

Gene position: 124666-126111 (Clockwise)

Preceding gene: 116515049

Following gene: 116515052

Centisome position: 29.94

GC content: 16.94

Gene sequence:

>1446_bases
ATGATTAGATTATTTAATGATATTATTCCTATTTTTCCTATTTTAATGTTAATTTTTTCAATTATAATTCTGTTTTTTAT
TCTTAATAATAAGAATAAGGTAAAATCTGGTTGTATTGTTACTACAATAAGTATTTTTTTTTCAATAATATATATTTTAT
ATATAAAAAGGTTTTTTTTTAATTATTCTTCAGATTTAATTCGAATTGATCAATATTCTTTTTATTTTATGATTTTATTA
TTAATTTCTAGTTTTTTTACATGTATATTTTCATATTCTTGGTTATTACTAGAAGATAACTATTCGATTGAATTTTATTT
TTTTGTTTTATTATCTACAATAGGTGGTATGTTAATAATTATATCCAATCATTTTCTTTCTTTATTTTTAGGAATAGAGT
TATTATTTCTTCCAATTTTAGGAATATTAAATTTTTTTTCTAATTCAAGAAAAAATTTGTTTTCTATTGTAAATTATATG
ATTTTATCTGTTTTTTCATCAGCTTTATTATTATTAGGTGTTTCTTTTATATATTTTGTTTCTGGAAGATTATCATTTTC
TTTTTTTCCTTTAATATTTATGTATTATCCGTCAATTATTTTGAATAGTATGATGATATTTGGTATATGTATGATATTAT
TATCTCTTTTTTTTAAATTATCACTTTTTCCTTTACATACTTGGTCTCCAAATATTTATCAGTATTCTAATCCTTGCTCT
CTTATTTTTTTTTCAACTGCTGTTAAAATTTCTATTTTTTCTTTTTTATTACGTTTTTTAAATTTTTTTCCTTATATTTA
TAAAATAAAATCTATATATTATATTATATATCTTATATCTATGTTTTCTGTTTTTTTTGGAAATATTATTGGAATTATAC
AAAATAATGTACAAAGATTGATTGGATATTTATCTATTTCTAATATTGGATTCTTATTAATTATTATAATTACTCAATCA
TATTCATTTGTTTTTTTAAATAAATTATTTATAATTTATTTATTTATTTATATATTTGGATTAATTGGTTTTTTTAGTAT
TAAAAGTATTATTGATATAAATTTTATTGAACGAAAAAATAATTTATTAAAAGAAAACTCTTTAATTGGTTTGTTTTGGT
ATAATCCTATATTAGGCATTTTAATGTCTATAATTTTGTTATCTTTATCAGGTTTTCCTATTACCTTAGGTTTTTGGGGA
AAATTTTTTATTTTTAAACATTTAATTCAAAAAAAATTTTTTATAACAACTTTATTAATTATGTTAAGTAATATAGTTGG
TATGCAAAATTATTTATATATTATTAGAAGTTTATATATCAAACCTATTAAATTTTCGAATACGAGTTTAGTAAATAATT
TATATATTTCAATATTACAAAAATTTTTACTAATTAGTATCGGTTTTTTATTTGTAATATTAGGATTTTTTCCATATATT
TTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTAGGTTTATATCCTAGTTTAATTTTAAATTTTTCTTTTAATATTCAAAAAAATATATTTCAACATTATATATTTATAA
AATAATTAGGTAATAAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTATTAAATTTTAAAATTATCTTTATAATATAATGTTGGAATATTTTCCAACATTTATTATTTAACATTTTGAAAT
GATGTTATTATAACAATAAA

Product: NADH dehydrogenase I chain N

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit N; NDH-1 subunit N

Number of amino acids: Translated: 481; Mature: 481

Protein sequence:

>481_residues
MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFFNYSSDLIRIDQYSFYFMILL
LISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLIIISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYM
ILSVFSSALLLLGVSFIYFVSGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS
LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRLIGYLSISNIGFLLIIIITQS
YSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKNNLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWG
KFFIFKHLIQKKFFITTLLIMLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI
F

Sequences:

>Translated_481_residues
MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFFNYSSDLIRIDQYSFYFMILL
LISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLIIISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYM
ILSVFSSALLLLGVSFIYFVSGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS
LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRLIGYLSISNIGFLLIIIITQS
YSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKNNLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWG
KFFIFKHLIQKKFFITTLLIMLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI
F
>Mature_481_residues
MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFFNYSSDLIRIDQYSFYFMILL
LISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLIIISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYM
ILSVFSSALLLLGVSFIYFVSGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS
LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRLIGYLSISNIGFLLIIIITQS
YSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKNNLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWG
KFFIFKHLIQKKFFITTLLIMLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI
F

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocat

COG id: COG1007

COG function: function code C; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 2 family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=473, Percent_Identity=29.3868921775898, Blast_Score=236, Evalue=2e-63,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NUON_BUCCC (Q057W3)

Other databases:

- EMBL:   CP000263
- RefSeq:   YP_802679.1
- STRING:   Q057W3
- EnsemblBacteria:   EBBUCT00000001376
- GeneID:   4440819
- GenomeReviews:   CP000263_GR
- KEGG:   bcc:BCc_109
- GeneTree:   EBGT00050000007699
- HOGENOM:   HBG747830
- OMA:   ILSISYN
- BioCyc:   BAPH372461:BCC_109-MONOMER
- GO:   GO:0006810
- HAMAP:   MF_00445
- InterPro:   IPR010096
- InterPro:   IPR001750

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1

EC number: =1.6.99.5

Molecular weight: Translated: 56465; Mature: 56465

Theoretical pI: Translated: 9.93; Mature: 9.93

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xff4dd40)-; HASH(0x11d5c4cc)-; HASH(0x11cce944)-; HASH(0x11dea4c0)-; HASH(0x11e198dc)-; HASH(0x11e19900)-; HASH(0x11e0918c)-; HASH(0x11cce908)-; HASH(0x11e092d0)-; HASH(0x11d5c58c)-; HASH(0x11e09318)-; HASH(0x10da0328)-; HASH(0x1178beb4)-; HASH(0x11cce7dc)-;

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYSSDLIRIDQYSFYFMILLLISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLII
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEH
ISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYMILSVFSSALLLLGVSFIYFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEECCCCE
LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGYLSISNIGFLLIIIITQSYSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKN
HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWGKFFIFKHLIQKKFFITTLLI
CHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
F
H
>Mature Secondary Structure
MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYSSDLIRIDQYSFYFMILLLISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLII
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEH
ISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYMILSVFSSALLLLGVSFIYFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEECCCCE
LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGYLSISNIGFLLIIIITQSYSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKN
HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWGKFFIFKHLIQKKFFITTLLI
CHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
F
H

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA