| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 113476245
Identifier: 113476245
GI number: 113476245
Start: 4089736
End: 4090710
Strand: Reverse
Name: 113476245
Synonym: Tery_2638
Alternate gene names: NA
Gene position: 4090710-4089736 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113476246
Following gene: 113476244
Centisome position: 52.78
GC content: 29.23
Gene sequence:
>975_bases ATGAAACGACTAATTTCTCTAATTATCAGTTTACTTATTCTGATAGTAATTTACCAAAAAATTAATTTTACTGGACTCAT AAAAGTATTTCAAAACTCTCACCATATATGGATGATAATTAGCGTCAGTATGATAATTCCATTGACAATGTTAACTGCTT GGAGATTACAACAGTTAATGCCAAAAAAGGATAAAAAATTATCATCTTATTTAAATTTTGGGGAAGCAAATCAATTAATT TTAGCTGCTAGTGTATTGAATATGATTTTGCCCTCAAAAATGGGAGATATTGCTAAAGCTTATTTTATGAAAAAAAGGGG GAATTTAGAGGGAACTTTATCTTTATCTATAGTGATATTTGAAAAAGCCTGTGATTTAGTTTCTTTACTAATTTGGTGTG TTTTTGGATTAATTGTTTATCCAGAAAAAGACTTATTATTTTGGATAATGACTACTGGAGTTACATCAGGTTTAATTATT TGCCTATTGTTATTATCATCTCGGAAATTTGCCAGAATATTTTTTCACATTGCTCGAAAATTTACGCCTAAAAAAATTAG TTCAAAAATTGATGACTTAGAAAATTCTTGGATAGAAATGCACAAATATTTTTGGCATGACAAACGACAGTTAACAAAAA TTGCTGTTACCTCTATATTTATCTGGTTTGGGCATTTATCACAAATCTGGTTTTTTACTTTAGCATTAAATGCTTCAGCA CCATTTGTTCAAAGTTTAGCATTATCTTCTCTAGCAATTTTAGCAGGATTATTACCTTTAACTTTTGCTGGAGTTGGTAC TCGTGACGCAGCTTTTATTATGTTTTATAAACCTTATTTTTCTCAAGAAGTTGGAGCAGCTTTAGGATTACTTTGTACAT CCCGTTATGTATTACCAGCAATTGCTGGTTTACCATTTTTTGGCAAATATTTAATTGAAATGAATAAGATGAAAAGTCTC CAAAAATCTCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTTTTAATTTGTTCAGGGGTATTTTAATGATAAACTCTTTATAGTGCAGGCATATTGCCTAGCAAGGTTGTACCTAAA TGATATAAAAAACATTGTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TACCAAGTTAGACTAAATATCAAAAGTATTGCTATATTTTCTTGATAATAGAGAATATAGTTAGTATTAAAGTTCATAAA AAAATTATCATTAGGCTAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 324; Mature: 324
Protein sequence:
>324_residues MKRLISLIISLLILIVIYQKINFTGLIKVFQNSHHIWMIISVSMIIPLTMLTAWRLQQLMPKKDKKLSSYLNFGEANQLI LAASVLNMILPSKMGDIAKAYFMKKRGNLEGTLSLSIVIFEKACDLVSLLIWCVFGLIVYPEKDLLFWIMTTGVTSGLII CLLLLSSRKFARIFFHIARKFTPKKISSKIDDLENSWIEMHKYFWHDKRQLTKIAVTSIFIWFGHLSQIWFFTLALNASA PFVQSLALSSLAILAGLLPLTFAGVGTRDAAFIMFYKPYFSQEVGAALGLLCTSRYVLPAIAGLPFFGKYLIEMNKMKSL QKSQ
Sequences:
>Translated_324_residues MKRLISLIISLLILIVIYQKINFTGLIKVFQNSHHIWMIISVSMIIPLTMLTAWRLQQLMPKKDKKLSSYLNFGEANQLI LAASVLNMILPSKMGDIAKAYFMKKRGNLEGTLSLSIVIFEKACDLVSLLIWCVFGLIVYPEKDLLFWIMTTGVTSGLII CLLLLSSRKFARIFFHIARKFTPKKISSKIDDLENSWIEMHKYFWHDKRQLTKIAVTSIFIWFGHLSQIWFFTLALNASA PFVQSLALSSLAILAGLLPLTFAGVGTRDAAFIMFYKPYFSQEVGAALGLLCTSRYVLPAIAGLPFFGKYLIEMNKMKSL QKSQ >Mature_324_residues MKRLISLIISLLILIVIYQKINFTGLIKVFQNSHHIWMIISVSMIIPLTMLTAWRLQQLMPKKDKKLSSYLNFGEANQLI LAASVLNMILPSKMGDIAKAYFMKKRGNLEGTLSLSIVIFEKACDLVSLLIWCVFGLIVYPEKDLLFWIMTTGVTSGLII CLLLLSSRKFARIFFHIARKFTPKKISSKIDDLENSWIEMHKYFWHDKRQLTKIAVTSIFIWFGHLSQIWFFTLALNASA PFVQSLALSSLAILAGLLPLTFAGVGTRDAAFIMFYKPYFSQEVGAALGLLCTSRYVLPAIAGLPFFGKYLIEMNKMKSL QKSQ
Specific function: Unknown
COG id: COG0392
COG function: function code S; Predicted integral membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 36810; Mature: 36810
Theoretical pI: Translated: 10.43; Mature: 10.43
Prosite motif: PS00436 PEROXIDASE_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 4.0 %Met (Translated Protein) 5.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 4.0 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRLISLIISLLILIVIYQKINFTGLIKVFQNSHHIWMIISVSMIIPLTMLTAWRLQQLM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PKKDKKLSSYLNFGEANQLILAASVLNMILPSKMGDIAKAYFMKKRGNLEGTLSLSIVIF CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEH EKACDLVSLLIWCVFGLIVYPEKDLLFWIMTTGVTSGLIICLLLLSSRKFARIFFHIARK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH FTPKKISSKIDDLENSWIEMHKYFWHDKRQLTKIAVTSIFIWFGHLSQIWFFTLALNASA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC PFVQSLALSSLAILAGLLPLTFAGVGTRDAAFIMFYKPYFSQEVGAALGLLCTSRYVLPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAGLPFFGKYLIEMNKMKSLQKSQ HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKRLISLIISLLILIVIYQKINFTGLIKVFQNSHHIWMIISVSMIIPLTMLTAWRLQQLM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PKKDKKLSSYLNFGEANQLILAASVLNMILPSKMGDIAKAYFMKKRGNLEGTLSLSIVIF CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEH EKACDLVSLLIWCVFGLIVYPEKDLLFWIMTTGVTSGLIICLLLLSSRKFARIFFHIARK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH FTPKKISSKIDDLENSWIEMHKYFWHDKRQLTKIAVTSIFIWFGHLSQIWFFTLALNASA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC PFVQSLALSSLAILAGLLPLTFAGVGTRDAAFIMFYKPYFSQEVGAALGLLCTSRYVLPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAGLPFFGKYLIEMNKMKSLQKSQ HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA