Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113474401

Identifier: 113474401

GI number: 113474401

Start: 850299

End: 852104

Strand: Reverse

Name: 113474401

Synonym: Tery_0537

Alternate gene names: NA

Gene position: 852104-850299 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474402

Following gene: 113474399

Centisome position: 10.99

GC content: 30.73

Gene sequence:

>1806_bases
ATGTCAAATACTTTAATATCCAAATCAAAAATAACTAGATTTTTATTATTCTTACATAAAAACTTAATAAATAGAAGCAG
GATATTTTGGTTAAGTTTAACCATAGCAGTTGTATTAATTTATGGTATTGAATATCTAAAAGCAGCTTTTGAAACTAAAT
ATATAATCCAAGATGATGCACGACAACATATATTTTGGATGCGTCGTTTTTTCGATACAGAATTATTTCCCGAAGACTTA
ATAGCTAACTATTTTCAGTCAGTAGCACCTTGGGGTTATCAAACTTTTTATTGGTTAATAACATCTCTAGGTATCGACCC
AATTTTTTTCGGTAAATTATTACCAATATTTCTGGGATTAATTTCTACAATTTACTGCTTTGGAATCAGTTTACAAATTC
TGCCAATTCCCGCCGTCGGATTTTTGAGCTCATTTATTTTAAACCAAAGTTTATGGATGGAAGATGACTTAGTTTCTGCT
ACTCCCCGAGCATTTTTCTATCCACTTTTTTTAGCATTTTTATATTACTTACTCCGAGGTTCCTTATTTCCTGTTTTAGT
AGCGATCGCTCTCCAAGCAATTTTTTATCCCCAGACTGTTTTACTATCACTAAGCATCCTAACTATTAGACTATTCTCCT
ATCAGCAAAAGCGGTTAAAATTCACCTCAATTAAACTAAATTATTTACTTTGGTTAGGAGCAATAATAACTGCTGCCATA
ATACTTTTACCATACAAATTAACTGCTACTGAATTCGGACCAATTATTACTACTACCGCAGCCAAAATACAACCTATTTT
CAATTATGCTGATAGTAAATATGGCAGAGCATTCTTTTTTCATCATAACCCCTTAGTTTTTTGGCTCACAGGACCAAGGA
GTGGTATCTTATTTGTAGGATTATTCTCACCACTGGCTATAGCTTCATTACTATTACCTTTTTTACTTAAAAAAGAAAAA
TTTCCTCTAGGAAAACAAGTTTCGGAAAAAGTAGGAATATTAGTTCAAATTTTCATAGCATCAGTAGGATTATTTTTTCT
AGCTCATATCTTTTTATTTCAGCTTCATTTTCCCAATAGATATATTTACCATAGTATACGAGTGACGATGGCAATAACTG
CTGGTATTGCCTTAATAATCTGGTTAGATAGTTATTTAAAGGCAACTATTTATCAGATAAAAAATAGTTTTACTTGTCTA
CAGGGAATATACCTCGGATGTACAACTTTGTTATTAGTATTATTCAGTATTATTCCTTTTTCCACAGACTTAACAATAGA
TAATCAATCCTACATTAAAGGCAAAGAAAAAGAATTATATGAATACTTATTAGTACAACCTAAAGATACATTAATTGCTT
CCATATCTAAGGAATCAAATAATATTCCTACCTTTGCTCAACGTTCGACCTTAGTAGCCCAAGAATATAGCTTACCCTAT
CACGTAGGATATTATAATCAATTTAGTCAAAGAGCCATTGATTTAATTCAGGCTCAATATACTCCTAACCCAGAACAAGT
TAATAATTTTATTCAAAATTATGGGGTTGATTTTTGGTTGCTCGATCTAACTGCTTATAATCCTAGATATGTAGCTGATA
AACAGTTAATTCGTCAGTATAATTTAGCAGATTCAATTATTTATCAACTGGAGCAAAATATGATCCCGGCATTATCAACA
ACCATGGAAATTTGTAGTGTATTAAGCAGTAAGCGAATAACATTATTATCAACATCATGTATTACAAATGAGTTGATAAA
ATTGAGTATTAATAATCCTAAAAATTATCACAAACATAAGACTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCTCCTGGTATTAGTCTTTCTTTTTTATTTCCTTATTCCTAGGTACGTTGCATACAATATCCCTACTATTTATAACAAAC
ATTTATCAAATTGTTATAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTACATCAGATTCTAGATTTATGTGGTGTAATTAGTAAATTAAATATTTTTTACTTGTTCCCTATCCTACCCTCCATCA
CCCTATTCTCTAAAAGGATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 601; Mature: 600

Protein sequence:

>601_residues
MSNTLISKSKITRFLLFLHKNLINRSRIFWLSLTIAVVLIYGIEYLKAAFETKYIIQDDARQHIFWMRRFFDTELFPEDL
IANYFQSVAPWGYQTFYWLITSLGIDPIFFGKLLPIFLGLISTIYCFGISLQILPIPAVGFLSSFILNQSLWMEDDLVSA
TPRAFFYPLFLAFLYYLLRGSLFPVLVAIALQAIFYPQTVLLSLSILTIRLFSYQQKRLKFTSIKLNYLLWLGAIITAAI
ILLPYKLTATEFGPIITTTAAKIQPIFNYADSKYGRAFFFHHNPLVFWLTGPRSGILFVGLFSPLAIASLLLPFLLKKEK
FPLGKQVSEKVGILVQIFIASVGLFFLAHIFLFQLHFPNRYIYHSIRVTMAITAGIALIIWLDSYLKATIYQIKNSFTCL
QGIYLGCTTLLLVLFSIIPFSTDLTIDNQSYIKGKEKELYEYLLVQPKDTLIASISKESNNIPTFAQRSTLVAQEYSLPY
HVGYYNQFSQRAIDLIQAQYTPNPEQVNNFIQNYGVDFWLLDLTAYNPRYVADKQLIRQYNLADSIIYQLEQNMIPALST
TMEICSVLSSKRITLLSTSCITNELIKLSINNPKNYHKHKT

Sequences:

>Translated_601_residues
MSNTLISKSKITRFLLFLHKNLINRSRIFWLSLTIAVVLIYGIEYLKAAFETKYIIQDDARQHIFWMRRFFDTELFPEDL
IANYFQSVAPWGYQTFYWLITSLGIDPIFFGKLLPIFLGLISTIYCFGISLQILPIPAVGFLSSFILNQSLWMEDDLVSA
TPRAFFYPLFLAFLYYLLRGSLFPVLVAIALQAIFYPQTVLLSLSILTIRLFSYQQKRLKFTSIKLNYLLWLGAIITAAI
ILLPYKLTATEFGPIITTTAAKIQPIFNYADSKYGRAFFFHHNPLVFWLTGPRSGILFVGLFSPLAIASLLLPFLLKKEK
FPLGKQVSEKVGILVQIFIASVGLFFLAHIFLFQLHFPNRYIYHSIRVTMAITAGIALIIWLDSYLKATIYQIKNSFTCL
QGIYLGCTTLLLVLFSIIPFSTDLTIDNQSYIKGKEKELYEYLLVQPKDTLIASISKESNNIPTFAQRSTLVAQEYSLPY
HVGYYNQFSQRAIDLIQAQYTPNPEQVNNFIQNYGVDFWLLDLTAYNPRYVADKQLIRQYNLADSIIYQLEQNMIPALST
TMEICSVLSSKRITLLSTSCITNELIKLSINNPKNYHKHKT
>Mature_600_residues
SNTLISKSKITRFLLFLHKNLINRSRIFWLSLTIAVVLIYGIEYLKAAFETKYIIQDDARQHIFWMRRFFDTELFPEDLI
ANYFQSVAPWGYQTFYWLITSLGIDPIFFGKLLPIFLGLISTIYCFGISLQILPIPAVGFLSSFILNQSLWMEDDLVSAT
PRAFFYPLFLAFLYYLLRGSLFPVLVAIALQAIFYPQTVLLSLSILTIRLFSYQQKRLKFTSIKLNYLLWLGAIITAAII
LLPYKLTATEFGPIITTTAAKIQPIFNYADSKYGRAFFFHHNPLVFWLTGPRSGILFVGLFSPLAIASLLLPFLLKKEKF
PLGKQVSEKVGILVQIFIASVGLFFLAHIFLFQLHFPNRYIYHSIRVTMAITAGIALIIWLDSYLKATIYQIKNSFTCLQ
GIYLGCTTLLLVLFSIIPFSTDLTIDNQSYIKGKEKELYEYLLVQPKDTLIASISKESNNIPTFAQRSTLVAQEYSLPYH
VGYYNQFSQRAIDLIQAQYTPNPEQVNNFIQNYGVDFWLLDLTAYNPRYVADKQLIRQYNLADSIIYQLEQNMIPALSTT
MEICSVLSSKRITLLSTSCITNELIKLSINNPKNYHKHKT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69110; Mature: 68979

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNTLISKSKITRFLLFLHKNLINRSRIFWLSLTIAVVLIYGIEYLKAAFETKYIIQDDA
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCH
RQHIFWMRRFFDTELFPEDLIANYFQSVAPWGYQTFYWLITSLGIDPIFFGKLLPIFLGL
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
ISTIYCFGISLQILPIPAVGFLSSFILNQSLWMEDDLVSATPRAFFYPLFLAFLYYLLRG
HHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SLFPVLVAIALQAIFYPQTVLLSLSILTIRLFSYQQKRLKFTSIKLNYLLWLGAIITAAI
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLPYKLTATEFGPIITTTAAKIQPIFNYADSKYGRAFFFHHNPLVFWLTGPRSGILFVG
HHHCCEECHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEE
LFSPLAIASLLLPFLLKKEKFPLGKQVSEKVGILVQIFIASVGLFFLAHIFLFQLHFPNR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
YIYHSIRVTMAITAGIALIIWLDSYLKATIYQIKNSFTCLQGIYLGCTTLLLVLFSIIPF
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STDLTIDNQSYIKGKEKELYEYLLVQPKDTLIASISKESNNIPTFAQRSTLVAQEYSLPY
CCCEEECCHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCE
HVGYYNQFSQRAIDLIQAQYTPNPEQVNNFIQNYGVDFWLLDLTAYNPRYVADKQLIRQY
EECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
NLADSIIYQLEQNMIPALSTTMEICSVLSSKRITLLSTSCITNELIKLSINNPKNYHKHK
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCC
T
C
>Mature Secondary Structure 
SNTLISKSKITRFLLFLHKNLINRSRIFWLSLTIAVVLIYGIEYLKAAFETKYIIQDDA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCH
RQHIFWMRRFFDTELFPEDLIANYFQSVAPWGYQTFYWLITSLGIDPIFFGKLLPIFLGL
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
ISTIYCFGISLQILPIPAVGFLSSFILNQSLWMEDDLVSATPRAFFYPLFLAFLYYLLRG
HHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SLFPVLVAIALQAIFYPQTVLLSLSILTIRLFSYQQKRLKFTSIKLNYLLWLGAIITAAI
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILLPYKLTATEFGPIITTTAAKIQPIFNYADSKYGRAFFFHHNPLVFWLTGPRSGILFVG
HHHCCEECHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEE
LFSPLAIASLLLPFLLKKEKFPLGKQVSEKVGILVQIFIASVGLFFLAHIFLFQLHFPNR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
YIYHSIRVTMAITAGIALIIWLDSYLKATIYQIKNSFTCLQGIYLGCTTLLLVLFSIIPF
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STDLTIDNQSYIKGKEKELYEYLLVQPKDTLIASISKESNNIPTFAQRSTLVAQEYSLPY
CCCEEECCHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCE
HVGYYNQFSQRAIDLIQAQYTPNPEQVNNFIQNYGVDFWLLDLTAYNPRYVADKQLIRQY
EECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
NLADSIIYQLEQNMIPALSTTMEICSVLSSKRITLLSTSCITNELIKLSINNPKNYHKHK
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCC
T
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA