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The map label for this gene is 113474289

Identifier: 113474289

GI number: 113474289

Start: 648930

End: 650492

Strand: Reverse

Name: 113474289

Synonym: Tery_0414

Alternate gene names: NA

Gene position: 650492-648930 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474290

Following gene: 113474287

Centisome position: 8.39

GC content: 32.25

Gene sequence:

>1563_bases
ATGGTAATTATTAAACGATTAAAATCTGATTTTATATTTCAAATAACTATTATTGCTGCCATAATTTTATTTATCTGTAG
CACAGTGCGTCACTTATTATTTCAATCTACTGCTTTTGAAATGGGAATTTATGACCAAGTTACTTATTTAATAAGTCAAG
GTTTACCTCCAATTTCTTCCTTTTTAGAAGTACATCATTTGGGAAATCATGCTGCTTGGGCAATGTATCCAGTGGCATTA
TTTTATAAAATTTATCCTTCAGTTTATTGGCTATTACTAATACAAGCAATTTGTTTAGCAATAGGAACCTTACCTACTTG
GAGTTTAGCCCGTTATTCAGGGTTAAATAAAAAACAAGCTTTTGCCATAGTAATGGTTTATTTATTATACCCAGTAGTGT
TTAATCTCAACTTATTTGATTTTCATCCAGAGGTAATGGCATTGCCAGCAATATTAGGAGCAATTTTAGCAGCAAAATTA
GATAAAACCGTATGGTTTTGTTTAGCTATTATCTGGGTTTTAGGCTGTAAAGATGCCTTATCTTTACCTGTAGCTGCTAT
GGGTTTTTGGTTATATTTCTATGAAAAAAAGCGAGTATGTGGTGCCATAGCTTTGTTTGCTGGTGTGACTTGGTTTATTA
TCGCTACTCAAATACTAATACCTTATTTTAAGGATGGTCAACCGCCAGGAGGAATAGGACGTTATCGATATTTAGGTAAC
TCCATACCAGAAATTTTATTGAATCTTTTTTTAAGACCTGAACTGGTGTTTGGTAGATTAATTTCTCTTAAAACTTTAGA
ATATTTATTTTTGCTAAATCTACCGATAATTTGGTGGCTTGCTCCTAAATATTTAGCTCCTTTAATAGCTGCTTCTCCAG
TTTTGGCACTAAATATTCTCTCCGATATTGATGCTCAACGAGATTTAATTCATCAGTATTCTTTGCCAATATTGCCTTTT
TTATTAATGGCTGTAATTTATACTATTGCTGATGGTAAATGTGGTTTATGGTATTGGCTATGGAATTTACGCCGATCCCA
AAAAAAAGAAGCTAAAAATATATCTACAATTGTTAGTCAACTATTACCAAAATTTATCATAATTTGGTCTTGTATCGGAT
TTTTAGCTTTAGCTAAATATGGTTATTTTTGGTCTATTTACTTAGATTATTTAGATACTTGGCAAGCTACACGAACTGCG
GTGAATATAATTCAGACAAAAGGTAGTGTTTTAACTACTTCAGAAATTACTCCTCATTTAAGTCATCGTCAGTTTATTAA
GTTAATTATTGAAGAAGAAGAATTACCTAGAGATGAAGCCTTAGCTGAGTATGACTATGTATTAATAAATGTACGTCATC
CTGGTTGGAAAAGTAGTCAAGAATATGCGCGAAAATTAGTAGATAAACTCAAGGTTAATTCAGAATTTCAGCTTAGTTAC
CAAAAAGATGATGTTTATTTATTTGAAAAAGATAGTAGGGCGAAGCGCAAGTCAAAAGTAATTTCTGAGGTCGGGGTTAG
GGTGGGGTTTCCTACTCTCCCTTTTTCTTCACAAATCATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCTCAAAAAATATCCAATTATTTGTTTTTATTATAACTTGAGCCCTATCTATAACTTAGGAATCAAGTCACACTACGAT
CTGTAATTATAACTACTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATATATAGTAATTTCAAATCGTTTCTATGAAGTTATGTTTGGAGAACAACAAATTAAAAAATATAAATTCAACTTTACT
AATGAAAAATAAAGGTCTAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 520

Protein sequence:

>520_residues
MVIIKRLKSDFIFQITIIAAIILFICSTVRHLLFQSTAFEMGIYDQVTYLISQGLPPISSFLEVHHLGNHAAWAMYPVAL
FYKIYPSVYWLLLIQAICLAIGTLPTWSLARYSGLNKKQAFAIVMVYLLYPVVFNLNLFDFHPEVMALPAILGAILAAKL
DKTVWFCLAIIWVLGCKDALSLPVAAMGFWLYFYEKKRVCGAIALFAGVTWFIIATQILIPYFKDGQPPGGIGRYRYLGN
SIPEILLNLFLRPELVFGRLISLKTLEYLFLLNLPIIWWLAPKYLAPLIAASPVLALNILSDIDAQRDLIHQYSLPILPF
LLMAVIYTIADGKCGLWYWLWNLRRSQKKEAKNISTIVSQLLPKFIIIWSCIGFLALAKYGYFWSIYLDYLDTWQATRTA
VNIIQTKGSVLTTSEITPHLSHRQFIKLIIEEEELPRDEALAEYDYVLINVRHPGWKSSQEYARKLVDKLKVNSEFQLSY
QKDDVYLFEKDSRAKRKSKVISEVGVRVGFPTLPFSSQII

Sequences:

>Translated_520_residues
MVIIKRLKSDFIFQITIIAAIILFICSTVRHLLFQSTAFEMGIYDQVTYLISQGLPPISSFLEVHHLGNHAAWAMYPVAL
FYKIYPSVYWLLLIQAICLAIGTLPTWSLARYSGLNKKQAFAIVMVYLLYPVVFNLNLFDFHPEVMALPAILGAILAAKL
DKTVWFCLAIIWVLGCKDALSLPVAAMGFWLYFYEKKRVCGAIALFAGVTWFIIATQILIPYFKDGQPPGGIGRYRYLGN
SIPEILLNLFLRPELVFGRLISLKTLEYLFLLNLPIIWWLAPKYLAPLIAASPVLALNILSDIDAQRDLIHQYSLPILPF
LLMAVIYTIADGKCGLWYWLWNLRRSQKKEAKNISTIVSQLLPKFIIIWSCIGFLALAKYGYFWSIYLDYLDTWQATRTA
VNIIQTKGSVLTTSEITPHLSHRQFIKLIIEEEELPRDEALAEYDYVLINVRHPGWKSSQEYARKLVDKLKVNSEFQLSY
QKDDVYLFEKDSRAKRKSKVISEVGVRVGFPTLPFSSQII
>Mature_520_residues
MVIIKRLKSDFIFQITIIAAIILFICSTVRHLLFQSTAFEMGIYDQVTYLISQGLPPISSFLEVHHLGNHAAWAMYPVAL
FYKIYPSVYWLLLIQAICLAIGTLPTWSLARYSGLNKKQAFAIVMVYLLYPVVFNLNLFDFHPEVMALPAILGAILAAKL
DKTVWFCLAIIWVLGCKDALSLPVAAMGFWLYFYEKKRVCGAIALFAGVTWFIIATQILIPYFKDGQPPGGIGRYRYLGN
SIPEILLNLFLRPELVFGRLISLKTLEYLFLLNLPIIWWLAPKYLAPLIAASPVLALNILSDIDAQRDLIHQYSLPILPF
LLMAVIYTIADGKCGLWYWLWNLRRSQKKEAKNISTIVSQLLPKFIIIWSCIGFLALAKYGYFWSIYLDYLDTWQATRTA
VNIIQTKGSVLTTSEITPHLSHRQFIKLIIEEEELPRDEALAEYDYVLINVRHPGWKSSQEYARKLVDKLKVNSEFQLSY
QKDDVYLFEKDSRAKRKSKVISEVGVRVGFPTLPFSSQII

Specific function: Unknown

COG id: COG3463

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59550; Mature: 59550

Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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ECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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ECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA