Definition Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome, complete genome.
Accession NC_008229
Length 1,553,927

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The map label for this gene is 109947159

Identifier: 109947159

GI number: 109947159

Start: 504345

End: 506780

Strand: Direct

Name: 109947159

Synonym: Hac_0572

Alternate gene names: NA

Gene position: 504345-506780 (Clockwise)

Preceding gene: 109947158

Following gene: 109947160

Centisome position: 32.46

GC content: 33.21

Gene sequence:

>2436_bases
ATGGCGATCAACCTTAAAAAGATAAAATCTCTTAACGCGTTTTGTGGTTTAGACACGATTGAAACGGATGGGTTTGGGGA
CTACAATGTTATTTTTGGGAATAATGGGTGTGGAAAAACCAGCTTGACGAGGGCTTTTGAGTTACTAAAACACCCACACC
ACATTGAAAAGTATCGCACTATTTCTGCTGATAAATCCCCAAGCGTTGGATTTGAGTGTAGAAATCAAAGCTATACAATA
GAGCCAAACAGCAAGATTGAAGCGCCCTTTAAAGTTGAAATCTATAATAGCGATTTTTTGCACGATAATGCACCTTTTAA
TGGCGAGTTTGGGCTTAAAAAACTGGATGATGGCGCAATCATTTTGGATATTCCGGCTTTAGGCAAAGAAACGCAAGCAA
TCAATCAATTAAAGGGTTGTAGAGAGAAAGTAGAAAAAAGACAAAAGGAAATTAGAGATAAAAACAATGAGAACACCTTC
AGCGCCAAGCAAGAAAGTGAAATTAAAAAATGCAAGGGAGAAATAGAAACAATACGAAAAGGTGTGAGCTCAAAGATTAT
TCCAATAAAACCAGATGAGATTGAAATAGAGAATATCTGTAAGGTGTCAAAGGATGAGTTTAAAGATGAAGAAAATGCAT
TAACGGAGTTGGAAAACGATTTTGAGAGATTGAATGGAGCCATGAAAACATTTGATGGTTTAAAAGAGATAGAATTGCCT
GAATATGACCAAACGATACAAGATGGTTTGAAGTTTTTATTTGACTTTGATACAGACAAAGAGGTAGGAAAAGTTTCAGA
AAAAATTAAAGAGCATATTAACAGGGTTGGAAGAGATTTTATTGAGAAAGGAAGGGAATTGCAAAAAGCGATAAACGATC
ATGCATGCCCTTTTTGCACTCAAAAAATACCCGATAAGATTGTTCAAGAATATACAGATTACTTTAATGAGAGGGTTGAA
ACATTCAGCCAGCGTTCTTTAAAAATGAGTGAAACTTTGCAAAAGATTTTAGGGCAATGGAATACCAAAGAAATATTGCA
AGCGTTTGAGCGGTTTAAACCTTTCATACAGGATTTTCCACAAAAACAAGAAAGTTTAGAAAAGGCGTTAGAGCGAATAA
AAGGTTTATTAGAAAAACTTCAAAAAGAGGTGGTTAAAAAGGAAGGCGTTAAAAATAAAGAAGAGTTTCAAAAGACAGAT
GAAGAGTTGTCAGAAATCTATAAAAAGATCCAACAAGATGTCAAAGAGACTGCAGAGATCTTAAGCGGCAAGGAACAGCA
AGAAGAGAAATTAAAAAAATTAAAAATTGATTTAAGAGAAGCAAGGATTAAAAAGGCTAAACATGATAGTTATGATTTGC
AAAAACGCCAAAAAGAAGCTGAGAGAAAATTATCCGTTTTTGATCGTGGGCATGAAAGATTAGAACGCCTTTTAACAAAA
ATTGATAATCAACTTAAGGGGTTATATGAGCAAGAACGCCCCGATATTGAAGTTATTAATCATTATCTTAAGGTTTTCAA
TTTGCCTCAATATTCTTTGAATAAAGATTATCAAATTGTTTTAAACTCTAAGGCTTTAGAACATAGTGCGGCTAAAATGA
TTTTAAGCGATGGCGAAAAAAACACGCTTGCATTCGCGTATTTTTTAGCGCGTTTAAAATTATTTTACAAAAAAGAGAAT
TTAAAAGATTTAGTTATTGCCATAGATGATCCTGTATCCAGTTTGGATGAACAAAGGATTTATAACATTTCTGATAGAGT
GGCAAGAATCAATCAAGAACTAGCAGAGGAAAGATTGAAAAATGAAGAGAAAGCGCAAATATTCGTTTTAACTCATAACC
ATACTTTTATGGCGTGTTTAATCAACATGGTAGGCACATGTGCTCGCTATTTCCAATTAGAACGCGATCAAAATCAATTA
AAAATTGTTTGTAAAGATAAAGTGTTTGGTTATTTTGACACTTTCTACTTGCTTTTATTTAAAGAAGTGTATGGGTTTGC
GAAAAAAGAAAAAGTGCACGATAATCATAGTGAAGCCATAAATTATGGGAATAAAGTAAGGATTTTATTAGAAAGTTTTT
TAAAGATTAATTTCATTGACTCTTTTCTTGAAAAAAAACATGCTAGTGTTTTGGATAGAGATAAGATTGAAGGTTTGATA
GAAACAGCAAATGGGGAAGTTGGATTAAATTTTTCAAAGCTGCCTTTTAATGAGGATAATTGCAATATAAAGGATAAAGG
TATGCTTCTTGAGAAACTTTTAGGGATTAGAAAAGGCTTGCATTCAGAGAGCCATGGAAGCGTTACGGATGTTTTTAGCC
CTTATAAAATCCCACTTAAAAATGTCCAAGAATTTGCCAGAATAGCTATTAATGCTATGAAAATTTTAAGTCCTTATCAA
ACACAATCTTATATGAGGAGTGTGGATAAAAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGCGTTAGAGCTTGGGTATGATGGGGGTTTGGGGGATTAGTTTTGTATCCAATTTATGAGTGTGGAAAGTGGGGGAATT
AAAGAAAAAAGCGAGAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACAAGGAATAACATGCGCATCGTATTTATGGGAACGCCTGGTTTTGCTGAAGTGATCTTAAGGGCGTTAATTGAAAAT
CAAAACAACAATATAGAAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 811; Mature: 810

Protein sequence:

>811_residues
MAINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRTISADKSPSVGFECRNQSYTI
EPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAIILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTF
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EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCTQKIPDKIVQEYTDYFNERVE
TFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFPQKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTD
EELSEIYKKIQQDVKETAEILSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK
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LKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLKNEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQL
KIVCKDKVFGYFDTFYLLLFKEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI
ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLKNVQEFARIAINAMKILSPYQ
TQSYMRSVDKN

Sequences:

>Translated_811_residues
MAINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRTISADKSPSVGFECRNQSYTI
EPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAIILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTF
SAKQESEIKKCKGEIETIRKGVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP
EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCTQKIPDKIVQEYTDYFNERVE
TFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFPQKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTD
EELSEIYKKIQQDVKETAEILSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK
IDNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEKNTLAFAYFLARLKLFYKKEN
LKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLKNEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQL
KIVCKDKVFGYFDTFYLLLFKEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI
ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLKNVQEFARIAINAMKILSPYQ
TQSYMRSVDKN
>Mature_810_residues
AINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRTISADKSPSVGFECRNQSYTIE
PNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAIILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTFS
AKQESEIKKCKGEIETIRKGVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELPE
YDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCTQKIPDKIVQEYTDYFNERVET
FSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFPQKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTDE
ELSEIYKKIQQDVKETAEILSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTKI
DNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEKNTLAFAYFLARLKLFYKKENL
KDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLKNEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQLK
IVCKDKVFGYFDTFYLLLFKEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLIE
TANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLKNVQEFARIAINAMKILSPYQT
QSYMRSVDKN

Specific function: Unknown

COG id: COG4694

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94134; Mature: 94002

Theoretical pI: Translated: 7.24; Mature: 7.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRT
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
ISADKSPSVGFECRNQSYTIEPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAI
CCCCCCCCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEE
ILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTFSAKQESEIKKCKGEIETIRK
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC
EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCT
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
QKIPDKIVQEYTDYFNERVETFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTDEELSEIYKKIQQDVKETAEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEK
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCC
NTLAFAYFLARLKLFYKKENLKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQLKIVCKDKVFGYFDTFYLLLF
CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
KEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLK
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHH
NVQEFARIAINAMKILSPYQTQSYMRSVDKN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRT
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
ISADKSPSVGFECRNQSYTIEPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAI
CCCCCCCCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEE
ILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTFSAKQESEIKKCKGEIETIRK
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK
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NTLAFAYFLARLKLFYKKENLKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLK
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KEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI
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HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHH
NVQEFARIAINAMKILSPYQTQSYMRSVDKN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA