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The map label for this gene is 225630915

Identifier: 225630915

GI number: 225630915

Start: 1322602

End: 1324023

Strand: Direct

Name: 225630915

Synonym: WRi_012310

Alternate gene names: NA

Gene position: 1322602-1324023 (Clockwise)

Preceding gene: 225630910

Following gene: 225630916

Centisome position: 91.47

GC content: 31.93

Gene sequence:

>1422_bases
ATGCAATCTTATAAGTTTTTAGAGGAAGTATTATATAGGGTAAAGAATATCGAAAATACGCTAAAAGTACTAAACCAAAG
CCAATTGAATATAGAGGACAAAGTTGAACAAATGAGTCTTCTAGAAGAAATCAGACATGAAATTATCTCTCATGACGCAA
TAAAGGAATCATTAGCAGATGCTCTTGGTAACAAAAAAAGTGCAAATACTCAGCAGCTAAAGTTAATAGAGAGAATACAT
AAAAGCAACAGTGCTGTTCCTATTGATTTAGTAAAGTCTTTATCCAAAGCTAAGGTTGAATGCCAAGATTTATGGAAGCT
ATCTCATTCTGAAACCAGTAACTTAGAAAAACTAAAAGAACGTTTTACTGATTTAATCACACTCATTCGCGAAGTAGCTT
CTATAAAATCGCAGCAATTAAAATGCTCAAAATACGACTCACTGCTTGCTGACTATGACTCTGATATCACAGAAAAGAAT
ATAAGGGAAGTATTCCCCAAGGTAGGCAAATTTTTTAGCGAAAATGTAGATAAAATAATTGAAAAGCAGAAAAAGGATAA
GGTTACTAATATACAAAAAGTTGCTACTCAGAAACAGATTGAACTTGGCTCATTATGTTTACAGCAAATGGGTATTGCAC
TAAATGAGATTCGTACTTCTTATTACTACCCTATAGATTATGATGAATCTGATTTTTGTTATGGTTTATTTTCACTTTTA
CGGCATAGTGGTTATGCAATTTATCAAAAATGTTTAGCGCAAAATTCTATAAGTAGTCCAATTACGAGACATGTTATGTA
TGAAACTCAAGGGTTATTCATGGAAAGGATGATTGGAACATCCAGAGAATTTATTGAGTTTATTCAACCACACATAAAAG
AGAAATTTGCTATAAAAGGCAAAACTAACGAGAAAGTTAGCAGTGTTGAAAATTTGTACTTGATTTTCAATGAAATAAAC
CTTTCTTCTTTTTTAAAAAATGCAGATGAATTTAGTCTGTTAGCTCATATTATGTTGAGAACTAGGTTAGAACAAGATAT
AATAAATGGTACATTGGAAGTCAAAGACCTGCATGATGCGTGGCTGGAAGGTATGAAGCACTATAAAATTCCAGTAAAAG
CTGAAAATGAGCTAAACACTTATTTTCAAGATGAATATTGGGCAAGCGGTGTTATGGGCTACTTTCCTATAAAAATTATT
GCTTTAATTGCTGCTGTGCAGATTTTCTCTTTCGTTAAAAAGAATCATTACGAATCATTAAGTGCTATAATAAAAGGAGA
TTTTAGTTTACTTATCAGTTGGTTATCTCAAAATGTATACAGTGCAAAGTGTGGCCTGGAACTGCTAAAAAAAGTAACAG
GTAAGGGTTTAGACGTTGAGTGTGTTACTTACTACTTATCTGAAAAGTATAATTTGTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGTACAATTTTTTATTGTACTTTAAGCAAATATACTTTTAACTTTATTATTAATCTATTACGGTATTAAACAGATGTT
TTCTAAAATAATGAACAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATGGTTTTCTTGAGTTATGTATGAATTTTGTTCGAAAATTAACCGGAAAGTTTTATAGCCTTTTTACTTTCAAAGGT
TTGTTTGCTAGCGATATTGC

Product: Zn-dependent carboxypeptidase

Products: NA

Alternate protein names: Carboxypeptidase Taq [H]

Number of amino acids: Translated: 473; Mature: 473

Protein sequence:

>473_residues
MQSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNIEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDAIKESLADALGNKKSANTQQLKLIERIH
KSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQDLWKLSHSETSNLEKLKERFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKN
IREVFPKVGKFFSENVDKIIEKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSLCLQQMGIALNEIRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLL
RHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKGKTNEKVSSVENLYLIFNEIN
LSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDAWLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKII
ALIAAVQIFSFVKKNHYESLSAIIKGDFSLLISWLSQNVYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECVTYYLSEKYNLS

Sequences:

>Translated_473_residues
MQSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNIEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDAIKESLADALGNKKSANTQQLKLIERIH
KSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQDLWKLSHSETSNLEKLKERFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKN
IREVFPKVGKFFSENVDKIIEKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSLCLQQMGIALNEIRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLL
RHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKGKTNEKVSSVENLYLIFNEIN
LSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDAWLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKII
ALIAAVQIFSFVKKNHYESLSAIIKGDFSLLISWLSQNVYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECVTYYLSEKYNLS
>Mature_473_residues
MQSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNIEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDAIKESLADALGNKKSANTQQLKLIERIH
KSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQDLWKLSHSETSNLEKLKERFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKN
IREVFPKVGKFFSENVDKIIEKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSLCLQQMGIALNEIRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLL
RHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKGKTNEKVSSVENLYLIFNEIN
LSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDAWLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKII
ALIAAVQIFSFVKKNHYESLSAIIKGDFSLLISWLSQNVYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECVTYYLSEKYNLS

Specific function: Releases amino acids sequentially from the C-terminus with a broad substrate specificity (except for proline) [H]

COG id: COG2317

COG function: function code E; Zn-dependent carboxypeptidase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M32 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001333 [H]

Pfam domain/function: PF02074 Peptidase_M32 [H]

EC number: =3.4.17.19 [H]

Molecular weight: Translated: 54559; Mature: 54559

Theoretical pI: Translated: 7.09; Mature: 7.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNIEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDAIKESLAD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGNKKSANTQQLKLIERIHKSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQDLWKLSHSETSNLEKLKE
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
RFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKNIREVFPKVGKFFSENVDKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSLCLQQMGIALNEIRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHH
RHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKG
HHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
KTNEKVSSVENLYLIFNEINLSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHH
WLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKIIALIAAVQIFSFVKKNHYESL
HHHCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAIIKGDFSLLISWLSQNVYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECVTYYLSEKYNLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNIEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDAIKESLAD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGNKKSANTQQLKLIERIHKSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQDLWKLSHSETSNLEKLKE
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
RFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKNIREVFPKVGKFFSENVDKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSLCLQQMGIALNEIRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHH
RHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKG
HHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
KTNEKVSSVENLYLIFNEINLSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHH
WLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKIIALIAAVQIFSFVKKNHYESL
HHHCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAIIKGDFSLLISWLSQNVYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECVTYYLSEKYNLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7765282; 1369078 [H]