Definition Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011753
Length 3,299,303

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The map label for this gene is 218708282

Identifier: 218708282

GI number: 218708282

Start: 214670

End: 216136

Strand: Direct

Name: 218708282

Synonym: VS_0220

Alternate gene names: NA

Gene position: 214670-216136 (Clockwise)

Preceding gene: 218708281

Following gene: 218708283

Centisome position: 6.51

GC content: 27.13

Gene sequence:

>1467_bases
ATGATTACGGGTATACCATATTTAAAGGAGTTTTTCATAACTATGACCTTGCATAAAAAGGATAAAATTTTAGTTTTAAT
TTTATATTTAATCTACACTCTTACATGCTTATTATTTATAGAACTATCTTCGGTCAATGATTGGCTTTTACATGTGAATG
TGGTGATTTTTTCATCAATTCTAATTCAAAATTTTATTTTATTTTGTTTTGGTTTAAGGCTTCTTTCTCTGCCAATTATA
TTTTTATTTTTTAGTTATGTGTTTTCTTTATCATATCCAGTGCTAATTTATTTTAATGTAGACTTTGGTGGTATGTCTAG
CCAGGTTACAAATTTAGTTTATGGTGAAAGTGTTTTTAAAGAATCCGTGAACTTAGCGGTATTCTCTATATTGGTGATGT
ATATAGGTTTCATTTTAACGGAATTGTTAAATTTAAAAGAAAAGAAATTAAGCTTCCTATTTTTTAATAATTCATTTTTC
AAACGAAAACAAAATTTGAAAGTTTATGCTGTATTAGGGTGTATTATTTTTGGTTCTGTAGATATCTATTTGTTTAAAGA
AAGATTGATTTTGATGAGCTCTCTAGGATATATGGGGGTCGCTTTACATGAGTTTAATTTTCTACTGGTTTTGTTTTCTT
GGATATTTCCAGGATTCGTTTTTTTACTTTGCTATGTAAATAAAGAAAGCAGGATTAAAATTGTTTTAATCCTGCTTGTT
TTTTTAATTTATAAAAGTTTACAAACATTGACAGGTTTGAGAGCCTTTACTGTTCTTCAACTAGTTGTATTTATGATCTT
CTATAACCTCTATATTTCCAAGTTAAAGATGAAATCTATTCTCACCTTATCTATATCTATTTATTTTGCGTTGTGTTGGT
TTTTCGTTGTTCGGGAGAACAGAGCTTTAGGTATTACAATATCAGATTTTTTAAATATAGATAACTATACTTTAGGAATA
GATATTTTAATTTACTCAATGTCTGAATTTGGAGTTACGTTAAATGTAATTGCTGAAACTTATCAATCTAATATAGAATG
GTATGGAATACTTGGAACTCAAGTCCTTATTACCTTTTTTTCTGCTATACCTTTTATTTCAAAAATATCCCCCGATCTTT
TCTATTTAAATATATCTGAAGCACTTAATCTGTATAGGTATGGTGGTAGTTATATTGCAGATTTTTATTATGATTTTGGT
GTTTTTTGTTTTATACCACTTGTTTTTTTAGGTATGTTGGTTTCATTTGTCGACACTATAATGCTTCACGCAAAGAAAAG
AGAAAATATACTCACGGTAATTTTACTATTCCCTTTTATTGTGCAATTAATTTTTACTGTTAGAACGTCTACTTTTAAAA
TATTTAGGACATTATCTTGGTCATTTATTCTTATGATGATTGTTATGTTAATTGTCATATTGATTGTTTCATTTTTAAAA
ACTAGAGTCCCGGAATGCAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTAAGGTTCTTGAGAGCCTATATTGATGCTTATGATTTTTCCGTGCTGATCATAGTGTTTAGCATTAGCGTGATTTCA
TCGGAAATCAAGCATCTTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAAGTATCATTATACCTGTTTATAACTTGGAAGATCTTGTTGTCAATTGTTTAAATAGTGTATTTAATCAAAATACG
TCATATAATTATGAGGTAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSILIQNFILFCFGLRLLSLPII
FLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFKESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFF
KRKQNLKVYAVLGCIIFGSVDIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV
FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVRENRALGITISDFLNIDNYTLGI
DILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFFSAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFG
VFCFIPLVFLGMLVSFVDTIMLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK
TRVPECKK

Sequences:

>Translated_488_residues
MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSILIQNFILFCFGLRLLSLPII
FLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFKESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFF
KRKQNLKVYAVLGCIIFGSVDIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV
FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVRENRALGITISDFLNIDNYTLGI
DILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFFSAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFG
VFCFIPLVFLGMLVSFVDTIMLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK
TRVPECKK
>Mature_488_residues
MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSILIQNFILFCFGLRLLSLPII
FLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFKESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFF
KRKQNLKVYAVLGCIIFGSVDIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV
FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVRENRALGITISDFLNIDNYTLGI
DILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFFSAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFG
VFCFIPLVFLGMLVSFVDTIMLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK
TRVPECKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56682; Mature: 56682

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSI
CCCCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LIQNFILFCFGLRLLSLPIIFLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFFKRKQNLKVYAVLGCIIFGSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC
DIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVREN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RALGITISDFLNIDNYTLGIDILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFF
CEEEEEHHHHHCCCCEEEEHHHEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHH
SAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFGVFCFIPLVFLGMLVSFVDTI
HHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRVPECKK
HCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSI
CCCCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LIQNFILFCFGLRLLSLPIIFLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFFKRKQNLKVYAVLGCIIFGSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC
DIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVREN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RALGITISDFLNIDNYTLGIDILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFF
CEEEEEHHHHHCCCCEEEEHHHEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHH
SAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFGVFCFIPLVFLGMLVSFVDTI
HHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRVPECKK
HCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA