| Definition | Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011740 |
| Length | 4,588,711 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 218549515
Identifier: 218549515
GI number: 218549515
Start: 2228605
End: 2231292
Strand: Reverse
Name: 218549515
Synonym: EFER_2186
Alternate gene names: NA
Gene position: 2231292-2228605 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218549516
Following gene: 218549514
Centisome position: 48.63
GC content: 36.38
Gene sequence:
>2688_bases ATGTGTGAAATGATCGATTTTAAAGAAAAATACAGTAATATTATTGAATCGGGAAATTCAGAGCAATTAATAGCTTTATT AAAAGTACTGAATGAACAGTCTCGAAAAGAGTTAGCTCCATTAATCAAGAAAGATGTGAAAAGATTAATCGGTCACAAGG AGATATCACGGAATAGGTGGGGAGTTATTGGTAGTGAAAATCAGTTTAAAATGTTAGGTGTAGCAATATTATGCTGTTAC AATAAAAAAGATTGTAAAAACATAAAATCTGTCATGTTTAAGAATAATAATTATCTGGATATAGCTCTGGGGTTATTTTC TCCTGACTGGTTTACCGATTATGTCAATATCTTCGCAGATAAAGATGGTTGTCCTTTTAATTACGAACAAATTAGTGACT GGATTGCGGCAGGTTATCTATCTAATGTGTCGCCAACACTTATCGCAAAAAATATTATACATAGTATTACGCTACAAAAG CATTCTTTTACTTTAGATGTTCATCTTTGGGAAATATTTAATTATCCTTGTGATATATCATGGTCTGACCGCTGGTATCA TAAACAAGAGAAACCAGAAGACGCCGATGAACATAGATGGATATACTTGTTCAAAAAATACACTCAAGAAAAAAGGTTAG ACAGAATGCGGGTTTTAAAAGAAAGCCTTCTTGCTGTCAATCGCGGATTCAATAAAAATCAAACTAACTGGTATGTGGAC TTGTTGACTGCTCTGGAACCTGCTGAAAATGAATGTTTGCAACTACAAAATGAGTTATTTTCAGTATTTCATTGCCCGCA AAATAAACCTATTTCCTATGTATTAAAAATTATTAACAGCCTTAGTGTAAATCCTGAATTTGATTATGATGCATTTATTA ATCATCTGCCTCTCCTTTTTTCCTCAACAATTAAGAGTACTTTGAATAGTACTTTAATACTGGCCGATAAACTGGCAAGT AAATATCCTGATAAACGAATGATAATTTGTTATAACCTCACCGGTGTCTTTATAAATAAAGATACCAGCCTTCAGGAGAA AGCTGCAAAACTAATTGTTAAGTATGGCGATCCGACAGATGCTGAGTTGAGTGCATTGTTGGATAGTTATATTAATAATT TGCTTGCTGGCACTAAACAATTATTAACAGATTTTCTTGATAGCAAACCCCCGGTTGCTGATGAAGCGTTGCTATTGCAC CCAGTTATATCATTAATTCGTGATGATAACCGTATCCCAGAAATTGAAAGCTGGGATGATTTTGTCTTCCTGGCAGGTAG AGCGTGTCTTAACCTGGAATCGTATCATTTTGACCTGTTTCCCGCAGCGTTGTTACGTTTTGCGCCTGAGATTAATAAAG ATAATCTTAGTCAACTGGAGCCTGCTTTTGGTCTGGCGCTGAAAACATTGCAATCTGGTTCTTCATCAGTTGGCGCATTC GATCAAATCCTTGCAACATTTATCCTTGAGTTTGCTGGTTATTTACTTAATAAATTACCTAACGAAAATATACTTAAAAA GTATAATCAATATCTTGAATTAATTAATAATGAAAATAAGAACTTAAAACTTAACTGGGGGTTTCATGAGTGGCAAAAAT CTACCAAAGCAAAATTTCAGCCATGGATTGATATATTAATAAATGTCCTGCATTCGTTACAAAAATCAAACCACCTGCCA CTTCTTTCAACTCCGACGCATTTGCCGTGTTTTATTGATCCCTGTACTCTTGTGCAAAGGTTAAGAAAATATCAAGAGGT AACTCAGGTTCCTGATAATTTAGATTTACAACTTGCTATTCAACGTTGCGTGATACCTGAAAATGAAATTAATTTAGCCG GATTAAACCAAAATGATACTGCGCTATTAAAATATTTCTTCCATGGTGATGTGAAGTCACTTAAATGTGTTGAAAATGAT GATTTAGCATTGTCAGCCATTATTACACGTAATACCAGTCACTATGATTTAGCGTCATTCGAATACGGTTTGATTCTGCT AAGCAAAAACAATTTACCTGCAAATATCATCTCTAATGAGTTTTCATGGTGCCTTGAGACAAAAACACAGACAGTACCTT ATTCAAAGGAGATAGTTTCTTACAAACAATTGAACTTTGATATATCTCGATACTGGCAGCAGGAAAAGACCAGACTTTTT TATGCCTTTAGTTTTATGAAAACATCGAATGGTTGGGAAACAGATAAGCAACGACTGTTATTTTCTTTTCCCGCTGCTCA CGATCTTTTTTTAGTGCGGTTTATCGAATACCACTTTAAAATAGAATATAACGAGCCACGTGACACGATCCACTTGTTGC AGGCAATGCTTGAATTGCCTTTGCCGCTAACACCCATGGGACATCTACTTACCGCTTTTTGCATGCTTCACGCCGACAAA ACTGTCCGTGCTCTTGCCGGAGAATTATGGATTGAAAAGCTGCGTTATCCACAAGGTGTGAATTCCGCCCATATCGGCGA CATCCTGGGCCGGTTGGAAAAAGAGAGCTGGTCACCACTAAAGCGCTTTACCGATCTTGCCATGCAGTCGCTTATTAATA TCAGTTCCCGCCACAATCAGGCATTACTTGAGATGATAAGTGCAATGGACAGCCATTTGAGCACGGTAAAAATCACCAAC TACAAAAAGCTGACTGGGCTACGGCAGGAACTTGAAGCAGCATTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAAATTCTGGAGAATTGCATCACTCAGGCTGGTGACAACGATCTGCCCATTAATTATAAAAAATTAATAGCTAACCTT AATGAATTAACTGTACAAGG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGCTAATTTAGCACGTATAAAAATTGATATTCAGGGAAAGAGTAATGGATACGACTCAAGAACAATACAGCAAAATTAT TGAATCAGGGAATTCAGAGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 895; Mature: 895
Protein sequence:
>895_residues MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRWGVIGSENQFKMLGVAILCCY NKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFADKDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQK HSFTLDVHLWEIFNYPCDISWSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLFSSTIKSTLNSTLILADKLAS KYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTDAELSALLDSYINNLLAGTKQLLTDFLDSKPPVADEALLLH PVISLIRDDNRIPEIESWDDFVFLAGRACLNLESYHFDLFPAALLRFAPEINKDNLSQLEPAFGLALKTLQSGSSSVGAF DQILATFILEFAGYLLNKLPNENILKKYNQYLELINNENKNLKLNWGFHEWQKSTKAKFQPWIDILINVLHSLQKSNHLP LLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAIQRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVEND DLALSAIITRNTSHYDLASFEYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF YAFSFMKTSNGWETDKQRLLFSFPAAHDLFLVRFIEYHFKIEYNEPRDTIHLLQAMLELPLPLTPMGHLLTAFCMLHADK TVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPLKRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITN YKKLTGLRQELEAAL
Sequences:
>Translated_895_residues MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRWGVIGSENQFKMLGVAILCCY NKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFADKDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQK HSFTLDVHLWEIFNYPCDISWSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLFSSTIKSTLNSTLILADKLAS KYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTDAELSALLDSYINNLLAGTKQLLTDFLDSKPPVADEALLLH PVISLIRDDNRIPEIESWDDFVFLAGRACLNLESYHFDLFPAALLRFAPEINKDNLSQLEPAFGLALKTLQSGSSSVGAF DQILATFILEFAGYLLNKLPNENILKKYNQYLELINNENKNLKLNWGFHEWQKSTKAKFQPWIDILINVLHSLQKSNHLP LLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAIQRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVEND DLALSAIITRNTSHYDLASFEYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF YAFSFMKTSNGWETDKQRLLFSFPAAHDLFLVRFIEYHFKIEYNEPRDTIHLLQAMLELPLPLTPMGHLLTAFCMLHADK TVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPLKRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITN YKKLTGLRQELEAAL >Mature_895_residues MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRWGVIGSENQFKMLGVAILCCY NKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFADKDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQK HSFTLDVHLWEIFNYPCDISWSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLFSSTIKSTLNSTLILADKLAS KYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTDAELSALLDSYINNLLAGTKQLLTDFLDSKPPVADEALLLH PVISLIRDDNRIPEIESWDDFVFLAGRACLNLESYHFDLFPAALLRFAPEINKDNLSQLEPAFGLALKTLQSGSSSVGAF DQILATFILEFAGYLLNKLPNENILKKYNQYLELINNENKNLKLNWGFHEWQKSTKAKFQPWIDILINVLHSLQKSNHLP LLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAIQRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVEND DLALSAIITRNTSHYDLASFEYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF YAFSFMKTSNGWETDKQRLLFSFPAAHDLFLVRFIEYHFKIEYNEPRDTIHLLQAMLELPLPLTPMGHLLTAFCMLHADK TVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPLKRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITN YKKLTGLRQELEAAL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103197; Mature: 103197
Theoretical pI: Translated: 6.72; Mature: 6.72
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRW CCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC GVIGSENQFKMLGVAILCCYNKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFAD CCCCCCCCHHHHEEHHHEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCC KDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQKHSFTLDVHLWEIFNYPCDIS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEEEEHHHHCCCCCCC WSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLF HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SSTIKSTLNSTLILADKLASKYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTD HHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHEEEECCCCCC AELSALLDSYINNLLAGTKQLLTDFLDSKPPVADEALLLHPVISLIRDDNRIPEIESWDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC FVFLAGRACLNLESYHFDLFPAALLRFAPEINKDNLSQLEPAFGLALKTLQSGSSSVGAF EEEECCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH DQILATFILEFAGYLLNKLPNENILKKYNQYLELINNENKNLKLNWGFHEWQKSTKAKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH PWIDILINVLHSLQKSNHLPLLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH QRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVENDDLALSAIITRNTSHYDLASF HHHCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCEECCC EYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF CEEEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHEEE YAFSFMKTSNGWETDKQRLLFSFPAAHDLFLVRFIEYHFKIEYNEPRDTIHLLQAMLELP EEEEEHCCCCCCCCHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCC LPLTPMGHLLTAFCMLHADKTVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPL CCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHH KRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITNYKKLTGLRQELEAAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRW CCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC GVIGSENQFKMLGVAILCCYNKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFAD CCCCCCCCHHHHEEHHHEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCC KDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQKHSFTLDVHLWEIFNYPCDIS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEEEEHHHHCCCCCCC WSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLF HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SSTIKSTLNSTLILADKLASKYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTD HHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHEEEECCCCCC AELSALLDSYINNLLAGTKQLLTDFLDSKPPVADEALLLHPVISLIRDDNRIPEIESWDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC FVFLAGRACLNLESYHFDLFPAALLRFAPEINKDNLSQLEPAFGLALKTLQSGSSSVGAF EEEECCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH DQILATFILEFAGYLLNKLPNENILKKYNQYLELINNENKNLKLNWGFHEWQKSTKAKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH PWIDILINVLHSLQKSNHLPLLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH QRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVENDDLALSAIITRNTSHYDLASF HHHCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCEECCC EYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF CEEEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHEEE YAFSFMKTSNGWETDKQRLLFSFPAAHDLFLVRFIEYHFKIEYNEPRDTIHLLQAMLELP EEEEEHCCCCCCCCHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCC LPLTPMGHLLTAFCMLHADKTVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPL CCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHH KRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITNYKKLTGLRQELEAAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA