Definition Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome.
Accession NC_011740
Length 4,588,711

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The map label for this gene is 218549515

Identifier: 218549515

GI number: 218549515

Start: 2228605

End: 2231292

Strand: Reverse

Name: 218549515

Synonym: EFER_2186

Alternate gene names: NA

Gene position: 2231292-2228605 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218549516

Following gene: 218549514

Centisome position: 48.63

GC content: 36.38

Gene sequence:

>2688_bases
ATGTGTGAAATGATCGATTTTAAAGAAAAATACAGTAATATTATTGAATCGGGAAATTCAGAGCAATTAATAGCTTTATT
AAAAGTACTGAATGAACAGTCTCGAAAAGAGTTAGCTCCATTAATCAAGAAAGATGTGAAAAGATTAATCGGTCACAAGG
AGATATCACGGAATAGGTGGGGAGTTATTGGTAGTGAAAATCAGTTTAAAATGTTAGGTGTAGCAATATTATGCTGTTAC
AATAAAAAAGATTGTAAAAACATAAAATCTGTCATGTTTAAGAATAATAATTATCTGGATATAGCTCTGGGGTTATTTTC
TCCTGACTGGTTTACCGATTATGTCAATATCTTCGCAGATAAAGATGGTTGTCCTTTTAATTACGAACAAATTAGTGACT
GGATTGCGGCAGGTTATCTATCTAATGTGTCGCCAACACTTATCGCAAAAAATATTATACATAGTATTACGCTACAAAAG
CATTCTTTTACTTTAGATGTTCATCTTTGGGAAATATTTAATTATCCTTGTGATATATCATGGTCTGACCGCTGGTATCA
TAAACAAGAGAAACCAGAAGACGCCGATGAACATAGATGGATATACTTGTTCAAAAAATACACTCAAGAAAAAAGGTTAG
ACAGAATGCGGGTTTTAAAAGAAAGCCTTCTTGCTGTCAATCGCGGATTCAATAAAAATCAAACTAACTGGTATGTGGAC
TTGTTGACTGCTCTGGAACCTGCTGAAAATGAATGTTTGCAACTACAAAATGAGTTATTTTCAGTATTTCATTGCCCGCA
AAATAAACCTATTTCCTATGTATTAAAAATTATTAACAGCCTTAGTGTAAATCCTGAATTTGATTATGATGCATTTATTA
ATCATCTGCCTCTCCTTTTTTCCTCAACAATTAAGAGTACTTTGAATAGTACTTTAATACTGGCCGATAAACTGGCAAGT
AAATATCCTGATAAACGAATGATAATTTGTTATAACCTCACCGGTGTCTTTATAAATAAAGATACCAGCCTTCAGGAGAA
AGCTGCAAAACTAATTGTTAAGTATGGCGATCCGACAGATGCTGAGTTGAGTGCATTGTTGGATAGTTATATTAATAATT
TGCTTGCTGGCACTAAACAATTATTAACAGATTTTCTTGATAGCAAACCCCCGGTTGCTGATGAAGCGTTGCTATTGCAC
CCAGTTATATCATTAATTCGTGATGATAACCGTATCCCAGAAATTGAAAGCTGGGATGATTTTGTCTTCCTGGCAGGTAG
AGCGTGTCTTAACCTGGAATCGTATCATTTTGACCTGTTTCCCGCAGCGTTGTTACGTTTTGCGCCTGAGATTAATAAAG
ATAATCTTAGTCAACTGGAGCCTGCTTTTGGTCTGGCGCTGAAAACATTGCAATCTGGTTCTTCATCAGTTGGCGCATTC
GATCAAATCCTTGCAACATTTATCCTTGAGTTTGCTGGTTATTTACTTAATAAATTACCTAACGAAAATATACTTAAAAA
GTATAATCAATATCTTGAATTAATTAATAATGAAAATAAGAACTTAAAACTTAACTGGGGGTTTCATGAGTGGCAAAAAT
CTACCAAAGCAAAATTTCAGCCATGGATTGATATATTAATAAATGTCCTGCATTCGTTACAAAAATCAAACCACCTGCCA
CTTCTTTCAACTCCGACGCATTTGCCGTGTTTTATTGATCCCTGTACTCTTGTGCAAAGGTTAAGAAAATATCAAGAGGT
AACTCAGGTTCCTGATAATTTAGATTTACAACTTGCTATTCAACGTTGCGTGATACCTGAAAATGAAATTAATTTAGCCG
GATTAAACCAAAATGATACTGCGCTATTAAAATATTTCTTCCATGGTGATGTGAAGTCACTTAAATGTGTTGAAAATGAT
GATTTAGCATTGTCAGCCATTATTACACGTAATACCAGTCACTATGATTTAGCGTCATTCGAATACGGTTTGATTCTGCT
AAGCAAAAACAATTTACCTGCAAATATCATCTCTAATGAGTTTTCATGGTGCCTTGAGACAAAAACACAGACAGTACCTT
ATTCAAAGGAGATAGTTTCTTACAAACAATTGAACTTTGATATATCTCGATACTGGCAGCAGGAAAAGACCAGACTTTTT
TATGCCTTTAGTTTTATGAAAACATCGAATGGTTGGGAAACAGATAAGCAACGACTGTTATTTTCTTTTCCCGCTGCTCA
CGATCTTTTTTTAGTGCGGTTTATCGAATACCACTTTAAAATAGAATATAACGAGCCACGTGACACGATCCACTTGTTGC
AGGCAATGCTTGAATTGCCTTTGCCGCTAACACCCATGGGACATCTACTTACCGCTTTTTGCATGCTTCACGCCGACAAA
ACTGTCCGTGCTCTTGCCGGAGAATTATGGATTGAAAAGCTGCGTTATCCACAAGGTGTGAATTCCGCCCATATCGGCGA
CATCCTGGGCCGGTTGGAAAAAGAGAGCTGGTCACCACTAAAGCGCTTTACCGATCTTGCCATGCAGTCGCTTATTAATA
TCAGTTCCCGCCACAATCAGGCATTACTTGAGATGATAAGTGCAATGGACAGCCATTTGAGCACGGTAAAAATCACCAAC
TACAAAAAGCTGACTGGGCTACGGCAGGAACTTGAAGCAGCATTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAAAATTCTGGAGAATTGCATCACTCAGGCTGGTGACAACGATCTGCCCATTAATTATAAAAAATTAATAGCTAACCTT
AATGAATTAACTGTACAAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGCTAATTTAGCACGTATAAAAATTGATATTCAGGGAAAGAGTAATGGATACGACTCAAGAACAATACAGCAAAATTAT
TGAATCAGGGAATTCAGAGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 895; Mature: 895

Protein sequence:

>895_residues
MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRWGVIGSENQFKMLGVAILCCY
NKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFADKDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQK
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LLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAIQRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVEND
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TVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPLKRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITN
YKKLTGLRQELEAAL

Sequences:

>Translated_895_residues
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NKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFADKDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQK
HSFTLDVHLWEIFNYPCDISWSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD
LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLFSSTIKSTLNSTLILADKLAS
KYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTDAELSALLDSYINNLLAGTKQLLTDFLDSKPPVADEALLLH
PVISLIRDDNRIPEIESWDDFVFLAGRACLNLESYHFDLFPAALLRFAPEINKDNLSQLEPAFGLALKTLQSGSSSVGAF
DQILATFILEFAGYLLNKLPNENILKKYNQYLELINNENKNLKLNWGFHEWQKSTKAKFQPWIDILINVLHSLQKSNHLP
LLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAIQRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVEND
DLALSAIITRNTSHYDLASFEYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF
YAFSFMKTSNGWETDKQRLLFSFPAAHDLFLVRFIEYHFKIEYNEPRDTIHLLQAMLELPLPLTPMGHLLTAFCMLHADK
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YKKLTGLRQELEAAL
>Mature_895_residues
MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRWGVIGSENQFKMLGVAILCCY
NKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFADKDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQK
HSFTLDVHLWEIFNYPCDISWSDRWYHKQEKPEDADEHRWIYLFKKYTQEKRLDRMRVLKESLLAVNRGFNKNQTNWYVD
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LLSTPTHLPCFIDPCTLVQRLRKYQEVTQVPDNLDLQLAIQRCVIPENEINLAGLNQNDTALLKYFFHGDVKSLKCVEND
DLALSAIITRNTSHYDLASFEYGLILLSKNNLPANIISNEFSWCLETKTQTVPYSKEIVSYKQLNFDISRYWQQEKTRLF
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TVRALAGELWIEKLRYPQGVNSAHIGDILGRLEKESWSPLKRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITN
YKKLTGLRQELEAAL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103197; Mature: 103197

Theoretical pI: Translated: 6.72; Mature: 6.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRW
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCC
GVIGSENQFKMLGVAILCCYNKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFAD
CCCCCCCCHHHHEEHHHEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCC
KDGCPFNYEQISDWIAAGYLSNVSPTLIAKNIIHSITLQKHSFTLDVHLWEIFNYPCDIS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEEEEHHHHCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
LLTALEPAENECLQLQNELFSVFHCPQNKPISYVLKIINSLSVNPEFDYDAFINHLPLLF
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
SSTIKSTLNSTLILADKLASKYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTD
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EEEEEHCCCCCCCCHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCC
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>Mature Secondary Structure
MCEMIDFKEKYSNIIESGNSEQLIALLKVLNEQSRKELAPLIKKDVKRLIGHKEISRNRW
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GVIGSENQFKMLGVAILCCYNKKDCKNIKSVMFKNNNYLDIALGLFSPDWFTDYVNIFAD
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SSTIKSTLNSTLILADKLASKYPDKRMIICYNLTGVFINKDTSLQEKAAKLIVKYGDPTD
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CCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHH
KRFTDLAMQSLINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITNYKKLTGLRQELEAAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA