| Definition | Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011740 |
| Length | 4,588,711 |
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The map label for this gene is 218549514
Identifier: 218549514
GI number: 218549514
Start: 2225875
End: 2228580
Strand: Reverse
Name: 218549514
Synonym: EFER_2185
Alternate gene names: NA
Gene position: 2228580-2225875 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218549515
Following gene: 218549513
Centisome position: 48.57
GC content: 41.2
Gene sequence:
>2706_bases TTGATATTCAGGGAAAGAGTAATGGATACGACTCAAGAACAATACAGCAAAATTATTGAATCAGGGAATTCAGAGCAGTT ATTAGCATTTCTGAAGTCGCTGGATGATAAGCAGCGGAAAAATTTGGTGCCGCTTATAAAGAAAGACGTGAAACGATTAG GTGCCTATCAATGGTATGAAGTAAGCATCGGCGGTCTTCGTGGAGGAAGTTACAAGCAAAACGGTACAAAAAATCAATTA CAGATGCTTAGTGTTGCGATCATCAGTTGCTATGCACGAAAAGACTGTAAAAATATTGAACGTAACTTATTGAATTCTAA TAATGCAGTTAAAGAAACACTCAAATGGCGCTGCCCGGAATGGCTTACTGATTATATTAATGGTGATATTAAAGGTGGAG ATTTTTCAATAGATTATGCCACTCTCTGCGACTGGATTGCCGAAGGTTATGTTGGCAATATTACACCGCAGGTTATTGTT AATAAAATTACTTCTGCATCAATTCTTGAAAAACATCGTTTTTCTTTAGACGATCATATTTGGATGGTGTTTAATTATCC GTGCAGTGTTTCATGGTCAGATCAGTGGTATCCGAAAGAAAGTAAACCTGAGGGTGCCGATGATCATAAATGGATATATT TCTTCAAAAAATATACTATGGACAAACGCATCGACAGAATAAGAGTATTAAAAGAAAGCTTACTTGCGGTCAATCGTAAC TTTAATCGTGAACAAACATGTTGGTACGCCACGCTATTTACTTCGCTGCAACCGACAGCGGACGAATGTTTGCAACTTCA GGAAGCACTTTTTTCGACATTTTATTGCCCGCACAGTAAACCTGGCACTACGGCATTACAGGCAATCAAAAAAATATCCG AACATCCGGAGTTTCACCGTGATGAGTTTATTTCCTGCCTTCCTCTGTTATTTTCTTTCACCACGAAAGCTATTGTCGAT AGCGCATTAATGATTGCTGATAAACTGGCGAAACAGCACCCTGATAAAAGATTAGAAATCTGTCAACACCTCACCACGGT ATTCCTTAACAAAGATATCGCGCTACAAAATAAAACAGCAAAGTTAATTGCAAAATATTCTAGTCCATTAGATCCAGAAA TAAGTGCGTTATTAAGCAGTTATGCCGATAATCTGCTTACAGGCGCTCGTGATTTATTAACCGACTTTCTTGATATCACA CCGCTTGCGCCCGATGAATCTGCTGAACTTTCTCCCGTAGTGCCACTGATTCGTGATGATAACCGTATCCCCGCAATTGA AAACTGGGATGATTTTGTCTTCCTGGCAGGGCAGGCATTTCATAACGTGGAATCATATCACTTTGACCTGTTACCGGCTG CATTGTTACGTTTTGCTCCTGAAATTAATGAAGAGAATGTGAACCAACTGGAACCCGCGTTTATGCAGGCGCTTGAGGCA TCTGAACATATTTCTTTTTTTGACGGGATGTTGGGCTTTTTCTTTATGGAATATGCGGCAGAGCTTATCTCACGTTTTCC ACTACAGACAGCAAAAATTAAAATAATGTATGAAGATTTTCAGGGTTTAAAAAATACAACTGACAAATGGAAAAAGATAG ACTGGGGGTTTCATTCCTATGATGAAGAGGACAAAAAACGAAGCCGCTCATGGATTGCGTTTTTCAAAAACATTCTGTTG TTATTAAAAAACAACGTTAATCTGCCTTTGCTTTCAACACCCACGCATCTGCCTTGCTTTATTGACCCTACGGTGTTTGT AGAGCGTCTTTTACAATACCAAAATGCGGGTGTAGAACCTTGTAGTCAGGATATGCAACTTGCGATTCAACGATGTGTAT TTATTGACACTCAGCTTGATATTTCACAACTTAACACCGAATATGCCGCATTAGTGCGATATTTGTTTTCCGGCGAGCAG GATGCATTAGCACAGATCGCGCAGGATGATTGGAAACTGGCGGCCATTATTACCCGCAGTGCGGTTAACCCTGACACGAC GTCTTTTGATGTCGGGTATGCGTTGCTGGAAAAACATGCGTTACCGATGGAGTTATTAAGCAATTTGTTCCCGTGGTTTA TCAGGGAAAACAAAACTCGCTTCCCTGCCCGAACATTCAATTTTGACGTCTCGACGGCTGTTCAAAATCTGGAGATAACT TTGTTCTATGCTGACAGTTTCATGCCTTGCTGTAAATACAGTTACTTTGGCGGAGGGTATAAGCGGCGAACGCTGTATGC TTTTCCCTGGCAGGGTGATGTCACACTCATGCGTTATATAGAAATGAATTTTCATGATCCAAACATTTCATCAACGAAGT CTAATCTGGAAATCCTTCAGGCACTTTACGATCTCCCGTTGCCACTTTCACCCATGGGCCATTTACTCACCGCTTTTTGC ATGCTTCATGCCGACAAAACGGTGCGTGCTCTTGCTGGCGAACTATGGATTGAAAAACTGTGTTATCCACAAGGTGTGAA TTCTGCCCATATTGGCGACATCCTTGGTCGGCTGGAAAAAGAGGGCTGGTCGCCACTCAAACGCTTTACCGATCTTGCCA TGCAGGCGCTTATCAATATCAGTTCCCGCCACAATCAGGCATTACTTGAGATGATAAGTGCAATGGACAGCCATTTGAGC ACGGTAAAAATCACCAATTACAAAAAGCTCAATGAGCTGCAACTCGAACTTACAAGGAAGTCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCATTTGAGCACGGTAAAAATCACCAACTACAAAAAGCTGACTGGGCTACGGCAGGAACTTGAAGCAGCATTGTAAAAGC TAATTTAGCACGTATAAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGGAAGAGACACTCACTTATAGTTACAACATCCCATCCGCTTTGCACAAAACAAACGGAAAAGATGAATTACGCCTGGC GAAATACAGCGAGATCCAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 901; Mature: 901
Protein sequence:
>901_residues MIFRERVMDTTQEQYSKIIESGNSEQLLAFLKSLDDKQRKNLVPLIKKDVKRLGAYQWYEVSIGGLRGGSYKQNGTKNQL QMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPEWLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIV NKITSASILEKHRFSLDDHIWMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN FNREQTCWYATLFTSLQPTADECLQLQEALFSTFYCPHSKPGTTALQAIKKISEHPEFHRDEFISCLPLLFSFTTKAIVD SALMIADKLAKQHPDKRLEICQHLTTVFLNKDIALQNKTAKLIAKYSSPLDPEISALLSSYADNLLTGARDLLTDFLDIT PLAPDESAELSPVVPLIRDDNRIPAIENWDDFVFLAGQAFHNVESYHFDLLPAALLRFAPEINEENVNQLEPAFMQALEA SEHISFFDGMLGFFFMEYAAELISRFPLQTAKIKIMYEDFQGLKNTTDKWKKIDWGFHSYDEEDKKRSRSWIAFFKNILL LLKNNVNLPLLSTPTHLPCFIDPTVFVERLLQYQNAGVEPCSQDMQLAIQRCVFIDTQLDISQLNTEYAALVRYLFSGEQ DALAQIAQDDWKLAAIITRSAVNPDTTSFDVGYALLEKHALPMELLSNLFPWFIRENKTRFPARTFNFDVSTAVQNLEIT LFYADSFMPCCKYSYFGGGYKRRTLYAFPWQGDVTLMRYIEMNFHDPNISSTKSNLEILQALYDLPLPLSPMGHLLTAFC MLHADKTVRALAGELWIEKLCYPQGVNSAHIGDILGRLEKEGWSPLKRFTDLAMQALINISSRHNQALLEMISAMDSHLS TVKITNYKKLNELQLELTRKS
Sequences:
>Translated_901_residues MIFRERVMDTTQEQYSKIIESGNSEQLLAFLKSLDDKQRKNLVPLIKKDVKRLGAYQWYEVSIGGLRGGSYKQNGTKNQL QMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPEWLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIV NKITSASILEKHRFSLDDHIWMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN FNREQTCWYATLFTSLQPTADECLQLQEALFSTFYCPHSKPGTTALQAIKKISEHPEFHRDEFISCLPLLFSFTTKAIVD SALMIADKLAKQHPDKRLEICQHLTTVFLNKDIALQNKTAKLIAKYSSPLDPEISALLSSYADNLLTGARDLLTDFLDIT PLAPDESAELSPVVPLIRDDNRIPAIENWDDFVFLAGQAFHNVESYHFDLLPAALLRFAPEINEENVNQLEPAFMQALEA SEHISFFDGMLGFFFMEYAAELISRFPLQTAKIKIMYEDFQGLKNTTDKWKKIDWGFHSYDEEDKKRSRSWIAFFKNILL LLKNNVNLPLLSTPTHLPCFIDPTVFVERLLQYQNAGVEPCSQDMQLAIQRCVFIDTQLDISQLNTEYAALVRYLFSGEQ DALAQIAQDDWKLAAIITRSAVNPDTTSFDVGYALLEKHALPMELLSNLFPWFIRENKTRFPARTFNFDVSTAVQNLEIT LFYADSFMPCCKYSYFGGGYKRRTLYAFPWQGDVTLMRYIEMNFHDPNISSTKSNLEILQALYDLPLPLSPMGHLLTAFC MLHADKTVRALAGELWIEKLCYPQGVNSAHIGDILGRLEKEGWSPLKRFTDLAMQALINISSRHNQALLEMISAMDSHLS TVKITNYKKLNELQLELTRKS >Mature_901_residues MIFRERVMDTTQEQYSKIIESGNSEQLLAFLKSLDDKQRKNLVPLIKKDVKRLGAYQWYEVSIGGLRGGSYKQNGTKNQL QMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPEWLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIV NKITSASILEKHRFSLDDHIWMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN FNREQTCWYATLFTSLQPTADECLQLQEALFSTFYCPHSKPGTTALQAIKKISEHPEFHRDEFISCLPLLFSFTTKAIVD SALMIADKLAKQHPDKRLEICQHLTTVFLNKDIALQNKTAKLIAKYSSPLDPEISALLSSYADNLLTGARDLLTDFLDIT PLAPDESAELSPVVPLIRDDNRIPAIENWDDFVFLAGQAFHNVESYHFDLLPAALLRFAPEINEENVNQLEPAFMQALEA SEHISFFDGMLGFFFMEYAAELISRFPLQTAKIKIMYEDFQGLKNTTDKWKKIDWGFHSYDEEDKKRSRSWIAFFKNILL LLKNNVNLPLLSTPTHLPCFIDPTVFVERLLQYQNAGVEPCSQDMQLAIQRCVFIDTQLDISQLNTEYAALVRYLFSGEQ DALAQIAQDDWKLAAIITRSAVNPDTTSFDVGYALLEKHALPMELLSNLFPWFIRENKTRFPARTFNFDVSTAVQNLEIT LFYADSFMPCCKYSYFGGGYKRRTLYAFPWQGDVTLMRYIEMNFHDPNISSTKSNLEILQALYDLPLPLSPMGHLLTAFC MLHADKTVRALAGELWIEKLCYPQGVNSAHIGDILGRLEKEGWSPLKRFTDLAMQALINISSRHNQALLEMISAMDSHLS TVKITNYKKLNELQLELTRKS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103500; Mature: 103500
Theoretical pI: Translated: 6.11; Mature: 6.11
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIFRERVMDTTQEQYSKIIESGNSEQLLAFLKSLDDKQRKNLVPLIKKDVKRLGAYQWYE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCEEEE VSIGGLRGGSYKQNGTKNQLQMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPE EEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHH WLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIVNKITSASILEKHRFSLDDHI HHHHHHCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE WMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC FNREQTCWYATLFTSLQPTADECLQLQEALFSTFYCPHSKPGTTALQAIKKISEHPEFHR CCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHH DEFISCLPLLFSFTTKAIVDSALMIADKLAKQHPDKRLEICQHLTTVFLNKDIALQNKTA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHH KLIAKYSSPLDPEISALLSSYADNLLTGARDLLTDFLDITPLAPDESAELSPVVPLIRDD HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECC NRIPAIENWDDFVFLAGQAFHNVESYHFDLLPAALLRFAPEINEENVNQLEPAFMQALEA CCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHH SEHISFFDGMLGFFFMEYAAELISRFPLQTAKIKIMYEDFQGLKNTTDKWKKIDWGFHSY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCC DEEDKKRSRSWIAFFKNILLLLKNNVNLPLLSTPTHLPCFIDPTVFVERLLQYQNAGVEP CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCC CSQDMQLAIQRCVFIDTQLDISQLNTEYAALVRYLFSGEQDALAQIAQDDWKLAAIITRS CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC AVNPDTTSFDVGYALLEKHALPMELLSNLFPWFIRENKTRFPARTFNFDVSTAVQNLEIT CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHCCEEEE LFYADSFMPCCKYSYFGGGYKRRTLYAFPWQGDVTLMRYIEMNFHDPNISSTKSNLEILQ EEECCCCCHHHHHHHCCCCEECCEEEEECCCCCHHEEEEEHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH ALYDLPLPLSPMGHLLTAFCMLHADKTVRALAGELWIEKLCYPQGVNSAHIGDILGRLEK HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH EGWSPLKRFTDLAMQALINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITNYKKLNELQLELTRK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHEEECC S C >Mature Secondary Structure MIFRERVMDTTQEQYSKIIESGNSEQLLAFLKSLDDKQRKNLVPLIKKDVKRLGAYQWYE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCEEEE VSIGGLRGGSYKQNGTKNQLQMLSVAIISCYARKDCKNIERNLLNSNNAVKETLKWRCPE EEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHH WLTDYINGDIKGGDFSIDYATLCDWIAEGYVGNITPQVIVNKITSASILEKHRFSLDDHI HHHHHHCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE WMVFNYPCSVSWSDQWYPKESKPEGADDHKWIYFFKKYTMDKRIDRIRVLKESLLAVNRN EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC FNREQTCWYATLFTSLQPTADECLQLQEALFSTFYCPHSKPGTTALQAIKKISEHPEFHR CCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHH DEFISCLPLLFSFTTKAIVDSALMIADKLAKQHPDKRLEICQHLTTVFLNKDIALQNKTA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHH KLIAKYSSPLDPEISALLSSYADNLLTGARDLLTDFLDITPLAPDESAELSPVVPLIRDD HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECC NRIPAIENWDDFVFLAGQAFHNVESYHFDLLPAALLRFAPEINEENVNQLEPAFMQALEA CCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHH SEHISFFDGMLGFFFMEYAAELISRFPLQTAKIKIMYEDFQGLKNTTDKWKKIDWGFHSY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCC DEEDKKRSRSWIAFFKNILLLLKNNVNLPLLSTPTHLPCFIDPTVFVERLLQYQNAGVEP CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCC CSQDMQLAIQRCVFIDTQLDISQLNTEYAALVRYLFSGEQDALAQIAQDDWKLAAIITRS CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC AVNPDTTSFDVGYALLEKHALPMELLSNLFPWFIRENKTRFPARTFNFDVSTAVQNLEIT CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHCCEEEE LFYADSFMPCCKYSYFGGGYKRRTLYAFPWQGDVTLMRYIEMNFHDPNISSTKSNLEILQ EEECCCCCHHHHHHHCCCCEECCEEEEECCCCCHHEEEEEHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH ALYDLPLPLSPMGHLLTAFCMLHADKTVRALAGELWIEKLCYPQGVNSAHIGDILGRLEK HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH EGWSPLKRFTDLAMQALINISSRHNQALLEMISAMDSHLSTVKITNYKKLNELQLELTRK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHEEECC S C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA