| Definition | Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011312 |
| Length | 3,325,165 |
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The map label for this gene is ampG4 [H]
Identifier: 209694511
GI number: 209694511
Start: 1041789
End: 1043132
Strand: Reverse
Name: ampG4 [H]
Synonym: VSAL_I0944
Alternate gene names: 209694511
Gene position: 1043132-1041789 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209694512
Following gene: 209694510
Centisome position: 31.37
GC content: 39.36
Gene sequence:
>1344_bases ATGTCCCATTCGATGCAATGGAAAACCGCAATTAAAAGTTACATGGATAAACGCCTACTTTGGGTTTTTATGCTTGGTTG TTCAAGTGGTTTCCCGTGGGTTCTTATCGGCTCAAATATGTCAGGTTGGCTTCAAGATGCAGGGTTAACTCGTGCTGCTA TTGGCTATTTCGGTTCAGTATTTGCAGTTTATGCCATTAATTTTATGTGGGCACCTTTGGTTGACCGTGTAAAATTACCT TTCCTGAGTAAAAAATTAGGGCAACGTAAAAGTTGGATTTTCCTCTGCCAAGGCATTGTATTAGTCTCAACCTTCCAAAT TGCAGGTTTAAACCCTACCGATAATCTGGTGCTTATCTCAATGTTCGCACTCGTTATTTCAATCGCTTCTTCTACTCAAG ACATTGCCATTGATGCCTTCCGTATAGACACTTTTCCTAAATCAGAGTCAACCAAAATGCCACAAGCTTCTGCAATGGCC GTTATTGGTTGGTGGACTGGTTACTCCCTCCCTGGATATTTTGCTTTTGTTAATGCAGATACTATCGGATGGAATAATGT CTACTACGGTATGACCGCGATTGTGGCTCTATTAATGGTCTTCACTTTATTAGTTGGAGAACCAAAAACTAAACGTGATG AACTGCAACATGAAGCAGAAGAACGATACAATAAAGTCATTGGCTCAAAAACGGCTACTTGGTTTTCCGTAACGATCATC GAACCATTTTATGATTTCTTTAAACGTAATGGCGTAAAAACCGCTTGTACCCTGTTGTTATTCGTTTTCTTATTTAAAAT TGGCGAAGCCTTTTTAGGAAGAATGTCGATTACGTTTTACAAAGAAATTGGATTCAGTAATGAACAGATTGGTTATTACT CAAAATTAATTGGTTGGGGAGCGACCATCTTCTTTACACTTTTAGGCAGTTTAATTAATGTCCGTTTTGGTGTTATTAAA GGTCTAATGATTGGTGGGGTAGCGATGGCAGCAAGTAATTTGATGTTTGCATTGATTGCAAATGTTGGCCCTAACGAACA CTTATTCTTAGCAACCATCATTGTTGATAATTTCACAACGGCTTTTTCTACCGTTGCCTTTGTGTCCTTCTTAACTATTT TAACTGGCGAAGCTTTCTCTGCAACGCAGTACGCCTTACTTGCCTCTTTAGGGAACTTAGGTCGGACGACATTAGCCTCT TTCAGTGGAGAGCTTGCCGACTATCTAAATAGTTGGCCTCTATTCTTCATATTGACAGCGGTAATGGTTATCCCAAGCCT AATTATGTTGCTTATGCTTAAAGATCACTTTAAAGCCCTACTTGATAAGTCTCAAGGTTCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGATAATCCAATTACAGAGCAGCTTTCGAGCTGCTCTGTTGTTTATGCTGAATTATTTCCCTCTTTTATTCCTATTATA AGAATAACAAGGAGCGTTAC
Downstream 100 bases:
>100_bases ACCAGAGAAGTCATAACAAGTTTGCTACCAAAGCCCCCCTAACTCGGGGGCTTTATTGTTTCCAGATCACAAAATCATGT CAAATTAACGTCAAGTAAGT
Product: MSF transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 447; Mature: 446
Protein sequence:
>447_residues MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLP FLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLISMFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMA VIGWWTGYSLPGYFAFVNADTIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATIFFTLLGSLINVRFGVIK GLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLAS FSGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS
Sequences:
>Translated_447_residues MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLP FLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLISMFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMA VIGWWTGYSLPGYFAFVNADTIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATIFFTLLGSLINVRFGVIK GLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLAS FSGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS >Mature_446_residues SHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLPF LSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLISMFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAV IGWWTGYSLPGYFAFVNADTIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTIIE PFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATIFFTLLGSLINVRFGVIKG LMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASF SGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS
Specific function: Probably Acts As A Permease In The Beta-Lactamase Induction System And In Peptidoglycan Recycling. [C]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786636, Length=430, Percent_Identity=28.6046511627907, Blast_Score=186, Evalue=3e-48,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR020846 - InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49533; Mature: 49402
Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 4.0 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.8 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH FAVYAINFMWAPLVDRVKLPFLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLIS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH MFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAVIGWWTGYSLPGYFAFVNAD HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC TIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEH EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH ATIFFTLLGSLINVRFGVIKGLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH AFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASFSGELADYLNSWPLFFILTA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH VMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure SHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH FAVYAINFMWAPLVDRVKLPFLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLIS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH MFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAVIGWWTGYSLPGYFAFVNAD HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC TIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEH EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH ATIFFTLLGSLINVRFGVIKGLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH AFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASFSGELADYLNSWPLFFILTA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH VMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11557893 [H]