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Definition Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011312
Length 3,325,165

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The map label for this gene is ampG4 [H]

Identifier: 209694511

GI number: 209694511

Start: 1041789

End: 1043132

Strand: Reverse

Name: ampG4 [H]

Synonym: VSAL_I0944

Alternate gene names: 209694511

Gene position: 1043132-1041789 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209694512

Following gene: 209694510

Centisome position: 31.37

GC content: 39.36

Gene sequence:

>1344_bases
ATGTCCCATTCGATGCAATGGAAAACCGCAATTAAAAGTTACATGGATAAACGCCTACTTTGGGTTTTTATGCTTGGTTG
TTCAAGTGGTTTCCCGTGGGTTCTTATCGGCTCAAATATGTCAGGTTGGCTTCAAGATGCAGGGTTAACTCGTGCTGCTA
TTGGCTATTTCGGTTCAGTATTTGCAGTTTATGCCATTAATTTTATGTGGGCACCTTTGGTTGACCGTGTAAAATTACCT
TTCCTGAGTAAAAAATTAGGGCAACGTAAAAGTTGGATTTTCCTCTGCCAAGGCATTGTATTAGTCTCAACCTTCCAAAT
TGCAGGTTTAAACCCTACCGATAATCTGGTGCTTATCTCAATGTTCGCACTCGTTATTTCAATCGCTTCTTCTACTCAAG
ACATTGCCATTGATGCCTTCCGTATAGACACTTTTCCTAAATCAGAGTCAACCAAAATGCCACAAGCTTCTGCAATGGCC
GTTATTGGTTGGTGGACTGGTTACTCCCTCCCTGGATATTTTGCTTTTGTTAATGCAGATACTATCGGATGGAATAATGT
CTACTACGGTATGACCGCGATTGTGGCTCTATTAATGGTCTTCACTTTATTAGTTGGAGAACCAAAAACTAAACGTGATG
AACTGCAACATGAAGCAGAAGAACGATACAATAAAGTCATTGGCTCAAAAACGGCTACTTGGTTTTCCGTAACGATCATC
GAACCATTTTATGATTTCTTTAAACGTAATGGCGTAAAAACCGCTTGTACCCTGTTGTTATTCGTTTTCTTATTTAAAAT
TGGCGAAGCCTTTTTAGGAAGAATGTCGATTACGTTTTACAAAGAAATTGGATTCAGTAATGAACAGATTGGTTATTACT
CAAAATTAATTGGTTGGGGAGCGACCATCTTCTTTACACTTTTAGGCAGTTTAATTAATGTCCGTTTTGGTGTTATTAAA
GGTCTAATGATTGGTGGGGTAGCGATGGCAGCAAGTAATTTGATGTTTGCATTGATTGCAAATGTTGGCCCTAACGAACA
CTTATTCTTAGCAACCATCATTGTTGATAATTTCACAACGGCTTTTTCTACCGTTGCCTTTGTGTCCTTCTTAACTATTT
TAACTGGCGAAGCTTTCTCTGCAACGCAGTACGCCTTACTTGCCTCTTTAGGGAACTTAGGTCGGACGACATTAGCCTCT
TTCAGTGGAGAGCTTGCCGACTATCTAAATAGTTGGCCTCTATTCTTCATATTGACAGCGGTAATGGTTATCCCAAGCCT
AATTATGTTGCTTATGCTTAAAGATCACTTTAAAGCCCTACTTGATAAGTCTCAAGGTTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATAATCCAATTACAGAGCAGCTTTCGAGCTGCTCTGTTGTTTATGCTGAATTATTTCCCTCTTTTATTCCTATTATA
AGAATAACAAGGAGCGTTAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCAGAGAAGTCATAACAAGTTTGCTACCAAAGCCCCCCTAACTCGGGGGCTTTATTGTTTCCAGATCACAAAATCATGT
CAAATTAACGTCAAGTAAGT

Product: MSF transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 447; Mature: 446

Protein sequence:

>447_residues
MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLP
FLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLISMFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMA
VIGWWTGYSLPGYFAFVNADTIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII
EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATIFFTLLGSLINVRFGVIK
GLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLAS
FSGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS

Sequences:

>Translated_447_residues
MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLP
FLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLISMFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMA
VIGWWTGYSLPGYFAFVNADTIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII
EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATIFFTLLGSLINVRFGVIK
GLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLAS
FSGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS
>Mature_446_residues
SHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLPF
LSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLISMFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAV
IGWWTGYSLPGYFAFVNADTIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTIIE
PFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATIFFTLLGSLINVRFGVIKG
LMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASF
SGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS

Specific function: Probably Acts As A Permease In The Beta-Lactamase Induction System And In Peptidoglycan Recycling. [C]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786636, Length=430, Percent_Identity=28.6046511627907, Blast_Score=186, Evalue=3e-48,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49533; Mature: 49402

Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FAVYAINFMWAPLVDRVKLPFLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH
MFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAVIGWWTGYSLPGYFAFVNAD
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC
TIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEH
EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
ATIFFTLLGSLINVRFGVIKGLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
AFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASFSGELADYLNSWPLFFILTA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLQDAGLTRAAIGYFGSV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FAVYAINFMWAPLVDRVKLPFLSKKLGQRKSWIFLCQGIVLVSTFQIAGLNPTDNLVLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH
MFALVISIASSTQDIAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAVIGWWTGYSLPGYFAFVNAD
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC
TIGWNNVYYGMTAIVALLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERYNKVIGSKTATWFSVTII
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEH
EPFYDFFKRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
ATIFFTLLGSLINVRFGVIKGLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
AFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASFSGELADYLNSWPLFFILTA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VMVIPSLIMLLMLKDHFKALLDKSQGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11557893 [H]