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The map label for this gene is 167623843

Identifier: 167623843

GI number: 167623843

Start: 2297748

End: 2299256

Strand: Reverse

Name: 167623843

Synonym: Shal_1913

Alternate gene names: NA

Gene position: 2299256-2297748 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167623844

Following gene: 167623842

Centisome position: 43.99

GC content: 43.47

Gene sequence:

>1509_bases
ATGCATTCTAAGAAACCCTTTTACATTTTAGTGGCGTTACTGTTTATTAGCGGTATTGCCGCCAGTGTCTATCGTGGAAT
AGAGCACAGTGTACCTTTTCTACCGGGTAAACAAGTACAAAGCTGGGCTGTTGATGCCAAAGTTAGCTTTCAAGGAACCG
GTGAGCCAGCAGAAGTTTCTTTCTCATTGCCAGAAGATCCGGCCTATGAAATTTTGGTTGAAAACGCGACTTCACCAGGT
TACGGCTTAACCATTACCGACAATGCAATTGATCGCCGCGCCATCTGGTCTATTCGTCGAGCTGTTGGTATCCAAGATCT
TTATTATAAAGTGACCTTAATTCCAACGGGTCAAGATAAGCTTATAGCCGATAAAACTCCCGATACGCCAGCAGTCTATA
AGTGGCCAGCAACTGAACAAGCAGCAGCAGAACAAGCTATCGAAGAAGTCTGGTCAAAAAGCGCCACTAACCTTTCTTTT
GCACAACAGTTAAATAAAGATTTAAATGCTAATGAGCGTAGCCAGAACATCGAGCTACTGCTAACAAGTAATTCGCCAAA
TAAACTCTTTATCAGAATGCTGCATAGTAAAGGGATCCCGGCTAAAGAAGTCAGTGGTCTTTATCTAGAAGATCAACGTC
GTAGACAGCAATTATCTAACTTTGTTGAAGTGTACAACGATGGTCAATGGCATCTATTTAATGCGGAAGATGGCAGCCAG
GGCCGCCCTGATAATTTACTGCTATGGGATCGCTCTGGTACATCGGTACTTGATGTTATCGGTGGTGTTAACTCACAAGT
TAACTTCTCTATGCTACAAGATACTCGTTCAGCATTAGCCACTGCGATTGATGTCATGAAAAATGACAACGCCTTAGATT
TTTCTCTTTATCAGCTACCATTGGAAGAGCAGAGCCTATTTAAAGGGATTTTGTTAATTCCGATTGGCGTATTAATGGTT
GTGTTTCTGCGCGTACTCATCGGTATTAAAACCTCCGGCACCTTTATGCCAGTGTTGATCGCGCTCGCCTTTATCCAAAC
GACATTGATTACAGGGTTAGTTGGATTTTTGTTAATCGTGTCATTTGGCTTAATGATCCGCTCGTATCTGTCGGAGCTTA
ATCTCTTGCTCATATCGAGGATCTCCGCGGTGATTATTGTGGTGATAGGCATCATTGGCCTATTCACCCTATTGTCGTAT
AAGTTTGGCCTCAGTGAAGGCCTAACGATTACCTTCTTCCCAATGATTATCTTGGCATGGACGATTGAGAGAATGTCTAT
CCTGTGGGAAGAGGAAGGCCCTAAAGAAGTCGTAGTTCAAGGCGGTGGTAGCCTGTTTGTTGCAACCTTAGCCTACCTTG
CGATGAGCGCGACTTGGGTACAACACTGGGTATTTAACTTCTTAGGCATTCACTTAGTGATTTTGGCGCTAGTGTTACTA
ATGGGTCAATACACTGGATACCGCTTGCTTGAGCTTAAACGCTTCAGACCTCTAGCTGGAGAAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGCAAGACATCGCCGTTGTCGATGTTGGCCAAACCTATATCCATGGAAAAAAACAAGACGCTCAGCCGTCTAAGACG
AAAAAATAGGATAAATGCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTTCTAGCGAGCCCTTCAGTCTTAAAGCGCAACGGTGTGCTTGGTATGAACAAGCGTAATATCGACTATATCGGTCGA
TATAACCCGCGCAAGTACTA

Product: gonadoliberin III-like protein

Products: NA

Alternate protein names: Membrane-Associated HD Superfamily Hydrolase; GoNADoliberin III-Like Protein; Transglutaminase-Like; Transglutaminase Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 502; Mature: 502

Protein sequence:

>502_residues
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVSFSLPEDPAYEILVENATSPG
YGLTITDNAIDRRAIWSIRRAVGIQDLYYKVTLIPTGQDKLIADKTPDTPAVYKWPATEQAAAEQAIEEVWSKSATNLSF
AQQLNKDLNANERSQNIELLLTSNSPNKLFIRMLHSKGIPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYNDGQWHLFNAEDGSQ
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLPLEEQSLFKGILLIPIGVLMV
VFLRVLIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLITGLVGFLLIVSFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSY
KFGLSEGLTITFFPMIILAWTIERMSILWEEEGPKEVVVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
MGQYTGYRLLELKRFRPLAGEK

Sequences:

>Translated_502_residues
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVSFSLPEDPAYEILVENATSPG
YGLTITDNAIDRRAIWSIRRAVGIQDLYYKVTLIPTGQDKLIADKTPDTPAVYKWPATEQAAAEQAIEEVWSKSATNLSF
AQQLNKDLNANERSQNIELLLTSNSPNKLFIRMLHSKGIPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYNDGQWHLFNAEDGSQ
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLPLEEQSLFKGILLIPIGVLMV
VFLRVLIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLITGLVGFLLIVSFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSY
KFGLSEGLTITFFPMIILAWTIERMSILWEEEGPKEVVVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
MGQYTGYRLLELKRFRPLAGEK
>Mature_502_residues
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVSFSLPEDPAYEILVENATSPG
YGLTITDNAIDRRAIWSIRRAVGIQDLYYKVTLIPTGQDKLIADKTPDTPAVYKWPATEQAAAEQAIEEVWSKSATNLSF
AQQLNKDLNANERSQNIELLLTSNSPNKLFIRMLHSKGIPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYNDGQWHLFNAEDGSQ
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLPLEEQSLFKGILLIPIGVLMV
VFLRVLIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLITGLVGFLLIVSFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSY
KFGLSEGLTITFFPMIILAWTIERMSILWEEEGPKEVVVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
MGQYTGYRLLELKRFRPLAGEK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55754; Mature: 55754

Theoretical pI: Translated: 5.74; Mature: 5.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHEEEEEEEEECCCCCCCEEE
FSLPEDPAYEILVENATSPGYGLTITDNAIDRRAIWSIRRAVGIQDLYYKVTLIPTGQDK
EECCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCC
LIADKTPDTPAVYKWPATEQAAAEQAIEEVWSKSATNLSFAQQLNKDLNANERSQNIELL
EEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
LTSNSPNKLFIRMLHSKGIPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYNDGQWHLFNAEDGSQ
EECCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCC
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLP
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECC
LEEQSLFKGILLIPIGVLMVVFLRVLIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLITGLVGFLLIV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSYKFGLSEGLTITFFPMIILAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
TIERMSILWEEEGPKEVVVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGQYTGYRLLELKRFRPLAGEK
HCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHEEEEEEEEECCCCCCCEEE
FSLPEDPAYEILVENATSPGYGLTITDNAIDRRAIWSIRRAVGIQDLYYKVTLIPTGQDK
EECCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCC
LIADKTPDTPAVYKWPATEQAAAEQAIEEVWSKSATNLSFAQQLNKDLNANERSQNIELL
EEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
LTSNSPNKLFIRMLHSKGIPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYNDGQWHLFNAEDGSQ
EECCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCC
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLP
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECC
LEEQSLFKGILLIPIGVLMVVFLRVLIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLITGLVGFLLIV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSYKFGLSEGLTITFFPMIILAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
TIERMSILWEEEGPKEVVVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGQYTGYRLLELKRFRPLAGEK
HCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA