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The map label for this gene is spoVB [H]

Identifier: 167039188

GI number: 167039188

Start: 546158

End: 547714

Strand: Direct

Name: spoVB [H]

Synonym: Teth514_0529

Alternate gene names: 167039188

Gene position: 546158-547714 (Clockwise)

Preceding gene: 167039187

Following gene: 167039189

Centisome position: 22.23

GC content: 31.79

Gene sequence:

>1557_bases
ATGCACAATAGGTCTTTTATTCGCGGTGCTTTTATATTAACTATTGCCAATATTATAGACAGAGGCATTGGATTTATCTT
TAGAATAATTTTATCAAATATGTTAGGCCCGGAAGGTACGGGTATTTATCAATTAGTTCTTCCTATATATTTTGTTTCAA
TAACTTTTTTAACCTCTGGTACGATGGCTGTCACTTCTCGCTTTATTTCAGAAGAAAGAGCAAAAGGAAACAAAAAAAAT
ATGTTTAAAATTTTAAAAATTACTTTTTTGATAGTATTGATAATTGCTTTTACTATTTCTTCGTTGCTATTTTTTAATAC
TAAGTACGTAGCTGAAAAGTTACTTCACGAACCAAGAGCACTTTTATCAATTCTCATTTTTGCACCGGTGCTTATCATTG
TTGCTTCTTCATCAGTGTTTAAGGGATTTTTTCAAGGAGTTATAAATATGATACCTGCTTCAGTTTCAGAAATTGTTGAA
CAAATAGTACGGGTATCAACAACTTTATATTTAATACAGCTTTTTACAGGAGCTAAACTTGAATATTTAGTAGCGATAGC
TATATTTGGCATATCTGTAGGTGAAATTGTCAGTTTTCTTATGTACATACTTTTTTACAAAAGGGAAGTAAAAATTATAA
ACAAAGAAATGCCTTATGATGGAAAGGAATGGGATACTTTTTCTATAGTAAAAACGATAGTGGTTACTTCCATACCTATA
ACTTTTTCAAAATTAATTGTAAATGTGTTGGATTTAGCGGAATCTTTAATAATTCCTTCAAGACTTGTTGTCTCAGGTCT
CACTCACAGTGAAGCGATGTCTGAATTTGGCAAAATGTTAGGTATGGCAGTGCCTCTTGCATACATGCCAGCAGTTATAA
CTTCAAGTCTTTCCACTACTGTACTTCCTGCAGTTTCTGAAGCAGCTGCTCTAAAAAAGTGGGATACAGTAAGACTTAGG
ATTAACCAAGCAATTGGCTATACTACTTTAGTAGCTTTTCCTGCTATAATTTTATTTTTAGCTCTTCCTGAGCAAATTTC
TCAGCTTTTGTATCCTTCTTCCCCAGGAGTAGGGGCTTTTGTGAGAGTGATTTCCATGGGAAGTATTTTCGCCTTTCTAG
AAGCAGTAGTAGCGAGTATTCTCCATGGATTAGGAAAACAAACTGTAGTTTTAAAGAATTCCATAATATGGCTAGGAGTC
TGTATTATAGGTATGTATTACTTAACCGCTATGCCACAACTTAGACTTTTTGGATATATATACAGCTTTATATTTGCCGA
TGCTCTTATTTTAATGCTAAATATGTTTGAGCTCATAAAAATGACAGGATTAAGAATAGACTATTTAAATTGGTTTATAA
AACCGATAACAGCATCAACAATTATGGGAATAATTGTTATAATTATCCACAGTAAATTGTTGACAATTAATGTTAATATG
TGGATAAATATTTTTTTATCAATTTTTACGGGAATTCTTGCCTATTTACTGCTTTGCTCTGCGCTGAAACTACCTTATAT
TGAGGATTTAAGAAAAATAATTTTGTTGAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAAAATTTCTCCCCCTAATCCCCCTTTACTGCCGGCATACTGCCGGTTTTTTTCATATATAAAAAGCACTGCGAATAA
ACTATTGTGAGGTGTTGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATAATAGTATATAATAAAAATAAAACTAAGCCCAAGGGGATTTTCCTGAGGGTAAGGGAGGAGATAAAATATGATAAA
AGAAAAAGCAGATTTTATTG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: Stage III sporulation protein F [H]

Number of amino acids: Translated: 518; Mature: 518

Protein sequence:

>518_residues
MHNRSFIRGAFILTIANIIDRGIGFIFRIILSNMLGPEGTGIYQLVLPIYFVSITFLTSGTMAVTSRFISEERAKGNKKN
MFKILKITFLIVLIIAFTISSLLFFNTKYVAEKLLHEPRALLSILIFAPVLIIVASSSVFKGFFQGVINMIPASVSEIVE
QIVRVSTTLYLIQLFTGAKLEYLVAIAIFGISVGEIVSFLMYILFYKREVKIINKEMPYDGKEWDTFSIVKTIVVTSIPI
TFSKLIVNVLDLAESLIIPSRLVVSGLTHSEAMSEFGKMLGMAVPLAYMPAVITSSLSTTVLPAVSEAAALKKWDTVRLR
INQAIGYTTLVAFPAIILFLALPEQISQLLYPSSPGVGAFVRVISMGSIFAFLEAVVASILHGLGKQTVVLKNSIIWLGV
CIIGMYYLTAMPQLRLFGYIYSFIFADALILMLNMFELIKMTGLRIDYLNWFIKPITASTIMGIIVIIIHSKLLTINVNM
WINIFLSIFTGILAYLLLCSALKLPYIEDLRKIILLKN

Sequences:

>Translated_518_residues
MHNRSFIRGAFILTIANIIDRGIGFIFRIILSNMLGPEGTGIYQLVLPIYFVSITFLTSGTMAVTSRFISEERAKGNKKN
MFKILKITFLIVLIIAFTISSLLFFNTKYVAEKLLHEPRALLSILIFAPVLIIVASSSVFKGFFQGVINMIPASVSEIVE
QIVRVSTTLYLIQLFTGAKLEYLVAIAIFGISVGEIVSFLMYILFYKREVKIINKEMPYDGKEWDTFSIVKTIVVTSIPI
TFSKLIVNVLDLAESLIIPSRLVVSGLTHSEAMSEFGKMLGMAVPLAYMPAVITSSLSTTVLPAVSEAAALKKWDTVRLR
INQAIGYTTLVAFPAIILFLALPEQISQLLYPSSPGVGAFVRVISMGSIFAFLEAVVASILHGLGKQTVVLKNSIIWLGV
CIIGMYYLTAMPQLRLFGYIYSFIFADALILMLNMFELIKMTGLRIDYLNWFIKPITASTIMGIIVIIIHSKLLTINVNM
WINIFLSIFTGILAYLLLCSALKLPYIEDLRKIILLKN
>Mature_518_residues
MHNRSFIRGAFILTIANIIDRGIGFIFRIILSNMLGPEGTGIYQLVLPIYFVSITFLTSGTMAVTSRFISEERAKGNKKN
MFKILKITFLIVLIIAFTISSLLFFNTKYVAEKLLHEPRALLSILIFAPVLIIVASSSVFKGFFQGVINMIPASVSEIVE
QIVRVSTTLYLIQLFTGAKLEYLVAIAIFGISVGEIVSFLMYILFYKREVKIINKEMPYDGKEWDTFSIVKTIVVTSIPI
TFSKLIVNVLDLAESLIIPSRLVVSGLTHSEAMSEFGKMLGMAVPLAYMPAVITSSLSTTVLPAVSEAAALKKWDTVRLR
INQAIGYTTLVAFPAIILFLALPEQISQLLYPSSPGVGAFVRVISMGSIFAFLEAVVASILHGLGKQTVVLKNSIIWLGV
CIIGMYYLTAMPQLRLFGYIYSFIFADALILMLNMFELIKMTGLRIDYLNWFIKPITASTIMGIIVIIIHSKLLTINVNM
WINIFLSIFTGILAYLLLCSALKLPYIEDLRKIILLKN

Specific function: Involved, directly or indirectly, in spore cortex biosynthesis. Affects only indirectly the expression of late sporulation genes [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797
- InterPro:   IPR014249 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57676; Mature: 57676

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1744050; 9384377 [H]