| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876676
Identifier: 160876676
GI number: 160876676
Start: 4195316
End: 4198528
Strand: Direct
Name: 160876676
Synonym: Sbal195_3570
Alternate gene names: NA
Gene position: 4195316-4198528 (Clockwise)
Preceding gene: 160876675
Following gene: 160876679
Centisome position: 78.46
GC content: 47.49
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1070; Mature: 1069
Protein sequence:
>1070_residues MPLKDDVAQLKAELAQLQSLHLSQQFSLSRQLAEFSTKLDTLSQQIATEDASDTTVSMAAVSMTAGAASIAAVVPATDNA PTLTYAIHTPILESAPVAPVPVEPNPWQQNAVQGDPWQRNTKNTSAEQVAKTEYQAQGQQLSDEVKLQASVQVASQFDDL LSQGLAAIMAPFGAITEQIKSFYHHYQAKGLGPVFLMTVAGIITLTLGFGYLLQYSINHWFSELGKALLGFASANAIIAG GIFIRQKRTGMADFGSGIVGLGLILNFLCAYFIGPYFEIIPNSASFILLLLITLAGYGLSMRLDAKVIAVIALVGGSTAP MMLLSQSYAPLLYLPYLLLIGAGALAQSRKLKWPLLVEITALLHIGCIEAFSYFVPLPLTDFGGGSLLALISINATFYLY GITGLIFTKQFTHQDKQPSNTLSHRILALPIALLAFVLFELTQFTEFAGEIFAVNALICAALYWQLKSRLEKSRSGLLLV FAGSFAGFAALYLLSHDFLGLVLLLEALLLLWIGTKEELVSVRAEAYVLLLMGLGLNAFSVLDSMTLLESSMLDALAISP LSAFGFSLIALALSCSALVFAIRLLTFTNAPLSALEHQLCRILKELLSGFYVATIILAAYLLSSDYYFVILPLVSLLLLY LSAKDKLVISEFAAWILLLPLLFKVVEGITLTDSFSFSAQPLMAKLARIELFTALLLAHYWYRRHYKDALFAKAAYSMQI CCYLLLPLILLPKVIRNYWEYTAIALWLSTFMSLGLAYFVKHKSLNIEAKILTWLTVMMTASLCLIHAWQGLAALTVGAL FMGFTLLRYRQLPETWRPLLQLQWQLSPYYFALVLAVIVYGFNHSELVGIAMTALALSGYFALLIQRGVSQRPVSQASHS MKLILVAEIQAAIKESYHLAYGLTLGLALLPIMLHFEITLGLNRDNASFVLIEFLSLALLARLILQHGAAIRLHRRILPL QGLKWGWHLLLALSYFIWSYSFDNMIAAPLSAILLVIHGSVLMFISLKPQNADMIRLAAGLFILSTLKVLLLDMASFELV QKVIAFMLIGVILLTVSYFYQKARNRLQQD
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 117780; Mature: 117649
Theoretical pI: Translated: 8.18; Mature: 8.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPLKDDVAQLKAELAQLQSLHLSQQFSLSRQLAEFSTKLDTLSQQIATEDASDTTVSMAA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH VSMTAGAASIAAVVPATDNAPTLTYAIHTPILESAPVAPVPVEPNPWQQNAVQGDPWQRN HHHHCCHHHHEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC TKNTSAEQVAKTEYQAQGQQLSDEVKLQASVQVASQFDDLLSQGLAAIMAPFGAITEQIK CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFYHHYQAKGLGPVFLMTVAGIITLTLGFGYLLQYSINHWFSELGKALLGFASANAIIAG HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC GIFIRQKRTGMADFGSGIVGLGLILNFLCAYFIGPYFEIIPNSASFILLLLITLAGYGLS CEEEEECCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCE MRLDAKVIAVIALVGGSTAPMMLLSQSYAPLLYLPYLLLIGAGALAQSRKLKWPLLVEIT EEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHH ALLHIGCIEAFSYFVPLPLTDFGGGSLLALISINATFYLYGITGLIFTKQFTHQDKQPSN HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCH TLSHRILALPIALLAFVLFELTQFTEFAGEIFAVNALICAALYWQLKSRLEKSRSGLLLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE FAGSFAGFAALYLLSHDFLGLVLLLEALLLLWIGTKEELVSVRAEAYVLLLMGLGLNAFS EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH VLDSMTLLESSMLDALAISPLSAFGFSLIALALSCSALVFAIRLLTFTNAPLSALEHQLC HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH RILKELLSGFYVATIILAAYLLSSDYYFVILPLVSLLLLYLSAKDKLVISEFAAWILLLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLFKVVEGITLTDSFSFSAQPLMAKLARIELFTALLLAHYWYRRHYKDALFAKAAYSMQI HHHHHHCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CCYLLLPLILLPKVIRNYWEYTAIALWLSTFMSLGLAYFVKHKSLNIEAKILTWLTVMMT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH ASLCLIHAWQGLAALTVGALFMGFTLLRYRQLPETWRPLLQLQWQLSPYYFALVLAVIVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH GFNHSELVGIAMTALALSGYFALLIQRGVSQRPVSQASHSMKLILVAEIQAAIKESYHLA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH YGLTLGLALLPIMLHFEITLGLNRDNASFVLIEFLSLALLARLILQHGAAIRLHRRILPL HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCC QGLKWGWHLLLALSYFIWSYSFDNMIAAPLSAILLVIHGSVLMFISLKPQNADMIRLAAG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHH LFILSTLKVLLLDMASFELVQKVIAFMLIGVILLTVSYFYQKARNRLQQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure PLKDDVAQLKAELAQLQSLHLSQQFSLSRQLAEFSTKLDTLSQQIATEDASDTTVSMAA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH VSMTAGAASIAAVVPATDNAPTLTYAIHTPILESAPVAPVPVEPNPWQQNAVQGDPWQRN HHHHCCHHHHEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC TKNTSAEQVAKTEYQAQGQQLSDEVKLQASVQVASQFDDLLSQGLAAIMAPFGAITEQIK CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFYHHYQAKGLGPVFLMTVAGIITLTLGFGYLLQYSINHWFSELGKALLGFASANAIIAG HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC GIFIRQKRTGMADFGSGIVGLGLILNFLCAYFIGPYFEIIPNSASFILLLLITLAGYGLS CEEEEECCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCE MRLDAKVIAVIALVGGSTAPMMLLSQSYAPLLYLPYLLLIGAGALAQSRKLKWPLLVEIT EEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHH ALLHIGCIEAFSYFVPLPLTDFGGGSLLALISINATFYLYGITGLIFTKQFTHQDKQPSN HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCH TLSHRILALPIALLAFVLFELTQFTEFAGEIFAVNALICAALYWQLKSRLEKSRSGLLLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE FAGSFAGFAALYLLSHDFLGLVLLLEALLLLWIGTKEELVSVRAEAYVLLLMGLGLNAFS EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH VLDSMTLLESSMLDALAISPLSAFGFSLIALALSCSALVFAIRLLTFTNAPLSALEHQLC HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH RILKELLSGFYVATIILAAYLLSSDYYFVILPLVSLLLLYLSAKDKLVISEFAAWILLLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLFKVVEGITLTDSFSFSAQPLMAKLARIELFTALLLAHYWYRRHYKDALFAKAAYSMQI HHHHHHCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CCYLLLPLILLPKVIRNYWEYTAIALWLSTFMSLGLAYFVKHKSLNIEAKILTWLTVMMT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH ASLCLIHAWQGLAALTVGALFMGFTLLRYRQLPETWRPLLQLQWQLSPYYFALVLAVIVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH GFNHSELVGIAMTALALSGYFALLIQRGVSQRPVSQASHSMKLILVAEIQAAIKESYHLA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH YGLTLGLALLPIMLHFEITLGLNRDNASFVLIEFLSLALLARLILQHGAAIRLHRRILPL HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCC QGLKWGWHLLLALSYFIWSYSFDNMIAAPLSAILLVIHGSVLMFISLKPQNADMIRLAAG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHH LFILSTLKVLLLDMASFELVQKVIAFMLIGVILLTVSYFYQKARNRLQQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA