| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876392
Identifier: 160876392
GI number: 160876392
Start: 3869843
End: 3874612
Strand: Direct
Name: 160876392
Synonym: Sbal195_3286
Alternate gene names: NA
Gene position: 3869843-3874612 (Clockwise)
Preceding gene: 160876389
Following gene: 160876393
Centisome position: 72.37
GC content: 46.77
Gene sequence:
>4770_bases ATGGTTGTTGAGCAGCAGCTGGAACGTGCGCGTCTGGAATTACTTGATATGGGTCTTCGATCCAACCCTCAGCTGAATTA CCGCAGTGGTAGTAAAGCCCTCGACATTATTGATGAGCAATCTGCCAAGATATTTGAAATGCTGGTTGAGCAAGAAAACA CACTCAGCTTTTTACCATTGCCAGAAGCTTATCAACAAAAAATTGCCGACAGCGAAGATGAAGGATCATTCTTTCAGACC GACGATGAATCGGAATTGCCACCTCTTGATTTATACCTCGAACAGAAAAAGGGAGCGGCCCGCTTCACCGACAAATACCT ACAAACCGGATTAGTGCCCGCCAAGCTGGATAAAGCCCTGCTGAAACTGGAAACCGAAGCCCATACCATGCTGCAAGAGC AAGGTGTCGAGGTTCTGTATTTAGCACTTGGTTTTTTACAGTGGAATGAGCCAACAAACTCATCGGTTTCAAGATATGCG CCTTTAATTCTGATCCCTGTTCAACTAATGCGCTCATCAGCCAGAGATAGCTTCAAATTACGCTACACAGGCGAAGAGCT GGGTTCAAACCTGACCTTAGCAGCAAAACTAAGGACTGAGTTTAAGTTAATGCTTCCCGCCTATTCTGATGAGATGGTCA TCACAGATTATTATCAGGCGGTAGCTGATGCGATTACAGCGCAACCTTCATGGCGGGTGCATCAAGATAAAATTGGTTTA GGGCTGTTCTCTTTTGGCAAGTTTCAAATGTACATGGACTTGGACCCTACAGGCTGGCCGGAAGGAAAAAAACCATCACA GTTACCTTTGATTGGCCGCTTATTTCGTGATGGCTTTCCCCACGATGCAGAGATCAATCCAGCAGATCTGAATCATCCAG AAAAACTCCACTTGGTAAAAGACGCCGATTCCAGCCAGATTGAAGCAATCTTGGCGATGAAATCTGGCGCGGACCTGATC ATTCAAGGGCCGCCAGGTACAGGTAAATCCCAAACTATCACCAACATTATTGCCGAAGCGGTTGCGCTGGGTAAAAAGGT GCTGTTTGTTGCACAAAAAATGGCAGCACTTGAGGTGGTGAAAAAACGCCTTGATGAAACTCATATGGGCTACGCCGTAC TCGAACTACATAGTCACAAAAGTACCAAGAAATCTGTGCTTGGTTCTATTGCTGAGTCACTTGAGCAAGGTCGGCCACAA ACAGCAAACCGGGAGCAAGAGTTTTCAGATTTAGCGGAATCAAAAGCCTCGCTGGATGCTTATGTGCATGCCATCCGAGC CCCTATTCTGTATAGCGGTATCAATTACATTGAAGCGTTGGGCTCATTGCTGCAATTGAAGACAAAGGATCCCGACAACT CCTTACCAGCCCTCCCCTTTAGCTACTTCGAACAATGGATAGCTGAGGAATACAGTAATGCGAGGAAACTGGTTACGGAA TTAGTACAGCAACTAGCACGCATTGGCATACCTGCAGCGCATCCATTTGCGATGTCTGGTCGCACTGACTTTTCACCTGC ATTGCAGCAGGCACTAACCTCTACTTTGGTAGAAATAAGCCAGTTGCTTAGCCAACTTGATACGCAAACTCAAACCGTCA GTGTTTTTCTGCAGCTTGATAAACCACAAAGCTTGCAACAAGTCGCACCGCTGATTTCAACAACGAGCTGGCTATCCGAA GTACCGGATCTTAAAAGCGTTAAAGTAAATATCCCCATATGGGCGTTAGAAAAAAAGCGGATCGATAACGGCCTGTCTTG TCTGGCCAATTTCTTATCACTCAAAGCCAGCTGCGAACAACAATTTATCACGCAGGCGCTGGATGCCGATTTGCTGAGTA TCCGCCAAGGCTTGATTGGCAAAACAGATAAATGGTGGCGTTTCCTGTCGTCCAGCTATCGCCAAGCCAAAGCACAGCTA GCAGGGCTTTGGCTTGGCGTTCTGCCCGCTTCGTCTACCGACTGGCTTACTGCATTAGATACTGCTTTAACTTACCAAAG CACGAAAAAAGAGCTAACTAGCTACCACCCCCTGTTATCTGAAGCTTTTGGCGCGCAGTGGCAAGGCGAATTTTCGGAGC ACAATGAATTAACGCAAATTCACAGCTGGATAAACACCTTTTATGCAAAGGTAAACCGTGTTGAATTGTCGCAGTCATTG GCTGAACTGATTGATAAAGGCGTTGATAAAAAGCTGCTGCGTGACCAGACAAACTCACTGACAGCGCTTTGTAACGCTAT TGCAGTGCAGGCACAAACGCTGCAAGAGCTGATACAAATCCCCGACAGCAATCCAAACCATGATTTAGCTGCAATGCAAT TTGCGCAACTAAATGCTTTGTTAGAGGGCTGGAAAAACTCAGCCTTATTTTACGATTTTGCGCGCTACAACCAGATTATT AAGGCGTTTGAGCCTTATAACATCAAGGACTTCACTAAACTGGCGTACTCATGGCATGCAGCCCCTAACTTGCTAATGAC GGTATTCGAACTTAGCTATTATTCTGGTCTGGTTAACAATGCCTATGACAGCTCAGAAGCAATACGGCAATTTGACCGCA ATAAACATGAACAAAGCCTACACGACTTTAAACGTATTGATGGTAACAGTTTATTTTTCGCCCAAGAGTTTTTAGTAAAC AGTCTGTACGAGCGCTTGCCGAAGAAAACAGCTAAAGGTGAAATGGAATTAGTACTGCGTGAGCTAGGTAAGAAAAAACG TCATATTCCTATTAGGAAATTGCTGACTGAAGCAGGTAACGTGATCCAGCAAGTAAAACCTATTTTTATGATGAGCCCTA TGTCCATCGCCACCTACCTAAAACAAGGTGCGTTAGATTTTGACCTGGTGATTTTTGACGAAGCGAGTCAAATTCCAGCA CCCGATGCCTTAGGCGCAATGCTGCGCGGGCAGCAAGTAATTGTGGTAGGTGACAGTAAGCAAATGCCACCAAGCAACCT GTTTGGTAAAGCCGTTGAACTGGAAGAGGAGGAACTGGAAAGCAGCGCCACCGCAGAAATGGAAAGTATTCTGGCATTAA TGGAAGCCCGTGGTGCGGCAAGCAAAATGCTGCGCTGGCACTACCGCTCTCGCCACGATTCACTGATCGCAGTGTCCAAC GACCAGTTTTATAAAAACAAGTTAGTGGCCTTTCCAAGCCCAGGCTTTCACCCCGATGCAACAGGGCTGAAGTTTCATTA TTTACCTGAAACGCATTACGACAAAGGCAGCTCTCGCACTAATACAGGCGAAGTAAAAGCTGTGGTTGCAGCAGTACTGA ATCACGCTTTAACTAAACCTCACCTATCGTTAGGCGTGGTTGCGTTTAGCCTTTCGCAGCGAGATGCTATCTTGCTTGAG CTGGAAAAAGAGCGGCGCTTACAGCCAGAAACTGACGAATTCTTTGCACAACATGCAGGTGGTGATGAGTTTTTTGTAAA GAACCTGGAGAACGTGCAGGGTGACGAACGCGACGTTATTTTGATCAGCATTTGTTACGGCAAAACCAGCACAGGCCAGC TGAGCCAGAATTTTGGCCTTCTGAACAAACCAGGCGGCGAACGGCGGTTAAACGTACTGATTTCACGTGCGCGATTGGCA ATGGAAGTGTTTGCCAACTTCAAAGGTGATGAACTGAAAGTTGGCGCAGACAGCCCTTTTGGTGTGCGTTCACTGCAAAT CTTTTTGCAGTTTGCCGAATCAGGCCAATTGAACAAAGCCTATGAAAAACAGCAGGAACAAAACTTTGCTTTTGGCGCCC TACTGCATCAGACAATCCAGCGTTTAGGGTATCAGGTAGCCACCCGAGTCGGCAGTCAAGGTTATTACATCGACTTAGCC ATCAAGCATCCTGAAGACCCCAGTAAATTTGTATTGGCGCTGGAATATGACGGCGCTGGCTATTATGGAGCAACTTCGGC ACGCGACCGCGAAAGGTTGCGGCAAAGTGTACTGGAAGGCCTTGGCTGGAGCTTTGAACGCATTTGGTCCACTGACTGGT TTCGAGATCCAGAGGCAGAGTTACATCGCCTGAAAGTACTCATAGACAAAGCCATAACCCAACATAACGAACTGATGGTA ACAATGGCAGCACAAGCCACTAGCACCAGACAAGTGAAACACAAAGTTGCTGCGCCAGAGGCCATTGCAACGCCAATAAT GCGGGTAGAAGAAGAGCAACCAGAATTTGAAGCCTGCACTACGCCCTATAAAAAAGCTGATGTGTCTAAGCTCAATATTC CGCATGTCGATGATTTCAGCGCCATCCCTTTAAGTATGTTGGTGTATGCAGTGGAGCGTATTGTCGAAACCGAATACCCA ATATTCGCTAGCTTAGTGGCCACCCGCTTAGCTAATGCTGCTGGCTTAACACGAGTTGGTGCCAAAATTAAACGCACTGT AGATCAAGCCATCGAAAGTGCCGTAGCCAAAAGATTGATCCAGTTAGATAAAGATGAAGTGTTATGGCCGCAAGGCCGCA ACACAGTCAAATTAAGAAACTGGAACAGCACCGACACAGCCACTCGCAAGCTAGAAAACGTTTGTGATGCAGAACTGACC AACGCCCTATTACTCACAGTACAAGACGCCCACGCCATCAGCGTAACAGACGCAGCTTCAGCAGCTTTGGGCTTGTTGGG TTTTCAGCGCGCGACGGCGCAAGCGGCAGATAGGATGGCTAAGTTAGCACAGATACAGTGTGATAAAGGTGTGTTGGTTT GTGAGAATGAGCGGTTGAAAATATCAATAGCCAAGCCTTCGTTGCCCTGA
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAGAAAGAATACAAATTAACGCCAGCAAAAAATTTCAACAACTAATCCTTATTTTTATATGGGGTAATGAAATGCTA ATAGATACCGACTTAATTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1589; Mature: 1589
Protein sequence:
>1589_residues MVVEQQLERARLELLDMGLRSNPQLNYRSGSKALDIIDEQSAKIFEMLVEQENTLSFLPLPEAYQQKIADSEDEGSFFQT DDESELPPLDLYLEQKKGAARFTDKYLQTGLVPAKLDKALLKLETEAHTMLQEQGVEVLYLALGFLQWNEPTNSSVSRYA PLILIPVQLMRSSARDSFKLRYTGEELGSNLTLAAKLRTEFKLMLPAYSDEMVITDYYQAVADAITAQPSWRVHQDKIGL GLFSFGKFQMYMDLDPTGWPEGKKPSQLPLIGRLFRDGFPHDAEINPADLNHPEKLHLVKDADSSQIEAILAMKSGADLI IQGPPGTGKSQTITNIIAEAVALGKKVLFVAQKMAALEVVKKRLDETHMGYAVLELHSHKSTKKSVLGSIAESLEQGRPQ TANREQEFSDLAESKASLDAYVHAIRAPILYSGINYIEALGSLLQLKTKDPDNSLPALPFSYFEQWIAEEYSNARKLVTE LVQQLARIGIPAAHPFAMSGRTDFSPALQQALTSTLVEISQLLSQLDTQTQTVSVFLQLDKPQSLQQVAPLISTTSWLSE VPDLKSVKVNIPIWALEKKRIDNGLSCLANFLSLKASCEQQFITQALDADLLSIRQGLIGKTDKWWRFLSSSYRQAKAQL AGLWLGVLPASSTDWLTALDTALTYQSTKKELTSYHPLLSEAFGAQWQGEFSEHNELTQIHSWINTFYAKVNRVELSQSL AELIDKGVDKKLLRDQTNSLTALCNAIAVQAQTLQELIQIPDSNPNHDLAAMQFAQLNALLEGWKNSALFYDFARYNQII KAFEPYNIKDFTKLAYSWHAAPNLLMTVFELSYYSGLVNNAYDSSEAIRQFDRNKHEQSLHDFKRIDGNSLFFAQEFLVN SLYERLPKKTAKGEMELVLRELGKKKRHIPIRKLLTEAGNVIQQVKPIFMMSPMSIATYLKQGALDFDLVIFDEASQIPA PDALGAMLRGQQVIVVGDSKQMPPSNLFGKAVELEEEELESSATAEMESILALMEARGAASKMLRWHYRSRHDSLIAVSN DQFYKNKLVAFPSPGFHPDATGLKFHYLPETHYDKGSSRTNTGEVKAVVAAVLNHALTKPHLSLGVVAFSLSQRDAILLE LEKERRLQPETDEFFAQHAGGDEFFVKNLENVQGDERDVILISICYGKTSTGQLSQNFGLLNKPGGERRLNVLISRARLA MEVFANFKGDELKVGADSPFGVRSLQIFLQFAESGQLNKAYEKQQEQNFAFGALLHQTIQRLGYQVATRVGSQGYYIDLA IKHPEDPSKFVLALEYDGAGYYGATSARDRERLRQSVLEGLGWSFERIWSTDWFRDPEAELHRLKVLIDKAITQHNELMV TMAAQATSTRQVKHKVAAPEAIATPIMRVEEEQPEFEACTTPYKKADVSKLNIPHVDDFSAIPLSMLVYAVERIVETEYP IFASLVATRLANAAGLTRVGAKIKRTVDQAIESAVAKRLIQLDKDEVLWPQGRNTVKLRNWNSTDTATRKLENVCDAELT NALLLTVQDAHAISVTDAASAALGLLGFQRATAQAADRMAKLAQIQCDKGVLVCENERLKISIAKPSLP
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG1112
COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 177507; Mature: 177507
Theoretical pI: Translated: 6.01; Mature: 6.01
Prosite motif: PS00274 AEROLYSIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVVEQQLERARLELLDMGLRSNPQLNYRSGSKALDIIDEQSAKIFEMLVEQENTLSFLPL CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC PEAYQQKIADSEDEGSFFQTDDESELPPLDLYLEQKKGAARFTDKYLQTGLVPAKLDKAL CHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH LKLETEAHTMLQEQGVEVLYLALGFLQWNEPTNSSVSRYAPLILIPVQLMRSSARDSFKL HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCEEEEHHHHHCCCCCCEEE RYTGEELGSNLTLAAKLRTEFKLMLPAYSDEMVITDYYQAVADAITAQPSWRVHQDKIGL EEEHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHCC GLFSFGKFQMYMDLDPTGWPEGKKPSQLPLIGRLFRDGFPHDAEINPADLNHPEKLHLVK CEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE DADSSQIEAILAMKSGADLIIQGPPGTGKSQTITNIIAEAVALGKKVLFVAQKMAALEVV CCCCHHHHHHHEECCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKRLDETHMGYAVLELHSHKSTKKSVLGSIAESLEQGRPQTANREQEFSDLAESKASLDA HHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH YVHAIRAPILYSGINYIEALGSLLQLKTKDPDNSLPALPFSYFEQWIAEEYSNARKLVTE 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]