| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159900788
Identifier: 159900788
GI number: 159900788
Start: 5457057
End: 5458766
Strand: Direct
Name: 159900788
Synonym: Haur_4275
Alternate gene names: NA
Gene position: 5457057-5458766 (Clockwise)
Preceding gene: 159900787
Following gene: 159900789
Centisome position: 85.98
GC content: 51.4
Gene sequence:
>1710_bases GTGCAATCGAACAAACCGCAGCGGAGCCTCACCAGTGAGGTTTGGAGCGCAACGCTTTGGAATACGCTGCTGTTTCCAGC CCGCTTTTTAGTTGGCATCATCACCAGTGTGATTTATTACGGGCGGCTTGCACCTGAGCAGGTCGCTTTGATTTTTCTCC TCACCAGTTTGGCGGCTTCAATTGGCACCTACGCCGACCTTGGGATCGAACGTAGTTTGCCACGCTTCATCCCTGAAGTG GAAAAACGCCAAGGTCGCCAAGGTGTTTTGCGCTTTCTCTGGCGTATGATCGGACTTAAACTGGCAATTATGGCCGTGCT GGTGCTCGGTTTGAATCTGCTGGCCCAACCCATGGGCAATTATCTAATCGAGCAACAACGAACTGAGGTTGTTGAACTCG AAAGCCAAATCCGCAGCCTTGAGCAACAACCAGCCACGTCTGACCAAATCAGCAAGCTCAGCAAATTGCAAAATCAACGC ACTGGCACGCTCGCCGTGATCGAGCAAATTGAGCGCCAAAGCCACTGGTTTATGCTAGTGGTCAGCGCTTTATTAATTTT GGGTGCGCTGTTTGATGTCTTTATGCAGTTTCTGACCGCCTACTTCAAACAACGCGCTTGGAACTTGATCACCTTAGTTA CAACCTTGCTCCAACCAATTTTGGTAACGATCTTTATTTTGCTGGGTTGGGGCATCACGGGGGTGTTGATTGGCTTGGTG CTCACGCCATTGGTTAGCGTGTTGATGGCAGCGTGGCAAGCCTTACGCGCCAGCCGCGAGCTATCCAATACTGGCGAGGG CGAGGCGAGCGATCCCGAATTACCTAAGCGTTTTGCCAAATTTGCCGCAGTCTCCTATTTAATGCAAATCACCACCTGGG TGTATGATATTCAGTTTGTAACGCTGTTTACGGTGACCCAACTGAATGCCCGCGATGTGGCGATTTTGGCTTTTGCCTAT AAATTTGCCAAAGATTACCTTGGCTATATTTGGATGCCGCTCAACGGCGTGATGACTCCGCTGCTTTCGCGGATCAAATT GCGCCGCGATCCCCAATCGTTGCAAGATGCTCATGGTGGTTTGGCCCGCATGATTTGGCTGTTGATTGTGCCAGCAGGCG TGGGTTTGGCCTTGCTCACTCCGCGCATGGTGGCGGTGCTGTATCCACTCTACACCGATGCCAGCAGCTTAATTATTGTG TTTATCGCATTTACCTTTGGCGAATCGTTGCTGAGCGTGCCGCATAATGTACTGATGGTTTATGAGCAATATCGCGCTGT GATCATTTCGCGCTTGTTTGCCTTTATCAGTGTGCCATTGGTTTTTGTGTTGCTACCACGCTATGGCATGTTGGGCGTGG CGATTGCGGTTGGCGCAGTGCGAGTTGCCACCCGCTTGATCACGCTCTATTATGGATGGCGCAATTTGGGCTTGCAATTG CCCTGGCGGTTTTGGCTGCGGGTTTGTGCTGCCAGCGCCAGTTTTGCGGTGGCCCTCATTGGGTTAATGCAACTTTGGCC AATGCCTGAGGCGGCGGCTGGCTGGCAAACTAAATTAATCAATCTGTTGCCGTTGATGCTGTTTGCCGCAATTGGGGCTG GCCTCTATTTACTCACATTGAAATTGCTCGGCGGGCTTGATCCGGCTGAGCGAGAGCGTTTATTGAGCATGAAACTTCCA TTCAAGGGCGTGCTTCGGCGCGTATTATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTAAACCCATTCGCTGGTTGCCACCACATCGCAACCCGCTTGCTATTCCCTACCCGCCCTTGATCGGAAATGGGATGG TAGCCACTGGAGTACGTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTATGCAGCGATTTAAACGATTTCTACCATTGGCGCTAATTGCCTTGAGCGCCATTATTTTTCTCATTCCGCCTGCGCGG CCTAGCATCGATGTTGTGAT
Product: virulence factor MVIN family protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 569; Mature: 569
Protein sequence:
>569_residues MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAASIGTYADLGIERSLPRFIPEV EKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGNYLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQR TGTLAVIEQIERQSHWFMLVVSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFVTLFTVTQLNARDVAILAFAY KFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGGLARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIV FIAFTFGESLLSVPHNVLMVYEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTLKLLGGLDPAERERLLSMKLP FKGVLRRVL
Sequences:
>Translated_569_residues MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAASIGTYADLGIERSLPRFIPEV EKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGNYLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQR TGTLAVIEQIERQSHWFMLVVSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFVTLFTVTQLNARDVAILAFAY KFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGGLARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIV FIAFTFGESLLSVPHNVLMVYEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTLKLLGGLDPAERERLLSMKLP FKGVLRRVL >Mature_569_residues MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAASIGTYADLGIERSLPRFIPEV EKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGNYLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQR TGTLAVIEQIERQSHWFMLVVSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFVTLFTVTQLNARDVAILAFAY KFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGGLARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIV FIAFTFGESLLSVPHNVLMVYEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTLKLLGGLDPAERERLLSMKLP FKGVLRRVL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 63704; Mature: 63704
Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAAS CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IGTYADLGIERSLPRFIPEVEKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGN HHHHHHHCHHHCCHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQRTGTLAVIEQIERQSHWFMLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLFTVTQLNARDVAILAFAYKFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGG HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC LARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIVFIAFTFGESLLSVPHNVLMV HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH YEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLLGGLDPAERERLLSMKLPFKGVLRRVL HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAAS CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IGTYADLGIERSLPRFIPEVEKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGN HHHHHHHCHHHCCHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQRTGTLAVIEQIERQSHWFMLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLFTVTQLNARDVAILAFAYKFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGG HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC LARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIVFIAFTFGESLLSVPHNVLMV HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH YEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLLGGLDPAERERLLSMKLPFKGVLRRVL HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA