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Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159900788

Identifier: 159900788

GI number: 159900788

Start: 5457057

End: 5458766

Strand: Direct

Name: 159900788

Synonym: Haur_4275

Alternate gene names: NA

Gene position: 5457057-5458766 (Clockwise)

Preceding gene: 159900787

Following gene: 159900789

Centisome position: 85.98

GC content: 51.4

Gene sequence:

>1710_bases
GTGCAATCGAACAAACCGCAGCGGAGCCTCACCAGTGAGGTTTGGAGCGCAACGCTTTGGAATACGCTGCTGTTTCCAGC
CCGCTTTTTAGTTGGCATCATCACCAGTGTGATTTATTACGGGCGGCTTGCACCTGAGCAGGTCGCTTTGATTTTTCTCC
TCACCAGTTTGGCGGCTTCAATTGGCACCTACGCCGACCTTGGGATCGAACGTAGTTTGCCACGCTTCATCCCTGAAGTG
GAAAAACGCCAAGGTCGCCAAGGTGTTTTGCGCTTTCTCTGGCGTATGATCGGACTTAAACTGGCAATTATGGCCGTGCT
GGTGCTCGGTTTGAATCTGCTGGCCCAACCCATGGGCAATTATCTAATCGAGCAACAACGAACTGAGGTTGTTGAACTCG
AAAGCCAAATCCGCAGCCTTGAGCAACAACCAGCCACGTCTGACCAAATCAGCAAGCTCAGCAAATTGCAAAATCAACGC
ACTGGCACGCTCGCCGTGATCGAGCAAATTGAGCGCCAAAGCCACTGGTTTATGCTAGTGGTCAGCGCTTTATTAATTTT
GGGTGCGCTGTTTGATGTCTTTATGCAGTTTCTGACCGCCTACTTCAAACAACGCGCTTGGAACTTGATCACCTTAGTTA
CAACCTTGCTCCAACCAATTTTGGTAACGATCTTTATTTTGCTGGGTTGGGGCATCACGGGGGTGTTGATTGGCTTGGTG
CTCACGCCATTGGTTAGCGTGTTGATGGCAGCGTGGCAAGCCTTACGCGCCAGCCGCGAGCTATCCAATACTGGCGAGGG
CGAGGCGAGCGATCCCGAATTACCTAAGCGTTTTGCCAAATTTGCCGCAGTCTCCTATTTAATGCAAATCACCACCTGGG
TGTATGATATTCAGTTTGTAACGCTGTTTACGGTGACCCAACTGAATGCCCGCGATGTGGCGATTTTGGCTTTTGCCTAT
AAATTTGCCAAAGATTACCTTGGCTATATTTGGATGCCGCTCAACGGCGTGATGACTCCGCTGCTTTCGCGGATCAAATT
GCGCCGCGATCCCCAATCGTTGCAAGATGCTCATGGTGGTTTGGCCCGCATGATTTGGCTGTTGATTGTGCCAGCAGGCG
TGGGTTTGGCCTTGCTCACTCCGCGCATGGTGGCGGTGCTGTATCCACTCTACACCGATGCCAGCAGCTTAATTATTGTG
TTTATCGCATTTACCTTTGGCGAATCGTTGCTGAGCGTGCCGCATAATGTACTGATGGTTTATGAGCAATATCGCGCTGT
GATCATTTCGCGCTTGTTTGCCTTTATCAGTGTGCCATTGGTTTTTGTGTTGCTACCACGCTATGGCATGTTGGGCGTGG
CGATTGCGGTTGGCGCAGTGCGAGTTGCCACCCGCTTGATCACGCTCTATTATGGATGGCGCAATTTGGGCTTGCAATTG
CCCTGGCGGTTTTGGCTGCGGGTTTGTGCTGCCAGCGCCAGTTTTGCGGTGGCCCTCATTGGGTTAATGCAACTTTGGCC
AATGCCTGAGGCGGCGGCTGGCTGGCAAACTAAATTAATCAATCTGTTGCCGTTGATGCTGTTTGCCGCAATTGGGGCTG
GCCTCTATTTACTCACATTGAAATTGCTCGGCGGGCTTGATCCGGCTGAGCGAGAGCGTTTATTGAGCATGAAACTTCCA
TTCAAGGGCGTGCTTCGGCGCGTATTATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTAAACCCATTCGCTGGTTGCCACCACATCGCAACCCGCTTGCTATTCCCTACCCGCCCTTGATCGGAAATGGGATGG
TAGCCACTGGAGTACGTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATGCAGCGATTTAAACGATTTCTACCATTGGCGCTAATTGCCTTGAGCGCCATTATTTTTCTCATTCCGCCTGCGCGG
CCTAGCATCGATGTTGTGAT

Product: virulence factor MVIN family protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 569; Mature: 569

Protein sequence:

>569_residues
MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAASIGTYADLGIERSLPRFIPEV
EKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGNYLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQR
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PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTLKLLGGLDPAERERLLSMKLP
FKGVLRRVL

Sequences:

>Translated_569_residues
MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAASIGTYADLGIERSLPRFIPEV
EKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGNYLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQR
TGTLAVIEQIERQSHWFMLVVSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV
LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFVTLFTVTQLNARDVAILAFAY
KFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGGLARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIV
FIAFTFGESLLSVPHNVLMVYEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL
PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTLKLLGGLDPAERERLLSMKLP
FKGVLRRVL
>Mature_569_residues
MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAASIGTYADLGIERSLPRFIPEV
EKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGNYLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQR
TGTLAVIEQIERQSHWFMLVVSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV
LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFVTLFTVTQLNARDVAILAFAY
KFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGGLARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIV
FIAFTFGESLLSVPHNVLMVYEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL
PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTLKLLGGLDPAERERLLSMKLP
FKGVLRRVL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63704; Mature: 63704

Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAAS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IGTYADLGIERSLPRFIPEVEKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGN
HHHHHHHCHHHCCHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQRTGTLAVIEQIERQSHWFMLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLFTVTQLNARDVAILAFAYKFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGG
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
LARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIVFIAFTFGESLLSVPHNVLMV
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLLGGLDPAERERLLSMKLPFKGVLRRVL
HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MQSNKPQRSLTSEVWSATLWNTLLFPARFLVGIITSVIYYGRLAPEQVALIFLLTSLAAS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IGTYADLGIERSLPRFIPEVEKRQGRQGVLRFLWRMIGLKLAIMAVLVLGLNLLAQPMGN
HHHHHHHCHHHCCHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIEQQRTEVVELESQIRSLEQQPATSDQISKLSKLQNQRTGTLAVIEQIERQSHWFMLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSALLILGALFDVFMQFLTAYFKQRAWNLITLVTTLLQPILVTIFILLGWGITGVLIGLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTPLVSVLMAAWQALRASRELSNTGEGEASDPELPKRFAKFAAVSYLMQITTWVYDIQFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLFTVTQLNARDVAILAFAYKFAKDYLGYIWMPLNGVMTPLLSRIKLRRDPQSLQDAHGG
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
LARMIWLLIVPAGVGLALLTPRMVAVLYPLYTDASSLIIVFIAFTFGESLLSVPHNVLMV
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YEQYRAVIISRLFAFISVPLVFVLLPRYGMLGVAIAVGAVRVATRLITLYYGWRNLGLQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PWRFWLRVCAASASFAVALIGLMQLWPMPEAAAGWQTKLINLLPLMLFAAIGAGLYLLTL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLLGGLDPAERERLLSMKLPFKGVLRRVL
HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA