Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 159896858

Identifier: 159896858

GI number: 159896858

Start: 388096

End: 390231

Strand: Direct

Name: 159896858

Synonym: Haur_0325

Alternate gene names: NA

Gene position: 388096-390231 (Clockwise)

Preceding gene: 159896857

Following gene: 159896859

Centisome position: 6.12

GC content: 54.73

Gene sequence:

>2136_bases
ATGATTTTTATTCTGCAATCGATCGCGCTGGCGATTTCAATTTTCAATGCAATTATCTGTTTGTGGTTGGGCATGACTGT
GGCGCTCGATGGTGGGCGTGAACGTGGCCCGCGTTTGGCAGCGGCTGGTTTATTGATGGCTGGCGTGTTCTTTTTGATTC
ACGCGGCGATTATTGGGCGCGGCCCACCAGTGGTTGATGTGGGCTTGCCCTTTTGGTGGCGGGTGATCAGTGTGGTTTCG
TTGCTTGCGCCCTATGCCTGGTATGCCACGATGATCTGGTATACCGGGGTGAGCGGTAAGAGCCTGCGGATTCATAAATT
GCTGCTATTTACCATGGGCATTTTTATTGGAATTTTGGGCTTGGTGCTGACCGCAATTTACCCTTTACCCCAAGAAGCGC
GAATTTTGGCCCTGAAAATTGTGCCAGCTTGGTTGGTTGCCAATTTGCCGTTTATTGTGGCAGGCTATCTTTTGGCTTTG
ATTATGTGTTTTAGCTTGCCGATTCATGCCTTATTGACTGGTCCAGGGCGGCGCAACAACTTGCCGCATCAAGCATGGCT
GCGGGTGCGCTCGTGGCTGATTCGCACCTCGTTGCTGGGGTTGCTCGCTGGAATTGTGGCATTAATCGGCGCGGTGATCG
TTTTTTCGCAAGGTGCAGTGGGCCGCACTCCTGAGGTCGCTTGGCTGGCCGATCGCGCAATCGAACTCTTTTTTCAGCTT
GATGTGATGGTGCTCATCGTGGTGGCTGCGGCGTTGGGGGCTGCTGGTCAGGCGATGGGAGCCTACGCTGCCTTTACCGA
TCGCCCCTTGCCCCAATGGAATCGCATCGATCAATGGCGTTGGTTGGTGGCGATTGCTGGCGGTTTTGCCTTGATGGTTG
GGGTCAGCTCAGCGCTGCAAGTGGCCTCGATCTACATTGTGTTGTTTGCCACAACCTTGGCTTCGCTGGCCTATGGCCTG
TTGAGTTGGCGCTATCGGGTTGAGCACGAGGCTTTTATGGAGCGTTTGCGCCCGTTCGTTGGCAGTTTGCACTTTCAAGA
TCGTTTGTTGGATGGCGGGGCTAGCCTTTCGGCTTCGGTCGAAGGCTTGGTTGAGGCGGTCAGTCGTGATGTGCTGCGGG
CGGAACGAGCGTGTTTGTTGCTGCGCGATGCCGTGCCTGGCCTGCCCAACGTAATTAGCTATCACTGGGGCCAAACCCCA
ATTCCATTACTTGAACAATTGCCAATTTCCAACGAACGGCGAACGTCGGGCATTCGGCTTGAGGCGCAAAGTGGGGCCGA
GTGGGCTGTGCCCTTGTGGGATGGGCGGGGTTTGGCCGGAGCGTTGGTGCTTGGTTCGCCCCAAGCTGGCGCGGTGTATA
GCGAAGAATTGATGGAAGTTGCGGCGGCCTGCTGTGCCCGTTTGACCGATGCGCTGGCTGGCGAACGGGCGGCGCGAATG
TTGGGTGATGTGTTGCGCCAACGAATTGCTGAAGTCAAAGTCTTGGGTAGCCAAGGGCGACGCACCTTGCACGACGATGT
ATTGCCGCAAATTCATGCCGCATTGATTCATCTCAGCGCGGTTTCGGCCAACGATCCCATGGCGCAACAAACAATTCAGG
CCTTATCCGAGGCCCATACCAAGCTTTCGGCGTTGATTCGCTCGTTGCCGCCCGCCACTCCCCATCGTTTGGCCCAAGGT
GGTTTAGCCCAAACCTTGCACGATATGGTTTTAGTTGATTTTGGCAATGCCTTTGATCAGGTCAGTTATACCGTTGCGCC
TGCGGCAGAAGCCCGTTTGGCTGATACGCCGCAATTTATCGGCGAAGTGATTAGCTATGCCTTGCAAGAAACTCTGCGTA
ATGCCGCCCGCCATGCTCGTGGCAACGATCCACGCCGCACATTGCAGATGCGGGTACAAATTGATTGGCAACATGGTTTA
GTTGTCGATATTTGTGACGACGGTGTGGGCATGCAACCGCATCAATCGAGTTCATCGGGCAGTGGTAGCGGCTTGCGTCT
ACATCGCGGCTTGTTGATGGTGATTGGTGGCAGCCTGAATATTGCTACACCAGGGCAGGGTGGCACGCATATTCACATTC
AAGTGCCTGAAGAATTATGGAACTTGCCAGTGCTCGAACCCGAAGAAATTGCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAACGACGATCTCAGCAATGGGATCGTCGTTGGTATTTAAGCACCTAGGTGCTAGCTCGAAGCTGGTATGATGAAACAA
CTGGCTTATAGGTAGCATCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAGTAGGTTCCAACCTGCAATCGCCAATAGTCAATCCCAATCAGCGACTTAAGTCATAGCTAGTCGTGCTATAATCG
TTCTAAATAGTACAACAAGA

Product: integral membrane sensor signal transduction histidine kinase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 711; Mature: 711

Protein sequence:

>711_residues
MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGRGPPVVDVGLPFWWRVISVVS
LLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILGLVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLAL
IMCFSLPIHALLTGPGRRNNLPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL
DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQVASIYIVLFATTLASLAYGL
LSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASVEGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTP
IPLLEQLPISNERRTSGIRLEAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM
LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHTKLSALIRSLPPATPHRLAQG
GLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFIGEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGL
VVDICDDGVGMQPHQSSSSGSGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA

Sequences:

>Translated_711_residues
MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGRGPPVVDVGLPFWWRVISVVS
LLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILGLVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLAL
IMCFSLPIHALLTGPGRRNNLPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL
DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQVASIYIVLFATTLASLAYGL
LSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASVEGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTP
IPLLEQLPISNERRTSGIRLEAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM
LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHTKLSALIRSLPPATPHRLAQG
GLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFIGEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGL
VVDICDDGVGMQPHQSSSSGSGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA
>Mature_711_residues
MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGRGPPVVDVGLPFWWRVISVVS
LLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILGLVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLAL
IMCFSLPIHALLTGPGRRNNLPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL
DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQVASIYIVLFATTLASLAYGL
LSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASVEGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTP
IPLLEQLPISNERRTSGIRLEAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM
LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHTKLSALIRSLPPATPHRLAQG
GLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFIGEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGL
VVDICDDGVGMQPHQSSSSGSGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76830; Mature: 76830

Theoretical pI: Translated: 7.73; Mature: 7.73

Prosite motif: PS50109 HIS_KIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGR
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GPPVVDVGLPFWWRVISVVSLLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILG
CCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLALIMCFSLPIHALLTGPGRRNN
HHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCC
LPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQ
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VASIYIVLFATTLASLAYGLLSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHH
EGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTPIPLLEQLPISNERRTSGIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEE
EAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM
EECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KLSALIRSLPPATPHRLAQGGLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFI
HHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCEEEECCCCHHHCCCCHHHH
GEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGLVVDICDDGVGMQPHQSSSSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
SGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA
CCCCCEECCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEEEECHHHCCCCCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure
MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGR
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GPPVVDVGLPFWWRVISVVSLLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILG
CCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLALIMCFSLPIHALLTGPGRRNN
HHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCC
LPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQ
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VASIYIVLFATTLASLAYGLLSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHH
EGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTPIPLLEQLPISNERRTSGIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEE
EAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM
EECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KLSALIRSLPPATPHRLAQGGLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFI
HHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCEEEECCCCHHHCCCCHHHH
GEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGLVVDICDDGVGMQPHQSSSSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
SGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA
CCCCCEECCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEEEECHHHCCCCCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA