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Definition Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome.
Accession NC_009954
Length 2,077,567

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The map label for this gene is atpI [H]

Identifier: 159041944

GI number: 159041944

Start: 1453395

End: 1455902

Strand: Reverse

Name: atpI [H]

Synonym: Cmaq_1380

Alternate gene names: 159041944

Gene position: 1455902-1453395 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159041946

Following gene: 159041940

Centisome position: 70.08

GC content: 42.22

Gene sequence:

>2508_bases
ATGGAGGACCTATTTGATTTAAACTTAAAAATCAAGCCCAGTGAGCCTAATGTGCCCATAGAGAGGATTGTGGAGTATAA
GATAACGGTACCTAGGCATGCGGCATTGGATTTAATATTCAGGGTGGGTTTACTTGGTGAATTCATGCCCATTGATAGAC
CCCCTAAGTTACCTGCCCCCTCAATTGACCAGGAAACCTACACTAGCGTTAGGAGATTGACTGAAGCCGCTAGGACAATA
TCAAGGTATGGTCAAACCCAACAGGAGCCATCAATAGGTAGGTTTAGGGTTAAGGCAACCTCTTTCAAGGACTTCATAGA
CTCAGTGTATAAGAATGGTGAGGAATTGATAGGTAGGATTAGGCAAATTGAGGATTCACTAAATAATGCTGAAGAGGAGT
TAACGAAACTTAGGCTAATGATAAGCGTTAATTCCCTAATAGGATTAATGCAGCTTAAGAATATTAGGTACATTGTCGTC
GAGACCCCCCATAGGGCTTTAAGTGACTTCGAGAACTCCATTAAGCAGATTGAGGATGTAGTCTTAACTAGGCTTGGTGA
AGTTAATGATAGGATTCACTTACTTATAATTGCCCCAACCTGGGAGTTGAGGAGGATTAATGACATCATTAGGCTGCATA
ACGTTAAGGTAATTGAATTACCTGAGAGTGATTTAAGTAATGTGGAGGCCAGGGTTAAGGAGACTGAGGCAACCATAAGT
AGCTTAAGGAGTCAACTTGAGTCATTAATAAGTAGTAATAAGCAGGTGATAAGGGGTATTTTAGAGGCTGCAGGTGTTGC
TGAGAATGTTATTCAAACTTACGTTAATAGTGCCGTTGAAGAGGGGGGTGAGGTTATTGCTAGGATTGATGCAATTAAGA
CTCAGATGGTGGAAATGGAGAGTAGGTTAAGTAGGCTTAGGTTACTCATCGAGGCGTATAATGGTTTAATTAGAAGTGGG
ATTAAGGAGATGGGGCTTAAGGCGCTAGATTACTCATTATTCATAATTAAGGGTCAAATACCCCCTGACCTAGATAAGTA
CTCGGGGTACGTTATCAACATAGGTGATGAATTATCAGCCTACTTAATCATGAGCAACGTGGATTATCCAGAATCCAACA
ATATTGTTAAGGCGCCAAGGGAGCATTTAACAAACCTGGAGGCGTCAGTGGAGTTGCTTAGTAGGGAGATTAGGGAAATG
GAGAGGAGGCTGGGTGAATTGAAGAATGAGCTTAATGAAATGATTAGGGAGAGGGAGGAGGCTTGTAATTACAGTATTGA
GGAGGCTAGGCAGGTAAGTGACCTAGTTACTATTAGGGGTTTTGTGATTGAGAAGAATGTGAAGCTTTTCGAGGACTTCC
TGTACAGGACCTTAACCGACCTAGCCGTTGACGCTAGGGTTAGGAAGTTCACCAGGATTATTCAAGTTAATACAATTAAC
CCGCATGAAGCACCCACCAGTGAGGAGTATCCAACACCCATTAATGCTTTTAGGGAGATAACCTACATGTACGGTATACC
AAGGTATGGTGAATTAAGCCCAGTAACATTAACCGCCGTATTATTCCCAGTCTTCTTCGGCTGGATGTTCCCAGATGCTG
GACAAGGTGCAATACTACTACTCTTCGGTATACTCATGAATGTGCTTAAGTATAATGGTAGGAATAGTATACTTAGGGCG
ATGTTTTCAGGGAAGGCTAATCTATGGGGTCAATTATTCGTAATGATGGGTACCTGGGCCATAGTGTTCTCAATACTGAA
TAGTGGTGAAGTCTTCGGAATGGATTTAATTAAGCCAATACTACCGTGGGGCCGAGTCTTCGTTAATGGTACAATAAGCG
AGTATTGGATAAACTGGGTGCTACCATTGGCAATGCTCTTCGGCTTCACACTACTGGTGATGTCACTGATACTTAAGCCA
CTGAATAGGGCTAGACTTGGGCACAGGTTAGATGCCTTATCACTGGCTTGGGTTCCACTGGTCTTCATAGGCTTTGGCCT
ACTCATGATGAATGTTGGAATAATACCGGTAGCCCTATTAAACCCGGTATTCTCAGCATTATTAACCCCCCAAGTTAGGT
TAATTGGTGCGGCATTAATGGTTATAGGCTTCGGTGGGTTCTTCGGCTCATTCATGTACATTAAATCAATGCCCAACACT
GAGGTTGATGCCGCTGAGTTAATGGTTGGGTTAACCATAGAGGGTATACTGGATGCAATAGCCAATACCTTATCATTCAT
GAGGCTTGGAATAATAGCATTGGTGCACAGTATATTCACCTACATGACGTACCACCTGGCGTTAACATATGGGTTACTAA
CCCCAGCCGGCTTACTAATAATGATATTACTCAATGCACTAATCATTGCTGGGGAAGGATTCCTAACCTTCATTCAGACA
AGTAGGTTAACATTCTATGAAGTATACTCCAAGTTCTATGAAGGATCAGGTAAATTATATATGCCGTTAAGGTATGCCCT
CACTGCACTAAGTATTGAATTACCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAATACCAGACCTCATGCTCAATGCGTATGCTTCAGTATTTTAAAATACAACCGCATTCATCACAATTATTAATGATGCG
TACTCGGTATTTAAGAATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCATATTGAGTGAAAAATTAATTTACAACCTAAGTTAAGCCTAACTGGTGGAGGGCCCGTAGCTCAGCCAGGTTAGAGC
GGCGGCCTTCGGAGCCGTAG

Product: V-type ATPase 116 kDa subunit

Products: ADP; phosphate; H+

Alternate protein names: V-ATPase subunit I [H]

Number of amino acids: Translated: 835; Mature: 835

Protein sequence:

>835_residues
MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAPSIDQETYTSVRRLTEAARTI
SRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRIRQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVV
ETPHRALSDFENSIKQIEDVVLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS
SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEMESRLSRLRLLIEAYNGLIRSG
IKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSAYLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREM
ERRLGELKNELNEMIREREEACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN
PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILLLFGILMNVLKYNGRNSILRA
MFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPILPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKP
LNRARLGHRLDALSLAWVPLVFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT
EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLIMILLNALIIAGEGFLTFIQT
SRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP

Sequences:

>Translated_835_residues
MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAPSIDQETYTSVRRLTEAARTI
SRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRIRQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVV
ETPHRALSDFENSIKQIEDVVLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS
SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEMESRLSRLRLLIEAYNGLIRSG
IKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSAYLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREM
ERRLGELKNELNEMIREREEACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN
PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILLLFGILMNVLKYNGRNSILRA
MFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPILPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKP
LNRARLGHRLDALSLAWVPLVFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT
EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLIMILLNALIIAGEGFLTFIQT
SRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP
>Mature_835_residues
MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAPSIDQETYTSVRRLTEAARTI
SRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRIRQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVV
ETPHRALSDFENSIKQIEDVVLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS
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IKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSAYLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREM
ERRLGELKNELNEMIREREEACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN
PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILLLFGILMNVLKYNGRNSILRA
MFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPILPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKP
LNRARLGHRLDALSLAWVPLVFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT
EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLIMILLNALIIAGEGFLTFIQT
SRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP

Specific function: Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane [H]

COG id: COG1269

COG function: function code C; Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the V-ATPase 116 kDa subunit family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002490 [H]

Pfam domain/function: PF01496 V_ATPase_I [H]

EC number: 3.6.3.14

Molecular weight: Translated: 94289; Mature: 94289

Theoretical pI: Translated: 5.55; Mature: 5.55

Prosite motif: PS00422 GRANINS_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAP
CCCCEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SIDQETYTSVRRLTEAARTISRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
RQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVVETPHRALSDFENSIKQIEDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS
HHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEME
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRLSRLRLLIEAYNGLIRSGIKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHCCEEEEECCCCEE
YLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREMERRLGELKNELNEMIREREE
EEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILL
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
LFGILMNVLKYNGRNSILRAMFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHH
LPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKPLNRARLGHRLDALSLAWVPL
CCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MILLNALIIAGEGFLTFIQTSRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHEECC
>Mature Secondary Structure
MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAP
CCCCEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SIDQETYTSVRRLTEAARTISRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
RQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVVETPHRALSDFENSIKQIEDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS
HHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEME
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRLSRLRLLIEAYNGLIRSGIKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHCCEEEEECCCCEE
YLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREMERRLGELKNELNEMIREREE
EEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILL
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
LFGILMNVLKYNGRNSILRAMFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHH
LPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKPLNRARLGHRLDALSLAWVPL
CCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MILLNALIIAGEGFLTFIQTSRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: ATP; H2O; H+

Specific reaction: ATP + H2O + H+(in) = ADP + phosphate + H+(out)

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10701121; 11427726 [H]